Kozak consensus sequence (original) (raw)
La séquence de Kozak ou séquence Kozak est une séquence conservée que l'on trouve sur les ARN messagers eucaryotes au niveau du site de démarrage de la traduction, autour du codon de démarrage AUG.Chez les vertébrés, la séquence de Kozak a pour consensus gccRccAUGG où R représente une purine (le codon de démarrage est en gras et les nucléotides en minuscules sont moins conservés que le reste de la séquence). Chez d'autres espèces, la séquence consensus autour du codon de démarrage peut être différente. C'est une séquence très conservée lors de l'évolution présente dans un ARNm monocistronique.
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| dbo:abstract | Die Kozak-Sequenz, auch engl. Kozak consensus sequence genannt, ist eine nach der US-amerikanischen Biochemikerin benannte Nukleinbasen-Sequenz in der Messenger-RNA (mRNA) eukaryotischer Lebewesen. Sie stellt einen Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des Startcodons AUG auf der mRNA dar. Als Kozak-Sequenz wird oft die Basenfolge (gcc)gccRccATGG genannt, wobei es deutliche Unterschiede zwischen verschiedenen Gruppen von Eukaryoten gibt. Die Kozak-Sequenz oder eine ähnliche Nukleinbasenfolge wird von den Ribosomen erkannt und ist für den Start der Translation im Rahmen der Proteinbiosynthese von Bedeutung. Abweichungen in der Nukleinbasenfolge können Auswirkungen auf die Proteinbiosynthese haben. Bei Prokaryoten übernimmt die Shine-Dalgarno-Sequenz die Funktion der Kozak-Sequenz. (de) La séquence de Kozak ou séquence Kozak est une séquence conservée que l'on trouve sur les ARN messagers eucaryotes au niveau du site de démarrage de la traduction, autour du codon de démarrage AUG.Chez les vertébrés, la séquence de Kozak a pour consensus gccRccAUGG où R représente une purine (le codon de démarrage est en gras et les nucléotides en minuscules sont moins conservés que le reste de la séquence). Chez d'autres espèces, la séquence consensus autour du codon de démarrage peut être différente. C'est une séquence très conservée lors de l'évolution présente dans un ARNm monocistronique. (fr) The Kozak consensus sequence (Kozak consensus or Kozak sequence) is a nucleic acid motif that functions as the protein translation initiation site in most eukaryotic mRNA transcripts. Regarded as the optimum sequence for initiating translation in eukaryotes, the sequence is an integral aspect of protein regulation and overall cellular health as well as having implications in human disease. It ensures that a protein is correctly translated from the genetic message, mediating ribosome assembly and translation initiation. A wrong start site can result in non-functional proteins. As it has become more studied, expansions of the nucleotide sequence, bases of importance, and notable exceptions have arisen. The sequence was named after the scientist who discovered it, Marilyn Kozak. Kozak discovered the sequence through a detailed analysis of DNA genomic sequences. The Kozak sequence is not to be confused with the ribosomal binding site (RBS), that being either the 5′ cap of a messenger RNA or an internal ribosome entry site (IRES). (en) La secuencia Kozak es una secuencia de nucleótidos que funciona como el sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de las transcripciones de ARNm eucariota. Considerada como la secuencia óptima para iniciar la traducción en eucariotas, la secuencia es un aspecto integral de la regulación