ChIP sequencing (original) (raw)
رقاقة التسلسل، تسمى أيضا ChIP-seq ، هي طريقة مستخدمة لتحليل تفاعلات البروتين مع الحمض النووي . يجمع ChIP-seq بين المناعة المناعية للكروماتين (ChIP) وتسلسل الحمض النووي المتوازي بشكل كبير لتحديد مواقع الربط للبروتينات المرتبطة بالحمض النووي. يمكن استخدامه لتعيين مواقع الربط بشكل عمومي بالتحديد لأي بروتين مهم. في السابق، كان Chip-on-chip هو الأسلوب الأكثر شيوعًا المستخدم لدراسة علاقة الحمض النووي بالبروتين .
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | رقاقة التسلسل، تسمى أيضا ChIP-seq ، هي طريقة مستخدمة لتحليل تفاعلات البروتين مع الحمض النووي . يجمع ChIP-seq بين المناعة المناعية للكروماتين (ChIP) وتسلسل الحمض النووي المتوازي بشكل كبير لتحديد مواقع الربط للبروتينات المرتبطة بالحمض النووي. يمكن استخدامه لتعيين مواقع الربط بشكل عمومي بالتحديد لأي بروتين مهم. في السابق، كان Chip-on-chip هو الأسلوب الأكثر شيوعًا المستخدم لدراسة علاقة الحمض النووي بالبروتين . (ar) ChIP-sequencing, també conegut com a ChIP-seq o immunoprecipitació de cromatina seguida de seqüenciació, és un mètode utilitzat per analitzar interaccions de proteïna amb ADN. ChIP-seq combina immunoprecipitació de cromatina ("ChIP") amb tècniques de seqüenciació massiva d'ADN ("seq"). S'utilitza per identificar els llocs d'unió de les proteïnes amb la molècula d'ADN. Fins ara, ChIP-chip era la tècnica més utilitzada per estudiar aquestes relacions entre ADN i proteïna. (ca) ChIP-sequencing, also known as ChIP-seq, is a method used to analyze protein interactions with DNA. ChIP-seq combines chromatin immunoprecipitation (ChIP) with massively parallel DNA sequencing to identify the binding sites of DNA-associated proteins. It can be used to map global binding sites precisely for any protein of interest. Previously, ChIP-on-chip was the most common technique utilized to study these protein–DNA relations. (en) Die ChIP-Seq (von engl. Chromatin ImmunoPrecipitation DNA-Sequencing) ist eine biochemische Methode zur Bestimmung von Protein-DNA-Interaktionen. Die ChIP-Seq ist eine Kombination aus einer Chromatin-Immunpräzipitation und der DNA-Sequenzierung im Hochdurchsatz. DNA-Protein-Interaktionen kommen bei Bindungssequenzen für Transkriptionsfaktoren an Promotoren, Enhancer, Repressoren, Silencer, Isolatoren sowie bei Bindungssequenzen für die DNA-Replikation vor. (de) La técnica Secuenciación de Inmunoprecipitación de Cromatina, ChIP-sequencing (ChIP-seq) es un método utilizado para identificar los sitios de unión de las proteínas con la molécula de ADN. Este método combina ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina con técnicas de secuenciación masiva. El ChIP-seq es una técnica que se utiliza para el diagnóstico de enfermedades, la expresión génica y la diferenciación celular. (es) Le séquençage ChIP-Seq, également connu en tant que séquençage ChIP, est une méthode utilisée pour analyser les interactions entre protéines et l'ADN. (fr) Chromatine immunoprecipitatie-sequencing, afgekort tot ChIP-seq (Engels: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing), is een relatief nieuwe moleculaire laboratoriumtechniek die het mogelijk maakt om DNA-bindingsplaatsen van een specifiek eiwit in kaart te brengen. Hierbij worden de stukken DNA die gebonden zijn aan het specifieke eiwit opgevangen met behulp van gesynthetiseerde immunoglobulinen om nadien de stukken DNA te sequencen. De verkregen DNA-sequenties worden vervolgens door middel van softwaretools geanalyseerd om de kwaliteit van de ChIP-seq en eventuele DNA-bindingsplaatsen te