Transcriptome (original) (raw)
Das Transkriptom ist die Summe aller zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer Zelle transkribierten, das heißt von der DNA in RNA umgeschriebenen Gene, also die Gesamtheit aller in einer Zelle hergestellten RNA-Moleküle.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | الترنسكريبتوم (بالإنجليزية: Transcriptome) هي مجموعة كل جزيئات الرنا (RNA) التي تتضمن الرنا المرسال والرنا الريبوسومي والرنا الناقل وغيرها من أنواع التي يتم إنتاجها في خلية واحدة أو تجمع من الخلايا، تنتج جزيئات الرنا تلك من الدنا (DNA) . يمكن إطلاق هذا المصطلح على مجموعة النواسخ الكاملة في كائن ما أو على مجموعة فرعية محددة من النواسخ التي توجد في نوع خلوي معين. بعكس الجينوم وهو ثابت تقريبا لخط خلوي معين (إذا ما استثنينا الطفرات)، يمكن أن تتنوع مجموعة الترانسكربيتوم بتنوع الظروف البيئية. يعكس الترانسكربيتوم الجينات التي تم تعبيرها بنشاط في أي وقت محدد وذلك لأنه يشمل كل ناسخات الرنا في الخلية باستثناء ظاهرة تحلل الرنا المرسال مثل (بالإنجليزية: Transcriptional Attenuation). يرمز إلى دراسة الترانسكريبتوم أيضا (بالإنجليزية: Expression Profiling) والتي تفحص مستوى التعبير للرنا المرسال في تجمع خلوي محدد غالبا باستخدام تقنيات تعتمد على تقنية مصفوفات الدنا الدقيقة. يعرف استخدام الجيل القادم من السلسلة لدراسة الترنسكريبتوم على مستوى النيوكليتويد بسلسلة الرنا. إن الترانسكريبتوم هو فرع من الأحياء الجزيئية يتعامل مع دراسة جزيئات الرنا الرسول المنتجة في خلية أو تجمع من نوع خلوي معين. (ar) El transcriptoma és el conjunt de totes les molècules d'ARN, incloent l'ARN missatger, l'ARN ribosòmic, l'ARN de transferència i altres ARN no codificants que es produeix en una cèl·lula o en una població de cèl·lules en un moment determinat.Aquest terme es pot aplicar al conjunt total de transcrits en un determinat organisme o al subconjunt específic de transcripcions presents en un tipus de cèl·lula particular. Al contrari que el genoma, el qual està a grans trets fixat per una línia de cèl·lules donada (excloent les mutacions), el transcriptoma pot variar d'acord amb les condicions ambientals externes. El transcriptoma, així, apareix com un component dinàmic, en contraposició amb el genoma, molt més estàtic. Com que inclou totes les transcripcions de l'ARN missatger dins la cèl·lula, el transcriptoma reflecteix els gens que estan sent activament expressats (expressió gènica) a qualsevol moment donat, amb l'excepció del fenòmens de degradació d'ARN com l'atenuació transcripcional. (ca) Das Transkriptom ist die Summe aller zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer Zelle transkribierten, das heißt von der DNA in RNA umgeschriebenen Gene, also die Gesamtheit aller in einer Zelle hergestellten RNA-Moleküle. (de) El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas de ARN (también llamadas transcritos) presentes en una célula o grupo de células en un momento determinado. El término transcriptoma engloba tanto al ARN mensajero (mRNA), que puede traducirse en una proteína, como al ARN no codificante (ncRNA), que no se traduce; sin embargo, en ocasiones se utiliza de manera más laxa para referirse únicamente al conjunto de ARNs mensajeros. Dado que diferentes células expresan diferentes genes, cada tejido o tipo celular posee un transcriptoma único y distinto. Uno de los objetivos más importantes de la transcriptómica es identificar qué porción del genoma es transcrito en cada tipo celular y bajo qué condiciones. (es) Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales. (fr) Transkriptomika (bahasa Inggris: transcriptomics) merupakan bagian dari biologi molekular yang mengkaji tentang produk transkripsi secara keseluruhan (transkriptom). Produk transkripsi hanyalah RNA, sehingga