CLARITY (original) (raw)
CLARITY es un método de fabricación de tejido cerebral transparente usando electroforesis en hidrogel y acrilamida. Cuando se acompaña con anticuerpos, permite obtener imágenes altamente detalladas de la estructura de la proteína y ácido nucleico de órganos, especialmente el cerebro. Deriva de la sigla en inglés Clear, Lipid-exchanged, Acrylamide-hybridized Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel. Fue desarrollado por y sus colegas de la Escuela de Medicina de la Universidad de Stanford.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | CLARITY is a method of making tissue transparent using acrylamide-based hydrogels built from within, and linked to, the tissue, and as defined in the initial paper, represents "transformation of intact biological tissue into a hybrid form in which specific components are replaced with exogenous elements that provide new accessibility or functionality". When accompanied with antibody or gene-based labeling, CLARITY enables highly detailed pictures of the protein and nucleic acid structure of organs, especially the brain. It was developed by Kwanghun Chung and Karl Deisseroth at the Stanford University School of Medicine. Several published papers have applied the CLARITY method to a wide range of tissues and disease states such as immuno-oncology for human breast cancer, Alzheimer's disease human brains, mouse spinal cords, multiple sclerosis animal models, and plants. CLARITY has also been combined with other technologies to develop new microscopy methods including confocal expansion microscopy, SPIM light sheet microscopy, and CLARITY-optimized light sheet microscopy (COLM). (en) CLARITY es un método de fabricación de tejido cerebral transparente usando electroforesis en hidrogel y acrilamida. Cuando se acompaña con anticuerpos, permite obtener imágenes altamente detalladas de la estructura de la proteína y ácido nucleico de órganos, especialmente el cerebro. Deriva de la sigla en inglés Clear, Lipid-exchanged, Acrylamide-hybridized Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel. Fue desarrollado por y sus colegas de la Escuela de Medicina de la Universidad de Stanford. (es) ( 클래리티는 여기로 연결됩니다. 다른 뜻에 대해서는 클래리티 (동음이의) 문서를 참고하십시오.) CLARITY는 뇌 조직을 투명하게 하는 실험 기법이다. 처음 논문에서 정의된 것처럼, "온전한 생체 조직을 특정 구성 요소는 새로운 접근성 또는 기능성을 제공하는 외래 요소로 대체된 하이브리드 형태로의 변화"를 나타낸다. 또는 유전자 기반의 라벨링을 동반하는 경우, CLARITY는 기관의 단백질과 핵산 구조, 특히 그것에 의해 개발되었다. 광 및 분자 접근성을 향상시키기 위해 조직 내에서 아크릴 아미드 기반의 조직 - 겔 하이브리드를 구축하는 CLARITY 방법을 사용한 후속 발표 논문은 알츠하이머 병에 걸린 인간의 뇌, 마우스 척수, 다발성 경화증 동물 모델, 식물,에 관한 연구 및 공초점 현미경(F. Chen 등. Science, 2015년 1월)과 CLARITY-강화된 광시트 현미경 또는 COLM에서 사용하기 위한 조직의 확장 또는 부풀어오름을 포함하는 현미경적 방법들을 포함했다. (ko) CLARITY (ang. Clear, Lipid-exchanged, Acrylamide-hybridized Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel) – metoda służąca do otrzymywania preparatów biologicznych w postaci przezroczystych mózgów, po ich wcześniejszej izolacji. (pl) CLARITY (acronimo di Clear, Lipid-exchanged, Anatomically Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel, così come citato dai suoi inventori), è una tecnica di preparazione di campioni istologici messa a punto da un team della della Stanford University, in una ricerca finanziata dai National Institutes of Health, diretta da e condotta da un'équipe di neuroscienziati, psichiatri, ingegneri e informatici: K. Chung, S. Kim, K.A. Zalocusky, J.H. Mattis, V. Gradinaru, S. Kalyanasundaram, S.M. Pak, C. Ramakrishnan, J.J. Mirzabekov, K. Deisseroth. In seguito sono stati pubblicati studi che hanno fatto uso della metodologia CLARITY per costruire ibridi gel-tessuti a base di acrilammide all'interno di tessuti per un migliore accesso ottico e molecole: tra questi studi vi sono stati quelli su cervelli umani affetti da sindrome di Alzheimer, su midollo spinale di topi, su modelli animali per la sclerosi multipla e metodi di microscopia tra cui l'espansione e il gonfiaggio di tessuti per l'uso nella microscopia confocale e nella migliorata attraverso la tecnica CLARITY (CLARITY Optimized Light-sheet Microscope, o COLM). (it) CLARITY är en