beoordelen. (nl) ChIP-seq (z ang. chromatin immunoprecipitation-sequencing) – metoda analizy interakcji białek z DNA. Wykorzystuje immunoprecypitację chromatyny oraz sekwencjonowanie wysokoprzepustowe. Pierwszym krokiem jest uzyskanie fragmentów DNA, do których wiążą się badane białka – czynników transkrypcyjnych i histonów, najczęściej specyficznie modyfikowanych. Następnie fragmenty te są sekwencjonowane, na genom i poddawane dalszej analizie bioinformatycznej. Stopniowo ChIP-seq staje się coraz bardziej popularna i wypiera uprzednio stosowaną metodę , która również opiera się na immuoprecypitacji chromatyny, ale zamiast sekwencjonowania wykorzystuje mikromacierze DNA. (pl) ChIP-seq — метод анализа ДНК-белковых взаимодействий, основанный на иммунопреципитации хроматина (ChIP) и высокоэффективном секвенировании ДНК. Метод был разработан для изучения модификаций гистонов по всему геному, а также поиска мест связывания транскрипционных факторов. Ранее самым популярным методом для установления ДНК-белковых взаимодействий был , сочетающий иммунопреципитацию хроматина с гибридизацией на ДНК-микрочипах. (ru) ChIP-seq é um método utilizado para analisar a interação de proteínas com o DNA. ChIP-seq combina imunoprecipitação da cromatina (ChIP) com sequenciamento de DNA massivamente paralelo para identificar os sítios de ligação de DNA associado a proteínas. Ele pode ser usado para mapear com precisão os sítios de ligação de qualquer proteína de interesse no genoma. Anteriormente, o método mais popular para estabelecer interações DNA-proteína era ChIP-on-chip, que combina a imunoprecipitação da cromatina com a hibridação em microarranjos de DNA (pt) 染色质免疫沉淀-测序（英語：ChIP-sequencing，简称为ChIP-seq）被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀（ChIP）与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前，是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。 (zh) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Chromatin_immunoprecipitation_sequencing.svg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://rna.sysu.edu.cn/chipbase/ http://www.biodatamining.org/content/8/1/20 http://www.ploscompbiol.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pcbi.1003326 https://web.archive.org/web/20170103002633/http:/tagc.univ-mrs.fr/remap/ http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp%3Farnumber=7089223 http://www.regulatory-genomics.org/odin-2/basic-introduction/ http://www.geneprof.org https://archive.today/20140909220058/http:/bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2014/09/05/bioinformatics.btu604.short |
| dbo:wikiPageID | 15360151 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 27749 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1122036539 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Enhancer_(genetics) dbr:DNA dbr:DNase-Seq dbr:DRIP-seq dbr:Nucleosome dbr:Peak_calling dbc:Biotechnology dbc:DNA dbr:Massively_parallel_signature_sequencing dbr:ChiRP-Seq dbr:Gene_expression dbr:Genotype dbr:Oligonucleotide dbr:Pyrosequencing dbr:Crosslinking_of_DNA dbr:Systematic_Evolution_of_Ligands_by_Exponential_Enrichment dbr:Antibody dbr:Competition-ChIP dbr:Paired-end_tag dbr:Microarray dbr:Protein_microarray dbr:Cell_(biology) dbr:Transcription_(genetics) dbr:Transcription_factors dbr:HITS-CLIP dbr:HeLa dbr:RIP-Chip dbc:Genomics_techniques dbr:DNA_sequencing dbr:Chromatin dbr:Chromatin_immunoprecipitation dbr:Epigenetic dbr:Protein dbr:Real-time_polymerase_chain_reaction dbr:Hidden_Markov_Model dbr:Binding_site dbr:CUT&RUN_sequencing