transkriptomika bisa juga disebut sebagai ilmu tentang RNA dalam suatu organisme. Meskipun demikian, karena dinamika RNA dalam sel dipelajari pula, sejumlah protein (vis a vis enzim) dan beberapa zat lain juga dipelajari dalam kaitan dengan modifikasi RNA. Dalam transkriptomika, peran PCR dan penggunaan cDNA sangat vital. RNA bersifat tidak stabil dan sangat mudah terpengaruh keadaan lingkungan sel. Pengubahan RNA hasil ekspresi menjadi cDNA menggunakan PCR membuat komposisi hasil ekspresi gen dapat diamati dengan lebih baik. * l * * s (in) The transcriptome is the set of all RNA transcripts, including coding and non-coding, in an individual or a population of cells. The term can also sometimes be used to refer to all RNAs, or just mRNA, depending on the particular experiment. The term transcriptome is a portmanteau of the words transcript and genome; it is associated with the process of transcript production during the biological process of transcription. The early stages of transcriptome annotations began with cDNA libraries published in the 1980s. Subsequently, the advent of high-throughput technology led to faster and more efficient ways of obtaining data about the transcriptome. Two biological techniques are used to study the transcriptome, namely DNA microarray, a hybridization-based technique and RNA-seq, a sequence-based approach. RNA-seq is the preferred method and has been the dominant transcriptomics technique since the 2010s. Single-cell transcriptomics allows tracking of transcript changes over time within individual cells. Data obtained from the transcriptome is used in research to gain insight into processes such as cellular differentiation, carcinogenesis, transcription regulation and biomarker discovery among others. Transcriptome-obtained data also finds applications in establishing phylogenetic relationships during the process of evolution and in in vitro fertilization. The transcriptome is closely related to other -ome based biological fields of study; it is complementary to the proteome and the metabolome and encompasses the translatome, exome, meiome and thanatotranscriptome which can be seen as ome fields studying specific types of RNA transcripts. There are quantifiable and conserved relationships between the Transcriptome and other -omes, and Transcriptomics data can be used effectively to predict other molecular species, such as metabolites. There are numerous publicly available transcriptome databases. (en) Viene definito trascrittoma la totalità degli RNA trascritti a partire da un genoma. Da questo concetto deriva la trascrittomica, una delle branche che si sono evolute dopo i primi sequenziamenti di interi genomi, quando ci si rese conto del limite imposto dalle analisi d'espressione genica usate tipicamente fino a quel momento (analisi single gene, come northern blotting e RT PCR), in grado di quantificare in modo relativo (cioè utilizzando come riferimento l'espressione di un gene che mantiene un'espressione costante, detto housekeeping) o in modo assoluto (numero di copie di un dato mRNA presente nella cellula) l'espressione di solo uno o pochi geni. La trascrittomica mira all'analisi di interi profili d'espressione, cioè a quantificare l'espressione di un gran numero o di tutti i trascritti, il trascrittoma appunto. Un tipico esempio di strumento per l'analisi del trascrittoma è il microarray, che permette di confrontare l'espressione di un intero genoma in diverse condizioni di crescita cellulare. (it) トランスクリプトーム（transcriptome）とは、特定の状況下において細胞中に存在する全てのmRNA（ないしは一次転写産物、 transcripts）の総体を指す呼称である。ゲノムは原則として同一個体内のすべての細胞で同一だが、トランスクリプトームでは状況が異なり、同一の個体にあっても組織ごとに、あるいは細胞外からの影響に呼応して固有の構成をとる。 