SNED1 (original) (raw)
SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domains) is an extracellular matrix (ECM) protein expressed at low levels in a wide range of tissues. The gene encoding SNED1 is located in the human chromosome 2 at locus q37.3. The corresponding mRNA isolated from the spleen and is 6834bp in length, and the corresponding protein is 1413 amino-acid long. The mouse ortholog of SNED1 was cloned in 2004 from the embryonic kidney by Leimester et al. SNED1 present domains characteristic of ECM proteins, including an amino-terminal NIDO domain, several calcium binding EGF-like domains (EGF_CA), a Sushi domain also known as complement control protein (CCP) domain, and three type III fibronectin (FN3) domains in the carboxy-terminal region.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domains) is an extracellular matrix (ECM) protein expressed at low levels in a wide range of tissues. The gene encoding SNED1 is located in the human chromosome 2 at locus q37.3. The corresponding mRNA isolated from the spleen and is 6834bp in length, and the corresponding protein is 1413 amino-acid long. The mouse ortholog of SNED1 was cloned in 2004 from the embryonic kidney by Leimester et al. SNED1 present domains characteristic of ECM proteins, including an amino-terminal NIDO domain, several calcium binding EGF-like domains (EGF_CA), a Sushi domain also known as complement control protein (CCP) domain, and three type III fibronectin (FN3) domains in the carboxy-terminal region. (en) SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 413 амінокислот, а молекулярна маса — 152 204. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні. (uk) |
| dbo:wikiPageExternalLink | https://smart.embl.de/smart/show_motifs.pl%3FID=Q8TER0 http://smart.embl-heidelberg.de/smart/do_annotation.pl%3FDOMAIN=NIDO&BLAST=DUMMY https://www.genenames.org/data/gene-symbol-report/%23!/hgnc_id/HGNC:24696 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001080437.3 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/122937283%3Freport=genbank&log$=protalign&blast_rank=1&RID=T7EWA75B015 https://www.uniprot.org/uniprot/Q8TER0 https://www.ebi.ac.uk/interpro/protein/UniProt/Q8TER0/ |
| dbo:wikiPageID | 39280133 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 19773 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1064880501 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Protein_kinase_A dbr:EGF-like_domain dbr:Calcium-binding_EGF_domain dbr:Complement_control_protein dbr:Protein_kinase_C dbc:Extracellular_matrix_proteins dbr:Basement_membrane dbr:Entactin dbr:Transcription_factor dbr:Fibrillin-1 dbc:Glycoproteins dbr:Sushi_domain dbr:Collagen dbr:Fibronectin_type_III_domain dbr:Integrin dbr:Somatostatin dbr:Extracellular_matrix dbr:Factor_IX dbr:Plasmin dbr:Upstream_open_reading_frame dbr:NRXN1 dbr:Somatostatin_receptor_2 dbr:Spermine_synthase dbr:Fibrolytic dbr:Low_density_lipoprotein_receptor-related_protein_4 dbr:Anosmin_1 dbr:T-plasminogen_activator dbr:File:Conceptual_translation_of_SNED1_Annotated.pdf |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Extracellular_matrix_proteins dbc:Glycoproteins |
| gold:hypernym | dbr:Protein |
| rdf:type | yago:Abstraction100002137 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 dbo:Protein yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | SNED1 (Sushi, Nidogen, and EGF-like Domains) is an extracellular matrix (ECM) protein expressed at low levels in a wide range of tissues. The gene encoding SNED1 is located in the human chromosome 2 at locus q37.3. The corresponding mRNA isolated from the spleen and is 6834bp in length, and the corresponding protein is 1413 amino-acid long. The mouse ortholog of SNED1 was cloned in 2004 from the embryonic kidney by Leimester et al. SNED1 present domains characteristic of ECM proteins, including an amino-terminal NIDO domain, several calcium binding EGF-like domains (EGF_CA), a Sushi domain also known as complement control protein (CCP) domain, and three type III fibronectin (FN3) domains in the carboxy-terminal region. (en) SNED1 (англ. Sushi, nidogen and EGF like domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 413 амінокислот, а молекулярна маса — 152 204. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: ВалінW: Триптофан Y: Тирозин (uk) |
| rdfs:label | SNED1 (en) SNED1 (uk) |
| owl:sameAs | freebase:SNED1 yago-res:SNED1 wikidata:SNED1 wikidata:SNED1 http://tt.dbpedia.org/resource/SNED1 dbpedia-uk:SNED1 https://global.dbpedia.org/id/gUNA |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:SNED1?oldid=1064880501&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:SNED1 |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Metastasis_suppressor dbr:EGF-like_domain dbr:List_of_human_protein-coding_genes_4 dbr:Sushi_domain dbr:Fibronectin_type_III_domain |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:SNED1 |