Site-specific recombination (original) (raw)

About DBpedia

位點特異性重組(Site-specific recombination)是生物基因重組的一種機制,即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組,此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會,位點特異性(SSR)會與DNA結合,切割兩段DNA後促進酯交換反應,使一段DNA與另一段DNA連接-而形成霍利迪交叉,再進行第二次切割而得到重組過的兩段DNA。重組酶可分為酪胺酸重組酶(如與)與絲胺酸重組酶(如與)兩大類,兩者結構與詳細反應機理均不同,前者僅分別切割兩段DNA的一股,後者則將兩段共4股DNA都切割。 位點特異性重組的特異性很高,在DNA複製與可動遺傳因子插入等過程中會發生,也被用作基因工程的一項技術。此重組依重複片段的排列狀況可能有整合、切除與倒位三種結果,兩段不同DNA間的位點特異性重組可造成一段DNA被整合進另一段DNA中,同DNA中兩段同向序列的位點特異性重組可造成中間的序列被移除,而兩段反向序列的位點特異性重組則可造成中間序列倒位。

thumbnail

Property Value
dbo:abstract Site-specific recombination, also known as conservative site-specific recombination, is a type of genetic recombination in which DNA strand exchange takes place between segments possessing at least a certain degree of sequence homology. Enzymes known as site-specific recombinases (SSRs) perform rearrangements of DNA segments by recognizing and binding to short, specific DNA sequences (sites), at which they cleave the DNA backbone, exchange the two DNA helices involved, and rejoin the DNA strands. In some cases the presence of a recombinase enzyme and the recombination sites is sufficient for the reaction to proceed; in other systems a number of accessory proteins and/or accessory sites are required. Many different genome modification strategies, among these recombinase-mediated cassette exchange (RMCE), an advanced approach for the targeted introduction of transcription units into predetermined genomic loci, rely on SSRs. Site-specific recombination systems are highly specific, fast, and efficient, even when faced with complex eukaryotic genomes. They are employed naturally in a variety of cellular processes, including bacterial genome replication, differentiation and pathogenesis, and movement of mobile genetic elements. For the same reasons, they present a potential basis for the development of genetic engineering tools. Recombination sites are typically between 30 and 200 nucleotides in length and consist of two motifs with a partial inverted-repeat symmetry, to which the recombinase binds, and which flank a central crossover sequence at which the recombination takes place. The pairs of sites between which the recombination occurs are usually identical, but there are exceptions (e.g. attP and attB of λ integrase). (en) Сайт-специфическая рекомбинация — тип генетической рекомбинации, в которой при обмене цепей ДНК происходит реакция между специфическими . Перестановка сегментов ДНК происходит путем распознавания и связывания коротких последовательностей ДНК (сайтов), в которых специальные ферменты расщепляют, переставляют и снова соединяют цепи ДНК. Для одних систем рекомбинации достаточно только фермента рекомбиназы, другие же требуют наличия дополнительных факторов. В природе сайт-специфическая рекомбинация случается при интеграции вируса в геном (образование провируса). Системы сайтспецифической рекомбинации высокоспецифичны, быстры и эффективны даже при работе со сложными эукариотическими геномами и по этой причине широко используются в генетической инженерии Они участвуют во множестве клеточных процессов, включая репликацию бактериального генома, патогенез, передвижение мобильных генетических элементов и образовании антител в лимфоидных клетках млекопитающих. Сайты рекомбинации обычно имеют длину от 30 до 200 нуклеотидов и состоят из двух инвертированных повторов, с которыми связывается рекомбиназа, между которыми располагается последовательность, по которой и происходит рекомбинация. Оба сайта, по которым происходит рекомбинация, как правило идентичны, но бывают и исключения (например сайты интеграции фага λ attP и attB, см. фаг лямбда). (ru) 位點特異性重組(Site-specific recombination)是生物基因重組的一種機制,即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組,此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會,位點特異性(SSR)會與DNA結合,切割兩段DNA後促進酯交換反應,使一段DNA與另一段DNA連接-而形成霍利迪交叉,再進行第二次切割而得到重組過的兩段DNA。重組酶可分為酪胺酸重組酶(如與)與絲胺酸重組酶(如與)兩大類,兩者結構與詳細反應機理均不同,前者僅分別切割兩段DNA的一股,後者則將兩段共4股DNA都切割。 位點特異性重組的特異性很高,在DNA複製與可動遺傳因子插入等過程中會發生,也被用作基因工程的一項技術。此重組依重複片段的排列狀況可能有整合、切除與倒位三種結果,兩段不同DNA間的位點特異性重組可造成一段DNA被整合進另一段DNA中,同DNA中兩段同向序列的位點特異性重組可造成中間的序列被移除,而兩段反向序列的位點特異性重組則可造成中間序列倒位。 (zh)
dbo:thumbnail wiki-commons:Special:FilePath/STswap.png?width=300