トランスクリプトミクス（transcriptomics）とはトランスクリプトームを扱う学問である。トランスクリプトームの様態は、例えばDNAマイクロアレイの様に一度に幾万ものmRNAを識別する能力を持つ技術をもって解析される。遺伝子産物であるmRNAの階層の要素が、蛋白質の階層の要素と一対一に対応するとは限らない。蛋白質から構成されるシステムは、トランスクリプトームと同様な枠組みで理解され、プロテオームという概念で認識されている。トランスクリプトームの研究は生命を司る物質流転（メタボローム）を探求する上で残された重要な分野である。 (ja) 전사체(轉寫體, 영어: transcriptome)는 발현된 모든 RNA의 총합을 뜻한다. 이와 관련된 용어로, 유전체, 단백체, 상호작용체 등이 있다. 전사체는 주로 마이크로어레이를 이용하여 연구되고 있다. 전사체가 주는 의미는 유전자들의 기능을 총체적으로 네트워크로 이해할 수 있는 기본 자료와 분석 방법을 제공하는 것이다. (ko) Transkryptom (z połączenia słów transkrypt i genom) jest to zestaw cząsteczek mRNA (lub ogólniej: transkryptów) obecny w określonym momencie w komórce, grupie komórek lub organizmie. Transkryptom w przeciwieństwie do genomu jest tworem bardzo dynamicznym. Komórki w odpowiedzi na różne czynniki uruchamiają i wyłączają transkrypcję genów, zmieniając w ten sposób swój transkryptom. Często już kilka minut po zadziałaniu jakiegoś czynnika (np. stresu) na komórki można obserwować powstawanie transkryptów genów reakcji na ten czynnik. Badaniami transkryptomu zajmuje się dziedzina nauki nazywana transkryptomiką (przez analogię do genomiki czy proteomiki). Badania transkryptomiczne najczęściej służą określaniu poziomu ekspresji genów - ilości ich transkryptów w komórkach. Do badań tych wykorzystuje się techniki pozwalające na wykrywanie i ocenianie ilości różnych typów cząsteczek RNA, pochodzących z różnych genów, np. mikromacierze DNA. Poziom ekspresji genów może być mierzony wieloma metodami. Podstawowe metody powszechnie stosowane w laboratoriach do badania transkryptomu: * ilościowy PCR (ang. Quantitative Polymerase Chain Reaction, qPCR) - metoda, która służy do pomiaru poziomu pojedynczych transkryptów, wykorzystując ilościową amplifikację cDNA uzyskanego z reakcji odwrotnej transkrypcji RNA (ang. Reverse Transcription, RT); * mikromacierze - mikrochipy pokryte sondami DNA, które poprzez hybrydyzację na zasadzie komplementarności do wyznakowanych cząsteczek docelowych (cDNA lub cRNA) uzyskanych z badanego RNA umożliwiają symultaniczne określenie poziomu od dziesiątek do setek tysięcy transkryptów (ale tylko tych, które są reprezentowane na mikromacierzy przez komplementarne do nich sondy); * sekwencjonowanie RNA (RNAseq) - globalna metoda pomiaru poziomu wszystkich cząsteczek RNA stosująca sekwencjonowanie całego transkryptomu z wykorzystaniem sekwencjonowania następnej generacji (ang. Next Generation Seqeuncing, NGS). Zobacz też: proteom, genom, genomika. (pl) Het transcriptoom omvat alle RNA-moleculen in een cel, een populatie van cellen, of een organisme, die in verband staan met de transcriptie. In tegenstelling tot het genoom, dat min of meer constant van samenstelling is gedurende de levensduur van een cel of organisme, kan de samenstelling van het transcriptoom actief gewijzigd worden afhankelijk van ontwikkelingsstadia en invloeden vanuit de omgeving. (nl) Транскрипто́м (англ. transcriptome) — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа. В отличие от генома, который, как правило, одинаков для всех клеток одной линии, транскриптом может сильно меняться в зависимости от условий окружающей среды. Ввиду того, что понятие транскриптом включает в себя все транскрипты данной клетки, он также отражает профиль экспрессии генов в данный момент времени. Наиболее распространённый метод изучения транскриптома — секвенирование РНК и использование ДНК-микрочипов. (ru) Transcriptoma ou Transcritoma refere-se ao conjunto completo de transcritos (RNAs mensageiros, RNAs ribossômicos, RNAs transportadores e os microRNAs) de um dado organismo, órgão, tecido ou linhagem celular. Portanto, ele é o reflexo direto da