Bioinformatics (original) (raw)
المعلوماتية الحيوية (بالإنجليزية: Bioinformatics) أو علم الأحياء الحاسوبي (بالإنجليزية: computational biology) هو استخدام أحدث تقنيات الرياضيات التطبيقية، المعلوماتية informatics، الإحصاء، وعلوم الحاسب لحل مشكلات بيولوجية حيوية. جهود الأبحاث الرئيسية في هذا الحقل تتضمن التراصف التسلسلي Sequence alignment، إيجاد المورثات، مشروع الجينوم البشري، تراصف البنية البروتينية protein structural alignment، تنبؤ البنية البروتينية protein structure prediction، التنبؤ بالتعبير الجيني gene expression، وتآثرات بروتين-بروتين، إضافة لنمذجة التطور.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | المعلوماتية الحيوية (بالإنجليزية: Bioinformatics) أو علم الأحياء الحاسوبي (بالإنجليزية: computational biology) هو استخدام أحدث تقنيات الرياضيات التطبيقية، المعلوماتية informatics، الإحصاء، وعلوم الحاسب لحل مشكلات بيولوجية حيوية. جهود الأبحاث الرئيسية في هذا الحقل تتضمن التراصف التسلسلي Sequence alignment، إيجاد المورثات، مشروع الجينوم البشري، تراصف البنية البروتينية protein structural alignment، تنبؤ البنية البروتينية protein structure prediction، التنبؤ بالتعبير الجيني gene expression، وتآثرات بروتين-بروتين، إضافة لنمذجة التطور. (ar) تمثل بيولوجيا النظم التحليل الحسابي والرياضي ونمذجة الأنظمة البيولوجية المعقدة. إنه مجال دراسي متعدد التخصصات قائم على علم الأحياء ويركز على التفاعلات المعقدة داخل الأنظمة البيولوجية، باستخدام نهج شامل (نهج كلاني بدلًا من النهج الاختزالي الأكثر تقليدية) في سبيل البحث البيولوجي. استُخدم هذا المفهوم على نطاق واسع في علم الأحياء مع بداية الألفية الجديدة خاصة في مجموعة متنوعة من السياقات. يقدم مشروع الجينوم البشري مثالًا على تفكير النظم التطبيقية في علم الأحياء، تفكير أفضى إلى طرق جديدة وتعاونية للعمل على حل مشكلات في المجال البيولوجي لعلم الوراثة. يتمثل أحد أهداف بيولوجيا النظم في نمذجة الخصائص الناشئة واكتشافها، مثل خصائص الخلايا والأنسجة والكائنات الحية التي تعمل بمثابة نظام لا يمكن وصفه نظريًا إلا باستخدام تقنيات بيولوجيا النظم. عادة ما تتضمن هذه التقنيات الشبكات الأيضية أو شبكات الإشارات الخلوية. (ar) La biologia de sistemes és una branca de les ciències naturals que es centra en l'estudi sistemàtic de les interaccions complexes en els sistemes biològics. A diferència dels mètodes clàssics d'estudi usats en la biologia tradicional, la biologia de sistemes empra fonamentalment la modelització. Aquestes tècniques sorgeixen fonamentalment de l'ús de models matemàtics que descriuen el comportament del sistema en estudi. Els models permeten predir el comportament del procés com un sistema dinàmic, generalment tractat com una xarxa complexa, i comparar-lo amb les observacions experimentals. Per la seva pròpia naturalesa, la biologia de sistemes és inherentment una àrea interdisciplinària. Solen trobar-se, a més de biòlegs i bioquímics, professionals i especialistes en matemàtiques, física, enginyeria de control i teoria de sistemes. (ca) Systémová biologie je vědecký směr v biologii silně využívající přístupy dalších věd, především biochemie, chemie, informatiky a matematiky. Zabývá se studiem biologických funkcí a mechanizmů vzniklých následkem komplexních interakcí v biologických systémech. Základní myšlenkou je komplexní pohled, opak redukcionismu (který je převládajícím paradigmatem například v molekulární biologii), tedy předpoklad, že systém je víc než součet jeho částí. Organismus či jeho část (tkáň, buňka, organela) je chápán jako komplexní systém. Předmětem zájmu jsou potom interakce mezi komponentami tohoto systému a jeho emergentní vlastnosti, tedy takové, které nemohou být vysvětleny pouze na základě součtu vlastností komponent. Systémová biologie pracuje s velkým množstvím biologických dat, začala se prudce rozvíjet po roce 2000 následkem rozvoje technologií pro získávání genomických a proteomických dat a zvýšení výkonu počítačů. Systémová biologie často pracuje s modely, které jsou vytvářeny matematickými a informatickými přístupy na základě biologických dat, jejichž vlastnosti jsou posléze porovnávány s vlastnostmi živých systémů. Proto vyžaduje úzký kontakt znalostí z několika oborů. (cs) Bioinformatika je vědní disciplína, která se zabývá metodami pro shromažďování, analýzu a vizualizaci rozsáhlých souborů biologických dat, zejména dat molekulárně-biologických. Předmětem zájmu a používanými metodami se bioinformatika prolíná s dalšími příbuznými obory, např. molekulární biologií, genomikou, proteomikou, genetikou, , matematickou biologií, systémovou biologií, , , biomedicínským inženýrstvím, výpočetní chemií, informatikou a počítačovou lingvistikou. (cs) Η Βιολογία Συστημάτων είναι ένας τομέας που αναπτύχθηκε πολύ πρόσφατα, αλλά βρίσκει όλο και περισσότερους υποστηρικτές. Η γενική ιδέα αφορά την ερμηνεία διάφορων βιολογικών συμβάντων χρησιμοποιώντας τη θεωρία των συστημάτων. Η έννοια του συστήματος χρησιμοποιείται εδώ και πάρα πολλά χρόνια από πολλές διαφορετικές επιστήμες με ισχυρό μαθηματικό υπόβαθρο. Έτσι λοιπόν, η εισαγωγή μιας τέτοιας έννοιας στη βιολογία έδωσε νέα ώθηση στην κατανόηση διαφόρων δομών και λειτουργιών. Από τη μελέτη μεμονωμένων βιομορίων, η βιολογία συστημάτων έχει μετατοπίσει το ενδιαφέρον της στην ολοκληρωμένη μελέτη ομάδων βιομορίων τα συστατικά των οποίων αλληλεπιδρούν συνεργατικά για την εκτέλεση και ολοκλήρωση βιολογικών λειτουργιών. (el) Η βιοπληροφορική (bioinformatics) είναι ένα διεπιστημονικό πεδίο που αναπτύσσει μεθόδους και εργαλεία λογισμικού για την κατανόηση βιολογικών δεδομένων. Ως ένα διεπιστημονικό πεδίο της επιστήμης, η βιοπληροφορική συνδυάζει την υπολογιστική επιστήμη, τη στατιστική, τα μαθηματικά και τη μηχανική για να αναλύσει και να ερμηνεύσει βιολογικά δεδομένα. Η βιοπληροφορική έχει χρησιμοποιηθεί για in silico (υπολογιστικές) αναλύσεις βιολογικών ερωτημάτων χρησιμοποιώντας μαθηματικές και στατιστικές τεχνικές. Ο όρος βιοπληροφορική περικλείει το μέρος των βιολογικών ερευνών όπου ο προγραμματισμός είναι μέρος της μεθοδολογίας, και αναφέρεται σε ειδικές διοχετεύσεις (pipelines) ανάλυσης που χρησιμοποιούνται συχνά, ειδικά στο πεδίο της γενομικής. Συχνές χρήσεις της βιοπληροφορικής περιλαμβάνουν την αναγνώριση υποψήφιων γονιδίων και μονονουκλεοτιδικών πολυμορφισμών (SNPs). Συχνά αυτή η αναγνώριση γίνεται με σκοπό την κατανόηση της γενετικής βάσης μιας ασθένειας, μοναδικών προσαρμογών, επιθυμητών ιδιοτήτων (ειδικά στα γεωργικά είδη) ή τις διαφορές μεταξύ πληθυσμών. Θεωρώντας τα βιολογικά δεδομένα (DNA, RNA, πρωτεΐνες) ως ψηφιακή πληροφορία, εφαρμόζει αλγορίθμους για την επεξεργασία τους και την παραγωγή χρήσιμων συμπερασμάτων με αποδοτικό τρόπο. Συνήθως χρησιμοποιούνται μέθοδοι κλάδων της τεχνητής νοημοσύνης, όπως η εξόρυξη δεδομένων (π.χ. νευρωνικά δίκτυα, κλπ) και ο (π.χ. γενετικοί αλγόριθμοι). (el) Biokomputiko estas scienco inter biologio kaj komputiko. Ĝi estas apliko de komputiko al la studo de kompleksaj fenomenoj aŭ strukturoj kiel ekzemple genaroj, genoj, genetika kodo aŭ filogenetikaj arboj. Ankaŭ, per biokomputiko oni povas ekzemple modeligi kuracan molekulon ensilicie kaj antaŭplani ties konduton kaj eksperimenti pri ties ago ĉe ricevilo, kiun oni volas stimuli por kuraci iun malsanon... Ĝenerale tiaj studoj necesigas multnombrajn kaj kompleksajn kalkulojn, kiujn ne eblas fari sen komputilaj programoj kaj/aŭ matematikaj modeloj (>Matematika komputiko). (eo) Bioinformatics (/ˌbaɪ.oʊˌɪnfərˈmætɪks/) is an interdisciplinary field that develops methods and software tools for understanding biological data, in particular when the data sets are large and complex. As an interdisciplinary field of science, bioinformatics combines biology, chemistry, physics, computer science, information engineering, mathematics and statistics to analyze and interpret the biological data. Bioinformatics has been used for in silico analyses of biological queries using computational and statistical techniques. Bioinformatics includes biological studies that use computer programming as part of their methodology, as well as specific analysis "pipelines" that are repeatedly used, particularly in the field of genomics. Common uses of bioinformatics include the identification of candidates genes and single nucleotide polymorphisms (SNPs). Often, such identification is made with the aim to better understand the genetic basis of disease, unique adaptations, desirable properties (esp. in agricultural species), or differences between populations. In a less formal way, bioinformatics also tries to understand the organizational principles within nucleic acid and protein sequences, called proteomics. Image and signal processing allow extraction of useful results from large amounts of raw data. In the field of genetics, it aids in sequencing and annotating genomes and their observed mutations. It plays a role in the text mining of biological literature and the development of biological and gene ontologies to organize and query biological data. It also plays a role in the analysis of gene and protein expression and regulation. Bioinformatics tools aid in comparing, analyzing and interpreting genetic and genomic data and more generally in the understanding of evolutionary aspects of molecular biology. At a more integrative level, it helps analyze and catalogue the biological pathways and networks that are an important part of systems biology. In structural biology, it aids in the simulation and modeling of DNA, RNA, proteins as well as biomolecular interactions. (en) Die Bioinformatik (englisch bioinformatics, auch computational biology) ist eine interdisziplinäre Wissenschaft, die Probleme aus den Lebenswissenschaften mit theoretischen computergestützten Methoden löst. Sie hat zu grundlegenden Erkenntnissen der modernen Biologie und Medizin beigetragen. Bekanntheit in den Medien erreichte die Bioinformatik in erster Linie 2001 mit ihrem wesentlichen Beitrag zur Sequenzierung des menschlichen Genoms. Bioinformatik ist ein weitgefächertes Forschungsgebiet, sowohl bei Problemstellungen als auch den angewandten Methoden. Wesentliche Gebiete der Bioinformatik sind die Verwaltung und Integration biologischer Daten, die Sequenzanalyse, die Strukturbioinformatik und die Analyse von Daten aus Hochdurchsatzmethoden (~omics). Da Bioinformatik unentbehrlich ist, um Daten in großem Maßstab zu analysieren, bildet sie einen wesentlichen Pfeiler der Systembiologie. Der Bioinformatik wird im englischen Sprachraum oft die computational biology gegenübergestellt, die einen weiteren Bereich als die klassische Bioinformatik abdeckt, meist benutzt man beide Begriffe jedoch synonym. (de) Die Systembiologie (Synonym: Systeomik, englisch systems biology, integrative biology oder predictive biology) ist ein Zweig der Biowissenschaften, der versucht, biologische Organismen in ihrer Gesamtheit zu verstehen. Das Ziel ist, ein integriertes Bild aller regulatorischen Prozesse über alle Ebenen vom Genom über das Proteom zu den Organellen bis hin zum Verhalten und zur Biomechanik des Gesamtorganismus zu bekommen. Wesentliche Methoden zu diesem Zweck stammen aus der Systemtheorie und ihren Teilgebieten. Da aber die mathematisch-analytische Seite der Systembiologie nicht perfekt ist, kommen als Forschungsmethoden häufig Computersimulationen und Heuristiken zum Einsatz. Die Systembiologie führt die Zeit als wichtigen Faktor wieder in die Molekularbiologie ein. Diese vermied bisher eher Überlegungen über den exakten zeitlichen Ablauf von Reaktionen; ganz im Gegensatz zur Biochemie. Die Systembiologie kehrt zur biochemischen Sichtweise der Welt zurück, macht sich Gedanken über Prozesse und wie diese sich im Laufe der Zeit verändern, jedoch mit einer radikalen Erweiterung der Skala. In der Systembiologie werden tausende Reaktanten beobachtet, wodurch Systembiologie in einer deutlich dynamischeren Sichtweise der Biologie resultiert als die der klassischen Molekularbiologie oder Genetik. (de) Bioinformatika diziplinarteko jakintza esparru bat da, datu biologikoak ulertzeko