Restriction site associated DNA markers (original) (raw)
O sequenciamento de fragmentos de DNA associado a sítios de restrição (do inglês Restriction site associated DNA sequencing, RADseq) é uma metodologia que descreve o sequenciamento dos marcadores RAD, que são um tipo de marcador molecular baseado em sítios de restrição enzimática ao longo do genoma.Essa metodologia consiste na digestão do DNA genômico por uma ou mais enzimas de restrição e ligação dos fragmentos a adaptadores, o que permite a multiplexação de centenas a milhares de indivíduos, permitindo uma representação reduzida do genoma, dos loci próximos aos sítios de restrição. Dessa forma caracteriza-se por um método de sequenciamento de bibliotecas de representação reduzida (RRLs, do inglês reduced-representation libraries).
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Restriction site associated DNA (RAD) markers are a type of genetic marker which are useful for association mapping, QTL-mapping, population genetics, ecological genetics and evolutionary genetics. The use of RAD markers for genetic mapping is often called RAD mapping. An important aspect of RAD markers and mapping is the process of isolating RAD tags, which are the DNA sequences that immediately flank each instance of a particular restriction site of a restriction enzyme throughout the genome. Once RAD tags have been isolated, they can be used to identify and genotype DNA sequence polymorphisms mainly in form of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Polymorphisms that are identified and genotyped by isolating and analyzing RAD tags are referred to as RAD markers. Although genotyping by sequencing presents an approach similar to the RAD-seq method, they differ in some substantial ways. (en) O sequenciamento de fragmentos de DNA associado a sítios de restrição (do inglês Restriction site associated DNA sequencing, RADseq) é uma metodologia que descreve o sequenciamento dos marcadores RAD, que são um tipo de marcador molecular baseado em sítios de restrição enzimática ao longo do genoma.Essa metodologia consiste na digestão do DNA genômico por uma ou mais enzimas de restrição e ligação dos fragmentos a adaptadores, o que permite a multiplexação de centenas a milhares de indivíduos, permitindo uma representação reduzida do genoma, dos loci próximos aos sítios de restrição. Dessa forma caracteriza-se por um método de sequenciamento de bibliotecas de representação reduzida (RRLs, do inglês reduced-representation libraries). (pt) |
| dbo:wikiPageID | 27962727 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 9681 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1121074535 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Amplified_fragment_length_polymorphism dbr:DNA_fragmentation dbr:DNA_microarray dbr:University_of_Oregon dbr:Genetic_marker dbr:Genotyping_by_sequencing dbr:Quantitative_trait_locus dbr:Streptavidin dbr:Population_genetics dbc:DNA_sequencing dbr:DNA_sequencing dbr:Restriction_enzyme dbr:Biotinylation dbr:D._melanogaster dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Illumina_dye_sequencing dbr:Blunt_ends dbr:RFLP dbr:Population_differentiation dbr:File:RADseq_schematic.pdf |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist dbt:Short_description |
| dct:subject | dbc:DNA_sequencing |
| gold:hypernym | dbr:Marker |
| rdf:type | dbo:HistoricPlace |
| rdfs:comment | O sequenciamento de fragmentos de DNA associado a sítios de restrição (do inglês Restriction site associated DNA sequencing, RADseq) é uma metodologia que descreve o sequenciamento dos marcadores RAD, que são um tipo de marcador molecular baseado em sítios de restrição enzimática ao longo do genoma.Essa metodologia consiste na digestão do DNA genômico por uma ou mais enzimas de restrição e ligação dos fragmentos a adaptadores, o que permite a multiplexação de centenas a milhares de indivíduos, permitindo uma representação reduzida do genoma, dos loci próximos aos sítios de restrição. Dessa forma caracteriza-se por um método de sequenciamento de bibliotecas de representação reduzida (RRLs, do inglês reduced-representation libraries). (pt) Restriction site associated DNA (RAD) markers are a type of genetic marker which are useful for association mapping, QTL-mapping, population genetics, ecological genetics and evolutionary genetics. The use of RAD markers for genetic mapping is often called RAD mapping. An important aspect of RAD markers and mapping is the process of isolating RAD tags, which are the DNA sequences that immediately flank each instance of a particular restriction site of a restriction enzyme throughout the genome. Once RAD tags have been isolated, they can be used to identify and genotype DNA sequence polymorphisms mainly in form of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Polymorphisms that are identified and genotyped by isolating and analyzing RAD tags are referred to as RAD markers. Although genotyping by (en) |
| rdfs:label | Restriction site associated DNA markers (en) Sequenciamento de fragmentos de DNA associados a sítios de restrição (RADseq) (pt) |
| owl:sameAs | freebase:Restriction site associated DNA markers wikidata:Restriction site associated DNA markers dbpedia-pt:Restriction site associated DNA markers https://global.dbpedia.org/id/4tMGz |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Restriction_site_associated_DNA_markers?oldid=1121074535&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Restriction_site_associated_DNA_markers |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:RAD |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:DdRAD-seq dbr:RAD-seq dbr:RADSeq dbr:RAD_sequencing dbr:RAD_tag_sequencing |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Intralocus_sexual_conflict dbr:Genetic_marker dbr:Genome_sequencing_of_endangered_species dbr:Genotyping dbr:Genotyping_by_sequencing dbr:Sebastes_diaconus dbr:African_wolf dbr:Albacore dbr:Ethiopian_wolf dbr:RAD dbr:Burrunan_dolphin dbr:Wahoo dbr:Fish_migration dbr:Population_genomics dbr:Monoallelic_gene_expression dbr:DdRAD-seq dbr:RAD-seq dbr:RADSeq dbr:RAD_sequencing dbr:RAD_tag_sequencing |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Restriction_site_associated_DNA_markers |