expressão dos genes (ver vídeo ). O perfil do transcritoma pode variar segundo o momento (numa dada fase do ciclo celular, por exemplo), estado fisiológico, estímulos físicos, químicos, biológicos ou doenças.Como são os RNAm os codificadores das proteínas e, portanto, o centro dos interêsses da pesquisa de genômica funcional; na prática ficou estabelecido que o transcritoma abrange o conjunto desta espécie de RNA.Entretanto, recentemente, os pesquisadores incluíram os microRNAs no conceito de transcritoma por representarem uma classe muito importante de pequenos RNAs (contendo aproximadamente 20 a 22 nucleotídeos) que controlam a expressão gênica ao nível pós-transcricional, impedindo a tradução dos RNAm em proteínas. Para estudar o transcritoma os pesquisadores utilizam métodos de análise em grande escala como SAGE (serial analysis of gene expression) e os microarrays ou microarranjos (microarranjos de cDNA), os microarranjos de oligos e os DNA-chips). Recentemente o método de seqüenciamento em grande escala chamado de "deep sequencing" foi introduzido no estudo do transcritoma, mas devido seu alto custo a as dificuldades de análise dos dados, esse método ainda não é rotina. (pt) 转录组(英語：Transcriptome)，也称为“转录物组”，广义上指在相同环境（或生理条件）下的在一个细胞、或一群细胞中所能转录出的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA；狭义上则指细胞所能转录出的所有信使RNA（mRNA）。 (zh) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Affymetrix-microarray.jpg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://www.hal.inserm.fr/inserm-00512388/document https://omictools.com/mtd-3-tool http://tagc.univ-mrs.fr/tbrowser/ http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ http://www.ensembl.org/biomart/martview/4e6c01c28faed033db52d0d30e4c21ab |
| dbo:wikiPageID | 1075071 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 38155 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1122323640 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Cancer dbr:Endonuclease dbr:Enhancer_RNA dbr:Messenger_RNA dbr:Mutation dbr:Next-generation_sequencing dbr:Meiocyte dbr:Metabolite dbr:Metabolome dbr:Metabolomics dbr:Oocyte dbr:Arabidopsis dbr:Rhodophyta dbr:Risk_assessment dbr:DNA dbr:DNA_microarray dbr:Viridiplantae dbr:De_novo_transcriptome_assembly dbr:List_of_omics_topics_in_biology dbr:RNA_interference dbr:Proteome dbr:1000_Plant_Genomes_Project dbc:Omics dbr:Massively_parallel_signature_sequencing dbr:Meiosis dbr:Gene_expression dbr:Gene_set_enrichment_analysis dbr:Genetic_divergence dbr:Genome dbr:Oligonucleotide dbr:Transfer_RNA dbr:Weighted_correlation_network_analysis dbr:RNA_extraction dbr:RNA_splicing dbr:Gene dbr:RNA_polymerase_II dbr:Apoptosis dbr:Stem_cell dbr:Stem_cells dbr:Functional_genomics dbr:Portmanteau dbr:TATA_box dbr:Transposon dbr:Microarray dbr:Omics dbr:Cell_(biology) dbr:Tobacco dbr:Transcription_(biology) dbr:Translation_(genetics) dbr:RNA-Seq dbc:Gene_expression dbr:Alternative_splicing dbr:Eukaryote dbr:Evolution dbr:Exome dbr:Base_pair dbr:Carcinogenesis dbr:Cellular_differentiation dbr:Central_dogma_of_molecular_biology dbr:Fluorophore dbr:Forensic_medicine dbr:File:Metabolomics_schema.png dbr:Transcription_factor dbr:Protein dbr:RNA dbr:Rice dbc:RNA dbr:Hydrolysis dbr:Fetal_development dbr:Small_nucleolar_RNA dbr:CDNA dbr:Argonaute dbr:Attenuator_(genetics) dbc:RNA_splicing dbr:Bioinformatics dbr:Biomarker dbr:Biomarker_discovery dbr:Blastocyst dbr:Homologous_chromosome dbr:Terminator_(genetics) dbr:Translation_(biology) dbr:Thanatotranscriptome dbr:Phylogenetics dbr:Pollen dbr:Circulating_tumor_cell dbr:Embryonic_stem_cells dbr:In_vitro_fertilisation dbr:In_vitro_fertilization dbr:Organism