Single-stranded binding protein (original) (raw)

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SSB protein (SSB či SSBP z angl. single strand binding protein) je označení pro bílkoviny, které se vážou na vlákno DNA v replikační vidlici, tedy především během replikace DNA. Mimo to se však účastní i opravy DNA a crossing-overu. Jsou schopné se navázat na zpožďující se (lagging) i vedoucí (leading) řetězec. SSB proteiny zamezují DNA, aby se sbalila do svého dvoušroubovicového tvaru, který je pro ní přirozený. Asistují tedy helikázám, jež jsou schopné rozmotat dvoušroubovici DNA.

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dbo:abstract SSB protein (SSB či SSBP z angl. single strand binding protein) je označení pro bílkoviny, které se vážou na vlákno DNA v replikační vidlici, tedy především během replikace DNA. Mimo to se však účastní i opravy DNA a crossing-overu. Jsou schopné se navázat na zpožďující se (lagging) i vedoucí (leading) řetězec. SSB proteiny zamezují DNA, aby se sbalila do svého dvoušroubovicového tvaru, který je pro ní přirozený. Asistují tedy helikázám, jež jsou schopné rozmotat dvoušroubovici DNA. (cs) Einzelstrang-bindende Proteine (SSB, single-stranded binding protein) sind Proteine, die an DNA binden, um die Replikation zu erleichtern, in dem sie die Primerhybridisierung (engl. primer annealing, Prozess der Anlagerung eines Primers an DNA-Sequenzen) verbessern. Gleichzeitig verhindern diese Proteine während der DNA-Replikation eine verfrühte Hybridisierung der bereits getrennten komplementären Stränge, welche ebenfalls als Annealing bezeichnet wird. Des Weiteren schützt sie die Einzelstränge vor Nukleasen. Sie kommen in allen Lebewesen außer vor. (de) Las proteínas SSB en células procariotas (single-stranded DNA binding proteins o proteínas ligantes de ADN de cadena sencilla) son un conjunto de proteínas encargadas de la estabilización de la apertura del ADN de cadena sencilla generada por la acción de las helicasas durante el proceso de replicación del ADN.​ Estas evitan el auto apareamiento entre las bases complementarias de la cadena, protegiéndola de la acción de las nucleasas y de asociaciones intracatenarias. Su análoga en células eucariotas se conocen como proteína de replicación A (RPA, por sus siglas en inglés: Replication protein A) (es) Single-stranded binding proteins (SSBs) are a class of proteins that have been identified in both viruses and organisms from bacteria to humans. (en) Una single-strand binding protein (dall'inglese, proteina legante il singolo filamento), nota anche come SSB o SSBP o proteina stabilizzante l'elica, è una proteina in grado di legare le regioni di DNA a singolo filamento, al fine di prevenirne il riappaiamento con un altro singolo filamento. Poiché i singoli filamenti di DNA tendono spontaneamente ad appaiarsi in una doppia elica, il legame delle SSB aiuta enzimi come le elicasi a stabilizzare l'elica denaturata, condizione necessaria per procedere alla replicazione del DNA. Le SSB sono state individuate in numerosi organismi, tra cui l'uomo. Le SSB meglio caratterizzate sono quelle provenienti da Escherichia coli. Come avviene per molte SSB batteriche, anche quella di E. coli è costituita da un omotetramero, composto da quattro subunità identiche da 18843 Da, che si lega ad un segmento di DNA di circa 32 nucleotidi. (it) SSB (do inglês, Single Strand DNA Binding - Proteínas ligantes a DNA de cadeia simples) fazem parte do complexo de proteínas que atuam no processo de replicação do DNA (Replissoma). Duas cadeias de ácidos nucléicos têm uma tendência muito grande em se associarem, tomando a configuração de hélice e formando um mesmo segmento de uma mesma cadeia com sequências complementares de bases, que por afinidade, tendem a se unir e como consequência, dobrando a molécula e formando a estrutura de dupla-hélice (hairpins ou grampos). As cadeias complementares de uma molécula de DNA, mantêm-se separadas na região da forquilha de replicação e sem formarem hairpins ou grampos graças a ação das SSB. Especificamente, as SSB interagem diretamente com cadeias simples de DNA sem cobrir suas bases, as quais ficam disponíveis para servirem de molde para a síntese da cadeia complementar. Ou seja, as SSB apesar de não serem capazes de abrirem uma hélice de DNA, são imprescindíveis para manter as duas cadeias separadas e sem se sobrar sobre elas mesmas. As SSB atuam cooperativamente : a ligação de uma delas facilita a ligação da seguinte de modo que a cadeia recém aberta vai progressivamente sendo coberta por moléculas dessa proteína. A presença de diversas moléculas de proteínas SSB sobre uma cadeia simples de DNA produz uma conformação estendida e pouco flexível, favorável a ação da polimerase III. À medida que as cadeias complementares vão sendo sintetizadas, as proteínas SSB se soltam do DNA, uma vez que elas não têm afinidade por dupla-hélice. Referências: https://edisciplinas.usp.br/pluginfile.php/2937177/mod\_resource/content/2/BiologiaMolecular\_texto02%20final.pdf (pt) Single strand binding protein eller SSB är ett protein som binder till enkla DNA-strängar för att hindra dem att återinbinda eller binda till sig själv vid exempelvis replikation i prokaryoter. (sv) Белки, связывающие одноцепочечную ДНК (SSB-моменты) (англ. Single-strand binding protein, SSB, SSBP) — связывают одноцепочечные фрагменты ДНК, и предотвращают комплементарное спаривание. Одноцепочечные участки ДНК имеют термодинамически более выгодную форму — дуплекс. Белки SSB предотвращают образование дуплекса и позволяют компонентам репликационной вилки осуществлять репликацию ДНК. Белки SSB обнаружены во всех живых организмах, от вирусов до человека. Многие SSB фагов и вирусов функционируют как мономеры, SSB эукариот, например репликативный белок А являются гетеротримерными, SSB E. coli — гомотетрамер. (ru)
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