dbo:wikiPageID 10095073 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength 19553 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID 1064285902 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink dbr:Nucleotide dbr:Deoxyribose dbr:Holliday_junction dbr:DNA dbr:DNA_replication dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:Nucleophilic dbc:Biotechnology dbc:Molecular_genetics dbr:Genetic_recombination dbr:Enzyme dbr:Genetic_engineering dbr:Transposon dbc:Cellular_processes dbr:Transesterification dbr:Tyrosine dbr:Adenosine_triphosphate dbc:Molecular_biology dbr:Eukaryotic dbr:Covalent_bond dbr:Cre-Lox_recombination dbr:Cre_recombinase dbr:P1_phage dbc:Genetics_techniques dbr:Lambda_phage dbr:Synapsis dbr:Cofactor_(biochemistry) dbr:Homologous_recombination dbr:Pathogenesis dbr:Recombinase dbr:Recombinase-mediated_cassette_exchange dbr:Phosphate dbr:Serine dbr:Sequence_homology dbr:Mobile_genetic_elements dbr:FLP-FRT_recombination dbr:Phosphodiester_bond dbr:Site-specific_recombinase_technology dbr:Hydroxyl_group dbr:Tn3_resolvase dbr:DNA_invertase dbr:Gamma-delta_resolvase dbr:File:Cre-lox_insertion_excision.svg dbr:File:Cre-lox_inversion.svg dbr:File:STswap.png dbr:File:SUrot.png dbr:Gamma-delta dbr:Wiktionary:resolvase
dbp:wikiPageUsesTemplate dbt:Reflist
dcterms:subject dbc:Biotechnology dbc:Molecular_genetics dbc:Cellular_processes dbc:Molecular_biology dbc:Genetics_techniques
gold:hypernym dbr:Recombination
rdf:type yago:WikicatCellularProcesses yago:Abstraction100002137 yago:Act100030358 yago:Activity100407535 yago:Event100029378 yago:Procedure101023820 yago:PsychologicalFeature100023100 yago:YagoPermanentlyLocatedEntity
rdfs:comment 位點特異性重組(Site-specific recombination)是生物基因重組的一種機制,即兩段具有一定同源序列的DNA發生重組,此過程中兩段DNA序列會發先發生聯會,位點特異性(SSR)會與DNA結合,切割兩段DNA後促進酯交換反應,使一段DNA與另一段DNA連接-而形成霍利迪交叉,再進行第二次切割而得到重組過的兩段DNA。重組酶可分為酪胺酸重組酶(如與)與絲胺酸重組酶(如與)兩大類,兩者結構與詳細反應機理均不同,前者僅分別切割兩段DNA的一股,後者則將兩段共4股DNA都切割。 位點特異性重組的特異性很高,在DNA複製與可動遺傳因子插入等過程中會發生,也被用作基因工程的一項技術。此重組依重複片段的排列狀況可能有整合、切除與倒位三種結果,兩段不同DNA間的位點特異性重組可造成一段DNA被整合進另一段DNA中,同DNA中兩段同向序列的位點特異性重組可造成中間的序列被移除,而兩段反向序列的位點特異性重組則可造成中間序列倒位。 (zh) Site-specific recombination, also known as conservative site-specific recombination, is a type of genetic recombination in which DNA strand exchange takes place between segments possessing at least a certain degree of sequence homology. Enzymes known as site-specific recombinases (SSRs) perform rearrangements of DNA segments by recognizing and binding to short, specific DNA sequences (sites), at which they cleave the DNA backbone, exchange the two DNA helices involved, and rejoin the DNA strands. In some cases the presence of a recombinase enzyme and the recombination sites is sufficient for the reaction to proceed; in other systems a number of accessory proteins and/or accessory sites are required. Many different genome modification strategies, among these recombinase-mediated cassette ex (en) Сайт-специфическая рекомбинация — тип генетической рекомбинации, в которой при обмене цепей ДНК происходит реакция между специфическими . Перестановка сегментов ДНК происходит путем распознавания и связывания коротких последовательностей ДНК (сайтов), в которых специальные ферменты расщепляют, переставляют и снова соединяют цепи ДНК. Для одних систем рекомбинации достаточно только фермента рекомбиназы, другие же требуют наличия дополнительных факторов. В природе сайт-специфическая рекомбинация случается при интеграции вируса в геном (образование провируса). (ru)
rdfs:label Site-specific recombination (en) Сайт-специфическая рекомбинация (ru) 位點特異性重組 (zh)
owl:sameAs freebase:Site-specific recombination yago-res:Site-specific recombination wikidata:Site-specific recombination dbpedia-ru:Site-specific recombination dbpedia-zh:Site-specific recombination https://global.dbpedia.org/id/4ujJn
prov:wasDerivedFrom wikipedia-en:Site-specific_recombination?oldid=1064285902&ns=0
foaf:depiction wiki-commons:Special:FilePath/Cre-lox_insertion_excision.svg wiki-commons:Special:FilePath/Cre-lox_inversion.svg wiki-commons:Special:FilePath/STswap.png wiki-commons:Special:FilePath/SUrot.png
foaf:isPrimaryTopicOf wikipedia-en:Site-specific_recombination
is dbo:knownFor of dbr:Nat_Sternberg
is dbo:wikiPageDisambiguates of dbr:SSR dbr:Site-specific
is dbo:wikiPageRedirects of dbr:Phage_integrase dbr:Site_specific_recombination
is dbo:wikiPageWikiLink of dbr:Holliday_junction dbr:DNA_binding_site dbr:Index_of_molecular_biology_articles dbr:Integrase dbr:Integron dbr:Inverted_repeat dbr:Ligation_(molecular_biology) dbr:Nucleoid dbr:Gene_cassette dbr:Genetic_recombination dbr:Cloning_vector dbr:Bacteriophage dbr:Bacteriophage_P2 dbr:Bacteriophage_T12 dbr:P1_phage dbr:Prostaglandin_EP4_receptor dbr:Lambda_phage dbr:Recombinase dbr:Recombinase-mediated_cassette_exchange dbr:Regine_Kahmann dbr:Nat_Sternberg dbr:CSSR dbr:SSR dbr:Site-specific dbr:FLP-FRT_recombination dbr:Site-specific_recombinase_technology dbr:Phage_integrase dbr:Site_specific_recombination
is dbp:knownFor of dbr:Nat_Sternberg
is foaf:primaryTopic of wikipedia-en:Site-specific_recombination