dbr:Long_non-coding_RNA dbr:Serial_analysis_of_gene_expression dbr:Neologism dbr:Expressed_sequence_tag dbr:Expression_quantitative_trait_loci dbr:Ribosome dbr:Transcription_factor_II_D dbr:Small_interfering_RNA dbr:Piwi-interacting_RNA dbr:Translatome dbr:Five-prime_cap dbr:Transpogene dbr:RNA_editing dbr:Multiomics dbr:Ribonucleotide dbr:Phylogenetic_inference_using_transcriptomic_data dbr:Polyadenylation dbr:Single-cell_transcriptomics dbr:Non-coding_RNA dbr:Sonication dbr:Transcriptomics_technologies dbr:RNA-seq dbr:Precursor_cells dbr:Reverse_transcription dbr:Transcription_regulation dbr:Transcriptomics_technique dbr:Micro_RNA dbr:RNA_processing dbr:S._cerevisiae dbr:18S_RNA dbr:Embryo_selection dbr:Transcriptomics dbr:Gene_promoter dbr:Human_embryo dbr:Silk_moth dbr:28S_RNA dbr:Glaucophyta dbr:Piwi_protein dbr:Expressed_sequence_tags dbr:Expression_profiling dbr:Splice_variant_analysis dbr:File:Affymetrix-microarray.jpg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Citation dbt:Citation_needed dbt:Cite_journal dbt:Cmn dbt:Further dbt:Main dbt:Note dbt:Portal_bar dbt:Ref dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:See_also dbt:Short_description dbt:Genomics |
| dcterms:subject | dbc:Omics dbc:Gene_expression dbc:RNA dbc:RNA_splicing |
| gold:hypernym | dbr:Set |
| rdf:type | owl:Thing |
| rdfs:comment | Das Transkriptom ist die Summe aller zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer Zelle transkribierten, das heißt von der DNA in RNA umgeschriebenen Gene, also die Gesamtheit aller in einer Zelle hergestellten RNA-Moleküle. (de) El transcriptoma es el conjunto de todas las moléculas de ARN (también llamadas transcritos) presentes en una célula o grupo de células en un momento determinado. El término transcriptoma engloba tanto al ARN mensajero (mRNA), que puede traducirse en una proteína, como al ARN no codificante (ncRNA), que no se traduce; sin embargo, en ocasiones se utiliza de manera más laxa para referirse únicamente al conjunto de ARNs mensajeros. Dado que diferentes células expresan diferentes genes, cada tejido o tipo celular posee un transcriptoma único y distinto. Uno de los objetivos más importantes de la transcriptómica es identificar qué porción del genoma es transcrito en cada tipo celular y bajo qué condiciones. (es) Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome. L'analyse transcriptomique peut caractériser le transcriptome d'un tissu particulier, d'un type cellulaire, ou comparer les transcriptomes entre différentes conditions expérimentales. (fr) トランスクリプトーム（transcriptome）とは、特定の状況下において細胞中に存在する全てのmRNA（ないしは一次転写産物、 transcripts）の総体を指す呼称である。ゲノムは原則として同一個体内のすべての細胞で同一だが、トランスクリプトームでは状況が異なり、同一の個体にあっても組織ごとに、あるいは細胞外からの影響に呼応して固有の構成をとる。 トランスクリプトミクス（transcriptomics）とはトランスクリプトームを扱う学問である。トランスクリプトームの様態は、例えばDNAマイクロアレイの様に一度に幾万ものmRNAを識別する能力を持つ技術をもって解析される。遺伝子産物であるmRNAの階層の要素が、蛋白質の階層の要素と一対一に対応するとは限らない。蛋白質から構成されるシステムは、トランスクリプトームと同様な枠組みで理解され、プロテオームという概念で認識されている。トランスクリプトームの研究は生命を司る物質流転（メタボローム）を探求する上で残された重要な分野である。 (ja) 전사체(轉寫體, 영어: transcriptome)는 발현된 모든 RNA의 총합을 뜻한다. 이와 관련된 용어로, 유전체, 단백체, 상호작용체 등이 있다. 전사체는 주로 마이크로어레이를 이용하여 연구되고 있다. 전사체가 주는 의미는 유전자들의 기능을 총체적으로 네트워크로 이해할 수 있는 기본 자료와 분석 방법을 제공하는 것이다. (ko) Het transcriptoom omvat alle RNA-moleculen in een cel, een populatie van cellen, of een organisme, die in verband staan met de transcriptie. In tegenstelling tot het genoom, dat min of meer constant van samenstelling is gedurende de levensduur van een cel of organisme, kan de samenstelling van het transcriptoom actief gewijzigd worden afhankelijk van ontwikkelingsstadia en invloeden vanuit de omgeving. (nl) 转录组(英語：Transcriptome)，也称为“转录物组”，广义上指在相同环境（或生理条件）下的在一个细胞、或一群细胞中所能转录出的所有RNA的总和，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA（rRNA）、转运RNA（tRNA）及非编码RNA；狭义上则指细胞所能转录出的所有信使RNA（mRNA）。 (zh) الترنسكريبتوم (بالإنجليزية: Transcriptome) هي مجموعة كل جزيئات الرنا (RNA) التي تتضمن الرنا المرسال والرنا الريبوسومي والرنا الناقل وغيرها من أنواع التي يتم إنتاجها في خلية واحدة أو تجمع من الخلايا، تنتج جزيئات الرنا تلك من الدنا (DNA) . يمكن إطلاق هذا المصطلح على مجموعة النواسخ الكاملة في كائن ما أو على مجموعة فرعية محددة من النواسخ التي توجد في نوع خلوي معين. بعكس الجينوم وهو ثابت تقريبا لخط خلوي معين (إذا ما استثنينا الطفرات)، يمكن أن تتنوع مجموعة الترانسكربيتوم بتنوع الظروف البيئية. يعكس الترانسكربيتوم الجينات التي تم تعبيرها بنشاط في أي وقت محدد وذلك لأنه يشمل كل ناسخات الرنا في الخلية باستثناء ظاهرة تحلل الرنا المرسال مثل (بالإنجليزية: Transcriptional Attenuation). (ar) El transcriptoma és el conjunt de totes les molècules d'ARN, incloent l'ARN missatger, l'ARN ribosòmic, l'ARN de transferència i altres ARN no codificants que es produeix en una cèl·lula o en una població de cèl·lules en un moment determinat.Aquest terme es pot aplicar al conjunt total de transcrits en un determinat organisme o al subconjunt específic de transcripcions presents en un tipus de cèl·lula particular. Al contrari que el genoma, el qual està a grans trets fixat per una línia de cèl·lules donada (excloent les mutacions), el transcriptoma pot variar d'acord amb les condicions ambientals externes. El transcriptoma, així, apareix com un component dinàmic, en contraposició amb el genoma, molt més estàtic. Com que inclou totes les transcripcions de l'ARN missatger dins la cèl·lula, el (ca) Transkriptomika (bahasa Inggris: transcriptomics) merupakan bagian dari biologi molekular yang mengkaji tentang produk transkripsi secara keseluruhan (transkriptom). Produk transkripsi hanyalah RNA, sehingga transkriptomika bisa juga disebut sebagai ilmu tentang RNA dalam suatu organisme. Meskipun demikian, karena dinamika RNA dalam sel dipelajari pula, sejumlah protein (vis a vis enzim) dan beberapa zat lain juga dipelajari dalam kaitan dengan modifikasi RNA. * l * * s (in) The transcriptome is the set of all RNA transcripts, including coding and non-coding, in an individual or a population of cells. The term can also sometimes be used to refer to all RNAs, or just mRNA, depending on the particular experiment. The term transcriptome is a portmanteau of the words transcript and genome; it is associated with the process of transcript production during the biological process of transcription. (en) Viene definito trascrittoma la totalità degli RNA trascritti a partire da un genoma. Da questo concetto deriva la trascrittomica, una delle branche che si sono evolute dopo i primi sequenziamenti di interi genomi, quando ci si rese conto del limite imposto dalle analisi d'espressione genica usate tipicamente fino a quel momento (analisi single gene, come northern blotting e RT PCR), in grado di quantificare in modo relativo (cioè utilizzando come riferimento l'espressione di un gene che mantiene un'espressione costante, detto housekeeping) o in modo assoluto (numero di copie di un dato mRNA presente nella cellula) l'espressione di solo uno o pochi geni. La trascrittomica mira all'analisi di interi profili d'espressione, cioè a quantificare l'espressione di un gran numero o di tutti i trasc (it) Transkryptom (z połączenia słów transkrypt i genom) jest to zestaw cząsteczek mRNA (lub ogólniej: transkryptów) obecny w określonym momencie w komórce, grupie komórek lub organizmie. Transkryptom w przeciwieństwie do genomu jest tworem bardzo dynamicznym. Komórki w odpowiedzi na różne czynniki uruchamiają i