Thermodynamic integration (original) (raw)

Property Value
dbo:abstract Thermodynamic integration is a method used to compare the difference in free energy between two given states (e.g., A and B) whose potential energies and have different dependences on the spatial coordinates. Because the free energy of a system is not simply a function of the phase space coordinates of the system, but is instead a function of the Boltzmann-weighted integral over phase space (i.e. partition function), the free energy difference between two states cannot be calculated directly from the potential energy of just two coordinate sets (for state A and B respectively). In thermodynamic integration, the free energy difference is calculated by defining a thermodynamic path between the states and integrating over ensemble-averaged enthalpy changes along the path. Such paths can either be real chemical processes or alchemical processes. An example alchemical process is the method. (en) 熱力学的積分法(ねつりきがくてきせきぶんほう、英: Thermodynamic integration、TI法)は、ポテンシャルエネルギーが空間座標に異なる依存性を持つ2つの任意の状態(ポテンシャルエネルギーおよびを持つ状態AおよびB)間の自由エネルギーにおける差を比較するために用いられる手法である。系の自由エネルギーは単に系の位相空間座標の関数ではなく、位相空間上のボルツマン重みをかけた積分の関数(すなわち分配関数)であるため、2つの状態間の自由エネルギー差は2つの座標セット(それぞれ状態AおよびBのもの)のポテンシャルエネルギーから直接的には計算できない。熱力学的積分法では、自由エネルギー差は状態間の熱力学的経路を定義し、この経路に沿ったアンサンブル平均エンタルピー変化を積分することによって計算される。こういった経路は実際の化学的(chemical)な過程でも錬金術的(alchemical)な過程でもよい。錬金術的(非科学的)過程の一例は、Kirkwoodの結合パラメーター法である。 (ja)
dbo:wikiPageID 15127042 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength 4670 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID 1049132261 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink dbr:Canonical_ensemble dbc:Statistical_mechanics dbr:Umbrella_sampling dbr:Thermodynamic_free_energy dbr:Bennett_acceptance_ratio dbr:Partition_function_(statistical_mechanics) dbc:Computational_chemistry dbr:Boltzmann_distribution dbr:Free_energy_perturbation dbr:Parallel_tempering dbr:Kirkwood's_coupling_parameter
dct:subject dbc:Statistical_mechanics dbc:Computational_chemistry
rdfs:comment 熱力学的積分法(ねつりきがくてきせきぶんほう、英: Thermodynamic integration、TI法)は、ポテンシャルエネルギーが空間座標に異なる依存性を持つ2つの任意の状態(ポテンシャルエネルギーおよびを持つ状態AおよびB)間の自由エネルギーにおける差を比較するために用いられる手法である。系の自由エネルギーは単に系の位相空間座標の関数ではなく、位相空間上のボルツマン重みをかけた積分の関数(すなわち分配関数)であるため、2つの状態間の自由エネルギー差は2つの座標セット(それぞれ状態AおよびBのもの)のポテンシャルエネルギーから直接的には計算できない。熱力学的積分法では、自由エネルギー差は状態間の熱力学的経路を定義し、この経路に沿ったアンサンブル平均エンタルピー変化を積分することによって計算される。こういった経路は実際の化学的(chemical)な過程でも錬金術的(alchemical)な過程でもよい。錬金術的(非科学的)過程の一例は、Kirkwoodの結合パラメーター法である。 (ja) Thermodynamic integration is a method used to compare the difference in free energy between two given states (e.g., A and B) whose potential energies and have different dependences on the spatial coordinates. Because the free energy of a system is not simply a function of the phase space coordinates of the system, but is instead a function of the Boltzmann-weighted integral over phase space (i.e. partition function), the free energy difference between two states cannot be calculated directly from the potential energy of just two coordinate sets (for state A and B respectively). In thermodynamic integration, the free energy difference is calculated by defining a thermodynamic path between the states and integrating over ensemble-averaged enthalpy changes along the path. Such paths can eit (en)
rdfs:label 熱力学的積分法 (ja) Thermodynamic integration (en)
owl:sameAs freebase:Thermodynamic integration wikidata:Thermodynamic integration dbpedia-ja:Thermodynamic integration https://global.dbpedia.org/id/4wy75
prov:wasDerivedFrom wikipedia-en:Thermodynamic_integration?oldid=1049132261&ns=0
foaf:isPrimaryTopicOf wikipedia-en:Thermodynamic_integration
is dbo:wikiPageDisambiguates of dbr:TI
is dbo:wikiPageWikiLink of dbr:Qbox dbr:Protein_pKa_calculations dbr:Bennett_acceptance_ratio dbr:Chorismate_mutase dbr:TI dbr:Free_energy_perturbation dbr:Integral
is foaf:primaryTopic of wikipedia-en:Thermodynamic_integration