software tresnak eta metodo informatikoak erabiltzen dituena. Biologia, informatika, matematika eta estatistika konbinatzen ditu datu biologikoak analizatu eta ulertzeko. Bioinformatika hitz orokorra da programazio informatikoa bere metodologiaren atal garrantzitsu modura erabiltzen duten azterketa biologikoak biltzeko. Batez ere, analisi informatikoak modu errepikakorrean erabiltzen dituzten esparruetan erabiltzen da, eta bereziki genomikan. Alor horretan, geneen aleloak eta nukleotidoen polimorfismoak identifikatzeko erabiltzen da, bai gaixotasun genetikoen oinarriak ulertzeko bai ingeniaritza genetikoa egiteko, adibidez propietate jakin batzuk dituzten nekazaritzako espezieak sortzeko. Ikuspuntu zabalago batetik, azido nukleikoen eta proteinen sekuentzien antolamendu printzipioak ulertzeko erabiltzen da bioinformatika. (eu) Sistemen biologia prozesu biologiko konplexuen eredugintza eta analisi konputazionalari eta matematikoari deritzo. Biologian oinarritutako ezagutza-eremua da, sistema biologikoetan eragiten duten elementuen (kanpo- zein barne-elementuak) arteko elkarrekintzan ardazten dena. Ikerketa biologikoari heldutako ikuspegi holistiko honek sistema biologikoen funtzionamendua modu integratuan ulertzeaz gain, posiblea egiten du aipatutako kanpo- eta barne-elkarrekintzek dakarten propietate zein prozesu berrien agerpenean sakontzea. Biologia tradizionalak ez bezala (gene indibidualen, proteinen, zelulen eta horien funtzioen analisian oinarritzen da), sistemen biologiak sistema biologikoak modu globalean aztertzen ditu: maila molekularrean, alegia. Gainera, diziplina ezberdinetako ezagutzak integratzen ditu: genomika, , , , fisiologia, patologia, eta abar. Sistemen biologiaren ezaugarri nagusietakoa da ikerketa esperimentaletatik lortutako datuen kudeaketa. Horrekin batera, eredu matematikoak proposatzen ditu, aztergai diren fenomeno biologiko ezberdinak azaltzeko. Horrela, prozesu biologiko horien portaera aurreikustea ahalbidetzen duen soluzio matematikoa eskaintzen da. Eratutako eredu matematiko horien kalitatea bermatzeko, ezagutza-eremu hau arduratzen da simulazio numerikoetatik eta datu esperimentaletatik lortutako balioen arteko konparaketa gauzatzeaz. Sistemen biologia jakintza-alorrarteko eremua da. Medikuntza, Fisika, Biologia, Biokimika, Matematika, Informatika eta Ingeniaritza biltzen ditu, besteak beste. (eu) La bio-informatique, ou bioinformatique, est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie. Plus généralement, la bio-informatique est l'application de la statistique et de l'informatique à la science biologique. Le spécialiste qui travaille à mi-chemin entre ces sciences et l'informatique est appelé bioinformaticien ou bionaute. Le terme bio-informatique peut également décrire, par abus de langage, toutes les applications informatiques résultant de ces recherches. L'utilisation du terme bio-informatique est documentée pour la première fois en 1970 dans une publication de Paulien Hogeweg et Ben Hesper (université d'Utrecht, Pays-Bas), en référence à l'étude des processus d'information dans les systèmes biotiques. Ce domaine s'étend de l'analyse du génome à la modélisation de l'évolution d'une population animale dans un environnement donné, en passant par la modélisation moléculaire, l'analyse d'image, l'assemblage de génome et la reconstruction d'arbres phylogénétiques (phylogénie). Cette discipline constitue la « biologie in silico », par analogie avec in vitro ou in vivo. (fr) La bioinformática puede definirse, de manera general, como la aplicación de tecnologías computacionales y la estadística a la gestión y análisis de datos biológicos. Los términos bioinformática, biología computacional, informática biológica y, en ocasiones, biocomputación, son utilizados en muchas situaciones como sinónimos, y hacen referencia a campos de estudios interdisciplinares muy vinculados que requieren el uso o el desarrollo de diferentes técnicas estudiadas universitariamente en la Ingeniería Informática como ciencia aplicada de la disciplina informática. Entre estas pueden destacarse las siguientes: matemática aplicada, estadística, ciencias de la computación, inteligencia artificial, química y bioquímica con las que el Ingeniero Informático soluciona problemas al analizar datos, o simular sistemas o mecanismos, todos ellos de índole biológica, y usualmente (pero no de forma exclusiva) en el nivel molecular. El núcleo principal de estas técnicas se encuentra en la utilización de recursos computacionales para solucionar o investigar problemas sobre escalas de tal magnitud que sobrepasan el discernimiento humano. La investigación en biología computacional se solapa a menudo con la biología de sistemas. Los principales esfuerzos de investigación en estos campos incluyen el alineamiento de secuencias, la predicción de genes, montaje del genoma, alineamiento estructural de proteínas, predicción de estructura de proteínas, predicción de la expresión génica, interacciones proteína-proteína, y modelado de la evolución. Una constante en proyectos de bioinformática y biología computacional es el uso de herramientas matemáticas para extraer información útil de datos producidos por técnicas biológicas de alta productividad, como la secuenciación del genoma. En particular, el montaje o ensamblado de secuencias genómicas de alta calidad desde fragmentos obtenidos tras la secuenciación del ADN a gran escala es un área de alto interés. Otros objetivos incluyen el estudio de la regulación genética para interpretar perfiles de expresión génica utilizando datos de chips de ADN o espectrometría de masas. (es) La biología sistémica o biología de sistemas es el campo de investigación interdisciplinaria de los procesos biológicos en el que las interacciones de los elementos, internos y externos, que influyen en el desarrollo del proceso se representan con un sistema matemático. Este enfoque "holístico" o "global" permite comprender integradamente el funcionamiento de los sistemas (procesos) biológicos y profundizar en el entendimiento de cómo sus interacciones internas y con otros sistemas conllevan a la aparición (emergencia) de nuevas propiedades. Prácticamente cualquier proceso biológico puede ser objeto de estudio de la biología sistémica, como por ejemplo, el crecimiento de una célula, la interacción entre dos bacterias o la circulación sanguínea en un organismo. La biología sistémica comenzó a desarrollarse en los años 1960, pero se estableció como disciplina académica alrededor del año 2000. Convencionalmente, en el estudio de los procesos biológicos se utiliza el método científico clásico, que se basa en la confirmación o refutación de una hipótesis al confrontarla con los resultados experimentales. La biología sistémica utiliza un enfoque distinto basado en la modelización matemática de los procesos en estudio. Como resultado de la simulación, al poner a funcionar los modelos matemáticos con los que se representa al proceso, se obtiene una serie de predicciones del estado del proceso biológico que corresponderían a los resultados experimentales esperados. Durante las simulaciones, la red de interacciones entre los elementos que componen al proceso biológico se representa con un sistema de ecuaciones diferenciales. Los valores de las características de esos elementos a distintos tiempos y bajo diversas condiciones experimentales (simuladas) son predecibles porque la dinámica, es decir los cambios del estado de ese sistema modelado, es calculable matemáticamente. Sin embargo, no puede afirmarse rotundamente que la biología de sistemas no utilice el método científico, ya que hace uso extenso de métodos experimentales para, en primer lugar, construir un modelo matemático utilizando un set de datos de "entrenamiento" (training dataset), que luego necesitan ser validados por un set de datos de replicación. La biología sistémica es un área interdisciplinaria en la que participan: Médicos, biólogos, bioquímicos, matemáticos, físicos, programadores, ingenieros en control automático y teoría de sistemas, entre otros. (es) Biologi sistem adalah penggabungan dari beberapa cabang ilmu, seperti , biokimia, dan biologi molekuler. Ilmu biologi sistem bertujuan untuk mendapatkan pemahaman yang menyeluruh (holistik) terhadap makhluk hidup sebagai kesatuan sistem. Beberapa strategi yang dipilih dalam biologi sistem antara lain adalah pengukuran kuantitatif komponen seluler dalam tingkat mRNA, protein, dan metabolit, pengembangan model matematika yang menggabungkan pemahaman biokimia dengan data-data yang dihasilkan oleh eksperimen dengan hasil data bervolume tinggi, aplikasi mikroorganisme. Karena yang dianalisis merupakan data bervolume tinggi, dibutuhkan semacam perangkat mutakhir untuk mengolah, menganalisis, memvisualisasi, dan mensimulasikan data tersebut. Oleh karena itu, pengembangan ilmu bioinformatika berperan. (in) Bioinformatika (bahasa Inggris: bioinformatics) adalah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Contoh topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen. (in) La biologie des systèmes (ou biologie intégrative) est un domaine récent de la biologie qui étudie les organismes vivants comme les systèmes qu'ils sont en réalité, par opposition aux approches historiques qui tendent à décomposer l'étude à tous les niveaux, en biologie, physiologie, biochimie… La biologie systémique cherche à intégrer différents niveaux d'informations pour comprendre comment fonctionne réellement un système biologique. En étudiant les relations et les interactions entre différentes parties du système biologique (organites, cellules, systèmes physiologiques, réseaux de gènes et de protéines permettant la communication des cellules), le chercheur tente de former un modèle de fonctionnement de la totalité du système. Si la biologie des systèmes est un domaine théorisé à la fin du XXe siècle, plusieurs biologistes et chimistes ont travaillé dans ce sens dès la fin du XIXe siècle (par exemple le biologiste et chimiste français Marcellin Berthelot qui privilégiait une approche systémique et synthétique de la biochimie). La biologie moléculaire des systèmes commence avec l'étude des gènes et des protéines d'un organisme, en utilisant la technique HTS (high-throughput screening, criblage à haut débit) pour quantifier les changements dans le génome, le transcriptome, le protéome et le métabolome en réponse à une perturbation donnée. Cette technique consiste à effectuer de manière automatique des centaines de fois la même opération, en pharmacologie par exemple, pour trouver une molécule qui convient. L'analyse à haut débit du transcriptome s'effectue à l'aide de puces à ADN. Pour détecter les différentes protéines, on utilise par exemple la HTS avec la spectrométrie de masse. D'autres approches en biologie des systèmes ne privilégient pas le niveau moléculaire et cherchent au contraire à intégrer les niveaux d'organisation de manière plus large. (fr) バイオインフォマティクス（英語：bioinformatics）とは、生命科学と情報科学の融合分野のひとつであり、DNAやRNA、タンパク質をはじめとする、生命が持つ様々な「情報」を対象に、情報科学や統計学などのアルゴリズムを用いた方法論やソフトウェアを開発し、またそれらを用いた分析から生命現象を解き明かしていく(in silico 解析)ことを目的とした学問分野である。そのためバイオインフォマティクスは広義には、生物学、コンピュータサイエンス、情報工学、数学、統計学といった様々な学問分野が組み合わさった学際分野自体を指す。日本語では生命情報科学や生物情報学、情報生命科学などと表記される。 ゲノミクス研究の初期においては、遺伝子予測等のゲノミクスに関する分野がバイオインフォマティクスの主要な対象であった。近年ではゲノムを超えて、ゲノムからの転写物の総体であるトランスクリプトームや、トランスクリプトーム（の一部）が翻訳されたタンパク質の総体であるプロテオーム、タンパク質の二次産物として合成される糖鎖の総体であるグライコーム、更にはゲノムからの直接的に転写・翻訳された実体だけではなく、代謝ネットワーク（代謝マップ）によって生じた代謝産物をも含めた総体を考えるメタボローム、生物個体の表現形の総体であるなど、バイオインフォマティクスが対象とする研究分野は生物学全体に拡大・発展しつつある。 (ja) La bioinformatica è una disciplina scientifica dedicata alla risoluzione di problemi biologici a livello molecolare con metodi informatici. (it) 계생명학(系生物學) 또는 시스템 생물학(Systems biology, SB)은 생명현상을 로 규정하고 생물학뿐만 아니라 전산학, 수학, 물리학, 화학 등의 원칙을 사용하여 분석하고 모사 발명하는 것을 목표로 하는 학문이다. 