Angélica Aparecida Vieira Adami - Academia.edu (original) (raw)
Papers by Angélica Aparecida Vieira Adami
Journal of Biological Systems, Mar 1, 2004
We present a model to study a fungi population submitted to chemical control, incorporating the f... more We present a model to study a fungi population submitted to chemical control, incorporating the fungicide application directly into the model. From that, we obtain an optimal control strategy that minimizes both the fungicide application (cost) and leaf area damaged by fungi population during the interval between the moment when the disease is detected (t=0) and the time of harvest (t=tf). Initially, the parameters of the model are considered constant. Later, we consider the apparent infection rate depending on the time (and the temperature) and do some simulations to illustrate and to compare with the constant case.
Orientadores: Gláucia Maria Pastore, Rosângela dos SantosDissertação (mestrado) - Universidade Es... more Orientadores: Gláucia Maria Pastore, Rosângela dos SantosDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de AlimentosResumo: Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinação deles; sao varios os fatores que envolvem os beneficios que estes em combinacao podem agregar para a saude dos consumidores. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar o comportamento simbiotico in vitro das linhagens probioticas Bifidobacterium animalis (Bb-12) e Lactobacillus acidophillus (LA-05), em substratos enriquecidos com oligossacarideos, ou seja, avaliar se esses potencializavam a capacidade probiotica das linhagens estudadas. Os oligossacarideos utilizados no estudo foram o galactooligossacarideo (GOS) sintetizado pela ?-galactosidase de Scopulariops sp., frutooligossacarideo (FOSOrafti) e extrato bruto de Yacon. Avaliou-se o efeito bifidogenico de diferentes concentracoes de GOS, FOS e Yacon utilizando as culturas probioticas e sua capacidade d...
Editora Direitos para esta edição cedidos à Atena Editora pelos autores. Open access publication ... more Editora Direitos para esta edição cedidos à Atena Editora pelos autores. Open access publication by Atena Editora Todo o conteúdo deste livro está licenciado sob uma Licença de Atribuição Creative Commons. Atribuição-Não-Comercial-NãoDerivativos 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0). O conteúdo dos artigos e seus dados em sua forma, correção e confiabilidade são de responsabilidade exclusiva dos autores, inclusive não representam necessariamente a posição oficial da Atena Editora. Permitido o download da obra e o compartilhamento desde que sejam atribuídos créditos aos autores, mas sem a possibilidade de alterála de nenhuma forma ou utilizá-la para fins comerciais. Todos os manuscritos foram previamente submetidos à avaliação cega pelos pares, membros do Conselho Editorial desta Editora, tendo sido aprovados para a publicação com base em critérios de neutralidade e imparcialidade acadêmica. A Atena Editora é comprometida em garantir a integridade editorial em todas as etapas do processo de publicação, evitando plágio, dados ou resultados fraudulentos e impedindo que interesses financeiros comprometam os padrões éticos da publicação. Situações suspeitas de má conduta científica serão investigadas sob o mais alto padrão de rigor acadêmico e ético.
Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinacao deles; sao varios os fato... more Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinacao deles; sao varios os fatores que envolvem os beneficios que estes em combinacao podem agregar para a saude dos consumidores. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar o comportamento simbiotico in vitro das linhagens probioticas Bifidobacterium animalis (Bb-12) e Lactobacillus acidophillus (LA-05), em substratos enriquecidos com oligossacarideos, ou seja, avaliar se esses potencializavam a capacidade probiotica das linhagens estudadas. Os oligossacarideos utilizados no estudo foram o galactooligossacarideo (GOS) sintetizado pela ?-galactosidase de Scopulariops sp., frutooligossacarideo (FOSOrafti) e extrato bruto de Yacon. Avaliou-se o efeito bifidogenico de diferentes concentracoes de GOS, FOS e Yacon utilizando as culturas probioticas e sua capacidade de acidificacao do meio. Foi avaliado o perfil hidrofobico e acido da membrana celular dos probioticos usando meio enriquecido com GOS, FOS e controle meio MRS (Man Rogosa e Sharpe) sem fonte de dextrose; pelo metodo MATH (aderencia microbiana de hidrocarbonetos). Realizou-se tambem a producao, extracao e quantificacao de exopolissacarideos (EPS) por Lactobacillus acidophillus (LA-05) em meios enriquecidos com FOS e GOS, a quantificacao foi pelo metodo fenol-sulfurico seguida de leitura de absorbancia a 490nm, os resultados foram submetidos a uma curva padrao de glicose. Verificou-se ainda o antagonismo das linhagens probioticas cultivadas em meios suplementados com GOS, FOS, Yacon, MRS sem fonte de dextrose e controle MRS adicionado de NaOH, sobre linhagens patogenicas; o antagonismo foi avaliado atraves do metodo de difusao em agar. Avaliou tambem a capacidade de producao de acido latico. Na avaliacao bifidogenica os resultados revelaram que os substratos estimularam o metabolismo dos probioticos estudados. A melhor atividade para as linhagem de Lactobacillus acidophillus (LA-05) foi com o substrato GOS com atividade de 11,56 LogUFC (na concentracao de 200mg de GOS, em 12 horas de incubacao), e para e Bifidobacterium animalis (Bb12) foi com o substrato FOS com atividade de 11,3 LogUFC (na concentracao de 100mg FOS, em 12 horas de incubacao), na medida que se aumentou a concentracao dos substratos, houve a reducao da atividade bifidogenica. Os resultados revelaram que os prebioticos GOS e FOS estimularam o perfil de adesao e acidez da membrana celular das linhagens probioticas estudadas, quando comparado com o controle meio MRS sem fonte de dextrose. Quanto a producao de EPS, o maior valor (13,53 \g.mL) foi obtido apos 48 horas de cultivo em caldo MRS suplementado com GOS (25% v/v), enquanto que o FOS (25% v/v) tambem estimulou a producao (7,68 \g.mL) em 12 horas, seguida da queda de producao apos este periodo. Verificou-se que os oligossacarideos estimularam a acao antagonica dos probioticos sobre os micro-organismos patogenicos, e que esta inibicao do crescimento pode estar ligada com a producao de acidos pelos probioticos em conjunto com os oligossacarideos. Em sintese, os resultados revelaram que os oligossacarideos estimularam o potencial probiotico das linhagens estudadas Abstract
Enciclopédia Biosfera, 2021
trabalho licenciado sob licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Inte... more trabalho licenciado sob licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License. RESUMO A pandemia causada pelo vírus SARS-CoV-2, conhecida como Covid-19, ocasionou uma nova realidade em todo planeta. Das grandes indústrias alimentícias, restaurantes comerciais, mercados até chegar ao pequeno agricultor, todos vivenciaram adaptação à mudanças, como distanciamento social, adequação ao uso de máscaras, novas práticas de trabalhos, uso frequente de álcool em gel, entre outras. O objetivo deste estudo foi verificar, por meio de relatos, como os empreendedores se ajustaram às condições impostas para a reabertura dos serviços oferecidos em restaurantes comerciais durante a pandemia da Covid-19. A coleta de dados foi realizada mediante informações fornecidas por empresários do ramo de restaurantes por meio de uma empresa de Consultoria de Nutrição,localizada no Sul de Minas Gerais. Foram relatadas as experiências e desafios de cada empresário acerca das restrições impostas pela Vigilância Sanitária para a reabertura dos estabelecimentos. Os resultados mostraram que as normas implementadas pela Agência Nacional de Vigilância Sanitária referente a Covid-19 foram aplicadas corretamente, garantindo a prevenção do contágio e a segurança dos clientes e mantendo a seguridade alimentar,fazendo com que assim os riscos de contágio sejam minimizados, fazendo parte de um processo evolutivo que visa reorganizar todas as ações dos estabelecimentos.
ICES Journal of Marine Science, 2018
In this article, we present the first use of genetic assignment to determine the origins of farme... more In this article, we present the first use of genetic assignment to determine the origins of farmed Atlantic salmon (Salmo salar L.) escaping directly into freshwater. Juvenile fish (n ¼ 220) sampled from rotary screw traps operating on tributaries of Loch Shin in Scotland had characteristics suggesting they were of farm origin (scale losses, fin damage, and vaccination marks). To investigate their origins, baseline samples (n ¼ 1200) were collected from the two freshwater smolt rearing facilities on the Loch. Baseline analysis with 186 single-nucleotide polymorphic (SNP) markers identified three assignment units associated with the aquaculture strains in production, Mowi and Aquagen at Site A and Fanad at Site B. Exclusion analysis identified at least 37% of the suspected escapees as being of farmed origin, 95% from Site A and 5% from B. The non-random nature of fish collection and trapping locations prevented determination of either absolute proportions of escapees in the entire Shin system or escape proportions from each site. However, it was clear that fish from both sources had escaped. The study demonstrates that genetic assignment to farm origin is possible in a novel situation in which fish have escaped at the smolt stage directly into freshwater.
Revista Agrogeoambiental, 2016
Este trabalho teve como objetivo avaliar a possível influência da cafeicultura implantada em Sist... more Este trabalho teve como objetivo avaliar a possível influência da cafeicultura implantada em Sistema Agroflorestal (SAF) e em Sistema Convencional de Produção (SCP), sobre os FMA’s. As amostragens das áreas de estudo, foram coletadas em Agosto de 2012 (época seca do ano). Os esporos foram extraídos pelo método do peneiramento úmido, e suas respectivas contagens foram realizadas 24 horas depois de realizada a técnica de extração dos mesmos, com o auxílio de microscópio estereoscópico. Os dados estatísticos foram tratados no software Statistica 2009, através da avaliação do DP (desvio padrão) dos valores e relação das médias através do Teste de Tukey (p<0,05). O menor número de esporos encontrados sob o cultivo de SCP foi de 103 unidades/50 mL de solo, e o maior foi de 142 unidades/50 mL de solo. O menor número de esporos encontrados sob o cultivo de SAF foi de 275 unidades/50 mL de solo, e o maior foi de 319 unidades/50 mL de solo. Os números de esporos de FMA’s encontrados neste ...
