* Количество игр и голов за профессиональный клуб считается только для различных лиг национальных чемпионатов, откорректировано по состоянию на 29 сентября 2006. ** Количество игр и голов за национальную сборную в официальных матчах, откорректировано по состояниюна 29 сентября 2006.
В период игровой карьеры, в 1967—1973 годах, нападающий также выступал и за сборную Мексики, в составе которой провёл 13 матчей и забил 5 мячей.
Тренерская
Клубная
Став тренером, Лапуэнте возглавил один из своих бывших клубов, «Пуэблу», с которым уже в сезоне 1982/83 стал чемпионом Мексики. Уйдя из клуба в 1984 году и вернувшись в него вновь в 1988-м, Мануэлю удалось с «Пуэблой» выиграть ещё 3 титула, а именно ещё раз стать чемпионом Мексики (в сезоне 1989/90), стать обладателем Кубка Мексики 1989/90 и выиграть Кубок чемпионов КОНКАКАФ 1991. В дальнейшем Лапуэнте удалось вновь стать дважды чемпионом Мексики, но уже руководя клубом «Некакса», за который тренер выступал во время игровой карьеры. Под руководством Мануэля, «Некакса» выиграла два чемпионата Мексики подряд, а произошло это в сезонах 1994/95 и 1995/96. Также Лапуэнте выигрывал ещё один чемпионат Мексики с клубом «Америка» из города Мехико, а произошло это летом2002 года. Последним клубным титулом в тренерской карьере Мануэля стала победа «Америки» в Кубке чемпионов КОНКАКАФ 2006.
С пятью чемпионскими титулами, Лапуэнте наряду с Хавьером де ла Торре делит третью строчку в рейтинге побед тренеров в чемпионатах Мексики. Выше разместились только Игнасио Трельес (7 титулов) и Рауль Карденас (6 титулов)[1].
В 2011 году Лапуэнте был предложен пост вице-президента клуба «Америка» из города Мехико, и Мануэль согласился.
Лапуэнте руководил сборной Мексики и на Чемпионате мира 1998[4], на котором мексиканцы дошли до стадии 1/8 финала, на которой со счётом 1:2 уступили сборной Германии.