시스템 생물학은 최신 생물학의 한 갈래로 적 수리모델을 수립하고 경향을 탐구하려는 성격을 가지고 있다. (ko) 생물정보학(生物情報學), 흔히 바이오인포매틱스(bioinformatics)는 생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학 등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문이다. 전산생물학의 연구분야는 시스템즈 생물학과 중복되기도 한다. 주 연구분야는 서열정렬, 유전자 검색, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 단백질 구조 예측, 유전자발현의 예측, 단백질간 상호작용, 등 다양하다. (ko) システム生物学（システムせいぶつがく、システムバイオロジー、システムズバイオロジー、英語: systems biology）は、システム工学の考え方や解析手法を生物学に導入し、生命現象をシステムとして理解することを目的とする学問分野。 (ja) Bio-informatica is de wetenschap die tot doel heeft de biologische kennis te verrijken door kennis uit de informatica toe te passen op biologische data. De bio-informatica wordt gezien als een van de deelgebieden van medische informatiekunde, in de Engelstalige vakliteratuur Biomedical Informatics genoemd. Ook wordt het als belangrijk aspect van de theoretische of wiskundige biologie gezien. De term bio-informatica werd in Nederland voor het eerst gebruikt door Paulien Hogeweg en Ben Hesper. (nl) La biologia dei sistemi è una disciplina biologica che studia gli organismi viventi in quanto sistemi che si evolvono nel tempo, ossia nell'interazione dinamica delle parti di cui sono composti. In particolare questo obiettivo viene conseguito tramite l'integrazione di modelli dinamici e dei risultati di differenti esperimenti ad alto rendimento (high-throughput), unendo nella pratica per esempio le conoscenze di genomica, proteomica, trascrittomica e di teoria dei sistemi dinamici. La biologia dei sistemi parte quindi dalla conoscenza dei geni e delle proteine presenti nel corso del tempo in un organismo e utilizza tecniche di trascrittomica quali i microarray per determinare cambiamenti nell'espressione genica o tecniche biochimiche e proteomiche quali la spettrometria di massa o l'analisi robotizzata delle attività enzimatiche, per valutare i cambiamenti dinamici derivati da una perturbazione del sistema. La disciplina utilizza quindi ampiamente gli approcci della teoria dei sistemi, della bioinformatica e della matematica-statistica con l'obiettivo di arrivare a creare un modello sempre più completo del funzionamento dei sistemi biologici. Al contrario ad esempio della biologia molecolare, che si focalizza sulle macromolecole biologiche come acidi nucleici e proteine, la biologia dei sistemi non si occupa del singolo meccanismo molecolare bensì delle interazioni dinamiche tra le varie molecole per formare nel corso del tempo un sistema. L'aspetto dinamico, e cioè la forte dipendenza dal tempo dei programmi di formazione di strutture e processi biologici, è proprio l'aspetto che fortemente caratterizza la biologia dei sistemi rispetto alla bioinformatica. (it) Systeembiologie (Engels: systems biology) is de wetenschap die biologische systemen op het niveau van de cel bestudeert als een geheel. Hoewel de term 'systems biology' vaak gebruikt wordt in wetenschappelijke literatuur, is er nog geen eenduidige, algemeen aanvaarde definitie van systeembiologie. Biologische systemen bestaan uit vele componenten, zoals genen, eiwitten en metabolieten. In de systeembiologie gaat het niet alleen om de functie van al deze componenten, maar vooral ook om de dynamische interacties tussen al deze componenten. Ieder biologisch systeem kan worden gezien als een hiërarchisch georganiseerd netwerk van interacties. Bijvoorbeeld: eiwitten hebben interacties met andere eiwitten, en vormen eiwitcomplexen. Verschillende eiwitcomplexen hebben interactie met elkaar, en vormen samen met andere componenten een celorganel. Ook celorganellen kunnen allerlei interacties met elkaar hebben, en maken deel uit van een cel, et cetera. Systeembiologie probeert al deze interacties in kaart te brengen. Hoewel de gedachte achter systeembiologie al vrij oud is (en in zekere mate afkomstig is van het holisme), is systeembiologie als wetenschap nog maar vrij recent in opkomst. Het Institute for Systems Biology in Seattle werd in 2000 opgericht en was het eerste van dergelijke instituten. Dit heeft vooral te maken met de sterke opkomst van onderzoeksgebieden als genomica, proteomica en andere '-omica'-gebieden. De ontwikkeling van zogenaamde methoden, (zoals DNA-microarrays) en technieken zoals massaspectrometrie dragen hieraan bij. Dankzij al deze methoden en technieken is het mogelijk de duizenden componenten waaruit een biologisch systeem bestaat enigszins in kaart te brengen. (nl) Bioinformatyka – interdyscyplinarna dziedzina łącząca nauki biologiczne i informatyczne. Obejmuje rozwój metod obliczeniowych służących do badania i symulacji struktury, funkcji i ewolucji genów, genomów i białek. Tworzy metody wykorzystywane do analizy i zarządzania informacji biologicznej gromadzonej w toku badań genomicznych oraz badań prowadzonych z zastosowaniem wysokoprzepustowych technik eksperymentalnych. Z bioinformatyką powiązane są: genomika, proteomika, lipidomika, metabolomika, transkryptomika i konektomika. W szerszym znaczeniu obejmuje także biokomputery i neuroinformatykę. (pl) Biologia sistémica (português europeu) ou Biologia Sistêmica (português brasileiro), ou mesmo biologia de sistemas, é a averiguação do intercâmbio entre os "componentes" (elementos, entidades) de um Sistema Biológico, e como essas influências mútuas conduzem à manifestação de funções (capacidades) e comportamentos do sistema em tese, tituladas de , do inglês emergent properties. Como exemplo de estudos em biologia sistêmica tem-se o ritmo cardíaco, ver por exemplo . Como explica . O ritmo cardíaco nasce da influência mútua entre proteínas; em geral, interação entre proteínas e como isso cria propriedade nos sistemas biológicos é estudado pela Proteômica. Quando a ideia de que o ritmo cardíaco era controlado por interação entre proteínas foi apresentada pela primeira vez, muita aversão foi criada; oscilação nasce sem a demanda física de um eixo rotatório, exclusivamente interação. Esse tipo de propriedade tem sido estudado pela biologia sistêmica valendo-se de sistemas dinâmicos. Como forma de instruir-se de muitas das particularidades da biologia sistêmica, ver vídeo publicado na língua inglesa, mas com textos em português. Nesse vídeo se espera de entender de forma bem clara as mudanças de paradigma, cada vez mais biólogos precisarão trabalhar em sinergia com físicos, matemáticos, engenheiros e vise-versa na busca de criar teorias mais completas no que tange explicações científicas. A biologia sistêmica faz pleno uso de matemática e computação. Como destaca Pires: "O emprego de modelos matemáticos começou basicamente no começo do século passado, mas ganhou impulso com a criação e disseminação dos computadores. A biologia sistêmica é um dos filhos dessa mudança." (pt) Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia. Como um campo interdisciplinar da ciência, a bioinformática combina a biologia, ciência da computação, estatística, matemática e engenharia para analisar, interpretar e processar dados biológicos. A bioinformática vem sendo utilizada para análises in silico de questões biológicas utilizando técnicas de matemática e estatística. Alguns especialistas brasileiros da área acreditam que a bioinformática, como se entende tradicionalmente no meio acadêmico e não pela análise da palavra, é circunscrita à biologia molecular, às vezes ainda mais especificamente restrita à Genômica. Outros acadêmicos, por outro lado, advogam a noção mais abrangente do termo para algo na direção da definição envolvendo informação biológica de modo geral. Buscando tratar os dados, é necessário desenvolver programas para, por exemplo: identificar genes, prever a configuração tridimensional de proteínas, identificar inibidores de enzimas, organizar e relacionar informação biológica, simular células, agrupar proteínas homólogas, montar árvores filogenéticas, comparar múltiplas comunidades microbianas por construção de bibliotecas metagenômicas e analisar experimentos de expressão gênica, entre outras inúmeras aplicações. De uma maneira menos formal, a bioinformática também tenta entender os princípios organizacionais de sequências de ácidos nucleicos e proteínas. Uma das maiores conquistas da bioinformática foi o mapeamento completo do . A bioinformática tornou-se uma parte muito importante de muitas áreas da biologia molecular. Em biologia molecular experimental, técnicas de bioinformática, tais como imagem e processamento de sinais, permitiram a extração de resultados úteis a partir de grandes quantidades de dados brutos. No campo da genética e genômica, ela auxilia no sequenciamento e anotações de genomas e suas mutações observadas. Ela também desempenha um papel importante na análise da expressão e regulação de genes e proteínas. As ferramentas de bioinformática auxiliam na comparação de dados genéticos e genômicos e, mais geralmente, na compreensão dos aspectos evolutivos da biologia ao nível molecular. A um nível mais integrativo, ela ajuda a analisar e catalogar as vias biológicas e redes, que são uma parte importante da biologia sistêmica. Em biologia estrutural, a bioinformática auxilia na simulação e modelagem de DNA, RNA e proteínas, bem como interações biomoleculares. (pt) Systembiologi är ett relativt nytt biologiskt studieområde som fokuserar på systematiskt studium av komplexa samspel i . Man utgår alltså ifrån ett nytt perspektiv där man utgår ifrån att helheten är mer än summan av beståndsdelarna. Detta kan jämföras med det tidigare förhärskande synsättet, reduktionism, där man utgår ifrån att ett system helt och hållet kan beskrivas i termer av sina beståndsdelar. Särskilt från år 2000 och framåt används termen allmänt inom biovetenskaperna och i flera olika sammanhang. Eftersom den vetenskapliga metoden huvudsakligen har varit fokuserad på reduktionism så är ett av målen med systembiologin att upptäcka nya egenskaper som kan uppenbaras genom en systematisk syn där man försöker förstå helheten av processerna i biologiska system. (sv) Bioinformatik är en tvärvetenskaplig disciplin där algoritmer för analys av biologiska (särskilt molekylärbiologi) data utvecklas. Man använder också termen synonymt med engelskans computational biology. Ursprungligen myntades begreppet för studiet av informatiska processer i biotiska system av Professor Paulien Hogeweg vid Universitetet i Utrecht, Nederländerna. Idag används begreppet fritt för att omfatta all forskning där datorberäkningar används för att analysera molekylärbiologiska data. Bioinformatiken inbegriper vitt skilda delområden, till exempel: * Hantering och strukturering av mycket stora datamängder. * Visualisering av data, till exempel proteinstruktur, fylogeni, och genomik. * Algoritmutveckling för att möta behov inom olika slags analyser, datahantering, och visualisering. * Modellering av fenomen inom evolution, , och cellbiologi. * Analys av molekylärbiologiska data såsom DNA- och proteinsekvenser, data från studier av genuttryck, och morfologiska karaktärer. Forskning inom bioinformatik bedrivs idag vid de flesta svenska universitet och även en del högskolor, exempelvis Högskolan i Skövde. (sv) Систе́мная биоло́гия — междисциплинарное научное направление, образовавшееся на стыке биологии и теории сложных систем, ориентированное на изучение сложных взаимодействий в живых системах. Впервые термин используется в статье 1993 года авторов W. Zieglgänsberger и TR. Tölle . Широкое распространение термин «системная биология» получил после 2000 года. Формирует новый подход к интерпретации результатов в биологии 21-го века вместо традиционного для биологии прошлых столетий редукционизма, и такой новый подход в настоящее время обозначают терминами холизм и англ. integrationism). Основное внимание в системной биологии уделяется так называемым эмерджентным свойствам, то есть свойствам биологических систем, которые невозможно объяснить только с точки зрения свойств её компонентов. Понимание (англ. insight) биологии на системном уровне даёт возможность для более верного осмысления структуры, динамики и функций как отдельной клетки, так и организма в целом, чем при рассмотрении по-отдельности частей клетки или организма. Системная биология тесно связана с математической биологией. (ru) Biologia systemów, biologia systemowa – dziedzina nauki zajmująca się systemami biologicznymi, takimi jak sieci interakcji białek lub sieci ścieżek metabolicznych. Stosuje narzędzia matematyczne, głównie z dziedziny teorii grafów, do badania cech systemów, analizowania właściwości ich komponentów i ich wpływu na działanie całej sieci, oraz modelowania systemów. Łączy informacje zdobywane przez dziedziny nauki takie jak: genomika, transkryptomika, proteomika, lipidomika i metabolomika. (pl) Биоинформа́тика — междисциплинарная область, объединяющая общую биологию, молекулярную биологию, кибернетику, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику. Крупномасштабные биологические проблемы, требующие анализа больших объемов данных, решаются биоинформатикой с вычислительной точки зрения. Биоинформатика главным образом включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных. В похожем контексте часто упоминается термин вычислительная биология. Эта область акцентирует свое внимание на разработке алгоритмов и математическом моделировании социальных, поведенческих и биологических систем. Биоинформатику считают областью внутри вычислительной биологии, которая главным образом сфокусирована на статистической обработке биологических данных.