Long interspersed nuclear element (original) (raw)
Un element nuclear llarg intercalat o LINE de l'anglès Long Interspersed Nuclear Element, són un grup d'elements genètics que es troben en un gran nombre de genomes eucariotes. Els LINE són transcrits a ARN (o són el vestigi evolutiu del que algun cop havia estat transcrit). Aquests ARNs provinents dels LINEs tenen una alta afinitat per la transcriptasa inversa que fa una còpia d'ADN que eventualment pot ser integrada en el genoma en un nou lloc.
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| dbo:abstract | Un element nuclear llarg intercalat o LINE de l'anglès Long Interspersed Nuclear Element, són un grup d'elements genètics que es troben en un gran nombre de genomes eucariotes. Els LINE són transcrits a ARN (o són el vestigi evolutiu del que algun cop havia estat transcrit). Aquests ARNs provinents dels LINEs tenen una alta afinitat per la transcriptasa inversa que fa una còpia d'ADN que eventualment pot ser integrada en el genoma en un nou lloc. (ca) Dlouhé rozptýlené jaderné elementy (Long interspersed nuclear elements - LINEs) jsou několik kbp (tisíc párů bází) dlouhé repetitivní DNA sekvence, patřící do skupiny non-LTR retrotranspozonů, tj. transpozonů (pohyblivých DNA sekvencí), které při svém pohybu v rámci genomu (transpozici) používají přechodný přepis do RNA. Jedná se o autonomní transpozony, to znamená, že si samy kódují proteiny potřebné k transpozici. Jsou široce rozšířenou součástí genomu mnoha eukaryot, např. v lidském genomu tvoří asi 21%. (cs) عنصر نووي طويل الانتشار (الاسم العلمي Long interspersed nuclear element) (يختصر بـLINE)، فصائل (عائلات) ذات عناصر (دي أن إيه) مشتركة، وبمتوسط طول 6,5 كيلوبيز، وتنتشر في مواقع عديدة داخل الجينوم. ويحتوي الجينوم البشري على مايزيد عن 500,000 من هذا العنصر (تمثل حوالي 16% من إجمالي الجينوم، ويبدو أنها تمثل نسخًا متدهورة من عناصر متناقلة. (ar) Unter LINEs (Abk. für engl. long interspersed nuclear elements) versteht man typischerweise 6 bis 8 kbp lange, häufig wiederholte und relativ frei verteilte DNA-Sequenzen im Genom. LINEs gehören zu den transponiblen Elementen, die eine Ribonukleinsäure (RNA) als Zwischenstufe benutzen (Retroelement) und keinen long terminal repeat besitzen, sondern sich durch Retrotransposition (siehe Retroposon, wobei diese nicht zu den Non-LTR-Retrotransposons zählen) vermehren. Sie besitzen Gene für zwei Proteine: eines zur Bindung und zum Transport von RNA und eines mit Aktivität für eine Reverse Transkriptase und für eine Endonuklease. LINEs finden sich vor allem in AT-reichen Regionen im Heterochromatin, bzw. in den G-Banden auf mittels Giemsa-Färbung behandelten Chromosomen, siehe auch Lebenszyklus. Beim Menschen machen LINEs etwas über 20 % des Gesamtgenoms aus, die häufigsten Elemente sind LINE-1 (ca. 17 %), weitere Elemente sind LINE-2 und LINE-3. Die Mehrzahl der humanen LINE-1-Elemente sind inaktiv, aber etwa 100 LINEs besitzen mobiles Potential und diese können bei Integration in das Genom neue Mutationen induzieren. (de) Long interspersed nuclear elements (LINEs) (also known as long interspersed nucleotide elements or long interspersed elements) are a group of non-LTR (long terminal repeat) retrotransposons that are widespread in the genome of many eukaryotes. They make up around 21.1% of the human genome. LINEs make up a family of transposons, where each LINE is about 7,000 base pairs long. LINEs are transcribed into mRNA and translated into protein that acts as a reverse transcriptase. The reverse transcriptase makes a DNA copy of the LINE RNA that can be integrated into the genome at a new site. The only abundant LINE in humans is LINE1. The human genome contains an estimated 100,000 truncated and 4,000 full-length LINE-1 elements. Due to the accumulation of random mutations, the sequence of many LINEs has degenerated to the extent that they are no longer transcribed or translated. Comparisons of LINE DNA sequences can be used to date transposon insertion in the genome. (en) Les éléments nucléaires dispersés longs (LINE pour long interspersed nuclear elements) font partie des séquences répétées dispersées au sein de l'ADN. Leur longueur est en général de quelques