Trans-activating crRNA (original) (raw)
El tracrRNA (trans-activating crRNA) o l'ARNcr trans-activador en biologia molecular és un fragment curt d'ARN que està involucrat en la maduració del crRNA,va ser primerament descubert en el sistema CRISPR de Streptococcus pyogenes. L'ARNcrtra és complementari amb el pre-crRNA, els quals formen un complex d'ARN. Una ribonucleasa III el talla per forma l'híbrid crRNA/tracrRNA. Aquest complex actua com a guía de la Cas9. Aquesta seqüència es troba a l'extrem 5' en el locus CRISPR, seguit pels gens Cas.
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| dbo:abstract | El tracrRNA (trans-activating crRNA) o l'ARNcr trans-activador en biologia molecular és un fragment curt d'ARN que està involucrat en la maduració del crRNA,va ser primerament descubert en el sistema CRISPR de Streptococcus pyogenes. L'ARNcrtra és complementari amb el pre-crRNA, els quals formen un complex d'ARN. Una ribonucleasa III el talla per forma l'híbrid crRNA/tracrRNA. Aquest complex actua com a guía de la Cas9. Aquesta seqüència es troba a l'extrem 5' en el locus CRISPR, seguit pels gens Cas. (ca) Trans-activating crRNA (tracrRNA) ist eine RNA, die in Bakterien als Bestandteil des antiviralen adaptiven Immunsystems CRISPR vorkommt und zur CRISPR/Cas-Methode, CRISPRi und CRISPRa verwendet wird. (de) In molecular biology, trans-activating crispr RNA (tracrRNA) is a small trans-encoded RNA. It was first discovered by Emmanuelle Charpentier in her study of human pathogen Streptococcus pyogenes, a type of bacteria that causes harm to humanity. In bacteria and archaea; CRISPR-Cas (clustered, regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins) constitute an RNA-mediated defense system which protects against viruses and plasmids. This defensive pathway has three steps. First a copy of the invading nucleic acid is integrated into the CRISPR locus. Next, CRISPR RNAs are transcribed from this CRISPR locus. The crRNAs are then incorporated into effector complexes, where the crRNA guides the complex to the invading nucleic acid and the Cas proteins degrade this nucleic acid. There are several CRISPR system subtypes. Type II CRISPR-Cas systems require a tracrRNA which plays a role in the maturation of crRNA.The tracrRNA is partially complementary to and base pairs with a pre-crRNA forming an RNA duplex. This is cleaved by RNase III, an RNA-specific ribonuclease, to form a crRNA/tracrRNA hybrid. This hybrid acts as a guide for the endonuclease Cas9, which cleaves the invading nucleic acid. (en) In biologia molecolare, il crRNA trans-attivatore (tracrRNA) è un piccolo RNA con un ruolo importante all'interno del sistema difensivo CRISPR/Cas; è, tuttavia, codificato da un gene esterno al locus CRISPR. È stato scoperto per la prima volta nel patogeno Streptococcus pyogenes. Nei batteri e archea; CRISPR/Cas (acronimo dall'inglese Clustered, Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats/CRISPR-associated proteins) costituisce un sistema difensivo che li protegge da invasioni virali o da plasmidi potenzialmente dannosi. Questo sistema difensivo è costituito fondamentalmente da tre fasi. Innanzitutto una copia del DNA invasore (fagico o plasmidico) è integrato all'interno del locus CRISPR. Dopodiché, esso viene trascritto producendo il cosiddetto pre-crRNA (CRISPR RNA non maturo). Infine, l'RNA viene reclutato da Cas9 formando un complesso attivo. Vi sono numerose vie attraverso cui questo RNA può essere attivato; una delle meglio conosciute richiede la trans-attività del tracrRNA, il quale è in grado di complementarsi parzialmente con il pre-crRNA formando un ibrido di RNA a doppio filamento. Tale ibrido non maturo è soggetto a tagli ribonucleasici mediati dalla RNasi III, una ribonucleasi RNA specifica, che genera il duplex maturo denominato ibrido crRNA/tracrRNA. Questo RNA è incorporato in un complesso effettore con la proteina endonucleasica Cas9, dove funge da RNA guida per il riconoscimento di acido nucleico estraneo, in seguito degradato da Cas9. (it) Em biologia molecular, o crRNA de ativação em trans (tracrRNA) é um pequeno RNA codificado em trans. Ele foi decoberto primeiramente no patógeno humano Streptococcus pyogenes. Em bacterias e arqueas, o sistema CRISPR/Cas (clustered, regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins, em português repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas/ Proteínas associadas ao CRISPR) constitue um sitema de defesa mediado por RNA que confere proteção a (contra?) vírus e plasmídeos. Essa via de defesa é constituída em três etapas. Na primeira, uma cópia de partes do ácido nucleico invasor é integrada ao locus CRISPR. Depois, os CRISPR RNAs (crRNAs) são transcritos a partir desse locus CRISPR. Os crRNAs são, então, incorporados a complexos efetores, onde o crRNA guia o complexo por complementariedade a demais cópias de vírus ou plasmídeos invasores, promovendo degradação pelas proteínas Cas. Há uma variedade de vias para ativação dos sistemas CRISPR, uma das quais utiliza tracrRNAs, que participam da maturação do crRNA. O tracrRNA é complementar e pareia com pre-crRNAs, formando duplex de RNA. Esse conjunto é clivado pela RNase III, uma ribonuclease específica para RNA, formando um híbrido crRNA/tracrRNA hybrid. Esse híbrido age como guia para a endonuclease Cas9, que é capaz de clivar a sequência de ácidos nucleicos alvo. (pt) |
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