de proteínas y la salud celular general, además de tener implicaciones en las enfermedades humanas. Asegura que una proteína se traduzca correctamente del mensaje genético, mediando el ensamblaje de ribosomas y el inicio de la traducción. Un sitio de inicio incorrecto puede resultar en proteínas no funcionales. A medida que se ha vuelto más estudiado, han surgido expansiones de la secuencia de nucleótidos, bases de importancia y excepciones notables. La secuencia lleva el nombre de la científica que la descubrió, . Kozak descubrió la secuencia a través de un análisis detallado de secuencias genómicas de ADN. La secuencia de Kozak no debe confundirse con el sitio de unión al ribosoma (RBS), que es la caperuza 5' de un ARN mensajero o un sitio interno de entrada al ribosoma (IRES). (es) コザック配列（Kozak sequence）は、真核生物のmRNAに出現する共通配列であり、主に翻訳の開始に関与している。ただし厳密な共通配列ではなく、不一致のあることも非常に多い。脊椎動物では (gcc)gccRccAUGG と表され、なかでも開始コドン (AUG) の3塩基上流のR（プリン塩基・アデニンまたはグアニン）と開始コドンの次のGが重要な役割を果たすと考えられている。リボソームが翻訳を始めるためにはコザック配列（不一致のあるものも含む）が必要であり、リボソームによって認識された部位からタンパク質の翻訳が開始される。コザック配列は、リボソーム結合部位 (ribosomal binding site; RBS)、つまりmRNAの5'キャップや内部リボソーム導入部位 (Internal Ribosome Entry Site; IRES) とは異なるので混同しないこと。 (ja) Negli Eucarioti, la sequenza di Kozak è una corta sequenza interna dell'mRNA (CCACCAUGG) riconosciuta dal complesso di pre-inizio della traduzione (comprendente la subunità ribosomale minore 40S) mentre questo scansiona l'mRNA a partire dal cap al 5'; solo dopo che è avvenuto il legame fra la subunità ribosomale 40S e tale sequenza, la subunità ribosomiale maggiore può completare il complesso d'inizio consentendo l'avvio della sintesi proteica; all'interno della sequenza di Kozak è contenuto il codone d'inizio AUG, codificante per la metionina. La sequenza di Kozak è l'equivalente eucariotico della sequenza di Shine-Dalgarno, che nei Procarioti identifica il sito di aggancio del ribosoma all'mRNA durante l'avvio della sintesi proteica; tuttavia, nei Procarioti non si verifica nessuna scansione a partire dal 5', bensì un appaiamento fra basi complementari dell'mRNA e dell'rRNA 16S della subunità ribosomale minore 30S. (it) Sekwencja Kozak (ang. Kozak (consensus) sequence) – sekwencja nukleotydowa występująca w mRNA u eukariontów (GCC)GCC(A/G)CCAUGG, gdzie (A/G) oznacza dowolną purynę (adeninę albo guaninę) 3 pary zasad w górę od kodonu start AUG i występująca po nim guanina. U eukariontów taka sekwencja mRNA jest rozpoznawana przez rybosom jako miejsce, od którego mRNA jest przepisywany na kolejność aminokwasów w łańcuchu polipeptydowym w procesie translacji. Rybosom potrzebuje sekwencji Kozak (albo podobnej do niej) żeby rozpocząć translację. Sekwencji Kozak nie należy mylić z miejscem wiązania rybosomu (rybosome binding site, RBS), które stanowi albo czapeczka 5' mRNA, albo sekwencja IRES (Internal Ribosome Entry Site). In vivo ilość syntetyzowanego białka zależna jest od "siły" sekwencji Kozak; jedne nukleotydy w jej obrębie są ważniejsze, tak jak niezbędny kodon start AUG, którego adenina oznaczana jest +1; "silny" konsensus wymaga ponadto guaniny w pozycji +4 i adeniny albo guaniny w pozycji -3. Wystarczająco silna sekwencja spełnia jeden z tych dwóch warunków, "słaba" nie spełnia żadnego. Sekwencja Kozak zawdzięcza nazwę amerykańskiej biochemiczce , która przeprowadziła badania prowadzące do jej zidentyfikowania w połowie lat 80. (pl) A sequência de Kozak, ingl. Kozak consensus sequence, é uma determinada sequência presente no RNA