EF hand (original) (raw)

About DBpedia

Ein EF-Hand ist ein spezifisches Aminosäurenmotiv in Proteinen. Das Motiv ist ein sogenanntes mit geladenen Aminosäuren, welche Ca2+-Ionen binden. Bedingt durch das Binden von Calcium verändert sich die Konformation des Proteins und kann so auch seine Funktion verändern. Der Name EF-Hand stammt aus der Nomenklatur bei der Untersuchung von , welches drei EF-Hand-Motive besitzt. EF-Hand-Motive findet man unter anderem auch im Signalprotein Calmodulin und im Muskelprotein Troponin C.

thumbnail

Property Value
dbo:abstract EF-ruka (z angl. EF-hand) je proteinový složený ze dvou alfa-helixů („“), který váže vápenaté ionty. EF hand byl popsán u kalmodulinu a pojmenován podle toho, že ho tvoří helixy E a F, a že připomíná lidskou ruku v určité poloze – jeho stavbu je možné napodobit pomocí pravé ruky, přičež palec a ukazovák ukazují ven a zbytek prstů je sbalen v pěsti. Palec a ukazovák v takovém případě představují helixy E a F, zatímco zbytek dlaně reprezentuje smyčku, v níž je navázán atom vápníku. EF-ruka se vyjma kalmodulinu vyskytuje i v mnohých dalších – k takovým patří např. různé enzymy (proteinkinázy s kalmodulinovou doménou či proteáza ), cytoskeletární proteiny (alfa-aktinin, , ) a další . (cs) Ein EF-Hand ist ein spezifisches Aminosäurenmotiv in Proteinen. Das Motiv ist ein sogenanntes mit geladenen Aminosäuren, welche Ca2+-Ionen binden. Bedingt durch das Binden von Calcium verändert sich die Konformation des Proteins und kann so auch seine Funktion verändern. Der Name EF-Hand stammt aus der Nomenklatur bei der Untersuchung von , welches drei EF-Hand-Motive besitzt. EF-Hand-Motive findet man unter anderem auch im Signalprotein Calmodulin und im Muskelprotein Troponin C. (de) The EF hand is a helix–loop–helix structural domain or motif found in a large family of calcium-binding proteins. The EF-hand motif contains a helix–loop–helix topology, much like the spread thumb and forefinger of the human hand, in which the Ca2+ ions are coordinated by ligands within the loop. The motif takes its name from traditional nomenclature used in describing the protein parvalbumin, which contains three such motifs and is probably involved in muscle relaxation via its calcium-binding activity. The EF-hand consists of two alpha helices linked by a short loop region (usually about 12 amino acids) that usually binds calcium ions. EF-hands also appear in each structural domain of the signaling protein calmodulin and in the muscle protein troponin-C. (en) La mano EF es un dominio estructural de proteínas de tipo hélice-bucle-hélice que se encuentra en una gran familia de proteínas de unión a calcio. Consta de dos hélices alfa situado aproximadamente perpendicular el uno al otro y unidos por