Retron (original) (raw)
레트론(Retron)은 세균에서 발견되는 유전인자로, 역전사효소를 가지고 있어 이것을 이용하여 이상한 RNA/DNA가 혼합된 분자를 만들어내지만 전이기작은 아직 알려지지 않았다. 대체로 세균의 바이러스에서 흔히 발견되며, 이는 세균의 염색체에 다시 삽입되지 않고 세균의 염색체에는 단 하나의 각 레트론만이 존재한다. 레트론은 역전사효소의 암호 영역과 번역이 안되는 RNA조각을 만드는 유전자 하나를 가지며, 생성된 역전사 효소가 레트론의 비번역된 mRNA와 반응해 RNA/DNA 분자를 만든다.
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| dbo:abstract | Un retrón es una secuencia de ADN específica que se encuentra en los genomas procariotas que codifican una transcriptasa inversa, un ARN y un ssADN híbrido único llamado ssADN, multicopia (MSDN, en inglés multicopy single-stranded DNA). El llamado "msrARN retrón" es el ARN no codificante producido por los elementos retrones y es el precursor inmediato de la síntesis del msADN. Un retrón msrARN se pliega en una estructura secundaria característica que contiene un residuo de guanosina conservado al final de un bucle de tallo. La síntesis de ADN por transcriptasa inversa (RT) codificada por resultados de los retrones en un ADN / ARN quimérico se compone de un ADN monocatenario unido a un ARN monocatenario. La cadena de ARN está unida al extremo 5 ' de la cadena de ADN mediante un enlace fosfodiéster 2'-5' que se produce en la posición 2 'del residuo de guanosina conservada. Los elementos retrones tienen aproximadamente 2 kb de largo. Contienen un solo operón que controla la síntesis de una transcripción de ARN que lleva tres loci: msr, msd y ret que están involucrados en la síntesis de msADN. La porción de ADN del msADN está codificada por el gen msd, la porción de ARN está codificada por el gen msr, mientras que el producto del gen ret es una transcriptasa inversa similar a las transcriptasas inversas de los retrovirus y otros tipos de retroelementos. Al igual que otras transcriptasas inversas, el retrón RT contiene siete regiones de aminoácidos conservadas (con los números 1 a 7 en la figura), incluida una secuencia altamente conservada de tyr - ala - asp - asp (YADD) asociada con el núcleo catalítico. El producto del gen ret es responsable de procesar la porción msd / msr de la transcripción de ARN en msADN. Durante muchos años después de su descubrimiento en virus de animales, se pensó que la transcriptasa inversa estaba ausente en los procariotas. Actualmente, los elementos que codifican RT, es decir, retroelementos, se han encontrado en una amplia variedad de bacterias y arqueas. Los retrones fueron la primera familia de retroelementos descubiertos en procariotas; Las otras dos familias de retroelementos procariotas conocidos son los intrones de los grupos I y II y retroelementos generadores de diversidad (DGR). Los intrones del grupo II son los retroelementos procariotas mejor caracterizados y el único tipo conocido que exhibe movilidad autónoma; consisten en una RT codificada en una estructura de ARN con auto-empalme catalítico. La movilidad del intrón del grupo II está mediada por una ribonucleoproteína que comprende un bucle de intrón (lariat) unido a dos proteínas codificadas en el intrón. La segunda familia de retroelementos procariotas, los DGR, no son móviles, sino que funcionan mediante la diversificación de secuencias de ADN. Por ejemplo, los DGR median el cambio entre las fases patogénicas y de vida libre de la bacteria Bordetella. Como los retrones no son móviles, su aparición en varias especies procariotas no es un fenómeno de "ADN egoísta". Por el contrario, los retrones deberían dar alguna ventaja selectiva al organismo huésped, pero no se sabe cuál puede ser esa ventaja. Y con la excepción de la producción de msADN, no se ha asociado ningún fenotipo claro con ellos. A pesar del considerable número de investigaciones realizadas, se sabe poco acerca de la función de los msADNs, la movilidad de los retrones o sus efectos en la célula huésped. (es) A retron is a distinct DNA sequence found in the genome of many bacteria species that codes for reverse transcriptase and a unique single-stranded DNA/RNA hybrid called multicopy single-stranded DNA (msDNA). Retron msr RNA is the non-coding RNA produced by retron elements and is the immediate