mensageiro (mRNA) de organismos eucarióticos. Ela representa um consenso entre as bases nucleotídicas encontradas mais frequentemente em volta do códon de início AUG no mRNA. A sequência de 5'-(gcc)gccRccAUGG-3' é, muitas vezes, chamada de sequência de Kozak, porém há diferenças significativas entre os diferentes grupos de eucariontes. A sequência de Kozak, ou sequências semelhantes, são reconhecidas pelo ribossomo, sendo importantes para o início da Tradução no contexto da biossíntese de proteínas. Variações nessa sequência podem afetar a eficiência e a magnitude da biossíntese da proteína codificada por esse mRNA. (pt) 科扎克共有序列, 或Kozak 序列 ，是在真核生物的mRNA中的(gcc)gccRccAUGG序列 。它在翻译过程的启动中扮演了重要角色。，得名自揭示了其重要性的玛丽莲·科扎克。 序列标识为(gcc)gccRccAUGG, 源自科扎克对大范围的样本（共约699种）的归纳和分析，其中： 1. * 小写字母表示此位置处最常见的的碱基（仍然可以变化）; 2. * 大写字母表示高度保守的碱基，例如“AUGG”序列是不变的或很少，甚至根本没有变化，唯一的例外是IUPAC的模糊码。“R”这表明嘌呤（A或G）总是在这个位置上（科扎克声称A更常见） 3. * 括号内的序列((gcc))重要性不明。 科扎克的研究局限于脊椎动物的一部分（例如人类，牛，猫，狗，鸡，豚鼠，仓鼠，小鼠，猪，兔，羊，非洲爪蟾）。 (zh) Консе́нсусная после́довательность Ко́зак (последовательность Козак, англ. Kozak consensus sequence) — последовательность нуклеотидов в составе молекулы мРНК эукариот, окружающая старт-кодон и важная для инициации трансляции. Консенсусная последовательность была впервые описана (англ. Marilyn Kozak) в 1986 году. (ru) Консенсусна послідовність Козак (англ. Kozak consensus sequence) — специфічна послідовність нуклеотидів близько СТАРТ-кодону у складі молекули мРНК еукаріотів. Вона є важливою для ініціації трансляції. Консенсусна послідовність була вперше описана Мерилін Козак (англ. Marilyn Kozak) у 1986 році. (uk) |
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(fr) コザック配列（Kozak sequence）は、真核生物のmRNAに出現する共通配列であり、主に翻訳の開始に関与している。ただし厳密な共通配列ではなく、不一致のあることも非常に多い。脊椎動物では (gcc)gccRccAUGG と表され、なかでも開始コドン (AUG) の3塩基上流のR（プリン塩基・アデニンまたはグアニン）と開始コドンの次のGが重要な役割を果たすと考えられている。リボソームが翻訳を始めるためにはコザック配列（不一致のあるものも含む）が必要であり、リボソームによって認識された部位からタンパク質の翻訳が開始される。コザック配列は、リボソーム結合部位 (ribosomal binding site; RBS)、つまりmRNAの5'キャップや内部リボソーム導入部位 (Internal Ribosome Entry Site; IRES) とは異なるので混同しないこと。 (ja) A sequência de Kozak, ingl. Kozak consensus sequence, é uma determinada sequência presente no RNA mensageiro (mRNA) de organismos eucarióticos. Ela representa um consenso entre as bases nucleotídicas encontradas mais frequentemente em volta do códon de início AUG no mRNA. A sequência de 5'-(gcc)gccRccAUGG-3' é, muitas vezes, chamada de sequência de Kozak, porém há diferenças significativas entre os diferentes grupos de eucariontes. A sequência de Kozak, ou sequências semelhantes, são reconhecidas pelo ribossomo, sendo importantes para o início da Tradução no contexto da biossíntese de proteínas. Variações nessa sequência podem afetar a eficiência e a magnitude da biossíntese da proteína codificada por esse mRNA. (pt) 科扎克共有序列, 或Kozak 序列 ，是在真核生物的mRNA中的(gcc)gccRccAUGG序列 。它在翻译过程的启动中扮演了重要角色。，得名自揭示了其重要性的玛丽莲·科扎克。 序列标识为(gcc)gccRccAUGG, 源自科扎克对大范围的样本（共约699种）的归纳和分析，其中： 1. * 小写字母表示此位置处最常见的的碱基（仍然可以变化）; 2. * 大写字母表示高度保守的碱基，例如“AUGG”序列是不变的或很少，甚至根本没有变化，唯一的例外是IUPAC的模糊码。“R”这表明嘌呤（A或G）总是在这个位置上（科扎克声称A更常见） 3. * 括号内的序列((gcc))重要性不明。 科扎克的研究局限于脊椎动物的一部分（例如人类，牛，猫，狗，鸡，豚鼠，仓鼠，小鼠，猪，兔，羊，非洲爪蟾）。 (zh) Консе́нсусная после́довательность Ко́зак (последовательность Козак, англ. Kozak consensus sequence) — последовательность нуклеотидов в составе молекулы мРНК эукариот, окружающая старт-кодон и важная для инициации трансляции. Консенсусная последовательность была впервые описана (англ. Marilyn Kozak) в 1986 году. (ru) Консенсусна послідовність Козак (англ. Kozak consensus sequence) — специфічна послідовність нуклеотидів близько СТАРТ-кодону у складі молекули мРНК еукаріотів. Вона є важливою для ініціації трансляції. Консенсусна послідовність була вперше описана Мерилін Козак (англ. Marilyn Kozak) у 1986 році. (uk) Die Kozak-Sequenz, auch engl. Kozak consensus sequence genannt, ist eine nach der US-amerikanischen Biochemikerin benannte Nukleinbasen-Sequenz in der Messenger-RNA (mRNA) eukaryotischer Lebewesen. Sie stellt einen Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des Startcodons AUG auf der mRNA dar. Als Kozak-Sequenz wird oft die Basenfolge (gcc)gccRccATGG genannt, wobei es deutliche Unterschiede zwischen verschiedenen Gruppen von Eukaryoten gibt. Die Kozak-Sequenz oder eine ähnliche Nukleinbasenfolge wird von den Ribosomen erkannt und ist für den Start der Translation im Rahmen der Proteinbiosynthese von Bedeutung. Abweichungen in der Nukleinbasenfolge können Auswirkungen auf die Proteinbiosynthese haben. (de) La secuencia Kozak es una secuencia de nucleótidos que funciona como el sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de las transcripciones de ARNm eucariota. Considerada como la secuencia óptima para iniciar la traducción en eucariotas, la secuencia es un aspecto integral de la regulación de proteínas y la salud celular general, además de tener implicaciones en las enfermedades humanas. Asegura que una proteína se traduzca correctamente del mensaje genético, mediando el ensamblaje de ribosomas y el inicio de la traducción. Un sitio de inicio incorrecto puede resultar en proteínas no funcionales. A medida que se ha vuelto más estudiado, han surgido expansiones de la secuencia de nucleótidos, bases de importancia y excepciones notables. La secuencia lleva el nombre de la (es) The Kozak consensus sequence (Kozak consensus or Kozak sequence) is a nucleic acid motif that functions as the protein translation initiation site in most eukaryotic mRNA transcripts. Regarded as the optimum sequence for initiating translation in eukaryotes, the sequence is an integral aspect of protein regulation and overall cellular health as well as having implications in human disease. It ensures that a protein is correctly translated from the genetic message, mediating ribosome assembly and translation initiation. A wrong start site can result in non-functional proteins. As it has become more studied, expansions of the nucleotide sequence, bases of importance, and notable exceptions have arisen. The sequence was named after the scientist who discovered it, Marilyn Kozak. Kozak discove (en) Negli Eucarioti, la sequenza di Kozak è una corta sequenza interna dell'mRNA (CCACCAUGG) riconosciuta dal complesso di pre-inizio della traduzione (comprendente la subunità ribosomale minore 40S) mentre questo scansiona l'mRNA a partire dal cap al 5'; solo dopo che è avvenuto il legame fra la subunità ribosomale 40S e tale sequenza, la subunità ribosomiale maggiore può completare il complesso d'inizio consentendo l'avvio della sintesi proteica; all'interno della sequenza di Kozak è contenuto il codone d'inizio AUG, codificante per la metionina. (it) Sekwencja Kozak (ang. Kozak (consensus) sequence) – sekwencja nukleotydowa występująca w mRNA u eukariontów (GCC)GCC(A/G)CCAUGG, gdzie (A/G) oznacza dowolną purynę (adeninę albo guaninę) 3 pary zasad w górę od kodonu start AUG i występująca po nim guanina. 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