RpoB (original) (raw)
The rpoB gene encodes the β subunit of bacterial RNA polymerase and the homologous plastid-encoded RNA polymerase (PEP). It codes for 1342 amino acids in E. coli, making it the second-largest polypeptide in the bacterial cell. It is targeted by the rifamycin family of antibacterials, such as rifampin. Mutations in rpoB that confer resistance to rifamycins do so by altering the protein's drug-binding residues, thereby reducing affinity for these antibiotics.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Le gène rpoB code la sous-unité β de l'ARN polymérase bactérienne. On le trouve aussi chez les chloroplastes des plantes où il forme la sous-unité β de l'ARN polymérase encodée par plaste (ou PEP en anglais pour Plastid Encoded Polymerase). La tagetitoxine, un inhibiteur de la transcription chez les bactéries, inhibe également la PEP, montrant ainsi que le complexe qu'on retrouve chez les plantes est très similaire à l'enzyme homologue des bactéries. Il code 1342 acides aminés, ce qui en fait le deuxième plus grand polypeptide dans la cellule bactérienne. Le gène rpoB est sujet à des mutations qui confèrent la résistance à la rifamycine et ses dérivés tel que la rifampicine. Les mutations dans rpoB qui confèrent une résistance aux rifamycines le font en altérant les résidus du site de liaison de la rifamycine sur l'ARN polymérase, réduisant ainsi l'affinité de liaison de la rifamycine pour les rifamycines. Certaines bactéries contiennent plusieurs copies du gène de l'ARNr 16S , qui est couramment utilisé comme marqueur moléculaire pour étudier la phylogénie. Dans ces cas, le gène rpoB peut être utilisé pour étudier la diversité microbienne. (fr) The rpoB gene encodes the β subunit of bacterial RNA polymerase and the homologous plastid-encoded RNA polymerase (PEP). It codes for 1342 amino acids in E. coli, making it the second-largest polypeptide in the bacterial cell. It is targeted by the rifamycin family of antibacterials, such as rifampin. Mutations in rpoB that confer resistance to rifamycins do so by altering the protein's drug-binding residues, thereby reducing affinity for these antibiotics. Some bacteria contain multiple copies of the 16S rRNA gene, which is commonly used as the molecular marker to study phylogeny. In these cases, the single-copy rpoB gene can be used to study microbial diversity. An inhibitor of transcription in bacteria, tagetitoxin, also inhibits PEP, showing that the complex found in plants is very similar to the homologous enzyme in bacteria. (en) Ген rpoB кодирует β-субъединицы РНК-полимеразы. Это сайт мутаций, которые придают устойчивость к рифамициновых антибактериальным агентам, таким как рифампицин. Мутации в гене rроВ, которые придают устойчивость к рифампицину. Сущность механизма этой мутации заключается том, что происходит замена аминокислотных остатков рифамицинового сайта в РНК-полимеразе, тем самым снижается эффективность связывания рифамицинов с этим ферментом. Зонды нуклеиновой кислоты могут обнаружить мутации в гена rроВ , которые придают устойчивость к рифампицину. Для микобактерий туберкулеза, рифамициноустойчивые мутации наиболее часто встречаются с привлечением кодонов 516, 526 и 531. Для золотистого стафилококка, рифамициновоустойчивые мутации чаще всего встречается с привлечением кодона 526. (ru) |
| dbo:wikiPageID | 4708781 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 11117 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1073336794 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Rifampicin dbr:Rifamycin dbr:Vancomycin dbc:Enzymes dbr:16S_rRNA dbr:Citric_acid_cycle dbr:Gene dbr:Staphylococcus_aureus dbc:Gene_expression dbr:Erythromycin dbr:Escherichia_coli dbc:RNA dbr:Tagetitoxin dbr:Phylogeny dbr:RNA_polymerase dbr:Neisseria_meningitidis dbr:Plastid dbr:Mycobacterium_tuberculosis dbr:Polyketide_synthase dbr:Vancomycin-intermediate_staphylococcus_aureus dbr:Rifampin |