un corto circuito región (por lo general alrededor de 12 aminoácidos) que normalmente se une a iones de calcio. El motivo toma su nombre de la nomenclatura tradicional utilizada para describir la proteína , que contiene tres de estos motivos, y está probablemente involucrada en la relajación muscular a través de su actividad de unión a calcio.Las manos EF figuran también en cada dominio estructural de la calmodulina y las en la proteína muscular . (es) La main EF (EF Hand) est un motif structurel observé dans les protéines, il est constitué de l'association deux hélices α liées à une boucle formée d'une douzaine d'acides aminés. Cette structure enserre un ion Ca2+. Ce domaine protéique a la forme d'une main dans laquelle l'ion Ca2+ se situerait dans la paume et les deux hélices formeraient le pouce et l'index relevés. Ce motif structurel ou plusieurs de ces motifs peuvent être trouvés dans les protéines fixant le calcium ou dans les protéines impliquées dans la régulation du niveau de calcium intracellulaire comme la calmoduline. (fr) EFハンド(EF Hand)はタンパク質の二次構造のモチーフの1つである。互いにおよそ垂直になっている2つのαヘリックスからなり、しばしばカルシウムイオンを結合した、12アミノ酸残基程度の短いリンカーループで繋がっている。名前は、3つのEFハンドモチーフを持ち、カルシウム結合活性により筋肉の弛緩に関わっていると見られるパルブアルブミンの古い名前に由来する。EFハンドはシグナル伝達タンパク質のカルモジュリンや筋肉に含まれるトロポニンCでも見られる。 (ja) EF手(英語:EF hand)是一种在钙结合蛋白中发现的螺旋-环-螺旋结构域或结构基序。 EF手包括一个螺旋-环-螺旋拓扑结构,就像人类的手上拇指和食指,而Ca2+离子与其配体就位于环内。这一结构最早在中发现,小清蛋白含有三个EF手结构,与钙离子结合而造成的肌肉放松有关。 EF手包含两个α螺旋,由一个短的(通常包括12个氨基酸)环状区域连接,常用于结合钙离子。EF手也出现在钙调蛋白的所有结构域和肌肉蛋白质肌钙蛋白C中。 (zh)
dbo:symbol efhand
dbo:thumbnail wiki-commons:Special:FilePath/PDB_1osa_EBI.jpg?width=300
dbo:wikiPageExternalLink http://chemistry.gsu.edu/faculty/Yang/Calciomics.htm https://prosite.expasy.org/cgi-bin/prosite/nicedoc.pl%3FPS50222 https://archive-ouverte.unige.ch/unige:36357/ATTACHMENT01%7C http://structbio.vanderbilt.edu/cabp_database/%7C https://web.archive.org/web/20091012002812/http:/chemistry.gsu.edu/faculty/Yang/Calciomics.htm http://www.ulb.ac.be/assoc/ecs/
dbo:wikiPageID 6491719 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength 17501 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID 1092136194 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink dbr:Calcium dbr:Calmodulin dbr:Muscle dbr:Structural_motif dbr:MACF1 dbr:MYL1 dbr:MYL2 dbr:MYL6B dbr:MYL7 dbr:MYL9 dbr:MYLPF dbr:HPCAL1 dbr:HPCAL4 dbr:CABP1 dbr:CALB2 dbr:CALU dbr:CAPS_(gene) dbr:SPTA1 dbr:DGKA dbr:DGKB dbr:DGKG dbr:CALB1 dbr:Dystonin dbc:EF_hand dbr:EFCAB6 dbr:EFHC1 dbr:EFHD2 dbr:EPS15 dbr:EPS15L1 dbr:LCP1 dbr:GCA_(gene) dbr:S100A1 dbr:SDF4 dbr:NIN_(gene) dbr:VSNL1 dbr:PLCD4 dbr:NUCB2 dbr:SLC25A24 dbr:RAB11FIP3 dbr:RASEF dbr:RASGRP2 dbr:REPS1 dbr:RHOT2 dbr:Clostridium_thermocellum dbr:Cnidarian dbr:Coelenterazine dbr:Glycine dbr:Calreticulin dbr:Parvalbumin