DNA–DNA hybridization (original) (raw)
In genomics, DNA–DNA hybridization is a molecular biology technique that measures the degree of genetic similarity between pools of DNA sequences. It is usually used to determine the genetic distance between two organisms and has been used extensively in phylogeny and taxonomy.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | In genomics, DNA–DNA hybridization is a molecular biology technique that measures the degree of genetic similarity between pools of DNA sequences. It is usually used to determine the genetic distance between two organisms and has been used extensively in phylogeny and taxonomy. (en) L'hybridation de l’ADN est un principe de biologie moléculaire, fondé sur les propriétés d’appariement des bases complémentaires d'acides nucléiques. Ce principe est utilisé dans différentes techniques permettant la mise en évidence de la présence de molécules d'acides nucléiques particulières, c'est entre autres le principe utilisé pour la phase de visualisation suivant un Northern blot ou un Southern blot. L'hybridation de l’ADN est également le nom d'une méthode d'analyse phylogénétique développée au début des années 1960. (fr) L'ibridazione, in biologia molecolare, è l'appaiamento complementare di due filamenti di DNA oppure di un filamento di DNA e l'altro di RNA diversi fra loro. L'ibridazione degli acidi nucleici, per esempio, si ritrova nel Southern blot e nel Northern blot, due tecniche volte a rilevare la presenza, in un determinato campione, di una specifica sequenza di DNA (nel Southern blot) o di RNA (nel Northern blot). L'ibridazione si ha quando il foglio di nitrocellulosa usato in queste tecniche viene incubato con sonde radioattive di RNA: in questo caso, le sonde di RNA andranno ad unirsi in modo complementare a quelle di DNA, formando ibridi DNA-RNA. L'ibridazione DNA-DNA è una tecnica utilizzata per l'identificazione batterica: un segmento di DNA di un certo organismo viene marcato e scisso, in seguito unito ad un segmento di DNA di un altro organismo se compatibile. In base al calcolo di quanto DNA dei due organismi si ibrida si può definire se essi appartengono alla stessa specie (75%), allo stesso genere (25%), o di generi differenti (<7%). (it) DNA-DNA分子交雑法（DNA-DNAぶんしこうざつほう）とはDNA配列間の類似性を評価する分子生物学的手法である。この手法は2つのDNA鎖の塩基配列の相同性を定量的に評価することに使用される。主に生物の種 (分類学)間の遺伝的な隔たりを用いることに使用され、特に細菌と古細菌の分類で重要視される。 また、このように種間の遺伝的な距離を定量的に評価することは生物の分類における系統樹を作り上げるために有効なアプローチの一つとして挙げられ、鳥類の分類における、シブリー・アールキスト鳥類分類に用いられた。 別名DNA - DNAハイブリダイゼーション、DNA-DNAハイブリ、DNA-DNA交雑法など。 (ja) DNA-DNA-hybridisatie is het vergelijken van de samenstelling van het DNA van twee verschillende organismen. Daarbij wordt gekeken naar de mate waarin DNA-hybridisatie (het samenvoegen van twee complementaire DNA-strengen tot een dubbele helix) plaatsvindt. Dit is een techniek om twee verschillende DNA-volgorden kwalitatief of semi-kwantitatief met elkaar te vergelijken. Men doet dat door een overeenkomstig stuk DNA uit twee bronnen, bijvoorbeeld van een paard en een zebra eerst in de afzonderlijke strengen te splitsen, met elkaar te mengen en dan weer te laten verenigen tot een dubbele helix. Als de twee strengen veel op elkaar lijken zal dat een stabieler geheel opleveren dan wanneer er op veel plaatsen een verschil in het molecuul zit. Op die plek kan het molecuul zich dan namelijk niet goed aan zijn partner hechten. Men kan de graad van hechting bepalen, bijvoorbeeld door de temperatuur te meten waarbij de helix weer in afzonderlijke strengen uiteenvalt. Deze temperatuur wordt wel de smelttemperatuur genoemd, hoewel dat enigszins in overdrachtelijke zin gezien moet worden. Door hybridisatie-experimenten te doen tussen een aantal verschillende soorten dieren, kan een maat voor de onderlinge verwantschap worden verkregen. In de jaren 1980-1990 is deze techniek populair geweest, maar na die tijd is het mogelijk geworden om zeer eenvoudig de van het te onderzoeken DNA te bepalen. Vergelijking van de base-volgorde is een statistisch veel rijkere bron van informatie. Het latere vergelijkend onderzoek naar stamverwantschap is dan ook vrijwel uitsluitend op deze veel betrouwbaardere methode gebaseerd en daarmee is de DNA-hybridisatietechniek op de achtergrond gedrongen. (nl) DNA-DNA-hybridisering