nytillkommen hjärn-avbildningsmetod som har utvecklats av forskare vid Deisseroth laboratory vid Stanford University, USA (2013). Utvecklingen av CLARITY leddes av Karl Deisseroth och hans team som bestod av bl.a. Kwanghun Chung och metoden bygger på att man lättare ska kunna studera hjärnvävnaden genom att göra den transparent genom att införa en hydrogel som består av akrylamid. Enligt Deisseroth et al. tillåter CLARITY att studera de neurala strukturerna på molekylnivå i deras intakta och originala tillstånd istället för att skära hjärnstrukturerna i tunna sektioner för att sedan rekonstruera dem del för del. Deisseroth et al. anser att dagens teknik håller oss tillbaka när det kommer till forskning kring mindre strukturer och regioner i hjärnan då man med de traditionella metoderna får mer ofullständiga bilder, vilket ofta leder till missbedömningar. CLARITY låter oss få studera dessa molekylära strukturer genom att låta dem vara intakta. Med hjälp av den så kallade akrylamid–baserade hydrogelen tar man bort fett från den intakta hjärnvävnaden, vilket gör den genomsläpplig för synliga spektrum fotoner och makromolekyler samtidigt som den bibehåller den fina strukturen hos vävnaden. På detta sätt får man rent principiellt en genomskinlig hjärna som sedan kan studeras i tre dimensioner med hjälp av ett mikroskop. Enligt Deisseroth et al. representerar detta en omvandling av biologisk vävnad till en hybridform där diverse specifika komponenter har ersatts med exogena faktorer som förser ny tillgänglighet och funktionalitet. CLARITY har bidragit till att vi kan skapa högupplösta, detaljerade rekonstruktioner av hela intakta hjärnor och att vi med hjälp av standardiserad immunhistokemisk teknik kan identifiera individuella nervceller samt prognoser över större volymer och regioner i hjärnan. För att studera diverse proteiner kan CLARITY kombineras med immunhistokemisk färgning, dess motsvarighet kallas för situ-hybridisering vilket används vid studier av uttryck från enskilda gener. Idag används CLARITY mestadels för att studera hjärnans strukturer, gener och proteiner i hela hjärnan, dock har Deisseroth och Kwanhun påpekat att metoden går att använda på andra organ än hjärnan. Forskarteamet vid Stanford University har stora förväntningar om att denna förmåga, denna teknik, att kunna studera samt beskriva neurala nätverk i sin helhet, samt hur sjukdomar påverkar dem, kommer troligtvis att breda ut nya gränser inom den neurovetenskapliga forskningen. (sv) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/CLARITY_Brain_Imaging.jpg?width=300 |
| dbo:wikiPageID | 39270382 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 14689 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1095403934 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Proteins dbr:Electrophoresis dbr:Carcinogenic dbr:Nucleic_acids dbr:Glutaraldehyde dbr:Brain dbr:Brainbow dbr:Multiple_sclerosis dbr:Connectome dbr:Antibody dbr:Stanford_University_School_of_Medicine dbr:Autism dbr:Lipid dbr:Acrylamide dbr:3DISCO dbr:Alzheimer's_disease dbc:Neuroimaging dbr:Fluorescence dbr:Formaldehyde dbr:Francis_Collins dbr:Paraformaldehyde dbr:File:CLARITY_Brain_Imaging.jpg dbr:Karl_Deisseroth dbr:DiI dbc:Stanford_University_medicine dbr:Antibodies dbr:National_Institutes_of_Health dbr:Neurotransmitters dbr:Neural_circuit dbr:Expansion_microscopy dbr:Immunohistochemistry dbr:Immunostaining dbr:Postmortem dbr:Diffusion_Tensor_Imaging |
| dbp:sign | dbr:Francis_Collins |
| dbp:text | "CLARITY is powerful. It will enable researchers to study neurological diseases and disorders, focusing on diseased or damaged structures without losing a global perspective. That's something we've never before been able to do in three dimensions." (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Blockquote dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Neuroimaging dbc:Stanford_University_medicine |
| gold:hypernym | dbr:Method |
| rdf:type | dbo:Software |
