Single-strand conformation polymorphism (original) (raw)
Unter SSCP (englisch single strand conformation polymorphism) versteht man ein molekulares Nachweisverfahren, welches die Zusammensetzung und Veränderung von mikrobiellen Lebensgemeinschaften charakterisiert. Sie zählt zu den „DNA-Fingerprint“-Methoden.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Unter SSCP (englisch single strand conformation polymorphism) versteht man ein molekulares Nachweisverfahren, welches die Zusammensetzung und Veränderung von mikrobiellen Lebensgemeinschaften charakterisiert. Sie zählt zu den „DNA-Fingerprint“-Methoden. (de) El Polimorfismo de Conformación de Cadena Simple o SSCP, de sus siglas en Inglés (Single Strand Conformational Polymorphism) es una técnica de rastreo de mutaciones usada en el diagnóstico molecular basada en la migración electroforética del ADN. Se calcula que esta técnica detecta del 35 al 100% de las posibles mutaciones, pero debe haber al menos 30% de alelos mutantes. Es útil para detectar enfermedades hereditarias; sin embargo, es más complicado para detectar enfermedades somáticas como el cáncer. (es) Le polymorphisme de conformation des simples brins ou SSCP (acronyme de l'anglais single strand conformation polymorphism) est une technique de biologie moléculaire visant à séparer différents allèles d'un même gène (allozyme) en misant sur la différence de migration dans un gel non dénaturant de leurs différentes conformations. On utilise cette technique sur des gènes variables tels le gène mitochondrial 16S2 ou le gène de la cytochrome oxydase de type II (COII). (fr) Single-strand conformation polymorphism (SSCP), or single-strand chain polymorphism, is defined as a conformational difference of single-stranded nucleotide sequences of identical length as induced by differences in the sequences under certain experimental conditions. This property allows sequences to be distinguished by means of gel electrophoresis, which separates fragments according to their different conformations. (en) SSCP（Single Strand Conformation Polymorphismの略語、一本鎖高次構造多型）とは、熱変性させたDNAが分子内で水素結合を起こして高次構造を形成する際に、僅かな塩基配列の違いによりその高次構造に変化が生ずる（多型を示す）ことを指す。また、その高次構造の変化を指標として遺伝子の変異や多型を検出する手法を指している。 遺伝子の変異や多型を調べるために現在多く用いられる手法として、特定の遺伝子領域をPCR法により増幅して得られた増幅産物を試料DNAとして検出操作を実施する場合が多いことから、PCR-SSCP法と呼ばれる場合もある。 (ja) Un polimorfismo di conformazione del singolo filamento, noto anche come SSCP (dall'inglese single-strand conformation polymorphism o single-strand chain polymorphism) è definito come la differenza di conformazione tra due sequenze nucleotidiche di identica lunghezza dovuta a differenze nella composizione delle sequenze stesse.Questa qualità permette di separare e distinguere le sequenze attraverso un'elettroforesi su gel. Gel su cui sono state caricate sequenze caratterizzate da single-strand conformation polymorphism (it) Polimorfismo de conformação de filamento único ou polimorfismo de conformação de fita simples (SSCP, do inglês Single Strand Conformation Polymorphism) é definida como uma técnica de diferenciação de filamentos únicos de DNA de comprimentos idênticos como induzidos por diferenças nas sequências sob certas condições experimentais. Esta propriedade permite distinguir as seqüências por meio de eletroforese em gel, que separa as diferentes conformações. (pt) Метод поліморфізму конформації однониткової ДНК або SSCP(Single strand conformation polymorphism) — це молекулярно-генетичний метод, що широко використовують для аналізу мутацій в певних нуклеотидних послідовностях людини, але також він застосовується для аналізу як окремих мікроорганізмів, так і бактеріальних асоціацій. Суть цього підходу полягає в ПЛР ампліфікації фрагментів (близько 400 п. о.) бактеріальної з універсальними праймерами, один із яких фосфорильований на 5’-кінці. Фосфорильований ланцюг ПЛР продукту перетравлюється лямбда екзонуклеазою, а одноланцюгову ДНК, що лишилась, розділяють в поліакріламідних гелях, додаючи до буфера для нанесення проб , який запобігає з’єднанню ланцюгів і утворенню гетеродуплексів. Під час електрофорезу в неденатуруючих умовах однониткова ДНК формує вторинні структури (конформації) відповідно до її нуклеотидної послідовності і фізичних та хімічних умов середовища (температури і іонної сили). Фрагменти різної конформації, але однакового розміру мають різну електрофоретичну рухливість і можуть розділятися в поліакріламідних гелях без денатуруючихградієнтів. Хоча можлива наявність кількох ліній для одного мікроорганізму, що має кілька різних рРНК оперонів, та близька електрофоретична рухливість ПЛР продуктів різних бактерій, цей підхід дозволяє розрізняти між собою до десятка різних штамів, а також виявляти окремі штами в штучно створених сумішах та аналізувати ризосферні асоціації різних рослин. (uk) 單鏈構象多態性（英語：single-strand conformation polymorphism，简称为SSCP)是一種分離核酸的技術，可以分離相同長度但序列不同的核酸（性質類似於DGGE和TGGE，但方法不同）。 (zh) |
| dbo:wikiPageID | 7851422 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 3967 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1045146609 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Electrophoresis dbr:DNA dbc:Gene_tests dbr:Sequencing dbc:Molecular_biology |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist |
| dcterms:subject | dbc:Gene_tests dbc:Molecular_biology |