Различия в подходе с разных сторон: биоинформатики — это биологи, специализирующиеся на использовании вычислительных систем и инструментов для решения биологических задач, а вычислительные биологи — это специалисты по компьютерным наукам, математики, статистики и инженеры, разрабатывающие инструменты для таких расчётов. Биоинформатика в широком смысле подразумевает работу с любыми видами биологических данных, включая исследование электронных микрофотографий, поиск ключевых слов в биологической литературе и так далее. Если рассматривать биоинформатику как набор подходов и методов для работы с данными, то в зависимости от типов технических задач она включает в себя: * Разработку алгоритмов и программ для более эффективной работы с данными * Хранение и передачу информации или работу с базами данных Однако, биоинформатические методы анализа также неразрывно связаны со многими научными областями, которые подразумевает поиск ответов на конкретные биологические вопросы. В таком случае основные направления можно выделить на основании исследуемых объектов: * Биоинформатика последовательностей * Анализ экспрессий * Структурная биоинформатика * Изучение клеточной организации * Системная биология Для каждого из перечисленных разделов можно выделить свои стандартные типы данных, способы их обработки, биоинформатические алгоритмы и базы данных. В биоинформатике используются методы прикладной математики, статистики и информатики. Биоинформатика используется в биохимии, биофизике, экологии и в других областях. Наиболее часто используемыми инструментами и технологиями в этой области являются языки программирования Python, R, Java, C#, C++; язык разметки — XML; язык структурированных запросов к базам данных — SQL; программно-аппаратная архитектура параллельных вычислений — CUDA; пакет прикладных программ для решения задач технических вычислений и одноимённый язык программирования, используемый в этом пакете — MATLAB, и электронные таблицы. (ru) 生物信息學（英語：bioinformatics）利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及利用（计算、模拟）。目前主要的研究方向有：序列比对、序列組裝、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、的预测，以及建立。 生物学技术往往生成大量的。与数据挖掘类似，生物信息学利用数学工具从大量数据中提取有用的生物学信息。生物信息学所要处理的典型问题包括：重新組裝在霰弹枪定序法测序过程中被打散的DNA序列，从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构，利用mRNA微阵列或质谱仪的数据检验的假说。 某些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理；但是另外一些人认为计算生物学和生物信息学应当被当作不同的条目处理，因为生物信息学更侧重於生物学领域中计算方法的使用和发展，而计算生物学强调应用信息学技术对生物学领域中的假说进行检验，并尝试发展新的理论。 (zh) Системна біологія — наукова дисципліна, що утворилася внаслідок перетину біології та теорії складних систем. Уперше термін був використаний 1993 року в статті авторів W. Zieglgänsberger і TR. Tölle. Системна біологія є міждисциплінарною наукою про життя. Спрямована на вивчення складних взаємодій в живих системах. Використовує новий підхід в біології: холізм замість редукціонізму. Основна увага в системній біології приділяється емерджентним властивостям, тобто властивостями біологічних систем, які неможливо пояснити тільки з точки зору властивостей її компонентів. Таким чином завданнями системної біології є дослідження та моделювання властивостей складних біологічних систем, які не можна пояснити сумою властивостей її складових. Широкого вжитку термін «системна біологія» набув після 2000 року. Системна біологія має зв'язок із математичною біологією. (uk) 系统生物学（systems biology），是一个使用整体论（而非还原论）的方式， 整合不同学科、层次的信息，以研究、分析、理解（即整合分析）生物系统如何行使功能的学术领域。系统生物学通过研究各个生物系统内部所有组成成分间，各分子层面上的相互关系和相互作用（例如，与细胞信号传送、代谢通路、细胞器、细胞、与生物等相关的基因和蛋白网络），期望最终能够建立整个系统的可理解模型，以及为有机体绘制完整图谱。系统生物学使用计算机模拟，数学分析的方法来构建复杂生物系统的模型。 系统生物学不同于以往只注意个别的基因和蛋白质的，研究所有的基因、所有的蛋白质和组分间的所有相互关系；其目标是：对复杂的生物系统构建计算的数学模型，从总体上预测生物系统的真实性。特别是从2000年开始，这个概念在各种环境下被广泛用于生物学。人类基因组计划是生物学中应用系统思维的一个例子，它导致新的合作的方式来处理在遗传学生物学领域的问题。系统生物学的目标之一是模拟和发现涌现的特性，细胞的，组织的和生物体的特性，作为一个系统，其理论描述只能用系统生物学的技术进行。这些通常涉及代谢网络或细胞信号传送网络。 系统生物学开始于对基因和蛋白质的研究，该研究使用高通量技术来测定某物种在给定条件干涉下基因组和蛋白质组的变化。研究基因组的高通量技术包括用来测定mRNA变化的生物芯片技术。高通量蛋白质组学方法包括质谱，该技术用于鉴定蛋白质，检测蛋白修饰和量化蛋白质表达水平。 (zh) Біоінформа́тика — галузь обчислювальної біології, що застосовує машинні алгоритми і статистичні методи для аналізу великих наборів біологічних даних, які, як правило, складаються з великого числа нуклеотидних (ДНК і РНК) та пептидних (білки) послідовностей і даних структури білків. Головні напрямки досліджень біоінформатики включають вирівнювання послідовностей, , збірку геномів, білків, передбачення структури білків, передбачення експресії генів та білок-білкової взаємодії та реконструювання процесу еволюції. Великим напрямком досліджень біоінформатики є отримання високоякісних послідовностей геномів з фрагментів послідовностей, отриманих за допомогою традиційних методів секвенування ДНК та конструювання сигнальних мереж за даними ДНК-мікрочипів. В останньому випадку біоінформатика нерідко перетинається з системною біологією. Хоча терміни біоінформатика і обчислювальна біологія часто взаємозамінюються, останній указує на ширшу галузь, що також включає розробку алгоритмів і конкретні обчислювальні методи та моделювання біологічних (математична біологія) і біохімічних (обчислювальна хімія, молекулярне моделювання) процесів. Часто також біофінформатику розглядають як галузь біомедичної інформатики. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/WPP_domain_alignment.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://compbio.mit.edu/6.047/ http://gjar.org/publishpaper/vol2issue1/d75r28.pdf http://jprr.org/index.php/jprr/article/view/8/5 http://print.achuth.googlepages.com/BINFTutorialV5.0CSI07.pdf http://www.computational-genomics.net/ https://web.archive.org/web/20071222091912/http:/ocw.mit.edu/OcwWeb/Biology/7-91JSpring2004/LectureNotes/index.htm https://www.mediawiki.org/wiki/Extension:WikiOpener http://expasy.org http://www.jprr.org http://www.nap.edu/catalog/11480.html http://www.nap.edu/catalog/2121.html |
| dbo:wikiPageID | 4214 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 72369 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1123990252 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Cancer dbr:BLAST dbr:Prion dbr:Provenance dbr:Science dbr:Enhancer_(genetics) dbr:List_of_bioinformatics_companies dbr:List_of_bioinformatics_institutions dbr:List_of_bioinformatics_journals dbr:List_of_bioinformatics_software dbr:Messenger_RNA dbr:Mutation dbr:Nucleotide dbr:Protein_nuclear_magnetic_resonance_spectroscopy dbr:Metabolic_network dbr:Metabolomics dbr:Morphometrics dbr:Bernd_Sturmfels dbr:BioCyc_database_collection dbr:BioJS dbr:BioJava dbr:BioPerl dbr:BioRuby dbr:Biochemistry dbr:Bioclipse dbr:Bioconductor dbr:Biodiversity dbr:Bioengineering dbr:Bioinformatics_Open_Source_Conference dbr:Biology dbr:Biopython dbr:Breast_cancer dbr:Algorithm dbr:Johns_Hopkins_University dbr:Paulien_Hogeweg dbr:Pfam dbr:Research_in_Computational_Molecular_Biology dbr:Current_Protocols dbr:Cyberbiosecurity dbr:DNA dbr:DNA_barcoding dbr:DNA_microarray dbr:UniProt dbr:University_of_California,_San_Diego dbr:De_facto dbr:EMBOSS dbr:Information_engineering_(field) dbr:Interactome dbr:Mass_spectrometry dbr:Sequence_alignment dbr:List_of_open-source_bioinformatics_software dbr:OBO_Foundry dbr:Nuclear_organization dbr:Nucleic_acid dbr:Nucleic_acid_sequence dbr:Protein_function_prediction dbr:Protein_structure_prediction dbr:Protein_subcellular_localization_prediction dbr:Protein–protein_interaction dbr:Proteomics dbr:QSAR dbr:.NET_Bio dbc:Bioinformatics dbr:Computational_genomics dbr:Computer dbr:Coursera dbr:Creative_Commons dbr:Massive_open_online_course dbr:Massively_parallel_signature_sequencing dbr:Mathematics dbr:Medical_imaging dbr:SOAP dbr:Elvin_A._Kabat dbr:GeneMark dbr:Gene_duplication dbr:Gene_expression dbr:Gene_mapping dbr:Gene_regulatory_network dbr:Genome_project dbr:Noise dbr:Objectivity_(science) dbr:Oligonucleotide dbr:Open_Bioinformatics_Foundation dbr:RNA_splicing dbr:Enzyme dbr:Frederick_Sanger dbr:Free_and_open-source_software dbr:Galaxy_(computational_biology) dbr:Gene dbr:Gene_Disease_Database dbr:Gene_ontology dbr:Genes dbr:Genetic_algorithm dbr:GenoCAD dbr:Genomics dbr:George_Washington_University dbr:Bovine_spongiform_encephalopathy dbr:Mitochondrion dbr:Consensus_clustering dbr:Control_theory dbr:Controlled_vocabulary dbr:Copy_number_variation dbr:Structural_biology dbr:Sulston_score dbr:System_theory dbr:Anduril_(workflow_engine) dbr:Apache_Taverna dbr:Approximation_algorithms dbr:Leghemoglobin dbr:Lior_Pachter dbr:Machine_learning dbr:Signal_processing dbr:Stanford_University dbr:Statistics dbr:Cluster_analysis dbr:Comparative_genomic_hybridization dbr:Computational_biology dbr:Computational_linguistics dbr:Computer_program dbr:Computer_programming dbr:Computer_science dbr:Computer_simulation dbr:Functional_genomics dbr:Haemophilus_influenzae dbr:Horizontal_gene_transfer dbr:Hormone dbr:Kepler_scientific_workflow_system dbr:Lesion dbr:Pattern_recognition dbr:Physics dbr:Plug-in_(computing) dbr:Point_mutation dbr:Population_genetics dbr:Protein_Data_Bank dbr:Protein_structure dbr:Protein_superfamily dbr:Microarray dbr:Protein_microarray dbr:Cell_(biology) dbr:UGENE dbr:Data_mining dbr:Drug_design dbr:Drug_discovery dbr:Health_informatics dbr:Jumping_library dbr:K-means_clustering dbr:RNA-Seq dbr:Sequencing dbr:Accuracy dbr:Amino_acid dbr:DNA_sequencing dbr:ENCODE dbr:EdX dbr:Alzheimer's_disease dbr:European_Bioinformatics_Institute dbr:European_Conference_on_Computational_Biology dbr:Evolution dbr:Evolutionary_tree dbr:Exome dbr:Food_and_Drug_Administration dbr:Base_calling dbr:Cell_cycle dbr:Cell_nucleus dbr:Cellular_model dbr:Cellular_respiration dbr:Chromosome_conformation_capture dbr:Biological_Data_Visualization dbr:Discrete_mathematics dbr:Educational_technology dbr:Flow_cytometry dbr:Germline dbr:Graph_theory dbr:Epithelial dbr:KEGG dbr:Master's_degree dbr:Protein_domain dbr:Protein_family dbr:Protein dbr:Quaternary_structure dbr:Regulation_of_gene_expression dbr:Species_richness dbr:Harvard_University dbr:Heuristics dbr:International_Society_for_Computational_Biology dbr:Terabyte dbr:The_Institute_for_Genomic_Research dbr:Speciation dbr:Artificial_intelligence dbr:Artificial_life dbr:Chemistry dbr:BioCompute_Object dbr:Biodiversity_informatics dbr:Bioimage_informatics dbr:Biological_computation