| rdfs:comment | CLARITY es un método de fabricación de tejido cerebral transparente usando electroforesis en hidrogel y acrilamida. Cuando se acompaña con anticuerpos, permite obtener imágenes altamente detalladas de la estructura de la proteína y ácido nucleico de órganos, especialmente el cerebro. Deriva de la sigla en inglés Clear, Lipid-exchanged, Acrylamide-hybridized Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel. Fue desarrollado por y sus colegas de la Escuela de Medicina de la Universidad de Stanford. (es) ( 클래리티는 여기로 연결됩니다. 다른 뜻에 대해서는 클래리티 (동음이의) 문서를 참고하십시오.) CLARITY는 뇌 조직을 투명하게 하는 실험 기법이다. 처음 논문에서 정의된 것처럼, "온전한 생체 조직을 특정 구성 요소는 새로운 접근성 또는 기능성을 제공하는 외래 요소로 대체된 하이브리드 형태로의 변화"를 나타낸다. 또는 유전자 기반의 라벨링을 동반하는 경우, CLARITY는 기관의 단백질과 핵산 구조, 특히 그것에 의해 개발되었다. 광 및 분자 접근성을 향상시키기 위해 조직 내에서 아크릴 아미드 기반의 조직 - 겔 하이브리드를 구축하는 CLARITY 방법을 사용한 후속 발표 논문은 알츠하이머 병에 걸린 인간의 뇌, 마우스 척수, 다발성 경화증 동물 모델, 식물,에 관한 연구 및 공초점 현미경(F. Chen 등. Science, 2015년 1월)과 CLARITY-강화된 광시트 현미경 또는 COLM에서 사용하기 위한 조직의 확장 또는 부풀어오름을 포함하는 현미경적 방법들을 포함했다. (ko) CLARITY (ang. Clear, Lipid-exchanged, Acrylamide-hybridized Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel) – metoda służąca do otrzymywania preparatów biologicznych w postaci przezroczystych mózgów, po ich wcześniejszej izolacji. (pl) CLARITY is a method of making tissue transparent using acrylamide-based hydrogels built from within, and linked to, the tissue, and as defined in the initial paper, represents "transformation of intact biological tissue into a hybrid form in which specific components are replaced with exogenous elements that provide new accessibility or functionality". When accompanied with antibody or gene-based labeling, CLARITY enables highly detailed pictures of the protein and nucleic acid structure of organs, especially the brain. It was developed by Kwanghun Chung and Karl Deisseroth at the Stanford University School of Medicine. (en) CLARITY (acronimo di Clear, Lipid-exchanged, Anatomically Rigid, Imaging/immunostaining compatible, Tissue hYdrogel, così come citato dai suoi inventori), è una tecnica di preparazione di campioni istologici messa a punto da un team della della Stanford University, in una ricerca finanziata dai National Institutes of Health, diretta da e condotta da un'équipe di neuroscienziati, psichiatri, ingegneri e informatici: K. Chung, S. Kim, K.A. Zalocusky, J.H. Mattis, V. Gradinaru, S. Kalyanasundaram, S.M. Pak, C. Ramakrishnan, J.J. Mirzabekov, K. Deisseroth. (it) CLARITY är en nytillkommen hjärn-avbildningsmetod som har utvecklats av forskare vid Deisseroth laboratory vid Stanford University, USA (2013). Utvecklingen av CLARITY leddes av Karl Deisseroth och hans team som bestod av bl.a. Kwanghun Chung och metoden bygger på att man lättare ska kunna studera hjärnvävnaden genom att göra den transparent genom att införa en hydrogel som består av akrylamid. Enligt Deisseroth et al. tillåter CLARITY att studera de neurala strukturerna på molekylnivå i deras intakta och originala tillstånd istället för att skära hjärnstrukturerna i tunna sektioner för att sedan rekonstruera dem del för del. Deisseroth et al. anser att dagens teknik håller oss tillbaka när det kommer till forskning kring mindre strukturer och regioner i hjärnan då man med de traditionella (sv) |
| rdfs:label | CLARITY (en) CLARITY (es) CLARITY (it) CLARITY (ko) CLARITY (pl) CLARITY (sv) |
| owl:sameAs | freebase:CLARITY wikidata:CLARITY dbpedia-es:CLARITY dbpedia-it:CLARITY dbpedia-ko:CLARITY dbpedia-pl:CLARITY dbpedia-sv:CLARITY https://global.dbpedia.org/id/VLPU |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:CLARITY?oldid=1095403934&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/CLARITY_Brain_Imaging.jpg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:CLARITY |
| is dbo:knownFor of | dbr:Karl_Deisseroth |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Clarity |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Light_sheet_fluorescence_microscopy dbr:List_of_psychiatrists dbr:Tissue_clearing dbr:Clarity dbr:3DISCO dbr:List_of_Stanford_University_people dbr:Karl_Deisseroth dbr:DiI dbr:CUBIC dbr:Viviana_Gradinaru dbr:Schizoaffective_disorder |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:CLARITY |
