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sbRNA (stem-bulge RNA) is a family of non-coding RNA first discovered in Caenorhabditis elegans. It was identified during a full transcriptome screen of the C. elegans cDNA library. Subsequent experimentation characterised sbRNA as having conserved 5' and 3' internal motifs which form a long paired stem which is interrupted with a bulge. (en) stem-bulge RNA (sbRNA)は線虫(Caenorhabditis elegans)で発見されたノンコーディングRNAファミリーである。線虫では現在18種類のsbRNAが確認されており、長さは短いもので67塩基、長いもので133塩基になる。5'末端と3'末端に保存された配列を持っており、二次構造を組むと保存配列からなるステムとシチジン残基がバルジアウトされた構造を共通に持つ。保存配列にはRoタンパク質結合サイトがあると考えられており、3'末端のポリU構造にはLaタンパク質結合できると考えられている。上流配列にPSE BとTATAボックスを持っており、RNAポリメラーゼⅢによって転写されると考えられている。 (ja) sbRNA（stem-bulgeRNA）是一个非编码RNA家族，最早在秀麗隱桿線蟲（Caenorhabditis elegans）的全转录组cDNA筛选中发现，随后的实验证明其保守的5'端和3'端会根据碱基互补配对形成“茎”（stem），剩余部分形成一个“膨大”（bulge）。 (zh) |
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Conserved secondary structure of nematode sbRNA (en) |
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April 2021 (en) |
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sbRNA (en) |
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An RNA is not made of proteins, a ribosome does not infect... This sentence is nonsense as it is, I can't guess the intended meaning. (en) |
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sbRNA (stem-bulge RNA) is a family of non-coding RNA first discovered in Caenorhabditis elegans. It was identified during a full transcriptome screen of the C. elegans cDNA library. Subsequent experimentation characterised sbRNA as having conserved 5' and 3' internal motifs which form a long paired stem which is interrupted with a bulge. (en) stem-bulge RNA (sbRNA)は線虫(Caenorhabditis elegans)で発見されたノンコーディングRNAファミリーである。線虫では現在18種類のsbRNAが確認されており、長さは短いもので67塩基、長いもので133塩基になる。5'末端と3'末端に保存された配列を持っており、二次構造を組むと保存配列からなるステムとシチジン残基がバルジアウトされた構造を共通に持つ。保存配列にはRoタンパク質結合サイトがあると考えられており、3'末端のポリU構造にはLaタンパク質結合できると考えられている。上流配列にPSE BとTATAボックスを持っており、RNAポリメラーゼⅢによって転写されると考えられている。 (ja) sbRNA（stem-bulgeRNA）是一个非编码RNA家族，最早在秀麗隱桿線蟲（Caenorhabditis elegans）的全转录组cDNA筛选中发现，随后的实验证明其保守的5'端和3'端会根据碱基互补配对形成“茎”（stem），剩余部分形成一个“膨大”（bulge）。 (zh) |
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Stem-bulge RNA (ja) SbRNA (en) SbRNA (zh) |
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