dbr:NUCB1 dbr:CAPN1 dbr:CAPN2 dbr:CAPN3 dbr:CAPN9 dbr:CAPNS1 dbr:Dockerin dbr:GUCA1A dbr:GUCA1B dbr:RCN2 dbr:RASGRP1 dbr:SPTAN1 dbr:S100A12 dbr:NINL dbr:APBA2BP dbr:Alpha_helix dbr:Amino_acid dbr:EFCBP2 dbr:European_Calcium_Society dbr:Oxygen dbr:Paramecium dbr:Cell_signaling dbr:Hippocalcin dbr:KCNIP1 dbr:KCNIP2 dbr:KCNIP4 dbr:Hydrophobic_core dbr:Protein_family dbr:Protein dbr:ACTN3 dbr:Bacillus_anthracis dbr:Bacillus_subtilis dbr:TCHH dbr:Aequorea_victoria dbr:Aequorin dbr:TNNC2 dbr:ITSN1 dbr:ITSN2 dbr:S100A6 dbr:CALM2 dbr:CALM3 dbr:CALML3 dbr:CALML5 dbr:CALN1 dbr:CBARA1 dbr:CIB1 dbr:Hydrophobic dbr:Apoaequorin dbr:DUOX1 dbr:DUOX2 dbr:RYR3 dbr:CETN1 dbr:CETN2 dbr:CETN3 dbr:CHP_(gene) dbr:Troponin_C dbr:SRI_(gene) dbr:FKBP10 dbr:FKBP14 dbr:FKBP7 dbr:FKBP9 dbr:FSTL1 dbr:IFPS dbr:PPEF1 dbr:Sphingomonas dbr:SLC25A12 dbr:S100A9 dbr:NOX5 dbr:RASGRP3 dbr:RHOT1 dbr:S100A8 dbr:Side_chain dbr:RPTN dbr:TBC1D9 dbr:Peptide_bond dbr:PEF1 dbr:S100G dbr:PDCD6 dbr:PLCD1 dbr:PLS3 dbr:PPP3R1 dbr:PPP3R2 dbr:PRKCSH dbr:PKD2 dbr:RCN1 dbr:S100A11 dbr:S100B dbr:SCN5A dbr:Salmonella_typhimurium dbr:Glutamate dbr:PLS1 dbr:PVALB dbr:SCGN dbr:SLC25A13 dbr:Helix–loop–helix dbr:Aspartate dbr:KCNIP3 dbr:RYR2 dbr:ACTN1 dbr:ACTN2 dbr:ACTN4 dbr:OCM_(gene) dbr:CHP2 dbr:Troponin-C dbr:Structural_domain dbr:TNNC1 dbr:NCALD dbr:CALML4 dbr:CALML6 dbr:CAPN11 dbr:CAPNS2 dbr:PLCH1 dbr:PLCH2 dbr:RASGRP dbr:AYTL1 dbr:AYTL2 dbr:C14orf143 dbr:CABP2 dbr:CABP3 dbr:CABP4 dbr:CABP5 dbr:CABP7 dbr:CAPS2 dbr:CAPSL dbr:CIB2 dbr:CIB3 dbr:CIB4 dbr:CRNN dbr:Calbindin_D9k dbr:EFCAB1 dbr:EFCAB2 dbr:EFCAB4A dbr:EFCAB4B dbr:EFCBP1 dbr:EFHA1 dbr:EFHA2 dbr:EFHB dbr:EFHD1 dbr:FKBP9L dbr:FREQ dbr:FSTL5 dbr:File:EF-hand-prediction.jpg dbr:File:EF_hand.jpg dbr:File:EFhandtree.jpg dbr:GPD2 dbr:GUCA1C dbr:HZGJ dbr:KIAA1799 dbr:MRLC2 dbr:MRLC3 dbr:MST133 dbr:MYL5 dbr:MYLC2PL dbr:NKD1 dbr:NKD2 dbr:PP1187 dbr:PPEF2 dbr:RCN3 dbr:RCV1 dbr:RCVRN dbr:RHBDL3 dbr:S100Z dbr:SCAMC-2 dbr:SLC25A23 dbr:SLC25A25 dbr:SPATA21 dbr:TBC1D9B dbr:TESC_(gene) dbr:ZZEF1 dbr:USP32
dbp:caption Structure of the recombinant Paramecium tetraurelia calmodulin. (en)
dbp:cdd cd00051 (en)
dbp:interpro IPR002048 (en)
dbp:name EF hand (en)
dbp:pfam PF00036 (en)
dbp:prosite PDOC00018 (en)
dbp:scop 1 (xsd:integer)
dbp:symbol efhand (en)
dbp:wikiPageUsesTemplate dbt:Cite_book dbt:Cite_journal dbt:Cite_web dbt:ELM dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:PDB2 dbt:InterPro dbt:PDB dbt:Pfam_box dbt:Protein_secondary_structure
dcterms:subject dbc:EF_hand
gold:hypernym dbr:Domain
rdf:type owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 yago:Abstraction100002137 yago:Attribute100024264 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Environment113934596 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Protein yago:Situation113927383 yago:Sphere114514039 yago:State100024720 yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatPeripheralMembraneProteins yago:WikicatProteinDomains