refererar generellt till en molekylärbiologisk teknik som mäter graden av genetisk likhet mellan olika enkelsträngade DNA-sekvenser. Tekniken används oftast för att avgöra graden av mellan två taxa. När man undersöker den genetiska skillnaden mellan en mängd taxa, med hjälp av denna teknik, kan man med hjälp av värdena på den gentiska likheten konstruera ett fylogenetiskt träd; tekniken är därmed en metod för att skapa en molekylär taxonomi. Charles Sibley och var pionjärer inom tekniken och använde DNA-DNA-hybridisering för att undersöka de fylogenetiska släktskapen bland fåglar (Sibley-Ahlquists taxonomi) och primater. Kritiker menar att tekniken är missvisande när man använder den för att undersöka skillnader mellan nära besläktade arter, eftersom alla uppmätta skillnader mellan ortologa sekvenser mellan olika närbesläktade organismer överskuggas av hybridiseringen av paraloga sekvenser inom organismens genom. Idag används istället ofta DNA-sekvensering och som metoder för att fastställa genetisk distans. DNA-DNA-hybridisering används dock fortfarande inom mikrobiologi för att identifiera bakterier. (sv) A hibridação de DNA-DNA ou hibridização de DNA-DNA, geralmente, refere-se a uma técnica biológica molecular que determina o grau de semelhança genética entre combinações de sequências de DNA. Esta técnica geralmente é usada para determinar a distância genética entre duas espécies. Quando várias espécies são comparadas dessa forma os valores semelhantes permitem que as espécies sejam dispostas em uma árvore filogenética; isto é o que torna possível a realização do sistema molecular. Charles Sibley e Jon Ahlquist, pioneiros desta técnica, usaram a hibridização DNA-DNA para examinar as relações filogenéticas de pássaros (a taxonomia de Sibley-Ahlquist) e primatas. Os críticos argumentam que esta técnica não é muito precisa para a comparação de espécies muito próximas, uma vez que qualquer tentativa para determinar diferenças entre os grupos de ortólogos entre organismos é denominado pela hibridação de sequências parólogas dentro do genoma de um organismo. O sequenciamento de DNA e comparações computacionais de sequências de hoje é geralmente o método para determinar a distância genética, embora a técnica ainda seja usada em microbiologia para identificar as bactérias. (pt) |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://ggdc.dsmz.de |
| dbo:wikiPageID | 241191 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 9726 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1095718288 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:DNA dbc:DNA dbr:Genetic_distance dbr:Genomics dbr:Sibley–Ahlquist_taxonomy_of_birds dbr:Whole_genome_sequencing dbr:DSMZ dbc:Molecular_biology dbr:Charles_Sibley dbr:Taxonomy_(biology) dbr:Phylogenetic_tree dbr:Phylogeny dbr:DNA_melting dbr:Temperature_gradient_gel_electrophoresis dbr:Molecular_biology dbr:Paralogous dbr:Orthologous dbr:Jon_Ahlquist dbr:Genetic_similarity dbr:Molecular_systematics |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:About dbt:Better_source_needed dbt:Citation_needed dbt:Clarify dbt:Expand_section dbt:Expert_needed dbt:More_citations_needed dbt:Multiple_issues dbt:Primary_sources dbt:Short_description dbt:Unreferenced_section dbt:Update |
| dct:subject | dbc:DNA dbc:Molecular_biology |
| rdfs:comment | In genomics, DNA–DNA hybridization is a molecular biology technique that measures the degree of genetic similarity between pools of DNA sequences. It is usually used to determine the genetic distance between two organisms and has been used extensively in phylogeny and taxonomy. (en) L'hybridation de l’ADN est un principe de biologie moléculaire, fondé sur les propriétés d’appariement des bases complémentaires d'acides nucléiques. Ce principe est utilisé dans différentes techniques permettant la mise en évidence de la présence de molécules d'acides nucléiques particulières, c'est entre autres le principe utilisé pour la phase de visualisation suivant un Northern blot ou un Southern blot. L'hybridation de l’ADN est également le nom d'une méthode d'analyse phylogénétique développée au début des années 1960. (fr) DNA-DNA分子交雑法（DNA-DNAぶんしこうざつほう）とはDNA配列間の類似性を評価する分子生物学的手法である。この手法は2つのDNA鎖の塩基配列の相同性を定量的に評価することに使用される。