dbr:Biological_data dbr:Biological_database dbr:Biological_network dbr:Swiss_Institute_of_Bioinformatics dbr:Systems_biology dbr:Hi-C_(genomic_analysis_technique) dbr:Hidden_Markov_model dbr:Hierarchical_clustering dbr:High-content_screening dbr:High-performance_Integrated_Virtual_Environment dbr:Homology_(biology) dbr:Homology_modeling dbr:Signal_transduction dbr:Tertiary_structure dbr:Service-orientation dbr:Directed_acyclic_graph dbr:Margaret_Oakley_Dayhoff dbr:Phylogenetic_tree dbr:Phylogenetics dbr:Speciesism dbr:Human_Genome_Project dbr:Human_Variome_Project dbr:Human_genome dbr:DNA_sequence dbr:Infertility dbr:Information_theory dbr:Insulin dbr:Intelligent_Systems_for_Molecular_Biology dbr:InterPro dbr:Metabolism dbr:Microbiome dbr:National_Institutes_of_Health dbr:New_York_Genome_Center dbr:Ontology_(information_science) dbr:Orange_(software) dbr:Organelle dbr:Canadian_Bioinformatics_Workshops dbr:REST dbr:Raspberry_Pi dbr:ChIA-PET dbr:Sequence_motif dbr:X-ray_crystallography dbr:Informatics_(academic_field) dbr:Sequence_homology dbr:Genbank dbr:Gene_finding dbr:Genome-wide_association_studies dbr:Genomes dbr:Markov_chain_Monte_Carlo dbr:Multiple_sequence_alignment dbr:Rosalind_(education_platform) dbr:Sequence_Read_Archive dbr:Serial_analysis_of_gene_expression dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Species dbr:Self-organizing_map dbr:Shotgun_sequencing dbr:Workflow_management_system dbr:Information_technologies dbr:European_Federation_for_Medical_Informatics dbr:Expressed_sequence_tag dbr:Computational_biomodeling dbr:Image_analysis dbr:Image_processing dbr:Immunohistochemistry dbr:In_silico dbr:Transmembrane_domain dbr:Srinivas_Aluru dbr:Evolutionary_biology dbr:Virtual_screening dbr:Named-entity_recognition dbr:Molecular_evolution dbr:Tissue_microarray dbr:Taxonomic_database dbr:Interdisciplinary dbr:Phi_X_174 dbr:Text_mining dbr:Endosymbiosis dbr:Soft_computing dbr:Owen_White dbr:Topologically_Associating_Domain dbr:Protein_sequences dbr:Protein_structural_alignment dbr:Protein–protein_docking dbr:Diagnostics dbr:Amino_acid_sequence dbr:Bayesian_analysis dbr:Secondary_structure dbr:Niche_modelling dbr:Open_code dbr:Signal_(information_theory) dbr:Regulatory_elements dbr:Software_tool dbr:Genome_assembly dbr:Molecular_systematics dbr:Bioinformatics_companies dbr:Bioinformatics_workflow_management_systems dbr:Sequence_alignment_software dbr:Primary_structure dbr:Ben_Hesper dbr:File:1kqf_opm.png dbr:File:Example_DNA_sequence.png dbr:File:Genome_viewer_screenshot_small.png dbr:File:MIcroarray_vs_RNA-Seq.png dbr:File:Muscle_alignment_view.png dbr:File:Sequencing_analysis_steps.png |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Biology_nav dbt:Branches_of_biology dbt:According_to_whom dbt:Authority_control dbt:Citation_needed dbt:Cite_journal dbt:Columns-list dbt:Commons_category-inline dbt:For dbt:Further dbt:IPAc-en dbt:ISBN dbt:Main dbt:Portal_bar dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Section_link dbt:See_also dbt:Short_description dbt:Spoken_Wikipedia dbt:Use_dmy_dates dbt:When dbt:Wikiversity-inline dbt:Wiktionary-inline dbt:Library_resources_box dbt:Genomics dbt:Computer_science dbt:Health_informatics dbt:Bioinformatics dbt:Informatics |
| dct:subject | dbc:Bioinformatics |
| rdf:type | owl:Thing dbo:MusicGenre |
| rdfs:comment | المعلوماتية الحيوية (بالإنجليزية: Bioinformatics) أو علم الأحياء الحاسوبي (بالإنجليزية: computational biology) هو استخدام أحدث تقنيات الرياضيات التطبيقية، المعلوماتية informatics، الإحصاء، وعلوم الحاسب لحل مشكلات بيولوجية حيوية. جهود الأبحاث الرئيسية في هذا الحقل تتضمن التراصف التسلسلي Sequence alignment، إيجاد المورثات، مشروع الجينوم البشري، تراصف البنية البروتينية protein structural alignment، تنبؤ البنية البروتينية protein structure prediction، التنبؤ بالتعبير الجيني gene expression، وتآثرات بروتين-بروتين، إضافة لنمذجة التطور. (ar) Bioinformatika je vědní disciplína, která se zabývá metodami pro shromažďování, analýzu a vizualizaci rozsáhlých souborů biologických dat, zejména dat molekulárně-biologických. Předmětem zájmu a používanými metodami se bioinformatika prolíná s dalšími příbuznými obory, např. molekulární biologií, genomikou, proteomikou, genetikou, , matematickou biologií, systémovou biologií, , , biomedicínským inženýrstvím, výpočetní chemií, informatikou a počítačovou lingvistikou. (cs) Η Βιολογία Συστημάτων είναι ένας τομέας που αναπτύχθηκε πολύ πρόσφατα, αλλά βρίσκει όλο και περισσότερους υποστηρικτές. Η γενική ιδέα αφορά την ερμηνεία διάφορων βιολογικών συμβάντων χρησιμοποιώντας τη θεωρία των συστημάτων. Η έννοια του συστήματος χρησιμοποιείται εδώ και πάρα πολλά χρόνια από πολλές διαφορετικές επιστήμες με ισχυρό μαθηματικό υπόβαθρο. Έτσι λοιπόν, η εισαγωγή μιας τέτοιας έννοιας στη βιολογία έδωσε νέα ώθηση στην κατανόηση διαφόρων δομών και λειτουργιών. Από τη μελέτη μεμονωμένων βιομορίων, η βιολογία συστημάτων έχει μετατοπίσει το ενδιαφέρον της στην ολοκληρωμένη μελέτη ομάδων βιομορίων τα συστατικά των οποίων αλληλεπιδρούν συνεργατικά για την εκτέλεση και ολοκλήρωση βιολογικών λειτουργιών. (el) Biokomputiko estas scienco inter biologio kaj komputiko. Ĝi estas apliko de komputiko al la studo de kompleksaj fenomenoj aŭ strukturoj kiel ekzemple genaroj, genoj, genetika kodo aŭ filogenetikaj arboj. Ankaŭ, per biokomputiko oni povas ekzemple modeligi kuracan molekulon ensilicie kaj antaŭplani ties konduton kaj eksperimenti pri ties ago ĉe ricevilo, kiun oni volas stimuli por kuraci iun malsanon... Ĝenerale tiaj studoj necesigas multnombrajn kaj kompleksajn kalkulojn, kiujn ne eblas fari sen komputilaj programoj kaj/aŭ matematikaj modeloj (>Matematika komputiko). (eo) Bioinformatika (bahasa Inggris: bioinformatics) adalah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Contoh topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen. (in) バイオインフォマティクス（英語：bioinformatics）とは、生命科学と情報科学の融合分野のひとつであり、DNAやRNA、タンパク質をはじめとする、生命が持つ様々な「情報」を対象に、情報科学や統計学などのアルゴリズムを用いた方法論やソフトウェアを開発し、またそれらを用いた分析から生命現象を解き明かしていく(in silico 解析)ことを目的とした学問分野である。そのためバイオインフォマティクスは広義には、生物学、コンピュータサイエンス、情報工学、数学、統計学といった様々な学問分野が組み合わさった学際分野自体を指す。日本語では生命情報科学や生物情報学、情報生命科学などと表記される。 ゲノミクス研究の初期においては、遺伝子予測等のゲノミクスに関する分野がバイオインフォマティクスの主要な対象であった。近年ではゲノムを超えて、ゲノムからの転写物の総体であるトランスクリプトームや、トランスクリプトーム（の一部）が翻訳されたタンパク質の総体であるプロテオーム、タンパク質の二次産物として合成される糖鎖の総体であるグライコーム、更にはゲノムからの直接的に転写・翻訳された実体だけではなく、代謝ネットワーク（代謝マップ）によって生じた代謝産物をも含めた総体を考えるメタボローム、生物個体の表現形の総体であるなど、バイオインフォマティクスが対象とする研究分野は生物学全体に拡大・発展しつつある。 (ja) La bioinformatica è una disciplina scientifica dedicata alla risoluzione di problemi biologici a livello molecolare con metodi informatici. (it) 계생명학(系生物學) 또는 시스템 생물학(Systems biology, SB)은 생명현상을 로 규정하고 생물학뿐만 아니라 전산학, 수학, 물리학, 화학 등의 원칙을 사용하여 분석하고 모사 발명하는 것을 목표로 하는 학문이다. 시스템 생물학은 최신 생물학의 한 갈래로 적 수리모델을 수립하고 경향을 탐구하려는 성격을 가지고 있다. (ko) 생물정보학(生物情報學), 흔히 바이오인포매틱스(bioinformatics)는 생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학 등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문이다. 전산생물학의 연구분야는 시스템즈 생물학과 중복되기도 한다. 주 연구분야는 서열정렬, 유전자 검색, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 단백질 구조 예측, 유전자발현의 예측, 단백질간 상호작용, 등 다양하다. (ko) システム生物学（システムせいぶつがく、システムバイオロジー、システムズバイオロジー、英語: systems biology）は、システム工学の考え方や解析手法を生物学に導入し、生命現象をシステムとして理解することを目的とする学問分野。 (ja) Bio-informatica is de wetenschap die tot doel heeft de biologische kennis te verrijken door kennis uit de informatica toe te passen op biologische data. De bio-informatica wordt gezien als een van de deelgebieden van medische informatiekunde, in de Engelstalige vakliteratuur Biomedical Informatics genoemd. Ook wordt het als belangrijk aspect van de theoretische of wiskundige biologie gezien. De term bio-informatica werd in Nederland voor het eerst gebruikt door Paulien Hogeweg en Ben Hesper. (nl) Bioinformatyka – interdyscyplinarna dziedzina łącząca nauki biologiczne i informatyczne. Obejmuje rozwój metod obliczeniowych służących do badania i symulacji struktury, funkcji i ewolucji genów, genomów i białek. Tworzy metody wykorzystywane do analizy i zarządzania informacji biologicznej gromadzonej w toku badań genomicznych oraz badań prowadzonych z zastosowaniem wysokoprzepustowych technik eksperymentalnych. Z bioinformatyką powiązane są: genomika, proteomika, lipidomika, metabolomika, transkryptomika i konektomika. W szerszym znaczeniu obejmuje także biokomputery i neuroinformatykę. (pl) Biologia systemów, biologia systemowa – dziedzina nauki zajmująca się systemami biologicznymi, takimi jak sieci interakcji białek lub sieci ścieżek metabolicznych. Stosuje narzędzia matematyczne, głównie z dziedziny teorii grafów, do badania cech systemów, analizowania właściwości ich komponentów i ich wpływu na działanie całej sieci, oraz modelowania systemów. Łączy informacje zdobywane przez dziedziny nauki takie jak: genomika, transkryptomika, proteomika, lipidomika i metabolomika. (pl) 生物信息學（英語：bioinformatics）利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据，其研究工具是计算机，研究方法包括对生物学数据的搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及利用（计算、模拟）。目前主要的研究方向有：序列比对、序列組裝、基因识别、基因重组、蛋白质结构预测、基因表达、的预测，以及建立。 生物学技术往往生成大量的。与数据挖掘类似，生物信息学利用数学工具从大量数据中提取有用的生物学信息。生物信息学所要处理的典型问题包括：重新組裝在霰弹枪定序法测序过程中被打散的DNA序列，从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构，利用mRNA微阵列或质谱仪的数据检验的假说。 某些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理；但是另外一些人认为计算生物学和生物信息学应当被当作不同的条目处理，因为生物信息学更侧重於生物学领域中计算方法的使用和发展，而计算生物学强调应用信息学技术对生物学领域中的假说进行检验，并尝试发展新的理论。 (zh) تمثل بيولوجيا النظم التحليل الحسابي والرياضي ونمذجة الأنظمة البيولوجية المعقدة. إنه مجال دراسي متعدد التخصصات قائم على علم الأحياء ويركز على التفاعلات المعقدة داخل الأنظمة البيولوجية، باستخدام نهج شامل (نهج كلاني بدلًا من النهج الاختزالي الأكثر تقليدية) في سبيل البحث البيولوجي. (ar) La biologia de sistemes és una branca de les ciències naturals que es centra en l'estudi sistemàtic de les interaccions complexes en els sistemes biològics. A diferència dels mètodes clàssics d'estudi usats en la biologia tradicional, la biologia de sistemes empra fonamentalment la modelització. Aquestes tècniques sorgeixen fonamentalment de l'ús de models matemàtics que descriuen el comportament del sistema en estudi. Els models permeten predir el comportament del procés com un sistema dinàmic, generalment tractat com una xarxa complexa, i comparar-lo amb les observacions experimentals. (ca) Systémová biologie je vědecký směr v biologii silně využívající přístupy dalších věd, především biochemie, chemie, informatiky a matematiky. Zabývá se studiem biologických funkcí a mechanizmů vzniklých následkem komplexních interakcí v biologických systémech. Systémová biologie pracuje s velkým množstvím biologických dat, začala se prudce rozvíjet po roce 2000 následkem rozvoje technologií pro získávání genomických a proteomických dat a zvýšení výkonu počítačů. (cs) Η βιοπληροφορική (bioinformatics) είναι ένα διεπιστημονικό πεδίο που αναπτύσσει μεθόδους και εργαλεία λογισμικού για την κατανόηση βιολογικών δεδομένων. Ως ένα διεπιστημονικό πεδίο της επιστήμης, η βιοπληροφορική συνδυάζει την υπολογιστική επιστήμη, τη στατιστική, τα μαθηματικά και τη μηχανική για να αναλύσει και να ερμηνεύσει βιολογικά δεδομένα. Η βιοπληροφορική έχει χρησιμοποιηθεί για in silico (υπολογιστικές) αναλύσεις βιολογικών ερωτημάτων χρησιμοποιώντας μαθηματικές και στατιστικές τεχνικές. (el) Die Bioinformatik (englisch bioinformatics, auch computational biology) ist eine interdisziplinäre Wissenschaft, die Probleme aus den Lebenswissenschaften mit theoretischen computergestützten Methoden löst. Sie hat zu grundlegenden Erkenntnissen der modernen Biologie und Medizin beigetragen. Bekanntheit in den Medien erreichte die Bioinformatik in erster Linie 2001 mit ihrem wesentlichen Beitrag zur Sequenzierung des menschlichen Genoms. (de) Bioinformatics (/ˌbaɪ.oʊˌɪnfərˈmætɪks/) is an interdisciplinary field that develops methods and software tools for understanding biological data, in