precursor to the synthesis of msDNA. The retron msr RNA folds into a characteristic secondary structure that contains a conserved guanosine residue at the end of a stem loop. Synthesis of DNA by the retron-encoded reverse transcriptase (RT) results in a DNA/RNA chimera which is composed of small single-stranded DNA linked to small single-stranded RNA. The RNA strand is joined to the 5′ end of the DNA chain via a 2′–5′ phosphodiester linkage that occurs from the 2′ position of the conserved internal guanosine residue. (en) 레트론(Retron)은 세균에서 발견되는 유전인자로, 역전사효소를 가지고 있어 이것을 이용하여 이상한 RNA/DNA가 혼합된 분자를 만들어내지만 전이기작은 아직 알려지지 않았다. 대체로 세균의 바이러스에서 흔히 발견되며, 이는 세균의 염색체에 다시 삽입되지 않고 세균의 염색체에는 단 하나의 각 레트론만이 존재한다. 레트론은 역전사효소의 암호 영역과 번역이 안되는 RNA조각을 만드는 유전자 하나를 가지며, 생성된 역전사 효소가 레트론의 비번역된 mRNA와 반응해 RNA/DNA 분자를 만든다. (ko) Um retron é uma sequência específica de ADN que se encontra no genoma de muitas espécies de bactérias, que codifica uma transcriptase reversa e um singular híbrido ARN/ADN monocatenário chamado (msDNA, do inglês multicopy single-stranded DNA). O chamado Retron msr RNA é o ARN não codificante produzido pelos elementos retron e é o imediato precursor da síntese do msDNA. O retron msr RNA prega-se numa estrutura secundária característica que contém um resíduo de guanosina conservado ao final duma . A síntese do ADN pela transcriptase reversa (RT) codificada pelo retron tem como resultado uma quimera ADN/ARN que é composta por um ADN monocatenário ligado a um ARN monocatenário. A fibra de ARN está unida à extremidade 5' da cadeia de ADN por meio duma ligação fosfodiéster 2'-5' que ocorre na posição 2' do resíduo de guanosina conservada. Os elementos retron possuem cerca de 2 kb de comprimento. Contêm um só operão que controla a síntese dum transcrito de ARN que leva três loci: msr, msd e ret, que estão envolvidos na síntese do msDNA. A porção de ADN do msDNA está codificada pelo gene msd, a porção de ARN está codificada pelo gene msr, enquanto que o produto do gene ret é uma transcritase reversa similar às transcritases reversas dos retrovírus e outros tipos de retroelementos. Tal como outras transcritases reversas, o retron RT contém sete regiões de aminoácidos (com números do 1 ao 7 na figura), incluindo uma sequência tyr-ala-asp-asp (YADD) muito conservada associada ao núcleo catalítico. O produto do gene ret é responsável por processar a porção msd/msr do transcrito de ARN em msDNA. Durante muitos anos após a sua descoberta em viroses animais, pensava-se que a transcriptase reversa estava ausente nos procarióticas. Actualmente, não obstante, os elementos que codificam RT, ou seja, , foram encontrados numa ampla variedade de bactérias. Os retrons foram a primeira família de retroelementos descobertos em bactérias; as outras duas famílias de retroelementos bacterianos conhecidas são os e os retroelementos geradores de diversidade (DGR, do inglês diversity-generating retroelements). Os intrões do grupo II são os retroelementos bacterianos melhor caracterizados e o único tipo conhecido que apresenta mobilidade autónoma; consistem duma RT codificada numa estrutura de ARN com splicing catalítico. A mobilidade do intrão do grupo II é mediada por uma ribonucleoproteína que compreende um laço (lariat) intrão unido a duas proteínas codificadas no intrão. A segunda família de retroelementos bacterianos, os DGR, non son móbiles, pero funcionan diversificando as sequências de ADN. Por exemplo, os DGR medeiam a mudança entre as fases patogénicas e de vida livre da bactéria Bordetella. Como os retron não são móveis, o seu aparecimento em diversas espécies bacterianas não é um fenômeno de "". Em vez disso, os retronos devem dar alguma vantagem seletiva ao organismo hospedeiro, mas não se sabe qual pode ser essa vantagem. E com a exceção da produção de msDNA, nenhum fenótipo foi claramente associado a eles. Apesar do considerável número de investigações realizadas, pouco se sabe sobre a função dos msDNA, a mobilidade dos elementos retron ou os seus efeitos na célula hospedeira. (pt) |
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