milliers de paires de bases et leur nature exacte varie suivant les espèces. Chez les primates, les principales séquences LINE sont une famille appelée LINE-1 dont il existe plusieurs centaines de milliers de copies dans le génome. Moins nombreuses que les répétitions SINE, elles représentent cependant du fait de leur longueur une fraction du génome plus importante (21 % du génome humain est constitué de LINE). Les séquences LINE actives sont capables de réplication autonome, ce qui leur permet de se dupliquer et de s'insérer à d'autres sites dans le génome. Leur réplication passe par un intermédiaire ARN, ce sont des rétrotransposons sans LTR. Les séquences LINE sont transcrites à partir d'un promoteur et sont polyadénylées en 3'. L'ARN intermédiaire transcrit est répliqué en ADN par une transcriptase inverse codée par le LINE. Le LINE code également en général une enzyme possédant une activité nucléase qui permet l'insertion de la séquence répliquée à un nouveau site.. (fr) 長鎖散在反復配列（ちょうささんざいはんぷくはいれつ、英: long interspersed nuclear element, LINE）とは、非LTR型レトロトランスポゾンの一群である。多くの真核生物のゲノムに広く見られ、ヒトゲノムでは全体のおよそ21.1%を占める。それぞれの長さはおおよそ7000塩基対程度である。mRNAへ転写されたのち、逆転写酵素活性を持つタンパク質へと翻訳される。この逆転写酵素によりLINE RNAからコピーされたDNAのゲノム上における新しいサイトへの組み込みが可能となる。 ヒトゲノムにおいて多量にみられるのはだけである。ヒトゲノム上には、切り詰められたもので100000個の、完全な長さを持つもので4000個のLINE1要素が存在する。多くのLINE配列は、ランダム変異の蓄積によりもはや転写および翻訳が起こらないほど劣化している。LINE DNA配列の比較により、ゲノムへのトランスポゾンの挿入時期を推定できる。 (ja) Een long interspersed nuclear element (LINE) (lang verspreid kernelement) is een 6 - 7 kbp lang, vaak herhaald (repeat) en relatief vrij verspreid voorkomende DNA-sequentie in een genoom. De eerste beschrijving van een ongeveer 6,4 kb lange LINE werd in 1980 door J. Adams et al. gepubliceerd. Een LINE bestaat uit een interne promotor voor het RNA-polymerase II, een 5' niet transcripteerbaar gebied en twee open leesramen. LINE's zijn springende genen, die een ribonucleïnezuur (RNA) als tussenstap gebruiken (retro-element) en geen long terminal repeat (lang eindstandige herhaling) bevatten. Ze vermeerderen zich door retrotranspositie, waarbij eerst een RNA-transcriptie gemaakt wordt, waarvan vervolgens met het enzym reverse-transcriptase weer DNA gemaakt wordt. De twee open leesramen geven twee eiwitten: een voor de binding en transport van RNA en één met een activiteit voor een reverse transcriptase en een endonuclease. De interne promotor zorgt ervoor dat het RNA-polymerase II uit zich zelf de transcriptie uitvoert. De endonuclease knipt op een bepaalde sequentie het DNA door (vaak is dit een oligo(dT). dT=desoxythymidine) en zorgt zo voor een vrij 3'-OH, dat weer als primer voor de reverse transcriptie dient. Aan dit oligo(dT) maakt zich een oligo(A)-staart (functie van de poly(A)-staart) vast, waarmee het LINE-mRNA als matrijs kan dienen. Het gevormde cDNA wordt in het genoom opgenomen. Vaak loopt de reverse transcriptase niet door tot het 5'-eind van de LINE-matrijs, waardoor maar een kleiner deel van de LINE in het genoom nog als springend gen kan werken. (nl) LINEs (англ. Long interspersed nuclear element, Длинные Диспергированные Повторы) — длинные (несколько тысяч пар оснований) последовательности ДНК в геноме эукариот, представляющие собой ретротранспозоны, не содержащие длинных концевых повторов. Первое описание LINE-последовательности, длиной около 6 400 пар оснований, было опубликовано в 1980 году. (ru) Longos elementos nucleares intercalados ou sequências LINE (do inglês Long Interdpersed Repeated Sequences) são um grupo de não-LTR retrotransposões, isto é, sequencias repetitivas intercalares, que têm origem viral, presente no genoma de muitos eucariotas . Existem 900000 locais LINE no genoma humano. Estes podem ser , L2 ou . No entanto, no genoma contemporâneo, apenas os L1 são móveis. A fim de serem incorporados no genoma, é necessário uma transcriptase reversa e uma endonuclease, sendo que ambas são expressas pela sequência na (ORF2). Muitos dos LINE não são móveis, visto que foram truncados na , não se formando . (pt) 长散在核元件（英語：Long interspersed nuclear element，或Long interspersed elements，缩写LINEs）是一类的不包含长末端重复序列的反转录转座子，遍布于许多真核生物的基因组中。LINE占了人类基因组的20%。 (zh) |
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