particular when the data sets are large and complex. As an interdisciplinary field of science, bioinformatics combines biology, chemistry, physics, computer science, information engineering, mathematics and statistics to analyze and interpret the biological data. Bioinformatics has been used for in silico analyses of biological queries using computational and statistical techniques. (en) Die Systembiologie (Synonym: Systeomik, englisch systems biology, integrative biology oder predictive biology) ist ein Zweig der Biowissenschaften, der versucht, biologische Organismen in ihrer Gesamtheit zu verstehen. (de) La biología sistémica o biología de sistemas es el campo de investigación interdisciplinaria de los procesos biológicos en el que las interacciones de los elementos, internos y externos, que influyen en el desarrollo del proceso se representan con un sistema matemático. Este enfoque "holístico" o "global" permite comprender integradamente el funcionamiento de los sistemas (procesos) biológicos y profundizar en el entendimiento de cómo sus interacciones internas y con otros sistemas conllevan a la aparición (emergencia) de nuevas propiedades. Prácticamente cualquier proceso biológico puede ser objeto de estudio de la biología sistémica, como por ejemplo, el crecimiento de una célula, la interacción entre dos bacterias o la circulación sanguínea en un organismo. La biología sistémica comenz (es) Sistemen biologia prozesu biologiko konplexuen eredugintza eta analisi konputazionalari eta matematikoari deritzo. Biologian oinarritutako ezagutza-eremua da, sistema biologikoetan eragiten duten elementuen (kanpo- zein barne-elementuak) arteko elkarrekintzan ardazten dena. Ikerketa biologikoari heldutako ikuspegi holistiko honek sistema biologikoen funtzionamendua modu integratuan ulertzeaz gain, posiblea egiten du aipatutako kanpo- eta barne-elkarrekintzek dakarten propietate zein prozesu berrien agerpenean sakontzea. (eu) La bioinformática puede definirse, de manera general, como la aplicación de tecnologías computacionales y la estadística a la gestión y análisis de datos biológicos. Los términos bioinformática, biología computacional, informática biológica y, en ocasiones, biocomputación, son utilizados en muchas situaciones como sinónimos, y hacen referencia a campos de estudios interdisciplinares muy vinculados que requieren el uso o el desarrollo de diferentes técnicas estudiadas universitariamente en la Ingeniería Informática como ciencia aplicada de la disciplina informática. Entre estas pueden destacarse las siguientes: matemática aplicada, estadística, ciencias de la computación, inteligencia artificial, química y bioquímica con las que el Ingeniero Informático soluciona problemas al anal (es) Bioinformatika diziplinarteko jakintza esparru bat da, datu biologikoak ulertzeko software tresnak eta metodo informatikoak erabiltzen dituena. Biologia, informatika, matematika eta estatistika konbinatzen ditu datu biologikoak analizatu eta ulertzeko. (eu) La biologie des systèmes (ou biologie intégrative) est un domaine récent de la biologie qui étudie les organismes vivants comme les systèmes qu'ils sont en réalité, par opposition aux approches historiques qui tendent à décomposer l'étude à tous les niveaux, en biologie, physiologie, biochimie… La biologie systémique cherche à intégrer différents niveaux d'informations pour comprendre comment fonctionne réellement un système biologique. En étudiant les relations et les interactions entre différentes parties du système biologique (organites, cellules, systèmes physiologiques, réseaux de gènes et de protéines permettant la communication des cellules), le chercheur tente de former un modèle de fonctionnement de la totalité du système. Si la biologie des systèmes est un domaine théorisé à la f (fr) La bio-informatique, ou bioinformatique, est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie. Plus généralement, la bio-informatique est l'application de la statistique et de l'informatique à la science biologique. Le spécialiste qui travaille à mi-chemin entre ces sciences et l'informatique est appelé bioinformaticien ou bionaute. (fr) Biologi sistem adalah penggabungan dari beberapa cabang ilmu, seperti , biokimia, dan biologi molekuler. Ilmu biologi sistem bertujuan untuk mendapatkan pemahaman yang menyeluruh (holistik) terhadap makhluk hidup sebagai kesatuan sistem. Beberapa strategi yang dipilih dalam biologi sistem antara lain adalah pengukuran kuantitatif komponen seluler dalam tingkat mRNA, protein, dan metabolit, pengembangan model matematika yang menggabungkan pemahaman biokimia dengan data-data yang dihasilkan oleh eksperimen dengan hasil data bervolume tinggi, aplikasi mikroorganisme. Karena yang dianalisis merupakan data bervolume tinggi, dibutuhkan semacam perangkat mutakhir untuk mengolah, menganalisis, memvisualisasi, dan mensimulasikan data tersebut. Oleh karena itu, pengembangan ilmu bioinformatika berpe (in) La biologia dei sistemi è una disciplina biologica che studia gli organismi viventi in quanto sistemi che si evolvono nel tempo, ossia nell'interazione dinamica delle parti di cui sono composti. In particolare questo obiettivo viene conseguito tramite l'integrazione di modelli dinamici e dei risultati di differenti esperimenti ad alto rendimento (high-throughput), unendo nella pratica per esempio le conoscenze di genomica, proteomica, trascrittomica e di teoria dei sistemi dinamici. (it) Systeembiologie (Engels: systems biology) is de wetenschap die biologische systemen op het niveau van de cel bestudeert als een geheel. Hoewel de term 'systems biology' vaak gebruikt wordt in wetenschappelijke literatuur, is er nog geen eenduidige, algemeen aanvaarde definitie van systeembiologie. Biologische systemen bestaan uit vele componenten, zoals genen, eiwitten en metabolieten. In de systeembiologie gaat het niet alleen om de functie van al deze componenten, maar vooral ook om de dynamische interacties tussen al deze componenten. (nl) Bioinformática é um campo interdisciplinar que corresponde à aplicação das técnicas da informática, no sentido de análise da informação, nas áreas de estudo da biologia. Como um campo interdisciplinar da ciência, a bioinformática combina a biologia, ciência da computação, estatística, matemática e engenharia para analisar, interpretar e processar dados biológicos. A bioinformática vem sendo utilizada para análises in silico de questões biológicas utilizando técnicas de matemática e estatística. Uma das maiores conquistas da bioinformática foi o mapeamento completo do . (pt) Биоинформа́тика — междисциплинарная область, объединяющая общую биологию, молекулярную биологию, кибернетику, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику. Крупномасштабные биологические проблемы, требующие анализа больших объемов данных, решаются биоинформатикой с вычислительной точки зрения. Биоинформатика главным образом включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных. (ru) Систе́мная биоло́гия — междисциплинарное научное направление, образовавшееся на стыке биологии и теории сложных систем, ориентированное на изучение сложных взаимодействий в живых системах. Впервые термин используется в статье 1993 года авторов W. Zieglgänsberger и TR. Tölle . Широкое распространение термин «системная биология» получил после 2000 года. Понимание (англ. insight) биологии на системном уровне даёт возможность для более верного осмысления структуры, динамики и функций как отдельной клетки, так и организма в целом, чем при рассмотрении по-отдельности частей клетки или организма. (ru) Biologia sistémica (português europeu) ou Biologia Sistêmica (português brasileiro), ou mesmo biologia de sistemas, é a averiguação do intercâmbio entre os "componentes" (elementos, entidades) de um Sistema Biológico, e como essas influências mútuas conduzem à manifestação de funções (capacidades) e comportamentos do sistema em tese, tituladas de , do inglês emergent properties. (pt) Bioinformatik är en tvärvetenskaplig disciplin där algoritmer för analys av biologiska (särskilt molekylärbiologi) data utvecklas. Man använder också termen synonymt med engelskans computational biology. Ursprungligen myntades begreppet för studiet av informatiska processer i biotiska system av Professor Paulien Hogeweg vid Universitetet i Utrecht, Nederländerna. Idag används begreppet fritt för att omfatta all forskning där datorberäkningar används för att analysera molekylärbiologiska data. Bioinformatiken inbegriper vitt skilda delområden, till exempel: (sv) Systembiologi är ett relativt nytt biologiskt studieområde som fokuserar på systematiskt studium av komplexa samspel i . Man utgår alltså ifrån ett nytt perspektiv där man utgår ifrån att helheten är mer än summan av beståndsdelarna. Detta kan jämföras med det tidigare förhärskande synsättet, reduktionism, där man utgår ifrån att ett system helt och hållet kan beskrivas i termer av sina beståndsdelar. (sv) Біоінформа́тика — галузь обчислювальної біології, що застосовує машинні алгоритми і статистичні методи для аналізу великих наборів біологічних даних, які, як правило, складаються з великого числа нуклеотидних (ДНК і РНК) та пептидних (білки) послідовностей і даних структури білків. Головні напрямки досліджень біоінформатики включають вирівнювання послідовностей, , збірку геномів, білків, передбачення структури білків, передбачення експресії генів та білок-білкової взаємодії та реконструювання процесу еволюції. Великим напрямком досліджень біоінформатики є отримання високоякісних послідовностей геномів з фрагментів послідовностей, отриманих за допомогою традиційних методів секвенування ДНК та конструювання сигнальних мереж за даними ДНК-мікрочипів. В останньому випадку біоінформатика нерід (uk) 系统生物学（systems biology），是一个使用整体论（而非还原论）的方式， 整合不同学科、层次的信息，以研究、分析、理解（即整合分析）生物系统如何行使功能的学术领域。系统生物学通过研究各个生物系统内部所有组成成分间，各分子层面上的相互关系和相互作用（例如，与细胞信号传送、代谢通路、细胞器、细胞、与生物等相关的基因和蛋白网络），期望最终能够建立整个系统的可理解模型，以及为有机体绘制完整图谱。系统生物学使用计算机模拟，数学分析的方法来构建复杂生物系统的模型。 系统生物学不同于以往只注意个别的基因和蛋白质的，研究所有的基因、所有的蛋白质和组分间的所有相互关系；其目标是：对复杂的生物系统构建计算的数学模型，从总体上预测生物系统的真实性。特别是从2000年开始，这个概念在各种环境下被广泛用于生物学。人类基因组计划是生物学中应用系统思维的一个例子，它导致新的合作的方式来处理在遗传学生物学领域的问题。系统生物学的目标之一是模拟和发现涌现的特性，细胞的，组织的和生物体的特性，作为一个系统，其理论描述只能用系统生物学的技术进行。这些通常涉及代谢网络或细胞信号传送网络。 (zh) Системна біологія — наукова дисципліна, що утворилася внаслідок перетину біології та теорії складних систем. Уперше термін був використаний 1993 року в статті авторів W. Zieglgänsberger і TR. Tölle. Системна біологія є міждисциплінарною наукою про життя. Спрямована на вивчення складних взаємодій в живих системах. Використовує новий підхід в біології: холізм замість редукціонізму. Основна увага в системній біології приділяється емерджентним властивостям, тобто властивостями біологічних систем, які неможливо пояснити тільки з точки зору властивостей її компонентів. Таким чином завданнями системної біології є дослідження та моделювання властивостей складних біологічних систем, які не можна пояснити сумою властивостей її складових. (uk) |
| rdfs:label | Bioinformatics (en) علم أنظمة الأحياء (ar) معلوماتية حيوية (ar) Bioinformàtica (ca) Biologia de sistemes (ca) Systémová biologie (cs) Bioinformatika (cs) Bioinformatik (de) Systembiologie (de) Βιοπληροφορική (el) Βιολογία συστημάτων (el) Biokomputiko (eo) Bioinformática (es) Biología de sistemas (es) Bioinformatika (eu) Sistemen biologia (eu) Biologi sistem (in) Bioinformatika (in) Bio-informatique (fr) Biologia dei sistemi (it) Bioinformatica (it) Biologie des systèmes (fr) システム生物学 (ja) バイオインフォマティクス (ja) 시스템 생물학 (ko) 생물정보학 (ko) Systeembiologie (nl) Bio-informatica (nl) Biologia systemów (pl) Bioinformatyka (pl) Biologia sistêmica (pt) Системная биология (ru) Bioinformática (pt) Биоинформатика (ru) Bioinformatik (sv) Systembiologi (sv) 系统生物学 (zh) Біоінформатика (uk) 生物信息学 (zh) Системна біологія (uk) |