| dbp:chromosome | genomic (en) |
| dbp:ecnumber | 2.700000 (xsd:double) |
| dbp:entrezchromosome | NC_000913.3 (en) |
| dbp:entrezgene | 948488 (xsd:integer) |
| dbp:genlocEnd | 4185876 (xsd:integer) |
| dbp:genlocStart | 4180640 (xsd:integer) |
| dbp:name | DNA-directed RNA polymerase subunit beta (en) |
| dbp:organism | Escherichia coli (en) |
| dbp:pdb | 3 (xsd:integer) |
| dbp:refseqprotein | NP_418414.1 (en) |
| dbp:symbol | rpoB (en) |
| dbp:taxid | 83333 (xsd:integer) |
| dbp:uniprot | P0A8V2 (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Infobox_nonhuman_protein dbt:Reflist dbt:Gene_expression dbt:Transcription |
| dcterms:subject | dbc:Enzymes dbc:Gene_expression dbc:RNA |
| rdf:type | yago:Abstraction100002137 yago:Activator114723079 yago:Catalyst114723628 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Enzyme114732946 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatEnzymes |
| rdfs:comment | The rpoB gene encodes the β subunit of bacterial RNA polymerase and the homologous plastid-encoded RNA polymerase (PEP). It codes for 1342 amino acids in E. coli, making it the second-largest polypeptide in the bacterial cell. It is targeted by the rifamycin family of antibacterials, such as rifampin. Mutations in rpoB that confer resistance to rifamycins do so by altering the protein's drug-binding residues, thereby reducing affinity for these antibiotics. (en) Le gène rpoB code la sous-unité β de l'ARN polymérase bactérienne. On le trouve aussi chez les chloroplastes des plantes où il forme la sous-unité β de l'ARN polymérase encodée par plaste (ou PEP en anglais pour Plastid Encoded Polymerase). La tagetitoxine, un inhibiteur de la transcription chez les bactéries, inhibe également la PEP, montrant ainsi que le complexe qu'on retrouve chez les plantes est très similaire à l'enzyme homologue des bactéries. Il code 1342 acides aminés, ce qui en fait le deuxième plus grand polypeptide dans la cellule bactérienne. Le gène rpoB est sujet à des mutations qui confèrent la résistance à la rifamycine et ses dérivés tel que la rifampicine. Les mutations dans rpoB qui confèrent une résistance aux rifamycines le font en altérant les résidus du site de liai (fr) Ген rpoB кодирует β-субъединицы РНК-полимеразы. Это сайт мутаций, которые придают устойчивость к рифамициновых антибактериальным агентам, таким как рифампицин. Мутации в гене rроВ, которые придают устойчивость к рифампицину. Сущность механизма этой мутации заключается том, что происходит замена аминокислотных остатков рифамицинового сайта в РНК-полимеразе, тем самым снижается эффективность связывания рифамицинов с этим ферментом. (ru) |
| rdfs:label | RpoB (fr) RpoB (en) RpoB (ru) |
| owl:sameAs | freebase:RpoB yago-res:RpoB wikidata:RpoB dbpedia-fr:RpoB dbpedia-ru:RpoB https://global.dbpedia.org/id/2LDhr |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:RpoB?oldid=1073336794&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:RpoB |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Rpob |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:MUBII-TB-DB dbr:Bifidobacteriaceae dbr:Rifampicin dbr:Multidrug-resistant_tuberculosis dbr:Mycobacteroides_abscessus dbr:Conserved_signature_indels dbr:Corynebacterium_uropygiale dbr:Haemophilus_felis dbr:Actinomyces dbr:Helicobacter dbr:PVC_superphylum dbr:Diplorickettsia_massiliensis dbr:Rpob dbr:RNA_polymerase dbr:Pasteurella_canis dbr:Mycobacterium_lepromatosis dbr:Tuberculosis_management |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:RpoB |