dbr:CUT&Tag_sequencing dbr:Phenotype dbc:Proteomic_sequencing dbr:ChIP-exo dbr:ChIP-on-chip dbr:ChIP-Seq dbr:FAIRE-Seq dbr:Mammalian_promoter_database dbr:PAR-CLIP dbr:TCP-seq dbr:Polymerase dbr:Tiling_array dbr:Sono-Seq dbr:Protein_modification dbr:ChIP dbr:ChIP-chip dbr:CLIP-Seq dbr:Histone_modification dbr:Flow_cell dbr:ChIP-nexus dbr:ChIP-PCR dbr:Cluster_amplification dbr:DNA_modification dbr:File:Chromatin_immunoprecipitation_sequencing.svg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Citation_needed dbt:Portal dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Use_dmy_dates |
| dct:subject | dbc:Biotechnology dbc:DNA dbc:Genomics_techniques dbc:Proteomic_sequencing |
| rdfs:comment | رقاقة التسلسل، تسمى أيضا ChIP-seq ، هي طريقة مستخدمة لتحليل تفاعلات البروتين مع الحمض النووي . يجمع ChIP-seq بين المناعة المناعية للكروماتين (ChIP) وتسلسل الحمض النووي المتوازي بشكل كبير لتحديد مواقع الربط للبروتينات المرتبطة بالحمض النووي. يمكن استخدامه لتعيين مواقع الربط بشكل عمومي بالتحديد لأي بروتين مهم. في السابق، كان Chip-on-chip هو الأسلوب الأكثر شيوعًا المستخدم لدراسة علاقة الحمض النووي بالبروتين . (ar) ChIP-sequencing, també conegut com a ChIP-seq o immunoprecipitació de cromatina seguida de seqüenciació, és un mètode utilitzat per analitzar interaccions de proteïna amb ADN. ChIP-seq combina immunoprecipitació de cromatina ("ChIP") amb tècniques de seqüenciació massiva d'ADN ("seq"). S'utilitza per identificar els llocs d'unió de les proteïnes amb la molècula d'ADN. Fins ara, ChIP-chip era la tècnica més utilitzada per estudiar aquestes relacions entre ADN i proteïna. (ca) ChIP-sequencing, also known as ChIP-seq, is a method used to analyze protein interactions with DNA. ChIP-seq combines chromatin immunoprecipitation (ChIP) with massively parallel DNA sequencing to identify the binding sites of DNA-associated proteins. It can be used to map global binding sites precisely for any protein of interest. Previously, ChIP-on-chip was the most common technique utilized to study these protein–DNA relations. (en) Die ChIP-Seq (von engl. Chromatin ImmunoPrecipitation DNA-Sequencing) ist eine biochemische Methode zur Bestimmung von Protein-DNA-Interaktionen. Die ChIP-Seq ist eine Kombination aus einer Chromatin-Immunpräzipitation und der DNA-Sequenzierung im Hochdurchsatz. DNA-Protein-Interaktionen kommen bei Bindungssequenzen für Transkriptionsfaktoren an Promotoren, Enhancer, Repressoren, Silencer, Isolatoren sowie bei Bindungssequenzen für die DNA-Replikation vor. (de) La técnica Secuenciación de Inmunoprecipitación de Cromatina, ChIP-sequencing (ChIP-seq) es un método utilizado para identificar los sitios de unión de las proteínas con la molécula de ADN. Este método combina ensayos de inmunoprecipitación de la cromatina con técnicas de secuenciación masiva. El ChIP-seq es una técnica que se utiliza para el diagnóstico de enfermedades, la expresión génica y la diferenciación celular. (es) Le séquençage ChIP-Seq, également connu en tant que séquençage ChIP, est une méthode utilisée pour analyser les interactions entre protéines et l'ADN. (fr) Chromatine immunoprecipitatie-sequencing, afgekort tot ChIP-seq (Engels: Chromatin Immunoprecipitation Sequencing), is een relatief nieuwe moleculaire laboratoriumtechniek die het mogelijk maakt om DNA-bindingsplaatsen van een specifiek eiwit in kaart te brengen. Hierbij worden de stukken DNA die gebonden zijn aan het specifieke eiwit opgevangen met behulp van gesynthetiseerde immunoglobulinen om nadien