rdfs:comment Ein EF-Hand ist ein spezifisches Aminosäurenmotiv in Proteinen. Das Motiv ist ein sogenanntes mit geladenen Aminosäuren, welche Ca2+-Ionen binden. Bedingt durch das Binden von Calcium verändert sich die Konformation des Proteins und kann so auch seine Funktion verändern. Der Name EF-Hand stammt aus der Nomenklatur bei der Untersuchung von , welches drei EF-Hand-Motive besitzt. EF-Hand-Motive findet man unter anderem auch im Signalprotein Calmodulin und im Muskelprotein Troponin C. (de) La mano EF es un dominio estructural de proteínas de tipo hélice-bucle-hélice que se encuentra en una gran familia de proteínas de unión a calcio. Consta de dos hélices alfa situado aproximadamente perpendicular el uno al otro y unidos por un corto circuito región (por lo general alrededor de 12 aminoácidos) que normalmente se une a iones de calcio. El motivo toma su nombre de la nomenclatura tradicional utilizada para describir la proteína , que contiene tres de estos motivos, y está probablemente involucrada en la relajación muscular a través de su actividad de unión a calcio.Las manos EF figuran también en cada dominio estructural de la calmodulina y las en la proteína muscular . (es) La main EF (EF Hand) est un motif structurel observé dans les protéines, il est constitué de l'association deux hélices α liées à une boucle formée d'une douzaine d'acides aminés. Cette structure enserre un ion Ca2+. Ce domaine protéique a la forme d'une main dans laquelle l'ion Ca2+ se situerait dans la paume et les deux hélices formeraient le pouce et l'index relevés. Ce motif structurel ou plusieurs de ces motifs peuvent être trouvés dans les protéines fixant le calcium ou dans les protéines impliquées dans la régulation du niveau de calcium intracellulaire comme la calmoduline. (fr) EFハンド(EF Hand)はタンパク質の二次構造のモチーフの1つである。互いにおよそ垂直になっている2つのαヘリックスからなり、しばしばカルシウムイオンを結合した、12アミノ酸残基程度の短いリンカーループで繋がっている。名前は、3つのEFハンドモチーフを持ち、カルシウム結合活性により筋肉の弛緩に関わっていると見られるパルブアルブミンの古い名前に由来する。EFハンドはシグナル伝達タンパク質のカルモジュリンや筋肉に含まれるトロポニンCでも見られる。 (ja) EF手(英語:EF hand)是一种在钙结合蛋白中发现的螺旋-环-螺旋结构域或结构基序。 EF手包括一个螺旋-环-螺旋拓扑结构,就像人类的手上拇指和食指,而Ca2+离子与其配体就位于环内。这一结构最早在中发现,小清蛋白含有三个EF手结构,与钙离子结合而造成的肌肉放松有关。 EF手包含两个α螺旋,由一个短的(通常包括12个氨基酸)环状区域连接,常用于结合钙离子。EF手也出现在钙调蛋白的所有结构域和肌肉蛋白质肌钙蛋白C中。 (zh) EF-ruka (z angl. EF-hand) je proteinový složený ze dvou alfa-helixů („“), který váže vápenaté ionty. EF hand byl popsán u kalmodulinu a pojmenován podle toho, že ho tvoří helixy E a F, a že připomíná lidskou ruku v určité poloze – jeho stavbu je možné napodobit pomocí pravé ruky, přičež palec a ukazovák ukazují ven a zbytek prstů je sbalen v pěsti. Palec a ukazovák v takovém případě představují helixy E a F, zatímco zbytek dlaně reprezentuje smyčku, v níž je navázán atom vápníku. (cs) The EF hand is a helix–loop–helix structural domain or motif found in a large family of calcium-binding proteins. The EF-hand motif contains a helix–loop–helix topology, much like the spread thumb and forefinger of the human hand, in which the Ca2+ ions are coordinated by ligands within the loop. The motif takes its name from traditional nomenclature used in describing the protein parvalbumin, which contains three such motifs and is probably involved in muscle relaxation via its calcium-binding activity. (en)
rdfs:label EF hand (en) EF-ruka (cs) EF-Hand (de) Mano EF (es) Main EF (fr) EFハンド (ja) EF手 (zh)
owl:sameAs freebase:EF hand yago-res:EF hand wikidata:EF hand http://bs.dbpedia.org/resource/EF-šaka dbpedia-cs:EF hand dbpedia-de:EF hand dbpedia-es:EF hand dbpedia-fa:EF hand dbpedia-fr:EF hand dbpedia-gl:EF hand dbpedia-ja:EF hand dbpedia-sh:EF hand dbpedia-sr:EF hand dbpedia-zh:EF hand https://global.dbpedia.org/id/2Kkqh
prov:wasDerivedFrom wikipedia-en:EF_hand?oldid=1092136194&ns=0
foaf:depiction wiki-commons:Special:FilePath/EF_hand.jpg wiki-commons:Special:FilePath/EF-hand-prediction.jpg wiki-commons:Special:FilePath/EFhandtree.jpg wiki-commons:Special:FilePath/PDB_1osa_EBI.jpg
foaf:isPrimaryTopicOf wikipedia-en:EF_hand
is dbo:wikiPageRedirects of dbr:EF-hand dbr:Ef_hand_motifs dbr:Efhand_motif dbr:EF-hands dbr:EH_domain
is dbo:wikiPageWikiLink of dbr:Calmodulin dbr:Neuronal_calcium_sensor dbr:MYL7 dbr:Parve101q dbr:Allograft_inflammatory_factor_1 dbr:Renilla-luciferin_2-monooxygenase dbr:Calretinin dbr:EHD3 dbr:Kv_channel_interacting_protein dbr:L-type_calcium_channel dbr:TPCN1 dbr:Protein_S100-A1 dbr:Osteonectin dbr:Phosphoinositide_phospholipase_C dbr:STIM1 dbr:RASEF dbr:RASGRP4 dbr:Oncomodulin_2 dbr:Cooperative_binding dbr:TEX55 dbr:Calbindin dbr:Calcium-binding_mitochondrial_carrier_protein_Aralar1 dbr:Calcium-binding_protein_1 dbr:Calmodulin_1 dbr:Calprotectin dbr:Calumenin dbr:Zinc dbr:Zinc_in_biology dbr:Parvalbumin dbr:Two-pore_channel dbr:Phospholipid_scramblase dbr:Phospholipase_C dbr:Dockerin dbr:Dual_oxidase_1 dbr:Alpha-actinin-2 dbr:Carbohydrate-binding_module dbr:Cbl_TKB_domain dbr:KCNIP1 dbr:KCNIP2 dbr:Protein_domain dbr:Dystrobrevin dbr:EF-hand dbr:Aequorin dbr:Binding_domain dbr:Signal_transduction dbr:IQ_calmodulin-binding_motif dbr:Troponin_C dbr:Neuronal_calcium_sensor-1 dbr:TPCN2 dbr:FSTL1 dbr:S100A9 dbr:Myopalladin dbr:Naked_cuticle dbr:Repetin dbr:STIM2 dbr:Unconventional_myosin-Ia dbr:S100A11 dbr:S100A7 dbr:Trichohyalin dbr:Ef_hand_motifs dbr:Efhand_motif dbr:EF-hands dbr:EH_domain
is foaf:primaryTopic of wikipedia-en:EF_hand