| rdf:type | yago:Abstraction100002137 yago:Cognition100023271 yago:Experiment105798043 yago:HigherCognitiveProcess105770664 yago:Inquiry105797597 yago:ProblemSolving105796750 yago:Process105701363 yago:PsychologicalFeature100023100 yago:WikicatGeneTests yago:Thinking105770926 yago:Trial105799212 |
| rdfs:comment | Unter SSCP (englisch single strand conformation polymorphism) versteht man ein molekulares Nachweisverfahren, welches die Zusammensetzung und Veränderung von mikrobiellen Lebensgemeinschaften charakterisiert. Sie zählt zu den „DNA-Fingerprint“-Methoden. (de) El Polimorfismo de Conformación de Cadena Simple o SSCP, de sus siglas en Inglés (Single Strand Conformational Polymorphism) es una técnica de rastreo de mutaciones usada en el diagnóstico molecular basada en la migración electroforética del ADN. Se calcula que esta técnica detecta del 35 al 100% de las posibles mutaciones, pero debe haber al menos 30% de alelos mutantes. Es útil para detectar enfermedades hereditarias; sin embargo, es más complicado para detectar enfermedades somáticas como el cáncer. (es) Le polymorphisme de conformation des simples brins ou SSCP (acronyme de l'anglais single strand conformation polymorphism) est une technique de biologie moléculaire visant à séparer différents allèles d'un même gène (allozyme) en misant sur la différence de migration dans un gel non dénaturant de leurs différentes conformations. On utilise cette technique sur des gènes variables tels le gène mitochondrial 16S2 ou le gène de la cytochrome oxydase de type II (COII). (fr) Single-strand conformation polymorphism (SSCP), or single-strand chain polymorphism, is defined as a conformational difference of single-stranded nucleotide sequences of identical length as induced by differences in the sequences under certain experimental conditions. This property allows sequences to be distinguished by means of gel electrophoresis, which separates fragments according to their different conformations. (en) SSCP（Single Strand Conformation Polymorphismの略語、一本鎖高次構造多型）とは、熱変性させたDNAが分子内で水素結合を起こして高次構造を形成する際に、僅かな塩基配列の違いによりその高次構造に変化が生ずる（多型を示す）ことを指す。また、その高次構造の変化を指標として遺伝子の変異や多型を検出する手法を指している。 遺伝子の変異や多型を調べるために現在多く用いられる手法として、特定の遺伝子領域をPCR法により増幅して得られた増幅産物を試料DNAとして検出操作を実施する場合が多いことから、PCR-SSCP法と呼ばれる場合もある。 (ja) Un polimorfismo di conformazione del singolo filamento, noto anche come SSCP (dall'inglese single-strand conformation polymorphism o single-strand chain polymorphism) è definito come la differenza di conformazione tra due sequenze nucleotidiche di identica lunghezza dovuta a differenze nella composizione delle sequenze stesse.Questa qualità permette di separare e distinguere le sequenze attraverso un'elettroforesi su gel. Gel su cui sono state caricate sequenze caratterizzate da single-strand conformation polymorphism (it) Polimorfismo de conformação de filamento único ou polimorfismo de conformação de fita simples (SSCP, do inglês Single Strand Conformation Polymorphism) é definida como uma técnica de diferenciação de filamentos únicos de DNA de comprimentos idênticos como induzidos por diferenças nas sequências sob certas condições experimentais. Esta propriedade permite distinguir as seqüências por meio de eletroforese em gel, que separa as diferentes conformações. (pt) 單鏈構象多態性（英語：single-strand conformation polymorphism，简称为SSCP)是一種分離核酸的技術，可以分離相同長度但序列不同的核酸（性質類似於DGGE和TGGE，但方法不同）。 (zh) Метод поліморфізму конформації однониткової ДНК або SSCP(Single strand conformation polymorphism) — це молекулярно-генетичний метод, що широко використовують для аналізу мутацій в певних нуклеотидних послідовностях людини, але також він застосовується для аналізу як окремих мікроорганізмів, так і бактеріальних асоціацій. (uk) |
| rdfs:label | SSCP (de) Polimorfismo de conformación de cadena simple (es) Polymorphisme de conformation des simples brins (fr) Polimorfismo di conformazione del singolo filamento (it) SSCP (ja) Single-strand conformation polymorphism (en) Polimorfismo de conformação de filamento único (pt) Поліморфізм конформації однониткової ДНК (uk) 單鏈構象多態性 (zh) |
| owl:sameAs | freebase:Single-strand conformation polymorphism yago-res:Single-strand conformation polymorphism wikidata:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-de:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-es:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-fr:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-it:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-ja:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-pt:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-uk:Single-strand conformation polymorphism dbpedia-zh:Single-strand conformation polymorphism https://global.dbpedia.org/id/jXxC |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Single-strand_conformation_polymorphism?oldid=1045146609&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Single-strand_conformation_polymorphism |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Single_strand_conformation_polymorphism dbr:Single_Strand_Conformation_Polymorphism dbr:Single-stranded_conformational_polymorphism |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Gel_electrophoresis dbr:Gene_polymorphism dbr:Ocular_albinism_type_1 dbr:Bisulfite_sequencing dbr:Single-nucleotide_polymorphism dbr:Single_strand_conformation_polymorphism dbr:Suillus_pungens dbr:Surveyor_nuclease_assay dbr:Single_Strand_Conformation_Polymorphism dbr:Single-stranded_conformational_polymorphism |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Single-strand_conformation_polymorphism |