wyłączają transkrypcję genów, zmieniając w ten sposób swój transkryptom. Często już kilka minut po zadziałaniu jakiegoś czynnika (np. stresu) na komórki można obserwować powstawanie transkryptów genów reakcji na ten czynnik. Zobacz też: proteom, genom, genomika. (pl) Transcriptoma ou Transcritoma refere-se ao conjunto completo de transcritos (RNAs mensageiros, RNAs ribossômicos, RNAs transportadores e os microRNAs) de um dado organismo, órgão, tecido ou linhagem celular. Portanto, ele é o reflexo direto da expressão dos genes (ver vídeo ). (pt) Транскрипто́м (англ. transcriptome) — совокупность всех транскриптов, синтезируемых одной клеткой или группой клеток, включая мРНК и некодирующие РНК. Понятие «транскриптом» может обозначать полный набор транскриптов в данном организме или специфический набор транскриптов (молекул РНК), представленный в клетках определённого типа. Наиболее распространённый метод изучения транскриптома — секвенирование РНК и использование ДНК-микрочипов. (ru) |
| rdfs:label | ترنسكربيتوم (ar) Transcriptoma (ca) Transkriptom (de) Transcriptoma (es) Transcriptome (fr) Transkriptomika (in) Trascrittoma (it) 전사체 (ko) トランスクリプトーム (ja) Transcriptoom (nl) Transkryptom (pl) Transcritoma (pt) Транскриптом (ru) Transcriptome (en) 转录组 (zh) |
| rdfs:seeAlso | dbr:Transcription_(biology) dbr:Transcriptomics_technologies |
| owl:sameAs | freebase:Transcriptome wikidata:Transcriptome dbpedia-ar:Transcriptome http://bs.dbpedia.org/resource/Transkriptom dbpedia-ca:Transcriptome dbpedia-de:Transcriptome dbpedia-es:Transcriptome dbpedia-fa:Transcriptome dbpedia-fr:Transcriptome dbpedia-gl:Transcriptome dbpedia-id:Transcriptome dbpedia-it:Transcriptome dbpedia-ja:Transcriptome dbpedia-ko:Transcriptome dbpedia-nl:Transcriptome dbpedia-pl:Transcriptome dbpedia-pt:Transcriptome dbpedia-ru:Transcriptome dbpedia-simple:Transcriptome dbpedia-zh:Transcriptome https://global.dbpedia.org/id/2NrBb |
| skos:closeMatch | http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/transcriptomics |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Transcriptome?oldid=1122323640&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Affymetrix-microarray.jpg wiki-commons:Special:FilePath/Metabolomics_schema.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Transcriptome |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Transcriptomes |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Cancer_Breakthroughs_2020 dbr:Carlos_Caldas dbr:Amur_ide dbr:Behavioral_syndrome dbr:Sarah_Tishkoff dbr:Epigenetic_clock dbr:Epitranscriptome dbr:Epitranscriptomic_sequencing dbr:Messenger_RNA dbr:MicroRNA dbr:Mervyn_Bibb dbr:Metabolome dbr:Metabolomics dbr:Metallome dbr:Monocyte dbr:Primary_transcript dbr:2021_in_science dbr:2022_in_science dbr:Bdelloidea dbr:Biomedicine dbr:Denma dbr:Antisense_RNA dbr:Apis_cerana dbr:Human_Cell_Atlas dbr:Human_brain dbr:Julian_Parkhill dbr:Bibliome dbr:Retina dbr:DNA_damage_theory_of_aging dbr:C1orf112 dbr:Victor_Velculescu dbr:De_novo_transcriptome_assembly dbr:Deinococcus_deserti dbr:Devil_facial_tumour_disease dbr:EWS/FLI dbr:Earthworm dbr:Index_of_genetics_articles dbr:Intestine-on-a-chip dbr:Polymerase_chain_reaction dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:List_of_omics_topics_in_biology dbr:Nutriepigenomics dbr:Proteome dbr:Pseudogene dbr:White-footed_mouse dbr:1000_Plant_Genomes_Project dbr:Compugen_(Israeli_company) dbr:Ancestry-informative_marker dbr:Chemical_defenses_in_Cannabis dbr:Erycina_pusilla dbr:Gene_expression dbr:Gene_prediction dbr:Genetic_engineering_techniques dbr:Genome_sequencing_of_endangered_species dbr:Genomic_imprinting dbr:Tarnished_plant_bug