| rdfs:seeAlso | dbr:Structural_motif dbr:Sequence_analysis |
| owl:sameAs | freebase:Bioinformatics http://d-nb.info/gnd/4809615-5 http://sw.cyc.com/concept/Mx4r2GnTUd-xSjiSey5NScw76Q http://d-nb.info/gnd/4611085-9 wikidata:Bioinformatics wikidata:Bioinformatics dbpedia-ar:Bioinformatics dbpedia-ar:Bioinformatics http://arz.dbpedia.org/resource/معلوماتيه_حيويه dbpedia-az:Bioinformatics dbpedia-az:Bioinformatics dbpedia-be:Bioinformatics dbpedia-bg:Bioinformatics dbpedia-bg:Bioinformatics http://bn.dbpedia.org/resource/জৈব_তথ্যবিজ্ঞান http://bn.dbpedia.org/resource/সাংগঠনিক_জীববিদ্যা http://bs.dbpedia.org/resource/Bioinformatika dbpedia-ca:Bioinformatics dbpedia-ca:Bioinformatics http://ckb.dbpedia.org/resource/زیندەزانیارییەکان dbpedia-cs:Bioinformatics dbpedia-cs:Bioinformatics dbpedia-da:Bioinformatics dbpedia-de:Bioinformatics dbpedia-de:Bioinformatics dbpedia-el:Bioinformatics dbpedia-el:Bioinformatics dbpedia-eo:Bioinformatics dbpedia-es:Bioinformatics dbpedia-es:Bioinformatics dbpedia-et:Bioinformatics dbpedia-et:Bioinformatics dbpedia-eu:Bioinformatics dbpedia-eu:Bioinformatics dbpedia-fa:Bioinformatics dbpedia-fa:Bioinformatics dbpedia-fi:Bioinformatics dbpedia-fi:Bioinformatics dbpedia-fr:Bioinformatics dbpedia-fr:Bioinformatics dbpedia-gl:Bioinformatics dbpedia-gl:Bioinformatics dbpedia-he:Bioinformatics dbpedia-he:Bioinformatics http://hi.dbpedia.org/resource/जैव_सूचना_विज्ञान http://hi.dbpedia.org/resource/सिस्टम्स_बायोलॉजी dbpedia-hr:Bioinformatics dbpedia-hu:Bioinformatics dbpedia-hu:Bioinformatics http://hy.dbpedia.org/resource/Կենսաինֆորմատիկա dbpedia-id:Bioinformatics dbpedia-id:Bioinformatics dbpedia-io:Bioinformatics dbpedia-is:Bioinformatics dbpedia-it:Bioinformatics dbpedia-it:Bioinformatics dbpedia-ja:Bioinformatics dbpedia-ja:Bioinformatics http://jv.dbpedia.org/resource/Bioinformatika dbpedia-kk:Bioinformatics http://kn.dbpedia.org/resource/ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ dbpedia-ko:Bioinformatics dbpedia-ko:Bioinformatics dbpedia-la:Bioinformatics dbpedia-lb:Bioinformatics http://li.dbpedia.org/resource/Bioinformatica http://lv.dbpedia.org/resource/Bioinformātika dbpedia-mk:Bioinformatics dbpedia-mk:Bioinformatics http://ml.dbpedia.org/resource/ബയോ_ഇൻഫർമാറ്റിക്സ് http://mn.dbpedia.org/resource/Биоинформатик dbpedia-ms:Bioinformatics dbpedia-nl:Bioinformatics dbpedia-nl:Bioinformatics dbpedia-nn:Bioinformatics dbpedia-no:Bioinformatics dbpedia-oc:Bioinformatics dbpedia-pl:Bioinformatics dbpedia-pl:Bioinformatics dbpedia-pt:Bioinformatics dbpedia-pt:Bioinformatics dbpedia-ro:Bioinformatics dbpedia-ro:Bioinformatics dbpedia-ru:Bioinformatics dbpedia-ru:Bioinformatics dbpedia-sh:Bioinformatics dbpedia-sh:Bioinformatics dbpedia-simple:Bioinformatics dbpedia-sk:Bioinformatics dbpedia-sk:Bioinformatics dbpedia-sl:Bioinformatics dbpedia-sq:Bioinformatics dbpedia-sr:Bioinformatics dbpedia-sr:Bioinformatics dbpedia-sv:Bioinformatics dbpedia-sv:Bioinformatics http://ta.dbpedia.org/resource/உயிர்_தகவலியல் http://ta.dbpedia.org/resource/தொகுப்பியக்க_உயிரியல் dbpedia-th:Bioinformatics dbpedia-th:Bioinformatics http://tl.dbpedia.org/resource/Biyoimpormatika dbpedia-tr:Bioinformatics dbpedia-tr:Bioinformatics dbpedia-uk:Bioinformatics dbpedia-uk:Bioinformatics http://ur.dbpedia.org/resource/حیاتی_اطلاعیات dbpedia-vi:Bioinformatics dbpedia-vi:Bioinformatics dbpedia-war:Bioinformatics http://yi.dbpedia.org/resource/ביאאינפארמאטיק dbpedia-zh:Bioinformatics dbpedia-zh:Bioinformatics https://global.dbpedia.org/id/K5aM |
| skos:broadMatch | http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/genome-informatics |
| skos:closeMatch | http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/bioinformatics http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/computational-biology-and-bioinformatics |
| skos:relatedMatch | http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/functional-clustering |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Bioinformatics?oldid=1123990252&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/1kqf_opm.png wiki-commons:Special:FilePath/Example_DNA_sequence.png wiki-commons:Special:FilePath/Genome_viewer_screenshot_small.png wiki-commons:Special:FilePath/MIcroarray_vs_RNA-Seq.png wiki-commons:Special:FilePath/Muscle_alignment_view.png wiki-commons:Special:FilePath/Sequencing_analysis_steps.png wiki-commons:Special:FilePath/The_protein_interaction_network_of_Treponema_pallidum.png wiki-commons:Special:FilePath/WPP_domain_alignment.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Bioinformatics |
| is dbo:academicDiscipline of | dbr:Carole_Goble dbr:Carolyn_Lawrence-Dill dbr:Ami_Bhatt dbr:Robert_Stevens_(scientist) dbr:Ron_Shamir dbr:Ross_Overbeek dbr:Sarah_Teichmann dbr:Tim_Hubbard dbr:Barry_H._Honig dbr:Blaž_Zupan dbr:Bonnie_Ann_Wallace dbr:David_Horn_(Israeli_physicist) dbr:David_J._Lipman dbr:David_S._Wishart dbr:David_Sankoff dbr:David_Tudor_Jones dbr:Desmond_G._Higgins dbr:Alfonso_Valencia dbr:Annie_Antón dbr:Houman_Younessi dbr:Jotun_Hein dbr:Julian_Gough_(scientist) dbr:Julian_Parkhill dbr:Julio_Collado-Vides dbr:Patricia_Babbitt dbr:Paulien_Hogeweg dbr:Pedro_Pedrosa_Mendes dbr:Peter_Karp_(scientist) dbr:Richard_M._Durbin dbr:Rita_Casadio dbr:Charles_Lawrence_(mathematician) dbr:Ulisses_Braga_Neto dbr:Vasant_Honavar dbr:Vinod_Scaria dbr:Deanna_M._Church dbr:Debora_Marks dbr:Duncan_Odom dbr:EMBnet dbr:PLOS_Computational_Biology dbr:Kenneth_H._Wolfe__Ken_Wolfe__1 dbr:Anders_Krogh dbr:Cheng_Xiang_Zhai dbr:Pavel_A._Pevzner dbr:Source_Code_for_Biology_and_Medicine dbr:Victor_V._Solovyev dbr:Shamkant_Navathe dbr:Christine_Orengo dbr:Christoph_Steinbeck dbr:Christophe_Dessimoz dbr:Christos_Ouzounis dbr:Alexander_Zelikovsky dbr:Edward_R._Dougherty dbr:Edward_Trifonov dbr:Elliot_McVeigh dbr:Gajendra_Pal_Singh_Raghava dbr:Gary_Stormo dbr:Gaston_Gonnet dbr:Gonçalo_Abecasis dbr:Minoru_Kanehisa dbr:Mona_Singh_(scientist) dbr:N._Gautham dbr:Thomas_Lengauer dbr:Dan_Hultmark dbr:Andreas_Dräger dbr:Andrew_Kasarskis dbr:Antoine_Danchin dbr:Lincoln_Stein dbr:Lior_Pachter dbr:Lukasz_Kurgan dbr:Stefano_Lonardi dbr:Stephen_Altschul dbr:Steve_Pettifer dbr:Zhiping_Weng dbr:Ziv_Bar-Joseph dbr:Mathieu_Blanchette_(computational_biologist) dbr:Aviv_Regev dbr:Burkhard_Rost dbr:Tom_Blundell dbr:Trevor_Hastie dbr:Database_(journal) dbr:Warren_Lyford_DeLano dbr:Webb_Miller dbr:Joel_Dudley dbr:Ming_Li dbr:Minnie_Sarwal dbr:Nikos_Kyrpides dbr:Veronica_Dahl dbr:A._Murat_Eren dbr:Adriano_Schneider dbr:Alan_C._Ashton dbr:Alex_Bateman dbr:Alicia_Oshlack dbr:Amos_Bairoch dbr:Daniel_P._Miranker dbr:Eran_Elhaik dbr:Erich_Bornberg-Bauer dbr:Eugene_Myers dbr:Ewan_Birney dbr:Andy_Brass dbr:Briefings_in_Bioinformatics dbr:Nicolas_Le_Novère dbr:Pardis_Sabeti dbr:Daniel_Janies dbr:Diether_Lambrechts dbr:Hanah_Margalit dbr:Ludmil_Alexandrov dbr:Helen_M._Berman dbr:Atul_Butte dbr:Janet_Kelso dbr:Janet_Thornton dbr:Terri_Attwood dbr:Terry_Speed dbr:Hákon_Hákonarson_(scientist) dbr:Jennifer_Gardy dbr:Advances_and_Applications_in_Bioinformatics_and_Chemistry dbr:Chitra_Dutta dbr:Alana_Alexander dbr:John_B._Hogenesch dbr:Kayhan_Erciyeş dbr:Kenneth_W._Kinzler dbr:Lawrence_Hunter dbr:Laxmi_Parida dbr:BioData_Mining dbr:Bioinformatics_and_Biology_Insights dbr:Susan_R._Wilson dbr:Søren_Brunak dbr:Tyra_Wolfsberg dbr:Don_R._Swanson dbr:BMC_Bioinformatics dbr:Manuel_Corpas_(scientist) dbr:Marco_Ramoni dbr:Margaret_Oakley_Dayhoff dbr:Mark_B._Gerstein dbr:Mark_Borodovsky dbr:Mark_Pallen dbr:Martin_Vingron dbr:Bonnie_Berger dbr:Philip_Bourne dbr:Michael_Ashburner dbr:Michael_Sternberg dbr:Mikhail_Gelfand dbr:Cathy_H._Wu dbr:Sepp_Hochreiter dbr:Christoph_Bock dbr:Nick_Goldman dbr:Toby_Gibson dbr:Tracy_Teal dbr:Olga_Troyanskaya dbr:Russell_Greiner dbr:Ruth_Nussinov dbr:Srinivas_Aluru dbr:Sean_Eddy dbr:Rolf_Apweiler dbr:Pierre_Baldi dbr:Sorin_Draghici dbr:Waldemar_W._Koczkodaj dbr:Owen_White dbr:Warren_Gish dbr:Vineet_Bafna dbr:Yaniv_Erlich dbr:Wojciech_Karlowski |
| is dbo:education of | dbr:Laurène_Meyniel-Schicklin |
| is dbo:genre of | dbr:ProteoWizard dbr:MacVector dbr:Beacon_designer dbr:BioBIKE dbr:BioJS dbr:BioJava dbr:BioPerl dbr:BioRuby dbr:Bioclipse dbr:Bioconductor dbr:Biopython dbr:Bowtie_(sequence_analysis) dbr:AlleleID dbr:DNADynamo dbr:Unipept dbr:ViennaRNA_Package dbr:.NET_Bio dbr:Comparative_Toxicogenomics_Database dbr:Mascot_(software) dbr:Mega2,_the_Manipulation_Environment_for_Genetic_Analysis dbr:SAMtools dbr:OLIGO_Primer_Analysis_Software dbr:GLIMMER dbr:GenGIS dbr:GenMAPP dbr:Molecular_Evolutionary_Genetics_Analysis dbr:Consed dbr:OrthoFinder dbr:Apache_cTAKES dbr:MG-RAST dbr:Skyline_(software) dbr:Staden_Package dbr:Dendroscope dbr:SPAdes_(software) dbr:BLAST_(biotechnology) dbr:CS-BLAST dbr:Trans-Proteomic_Pipeline dbr:Treefinder dbr:UGENE dbr:GENSCAN dbr:DAVID dbr:DECIPHER_(software) dbr:Database_of_Molecular_Motions dbr:PSIPRED dbr:FlyExpress dbr:HH-suite dbr:HMMER dbr:Archaeopteryx_(software) dbr:AMPHORA dbr:AMRFinderPlus dbr:CheShift dbr:Chemistry_Development_Kit dbr:BioNumerics dbr:BioPHP dbr:CodonCode_Aligner dbr:TimeTree dbr:Phyloscan dbr:Phyre dbr:Metascape dbr:Netprimer dbr:Newbler dbr:OpenChrom dbr:OpenMS dbr:RaptorX dbr:XCMS_Online dbr:Yass_(software) dbr:MEGAN dbr:FASTA dbr:Giant_Virus_Finder dbr:Primer_Premier dbr:SplitsTree dbr:Sequerome |
| is dbo:industry of | dbr:Genedata dbr:Genomatix dbr:Genostar dbr:Cofactor_Genomics dbr:Applied_Maths dbr:Ovid_Technologies dbr:DNASTAR dbr:Korean_Bioinformation_Center dbr:AstridBio dbr:Chemical_Computing_Group dbr:BioBam_Bioinformatics dbr:Dotmatics dbr:CLC_bio dbr:TimeLogic dbr:Biobase_(company)__BIOBASE_GmbH__1 dbr:Biomax_Informatics__AG__1 |
| is dbo:knownFor of | dbr:Ron_Shamir dbr:Melissa_Haendel dbr:Paulien_Hogeweg dbr:Robert_Ledley dbr:Wentian_Li dbr:Chris_Sander_(scientist) dbr:Reidun_Twarock dbr:Heng_Li dbr:Ajit_Johnson dbr:John_Quackenbush dbr:Gregory_Stephanopoulos dbr:Jennifer_Gardy dbr:Rameshwar_Nath_Koul_Bamezai dbr:Susan_B._Davidson dbr:Sorin_Draghici dbr:Ritam_Chowdhury |
| is dbo:occupation of | dbr:Imogen_Wright |
| is dbo:person of | dbr:UC_Santa_Cruz_Genomics_Institute__PersonFunction__2 |
| is dbo:product of | dbr:ATUM dbr:NantWorks dbr:Canadian_Bioinformatics_Workshops |
