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Phyloscan is a web service for DNA sequence analysis that is free and open to all users (without login requirement). For locating matches to a user-specified sequence motif for a regulatory binding site, Phyloscan provides a statistically sensitive scan of user-supplied mixed aligned and unaligned DNA sequence data. Phyloscan's strength is that it brings together * the Staden method for computing statistical significance, * the "phylogenetic motif model" scanning functionality of the MONKEY software that models evolutionary relationships among aligned sequences, * the use of the Bailey & Gribskov method for combining statistics across non-aligned sequence data, and * the Neuwald & Green technique for combining statistics across multiple binding sites found within a single gene promoter region. (en) Phyloscan é um serviço web service para de ADN que é livre e aberto a todos usuários (sem necessidade de login). Para a localização de pareamentos de especificadas pelo usuário para um regulatório, Phyloscan fornece uma varredura estatisticamente sensível de seqüência mistas de ADN alinhados e não alinhados fornecidas pelo usuário. A força do Phyloscan é que ele reúne * O método Staden para computação da significância estatística, * O "modelo de motivo de filogenética" funcionalidade de digitalização do software MONKEY este modela relacionamentos evolutivos entre seqüências alinhadas, * O uso do método Bailey & Gribskov para combinar as estatísticas não-alinhadas em seqüência de dados, e * A técnica Neuwald & Green para combinar estatísticas em vários sítios de ligação encontrados dentro de uma única região do gene promotor. (pt) |
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Phyloscan is a web service for DNA sequence analysis that is free and open to all users (without login requirement). For locating matches to a user-specified sequence motif for a regulatory binding site, Phyloscan provides a statistically sensitive scan of user-supplied mixed aligned and unaligned DNA sequence data. Phyloscan's strength is that it brings together (en) Phyloscan é um serviço web service para de ADN que é livre e aberto a todos usuários (sem necessidade de login). Para a localização de pareamentos de especificadas pelo usuário para um regulatório, Phyloscan fornece uma varredura estatisticamente sensível de seqüência mistas de ADN alinhados e não alinhados fornecidas pelo usuário. A força do Phyloscan é que ele reúne (pt) |
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