dbr:Oncovirus dbr:Oncogenomics dbr:Ribonuclease_V1 dbr:Quahog_parasite_unknown dbr:Scutogyrus dbr:Cluster_of_Excellence_Frankfurt_Macromolecular_Complexes dbr:Full-parasites dbr:GeneNetwork dbr:German_Network_for_Bioinformatics_Infrastructure dbr:Glossary_of_genetics dbr:Glossary_of_genetics_(M−Z) dbr:Molecular_phylogenetics dbr:N6-Methyladenosine dbr:Naked_mole-rat dbr:Cooperia_oncophora dbr:CrfA_RNA dbr:The_RNAi_Consortium dbr:Third-generation_sequencing dbr:Eric_R._Gamazon dbr:Anil_Grover dbr:Chimeric_RNA dbr:Chironomoidea dbr:Stampidine dbr:Clinical_metagenomic_sequencing dbr:Complementary_DNA dbr:Dendrogramma dbr:Embryo_quality dbr:John_Marioni dbr:Paired-end_tag dbr:Plant_matrix_metalloproteinase dbr:Transcriptome_in_vivo_analysis_tag dbr:Medical_biology dbr:Medicinal_plants dbr:Microbiome-wide_association_study dbr:Microfluidics dbr:Omics dbr:Balantidium dbr:Actin dbr:Timeline_of_senescence_research dbr:Transcription_(biology) dbr:Fusion_gene dbr:G&T-Seq dbr:Glasgow_Precision_Oncology_Laboratory dbr:HEK_293_cells dbr:Ion_semiconductor_sequencing dbr:LmαTX5 dbr:RNA-Seq dbr:Sequencing dbr:Natural_scientific_research_in_Canada dbr:Akhilesh_Kumar_Tyagi dbr:Alicia_Oshlack dbr:American_lobster dbr:DNA_sequencing dbr:Doxorubicin dbr:Erin_Schuman dbr:Evolution_of_snake_venom dbr:Exome dbr:Barbara_Wold dbr:Brine_shrimp dbr:Cellular_model dbr:Judy_Liu dbr:Zostera_marina dbr:List_of_RNA-Seq_bioinformatics_tools dbr:Siamese_fighting_fish dbr:RNA dbr:Jay_Dunlap dbr:Tapas_Kumar_Kundu dbr:Coverage_(genetics) dbr:Humulus_lupulus dbr:Plant_morphology dbr:Social_immunity dbr:Sociogenomics dbr:Arctic_fox dbr:ADAR dbr:Achim_Kramer dbr:John_B._Hogenesch dbr:Jute_genome dbr:Kathleen_Rubins dbr:Hermodice_carunculata dbr:High_throughput_biology dbr:Tau_protein dbr:Thanatotranscriptome dbr:Aspergillus_fumigatus_non-coding_RNAs dbr:Marine_protists dbr:C2orf74 dbr:C6orf136 dbr:CDNA_library dbr:CIT_Program_Tumor_Identity_Cards dbr:Pine dbr:Fergusonina dbr:Human_Endogenous_Retrovirus-W dbr:Human_epigenome dbr:Time-resolved_RNA_sequencing dbr:In_vitro_fertilisation dbr:Microbiome dbr:Cancer_Genome_Anatomy_Project dbr:Cancer_genome_sequencing dbr:Cap_analysis_gene_expression dbr:Xenacoelomorpha dbr:Long_non-coding_RNA dbr:Mountain_pine_beetle dbr:Seminal_fluid_protein dbr:Serial_analysis_of_gene_expression dbr:Stress_granule dbr:Suppression_subtractive_hybridization dbr:Short_Oligonucleotide_Analysis_Package dbr:Tobacco_smoking dbr:Neurogenomics dbr:TopHat_(bioinformatics) dbr:Eupolybothrus_cavernicolus dbr:European_Nucleotide_Archive dbr:Exometabolomics dbr:Expressome dbr:Extrachromosomal_DNA dbr:Extrachromosomal_circular_DNA dbr:FANTOM dbr:Illumina_dye_sequencing dbr:In_silico dbr:In_silico_PCR dbr:Ribosomal_pause dbr:Stem_cell_genomics dbr:Planarian_secretory_cell_nidovirus dbr:Rosehip_neuron dbr:Transdifferentiation dbr:Sunda_zebra_finch dbr:Translatomics dbr:Transpogene dbr:TCP-seq dbr:Molecular_cytogenetics dbr:Molecular_pathological_epidemiology dbr:Multiomics dbr:Phylogenetic_inference_using_transcriptomic_data dbr:SbRNA dbr:Polyploidy dbr:Popgenie dbr:Sequence_clustering dbr:Single-cell_analysis dbr:Tiling_array dbr:Single-cell_transcriptomics dbr:Micropeptide dbr:Non-coding_DNA dbr:RedToL dbr:Perturb-seq dbr:Pharmacometabolomics dbr:Phi_X_174 dbr:Ovarian_germ_cell_tumors dbr:Pan-cancer_analysis dbr:Parhyale_hawaiensis dbr:Rhabdosynochus dbr:Ribosome_profiling dbr:UniGene dbr:Transcriptomics_technologies dbr:Vanadyl_ribonucleoside dbr:Telomeric_repeat–containing_RNA dbr:Transcriptomes |
| is dbp:description of | dbr:UniGene |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Transcriptome |