| is dbo:service of | dbr:PubGene dbr:Centre_for_Applied_Genomics |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Bioinformatics,_LLC dbr:Biological_ontologies dbr:Bioinformatic dbr:Free_open_source_bioinformatics_projects dbr:History_of_bioinformatics dbr:Introduction_to_bioinformatics dbr:JBrowse dbr:Bioinformatics_and_Engineering dbr:Genetic_informatics dbr:Bio-informatics dbr:Bio_informatics dbr:Bioinformatic_pipeline dbr:Bioinformatician dbr:Bioinformaticians dbr:Bioinformatist dbr:Bioinformatrics dbr:Bioinformics dbr:Biomedical_computation dbr:Biotechnological_application_of_computer |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:California_State_University,_East_Bay dbr:Capital_University_of_Science_&_Technology dbr:Carnegie_Mellon_University dbr:Carole_Goble dbr:Caroline_Buckee dbr:Carolyn_Lawrence-Dill dbr:Ami_Bhatt dbr:Bayesian_inference dbr:Belgrade_IT_sector dbr:Pramod_P._Wangikar dbr:Pravindra_Kumar dbr:PrecisionFDA dbr:Protein_design dbr:ProteoWizard dbr:Pseudomon-groES_RNA_motif dbr:Pseudomonas_sRNA dbr:QFAB_Bioinformatics dbr:QIAGEN_Silicon_Valley dbr:Quaid-i-Azam_University dbr:Quaternion dbr:Robert_Stevens_(scientist) dbr:Robert_Tibshirani dbr:Robyn_Scott dbr:Rochester_Institute_of_Technology dbr:Roderic_D._M._Page dbr:Ron_Shamir dbr:Ross_D._King dbr:Ross_Overbeek dbr:Rsa_RNA dbr:Samuel_Karlin dbr:Sanjeev_Galande dbr:Santasabuj_Das dbr:Sarah_Ann_Douglas dbr:Sarah_Teichmann dbr:Sarawak_Biodiversity_Centre dbr:Satoru_Miyano dbr:SbcD_RNA_motif dbr:Science dbr:Enrichment_factor dbr:Enterobacteria_greA_leader dbr:Enterobacteria_rnk_leader dbr:Epigenetics dbr:Epigenomics dbr:Epitranscriptomic_sequencing dbr:List_of_University_of_Colorado_Boulder_alumni dbr:List_of_academic_databases_and_search_engines dbr:List_of_academic_fields dbr:List_of_acronyms:_B dbr:List_of_awards_in_bioinformatics_and_computational_biology dbr:List_of_bioinformatics_companies dbr:List_of_bioinformatics_institutions dbr:List_of_bioinformatics_journals dbr:List_of_bioinformatics_software dbr:List_of_biophysicists dbr:List_of_computer_science_conferences dbr:List_of_computer_scientists dbr:List_of_fields_of_doctoral_studies_in_the_United_States dbr:List_of_free_and_open-source_software_organizations dbr:List_of_genetic_algorithm_applications dbr:List_of_geneticists dbr:MUMmer dbr:Meral_Özsoyoglu dbr:Metamorphic_testing dbr:Michael_Levin_(biologist) dbr:Moco-II_RNA_motif dbr:National_Microbiology_Laboratory dbr:Non-negative_matrix_factorization dbr:Numerical_linear_algebra dbr:MIF4GD dbr:MIPOL1 dbr:MUBII-TB-DB dbr:MacVector dbr:Melissa_Haendel dbr:MetaboMiner dbr:Metabolic_network_modelling dbr:Metagenomics dbr:Mexican_International_Conference_on_Artificial_Intelligence dbr:Virtual_biobank dbr:Ontario_Institute_for_Cancer_Research dbr:Ontology-based_data_integration dbr:Open_Biology dbr:Particle_filter dbr:Pathogenomics dbr:Bioinformatics,_LLC dbr:SADI dbr:Tim_Hubbard dbr:Probabilistic_latent_semantic_analysis dbr:Barry_H._Honig dbr:Basel_Computational_Biology_Conference dbr:Bashiru_Aremu dbr:Beacon_designer dbr:Bell_Labs dbr:Bernadette_Bensaude-Vincent dbr:Bhubaneswar_Mishra dbr:Binary_logarithm dbr:Bio-inspired_computing dbr:BioBIKE dbr:BioJS dbr:BioJava dbr:BioLinux dbr:BioMaPS_Institute_for_Quantitative_Biology dbr:BioPerl dbr:BioRuby dbr:BioRxiv dbr:BioSLAX dbr:Bio_360_Life_Sciences_Park dbr:Bioclipse dbr:Biocomplexity_Institute_of_Virginia_Tech dbr:Bioconductor dbr:Bioinformatics_Open_Source_Conference dbr:Bioinformatics_workflow_management_system dbr:Biological_ontologies dbr:Biology dbr:Biomedicine dbr:Biopython dbr:Biosophy dbr:Biostatistics dbr:Birkbeck,_University_of_London dbr:Blast2GO dbr:Blaž_Zupan dbr:Bonnie_Ann_Wallace dbr:Book_embedding dbr:Bose_Institute dbr:Bowtie_(sequence_analysis) dbr:David_Eisenberg dbr:David_Fenyő dbr:David_Haussler dbr:David_Horn_(Israeli_physicist) dbr:David_J._Lipman dbr:David_S._Wishart dbr:David_Sankoff dbr:David_Tudor_Jones dbr:De_Bruijn_graph dbr:Debasisa_Mohanty dbr:Degeneracy_(graph_theory) dbr:Delaware_Biotechnology_Institute dbr:Department_of_Computer_Science,_University_of_Manchester dbr:Department_of_Management_Sciences_(PUMBA) dbr:Desmond_Fitzgerald_(professor) dbr:Desmond_G._Higgins dbr:Detlef_Weigel dbr:Alfonso_Valencia dbr:Algorithmic_inference dbr:Alignment-free_sequence_analysis dbr:Alison_Butler dbr:Alistair_Forrest dbr:AlleleID dbr:Andrew_J._Roger dbr:Anna_Maria_Di_Sciullo dbr:Anna_University_K_B_Chandrasekhar_Research_Centre dbr:Anne_Condon dbr:Annie_Antón dbr:Applied_Biosystems dbr:Arabidopsis dbr:Holkar_Science_College dbr:Houman_Younessi dbr:Human_brain dbr:Hunter_R._Rawlings_III dbr:Joshua_Lederberg dbr:Jotun_Hein dbr:Journal_of_Cell_and_Molecular_Biology dbr:Julian_Gough_(scientist) dbr:Julian_Parkhill dbr:Julio_Collado-Vides dbr:Betweenness dbr:Bibliome dbr:List_of_Missouri_University_of_Science_and_Technology_alumni dbr:List_of_Shanti_Swarup_Bhatnagar_Prize_recipients dbr:List_of_University_of_Georgia_people dbr:List_of_female_fellows_of_the_Royal_Society dbr:List_of_people_considered_father_or_mother_of_a_scientific_field dbr:Pathema dbr:Patricia_Babbitt dbr:Paulien_Hogeweg dbr:Pedro_Pedrosa_Mendes dbr:Pegasus_(workflow_management) dbr:Penn_State_University_College_of_Medicine dbr:Perl dbr:Personal_genomics dbr:Peter_Karp_(scientist) dbr:Peter_Kiewit_Institute dbr:Peter_Kollman dbr:Reid_Robison dbr:Research_Institute_of_Computer_Science_and_Random_Systems dbr:Research_in_Computational_Molecular_Biology dbr:Ribosomal_protein_L21_leader dbr:Riboswitch dbr:Richard_M._Durbin dbr:Richard_M._Karp dbr:Rita_Casadio dbr:Rita_R._Colwell dbr:Robert_Arp dbr:Robert_Ledley dbr:Charles_Lawrence_(mathematician) dbr:Cyano-2_RNA_motif dbr:Cycle_basis dbr:DIMPL dbr:DNA dbr:DNADynamo dbr:DNA_and_RNA_codon_tables dbr:DNA_barcoding dbr:DNA_binding_site dbr:DNA_microarray dbr:DNA_nanoball_sequencing dbr:DNA_sequencing_theory dbr:UTOPIA_(bioinformatics_tools) dbr:Ujjwal_Maulik dbr:Ulisses_Braga_Neto dbr:Ulrike_Sattler dbr:UniProt dbr:Unipept dbr:Universidad_Argentina_de_la_Empresa dbr:University_of_Agriculture,_Faisalabad dbr:University_of_Aveiro dbr:University_of_Development_Alternative dbr:University_of_Freiburg_Faculty_of_Biology dbr:University_of_Georgia dbr:University_of_Guadalajara dbr:University_of_Haifa dbr:University_of_Kalyani dbr:University_of_North_Carolina_at_Charlotte dbr:University_of_Tennessee_College_of_Medicine dbr:University_of_Texas_at_San_Antonio_College_of_Sciences dbr:University_of_Trás-os-Montes_and_Alto_Douro dbr:University_of_Zaragoza dbr:C11orf1 dbr:C3orf67 dbr:C9orf64 dbr:Variant_Call_Format dbr:Vasant_Honavar dbr:Vector_NTI dbr:ViennaRNA_Package dbr:Vilnius dbr:Vinod_Scaria dbr:Virginia_Tech dbr:Viridos_(company) dbr:Vladimir_Kapitonov dbr:David_R._Cheriton_School_of_Computer_Science dbr:Deanna_M._Church dbr:Debora_Marks dbr:Deccan_Park_(building) dbr:Deep_learning dbr:Donald_Danforth_Plant_Science_Center dbr:Doreen_Main dbr:Dot_plot_(bioinformatics) dbr:Downstream-peptide_motif dbr:Duncan_Odom dbr:Dynamic_Bayesian_network dbr:E-Science dbr:ELIXIR dbr:EMBOSS dbr:EMBnet dbr:Earth_Microbiome_Project dbr:Ina_Koch dbr:Index_of_biochemistry_articles dbr:Index_of_biodiversity_articles dbr:Index_of_biomedical_engineering_articles dbr:Index_of_biotechnology_articles dbr:Index_of_chemical_engineering_articles dbr:Index_of_chemistry_articles dbr:Index_of_conservation_articles dbr:Index_of_genetics_articles dbr:Indifference_graph dbr:Induction_of_regular_languages dbr:Inductive_logic_programming dbr:Infection,_Genetics_and_Evolution dbr:Inferring_horizontal_gene_transfer dbr:Information_engineering_(field) dbr:Information_ethics dbr:Information_system dbr:Inheritance_(genetic_algorithm) dbr:Institute_of_Arctic_Biology dbr:Institute_of_Bioinformatics_and_Biotechnology dbr:Institute_of_Microbial_Technology dbr:Integrated_DNA_Technologies dbr:Integrative_bioinformatics dbr:Interactome dbr:Interdisciplinarity dbr:Interferome dbr:International_Conference_on_Pattern_Recognition_in_Bioinformatics dbr:International_Human_Epigenome_Consortium dbr:International_Journal_of_Biomathematics dbr:International_Journal_of_Software_and_Informatics dbr:International_Max_Planck_Research_Scho..._Molecular_and_Cellular_Life_Sciences dbr:International_Nucleotide_Sequence_Database_Collaboration dbr:International_Protein_Index dbr:Interolog dbr:Invitrogen dbr:Jacques_Fellay dbr:Jane_Grogan dbr:Kyle_Biggar dbr:Sequence_alignment dbr:Structural_alignment dbr:Libertas_Academica dbr:Lie dbr:Lie-to-children dbr:Liliana_M._Dávalos dbr:List_of_independent_research_organisations_in_the_United_Kingdom dbr:List_of_life_sciences dbr:List_of_named_matrices |
| is dbp:data of | dbr:SNP_annotation dbr:Gene_Disease_Database |
| is dbp:discipline of | dbr:EMBnet dbr:PLOS_Computational_Biology dbr:Source_Code_for_Biology_and_Medicine dbr:Journal_of_Biomedical_Informatics dbr:Database_(journal) dbr:Briefings_in_Bioinformatics dbr:Advances_and_Applications_in_Bioinformatics_and_Chemistry dbr:BioData_Mining dbr:Bioinformatics_and_Biology_Insights dbr:BMC_Bioinformatics |
| is dbp:field of | dbr:Ron_Shamir dbr:Blaž_Zupan dbr:Annie_Antón dbr:Jotun_Hein dbr:Paulien_Hogeweg dbr:Charles_Lawrence_(mathematician) dbr:Vasant_Honavar dbr:Vinod_Scaria dbr:Anders_Krogh dbr:Edward_R._Dougherty dbr:Gajendra_Pal_Singh_Raghava dbr:Gaston_Gonnet dbr:Andrew_Kasarskis dbr:Antoine_Danchin dbr:Stephen_Altschul dbr:Trevor_Hastie dbr:Warren_Lyford_DeLano dbr:Webb_Miller dbr:Ming_Li dbr:Veronica_Dahl dbr:A._Murat_Eren dbr:Alan_C._Ashton dbr:Diether_Lambrechts dbr:Alana_Alexander dbr:John_B._Hogenesch dbr:Lawrence_Hunter dbr:Søren_Brunak dbr:Don_R._Swanson dbr:Marco_Ramoni dbr:Margaret_Oakley_Dayhoff dbr:Philip_Bourne dbr:Mikhail_Gelfand dbr:Ruth_Nussinov dbr:Srinivas_Aluru dbr:Pierre_Baldi dbr:Warren_Gish dbr:Yaniv_Erlich |
| is dbp:fields of | dbr:Ami_Bhatt dbr:Robert_Stevens_(scientist) dbr:Barry_H._Honig dbr:David_Horn_(Israeli_physicist) dbr:David_J._Lipman dbr:David_S._Wishart dbr:Patricia_Babbitt dbr:Peter_Karp_(scientist) dbr:Rita_Casadio dbr:Ulisses_Braga_Neto dbr:Deanna_M._Church dbr:Debora_Marks dbr:Cheng_Xiang_Zhai dbr:Pavel_A._Pevzner dbr:Victor_V._Solovyev dbr:Shamkant_Navathe dbr:Christophe_Dessimoz dbr:Christos_Ouzounis dbr:Edward_Trifonov dbr:Elliot_McVeigh dbr:Gary_Stormo dbr:Gonçalo_Abecasis dbr:Mona_Singh_(scientist) dbr:Lincoln_Stein dbr:Lior_Pachter dbr:Lukasz_Kurgan dbr:Stefano_Lonardi dbr:Aviv_Regev dbr:Joel_Dudley dbr:Minnie_Sarwal dbr:Adriano_Schneider dbr:Daniel_P._Miranker dbr:Eran_Elhaik dbr:Eugene_Myers dbr:Andy_Brass dbr:Pardis_Sabeti dbr:Daniel_Janies dbr:Hanah_Margalit dbr:Ludmil_Alexandrov dbr:Atul_Butte dbr:Terri_Attwood dbr:Hákon_Hákonarson_(scientist) dbr:Jennifer_Gardy dbr:Chitra_Dutta dbr:Kenneth_H._Wolfe dbr:Kenneth_W._Kinzler dbr:Laxmi_Parida dbr:Tyra_Wolfsberg dbr:Manuel_Corpas_(scientist) dbr:Mark_B._Gerstein dbr:Mark_Borodovsky dbr:Bonnie_Berger dbr:Cathy_H._Wu dbr:Sepp_Hochreiter dbr:Christoph_Bock dbr:Nick_Goldman dbr:Toby_Gibson dbr:Russell_Greiner dbr:Sean_Eddy dbr:Vineet_Bafna |
| is dbp:genre of | dbr:ProteoWizard dbr:MacVector dbr:Beacon_designer dbr:BioBIKE dbr:BioJS dbr:BioJava dbr:BioPerl dbr:BioRuby dbr:Bioclipse dbr:Bioconductor dbr:Biopython dbr:Bowtie_(sequence_analysis) dbr:AlleleID dbr:DNADynamo dbr:Unipept dbr:ViennaRNA_Package dbr:Comparative_Toxicogenomics_Database dbr:SAMtools dbr:OLIGO_Primer_Analysis_Software dbr:GenGIS dbr:GenMAPP dbr:General_feature_format dbr:GenoCAD dbr:Molecular_Evolutionary_Genetics_Analysis dbr:Consed dbr:OrthoFinder dbr:Apache_cTAKES dbr:MG-RAST dbr:Skyline_(software) dbr:Staden_Package dbr:Stockholm_format dbr:Dendroscope dbr:SPAdes_(software) dbr:Trans-Proteomic_Pipeline dbr:DAVID dbr:DECIPHER_(software) dbr:Database_of_Molecular_Motions dbr:FASTA_format dbr:FlyExpress dbr:Archaeopteryx_(software) dbr:AMPHORA dbr:CheShift dbr:Chemistry_Development_Kit dbr:BioNumerics dbr:BioPHP dbr:CodonCode_Aligner dbr:TimeTree dbr:CRAM_(file_format) dbr:Metascape dbr:Netprimer dbr:Newbler dbr:Nexus_file dbr:OpenChrom dbr:OpenMS dbr:XCMS_Online dbr:MEGAN dbr:SAM_(file_format) dbr:FASTA dbr:FASTQ_format dbr:Giant_Virus_Finder dbr:Primer_Premier dbr:SplitsTree dbr:Sequerome |
| is dbp:industry of | dbr:Genedata dbr:Genomatix dbr:Genostar dbr:Genome_Valley dbr:Applied_Maths dbr:Ovid_Technologies dbr:Korean_Bioinformation_Center dbr:BioBam_Bioinformatics dbr:Biobase_(company) dbr:Dotmatics dbr:CLC_bio |
| is dbp:knownFor of | dbr:Melissa_Haendel dbr:Chris_Sander_(scientist) dbr:Reidun_Twarock dbr:Heng_Li dbr:Ajit_Johnson dbr:John_Quackenbush dbr:Gregory_Stephanopoulos dbr:Jennifer_Gardy dbr:Rameshwar_Nath_Koul_Bamezai dbr:Susan_B._Davidson dbr:Ritam_Chowdhury |
| is dbp:occupation of | dbr:Gajendra_Pal_Singh_Raghava |
| is dbp:products of | dbr:NantWorks |
| is dbp:purpose of | dbr:South_African_National_Bioinformatics_Institute |
| is dbp:researchField of | dbr:Ontario_Institute_for_Cancer_Research dbr:McDonnell_Genome_Institute dbr:Stanley_Center_for_Psychiatric_Research_at_Broad_Institute dbr:Broad_Institute dbr:UKM_Medical_Molecular_Biology_Institute dbr:Wellcome_Genome_Campus dbr:New_York_Genome_Center |
| is dbp:scope of | dbr:German_National_Library_of_Medicine |
| is gold:hypernym of | dbr:Biocomplexity_Institute_of_Virginia_Tech dbr:Pseudomon-Rho_RNA_motif dbr:LivK_RNA_motif dbr:EsyN dbr:TDR_Targets dbr:Whalefall-1_RNA_motif dbr:Pan_RNA_motif |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Bioinformatics |