主に生物の種 (分類学)間の遺伝的な隔たりを用いることに使用され、特に細菌と古細菌の分類で重要視される。 また、このように種間の遺伝的な距離を定量的に評価することは生物の分類における系統樹を作り上げるために有効なアプローチの一つとして挙げられ、鳥類の分類における、シブリー・アールキスト鳥類分類に用いられた。 別名DNA - DNAハイブリダイゼーション、DNA-DNAハイブリ、DNA-DNA交雑法など。 (ja) L'ibridazione, in biologia molecolare, è l'appaiamento complementare di due filamenti di DNA oppure di un filamento di DNA e l'altro di RNA diversi fra loro. L'ibridazione degli acidi nucleici, per esempio, si ritrova nel Southern blot e nel Northern blot, due tecniche volte a rilevare la presenza, in un determinato campione, di una specifica sequenza di DNA (nel Southern blot) o di RNA (nel Northern blot). (it) DNA-DNA-hybridisatie is het vergelijken van de samenstelling van het DNA van twee verschillende organismen. Daarbij wordt gekeken naar de mate waarin DNA-hybridisatie (het samenvoegen van twee complementaire DNA-strengen tot een dubbele helix) plaatsvindt. Dit is een techniek om twee verschillende DNA-volgorden kwalitatief of semi-kwantitatief met elkaar te vergelijken. (nl) A hibridação de DNA-DNA ou hibridização de DNA-DNA, geralmente, refere-se a uma técnica biológica molecular que determina o grau de semelhança genética entre combinações de sequências de DNA. Esta técnica geralmente é usada para determinar a distância genética entre duas espécies. Quando várias espécies são comparadas dessa forma os valores semelhantes permitem que as espécies sejam dispostas em uma árvore filogenética; isto é o que torna possível a realização do sistema molecular. (pt) DNA-DNA-hybridisering refererar generellt till en molekylärbiologisk teknik som mäter graden av genetisk likhet mellan olika enkelsträngade DNA-sekvenser. Tekniken används oftast för att avgöra graden av mellan två taxa. När man undersöker den genetiska skillnaden mellan en mängd taxa, med hjälp av denna teknik, kan man med hjälp av värdena på den gentiska likheten konstruera ett fylogenetiskt träd; tekniken är därmed en metod för att skapa en molekylär taxonomi. (sv) |
| rdfs:label | DNA–DNA hybridization (en) Ibridazione (biologia molecolare) (it) Hybridation de l'ADN (fr) DNA-DNA分子交雑法 (ja) DNA-DNA-hybridisatie (nl) Hibridização de DNA-DNA (pt) DNA-DNA-hybridisering (sv) |
| owl:sameAs | freebase:DNA–DNA hybridization wikidata:DNA–DNA hybridization http://bs.dbpedia.org/resource/DNK-DNK_hibridizacija dbpedia-fr:DNA–DNA hybridization dbpedia-gl:DNA–DNA hybridization dbpedia-hu:DNA–DNA hybridization dbpedia-it:DNA–DNA hybridization dbpedia-ja:DNA–DNA hybridization dbpedia-nl:DNA–DNA hybridization dbpedia-no:DNA–DNA hybridization dbpedia-pt:DNA–DNA hybridization dbpedia-sh:DNA–DNA hybridization dbpedia-sv:DNA–DNA hybridization dbpedia-tr:DNA–DNA hybridization https://global.dbpedia.org/id/545fY |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:DNA–DNA_hybridization?oldid=1095718288&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:DNA–DNA_hybridization |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:DNA-DNA_Hybridization dbr:DNA-DNA_hybridization dbr:DNA-DNA_Hybridisation dbr:DNA-DNA_Reassociation dbr:DNA-DNA_hybridisation dbr:DNA-DNA_reassociation dbr:DNA–DNA_hybridisation dbr:Comparative_cDNA_hybridization |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Melampitta dbr:Melanocharitidae dbr:Black_stork dbr:Bradyrhizobium dbr:Antbird dbr:Hummingbird dbr:Deinococcus_frigens dbr:Polymerase_chain_reaction dbr:Limosilactobacillus_vaginalis dbr:Propionispira_raffinosivorans dbr:Corvidae dbr:Gemella_morbillorum dbr:Wader dbr:Frigatebird dbr:Grebe dbr:Bowerbird dbr:Brachybacterium_paraconglomeratum dbr:Limpkin dbr:Chlamydia_abortus dbr:Sibley–Ahlquist_taxonomy_of_birds dbr:Horsfield's_bush_lark dbr:Brown_pelican dbr:DNA-DNA_Hybridization dbr:DNA-DNA_hybridization dbr:Olive_warbler dbr:Sylvioidea dbr:Gruiformes dbr:Acetobacteraceae dbr:Black-necked_stork dbr:Wrentit dbr:Green_ibis dbr:DNA-DNA_Hybridisation dbr:DNA-DNA_Reassociation dbr:DNA-DNA_hybridisation dbr:DNA-DNA_reassociation dbr:DNA–DNA_hybridisation dbr:Old_World_flycatcher dbr:Cathartiformes dbr:Wood_stork dbr:Painted_berrypecker dbr:Species dbr:Michaelis–Menten_kinetics dbr:Sittella dbr:Nautilia_profundicola dbr:Sungrebe dbr:Telomeric_repeat–containing_RNA dbr:Comparative_cDNA_hybridization |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:DNA–DNA_hybridization |