de stukken DNA te sequencen. De verkregen DNA-sequenties worden vervolgens door middel van softwaretools geanalyseerd om de kwaliteit van de ChIP-seq en eventuele DNA-bindingsplaatsen te beoordelen. (nl) ChIP-seq (z ang. chromatin immunoprecipitation-sequencing) – metoda analizy interakcji białek z DNA. Wykorzystuje immunoprecypitację chromatyny oraz sekwencjonowanie wysokoprzepustowe. Pierwszym krokiem jest uzyskanie fragmentów DNA, do których wiążą się badane białka – czynników transkrypcyjnych i histonów, najczęściej specyficznie modyfikowanych. Następnie fragmenty te są sekwencjonowane, na genom i poddawane dalszej analizie bioinformatycznej. Stopniowo ChIP-seq staje się coraz bardziej popularna i wypiera uprzednio stosowaną metodę , która również opiera się na immuoprecypitacji chromatyny, ale zamiast sekwencjonowania wykorzystuje mikromacierze DNA. (pl) ChIP-seq — метод анализа ДНК-белковых взаимодействий, основанный на иммунопреципитации хроматина (ChIP) и высокоэффективном секвенировании ДНК. Метод был разработан для изучения модификаций гистонов по всему геному, а также поиска мест связывания транскрипционных факторов. Ранее самым популярным методом для установления ДНК-белковых взаимодействий был , сочетающий иммунопреципитацию хроматина с гибридизацией на ДНК-микрочипах. (ru) ChIP-seq é um método utilizado para analisar a interação de proteínas com o DNA. ChIP-seq combina imunoprecipitação da cromatina (ChIP) com sequenciamento de DNA massivamente paralelo para identificar os sítios de ligação de DNA associado a proteínas. Ele pode ser usado para mapear com precisão os sítios de ligação de qualquer proteína de interesse no genoma. Anteriormente, o método mais popular para estabelecer interações DNA-proteína era ChIP-on-chip, que combina a imunoprecipitação da cromatina com a hibridação em microarranjos de DNA (pt) 染色质免疫沉淀-测序（英語：ChIP-sequencing，简称为ChIP-seq）被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀（ChIP）与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前，是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。 (zh) |
| rdfs:label | رقاقة التسلسل (ar) ChIP-sequencing (ca) ChIP-Seq (de) CHIP-seq (es) ChIP sequencing (en) ChIP-Seq (fr) ChIP-sequencing (nl) ChIP-seq (pl) ChIP-seq (pt) ChIP-seq (ru) 染色质免疫沉淀-测序 (zh) |
| owl:sameAs | wikidata:ChIP sequencing dbpedia-ar:ChIP sequencing dbpedia-ca:ChIP sequencing dbpedia-de:ChIP sequencing dbpedia-es:ChIP sequencing dbpedia-fr:ChIP sequencing dbpedia-he:ChIP sequencing dbpedia-nl:ChIP sequencing dbpedia-pl:ChIP sequencing dbpedia-pt:ChIP sequencing dbpedia-ru:ChIP sequencing dbpedia-zh:ChIP sequencing https://global.dbpedia.org/id/4gw67 |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:ChIP_sequencing?oldid=1122036539&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Chromatin_immunoprecipitation_sequencing.svg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:ChIP_sequencing |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Chip-Sequencing dbr:Chip-sequencing dbr:ChiP-sequencing dbr:ChIP-sequencing dbr:ChIP-Seq dbr:ChIP-seq dbr:Chip-Seq dbr:Chipseq |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Patch-sequencing dbr:Chip-Sequencing dbr:Chip-sequencing dbr:Gene_regulatory_network dbr:ChiP-sequencing dbr:Microfluidics dbr:G-quadruplex dbr:Chromatin_immunoprecipitation dbr:ChIP-sequencing dbr:ChIP-on-chip dbr:ChIP-Seq dbr:ChIP-seq dbr:Whole_genome_bisulfite_sequencing dbr:Chip-Seq dbr:Chipseq |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:ChIP_sequencing |
