Paleopolyploidy (original) (raw)
古倍数性(こばいすうせい、英語: paleopolyploidy)は、少なくとも数百万年前に起こったゲノム重複の結果、倍数性を示す現象である。倍数化により遺伝子の機能的重複が起こり、重複したゲノム中の遺伝子は急速に不活性化または消失する。古倍数体 (paleopolyploid) はほとんどの場合、進化の過程でと呼ばれる過程によって倍数体としての性質を失い、現在では二倍体として扱われている。例えば、パン酵母 Saccharomyces cerevisiae やシロイヌナズナ Arabidopsis thaliana、ダイズ Glycine max、そしておそらくヒト Homo sapiensも古倍数体であることが知られている。 古倍数性は植物の系統で広く研究されており、ほぼすべての被子植物が進化の過程で少なくとも1回のゲノム重複を経験していることが分かっている。また、脊椎動物においては、四足動物を含む硬骨魚類の共通祖先でも、真骨類のステムの系統でも、非常に古い時代にゲノム重複が起こっている。小さなゲノムを持つパン酵母でさえ、進化の過程で倍数体を経験したとする証拠がある。 また、過去1700万年以内のような、より新しい時代における全ゲノム重複、全ゲノム3倍体化などの全ゲノム重複イベントを経た種に対して、mesopolyploid(中倍数体)という用語が用いられることもある。
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dbo:abstract | Paleopolyploidy is the result of genome duplications which occurred at least several million years ago (MYA). Such an event could either double the genome of a single species (autopolyploidy) or combine those of two species (allopolyploidy). Because of functional redundancy, genes are rapidly silenced or lost from the duplicated genomes. Most paleopolyploids, through evolutionary time, have lost their polyploid status through a process called diploidization, and are currently considered diploids e.g. baker's yeast, Arabidopsis thaliana, and perhaps humans. Paleopolyploidy is extensively studied in plant lineages. It has been found that almost all flowering plants have undergone at least one round of genome duplication at some point during their evolutionary history. Ancient genome duplications are also found in the early ancestor of vertebrates (which includes the human lineage) near the origin of the bony fishes, and another in the stem lineage of teleost fishes. Evidence suggests that baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae), which has a compact genome, experienced polyploidization during its evolutionary history. The term mesopolyploid is sometimes used for species that have undergone whole genome multiplication events (whole genome duplication, whole genome triplification, etc.) in more recent history, such as within the last 17 million years. (en) La paléopolyploïdie fait référence à une polyploïdie ancestrale survenue il y a plusieurs millions d'années à la suite d'une duplication complète du génome par autopolyploïdie ou bien allopolyploïdie. Cette duplication du génome donne un organisme avec 4n lots de chromosomes ou plus. Cet état est transitoire car en raison de la redondance fonctionnelle des gènes, les gènes (ohnologues) sont rapidement éteints ou massivement éliminés par le phénomène de fractionnement des génomes. La plupart des génomes paléoploïdes au cours de l'évolution ont perdu cette polyploïdie apparente par la perte des gènes redondants. Ce processus s'appelle la diploïdisation. De plus, les gènes ohnologues divergent en accumulant des mutations qui aboutissent à une subfonctionnalisation ou bien à une néofonctionnalisation. La recherche actuelle s'efforce de déterminer si cette perte de gènes est aléatoire ou biaisée. Par exemple, de nos jours, la levure du boulanger Saccharomyces cerevisiae, Arabidopsis thaliana et les poissons téléostéens sont des organismes diploïdes alors qu'au cours de leur évolution ils ont subi une ou plusieurs duplications complètes du génome. Ils sont donc paléopolyploïdes. (fr) 古倍数性(こばいすうせい、英語: paleopolyploidy)は、少なくとも数百万年前に起こったゲノム重複の結果、倍数性を示す現象である。倍数化により遺伝子の機能的重複が起こり、重複したゲノム中の遺伝子は急速に不活性化または消失する。古倍数体 (paleopolyploid) はほとんどの場合、進化の過程でと呼ばれる過程によって倍数体としての性質を失い、現在では二倍体として扱われている。例えば、パン酵母 Saccharomyces cerevisiae やシロイヌナズナ Arabidopsis thaliana、ダイズ Glycine max、そしておそらくヒト Homo sapiensも古倍数体であることが知られている。 古倍数性は植物の系統で広く研究されており、ほぼすべての被子植物が進化の過程で少なくとも1回のゲノム重複を経験していることが分かっている。また、脊椎動物においては、四足動物を含む硬骨魚類の共通祖先でも、真骨類のステムの系統でも、非常に古い時代にゲノム重複が起こっている。小さなゲノムを持つパン酵母でさえ、進化の過程で倍数体を経験したとする証拠がある。 また、過去1700万年以内のような、より新しい時代における全ゲノム重複、全ゲノム3倍体化などの全ゲノム重複イベントを経た種に対して、mesopolyploid(中倍数体)という用語が用いられることもある。 (ja) |
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