PLOS ONE, 2016
Understanding the habitat use patterns of migratory fish, such as Atlantic salmon (Salmo salar L.... more Understanding the habitat use patterns of migratory fish, such as Atlantic salmon (Salmo salar L.), and the natural and anthropogenic impacts on them, is aided by the ability to identify individuals to their stock of origin. Presented here are the results of an analysis of informative single nucleotide polymorphic (SNP) markers for detecting genetic structuring in Atlantic salmon in Scotland and NE England and their ability to allow accurate genetic stock identification. 3,787 fish from 147 sites covering 27 rivers were screened at 5,568 SNP markers. In order to identify a cost-effective subset of SNPs, they were ranked according to their ability to differentiate between fish from different rivers. A panel of 288 SNPs was used to examine both individual assignments and mixed stock fisheries and eighteen assignment units were defined. The results improved greatly on previously available methods and, for the first time, fish caught in the marine environment can be confidently assigned to geographically coherent units within Scotland and NE England, including individual rivers. As such, this SNP panel has the potential to aid understanding of the various influences acting upon Atlantic salmon on their marine migrations, be they natural environmental variations and/or anthropogenic impacts, such as mixed stock fisheries and interactions with marine power generation installations.
Journal of Applied Microbiology, 2010
Revista Agrogeoambiental, 2015
Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the... more Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the crops located in the south of Minas Gerais State, Brazil. The leaves of the plants were severely attacked by an uncommon fungus in the regional crops, mainly in 2005 and 2006. The non-immediate identification of the microorganism resulted in catastrophic pathogen control processes performed by farmers who, eagerly trying to save their crops ended up using a series of toxic agrochemicals that had been previously purchased for the control of other types of diseases. Due to these events, the present paper aims at identifying the pathogen and put chemical as well as biological products into test that might help control the disease. Results showed that no fungicide under test in the present experiment was able to inhibit the isolate at a 100% rate, even under in vitro conditions. Pathogen identification revealed a fungi known as Pestalotiopsis longisetula.
Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the... more Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the crops located in the south of Minas Gerais State, Brazil. The leaves of the plants were severely attacked by an uncommon fungus in the regional crops, mainly in 2005 and 2006. The non-immediate identification of the microorganism resulted in catastrophic pathogen control processes performed by farmers who, eagerly trying to save their crops ended up using a series of toxic agrochemicals that had been previously purchased for the control of other types of diseases. Due to these events, the present paper aims at identifying the pathogen and put chemical as well as biological products into test that might help control the disease. Results showed that no fungicide under test in the present experiment was able to inhibit the isolate at a 100% rate, even under in vitro conditions. Pathogen identification revealed a fungi known as Pestalotiopsis longisetula. Palavras-chave: Morango. Doenças do...
Two areas of coffee were evaluated, an implanted one in Agroforestry System (AFS) and another in ... more Two areas of coffee were evaluated, an implanted one in Agroforestry System (AFS) and another in Production Conventional System (PCS) on the arbuscular mycorrhizal fungi (AMFs). Soil samples in the areas of study were collected at a 0-20 cm depth with Dutch auger type in 10 random points with a limitation of 30 x 5 m; four replicates of each point were removed from the plant crown projection of four coffee plant quadrants in August 2012 (dry season). The spores were extracted by the wet sieving method and their respective scores of systems were performed 24 hours after its extraction with the aid of a stereoscopic microscope. The results were submitted to 2009 Statistic software,
through the evaluation of SD (standard deviation) values and ratio of averages by Tukey test (p < 0.05). In PCS, the number of spores ranged between 103 and 142 units/50 ml soil, whereas in the SAF, it ranged between 275 and 319 units/50 ml soil. The AMF spore numbers found were higher in the area under AFS cultivation than in the area under PCS cultivation; therefore, there was influence on the type of management
conducted in coffee areas.
Palavras-chave: Agrofloresta. Microbiologia. Micorrizas. Esporos.
Journal of Biological Systems, Mar 1, 2004
We present a model to study a fungi population submitted to chemical control, incorporating the f... more We present a model to study a fungi population submitted to chemical control, incorporating the fungicide application directly into the model. From that, we obtain an optimal control strategy that minimizes both the fungicide application (cost) and leaf area damaged by fungi population during the interval between the moment when the disease is detected (t=0) and the time of harvest (t=tf). Initially, the parameters of the model are considered constant. Later, we consider the apparent infection rate depending on the time (and the temperature) and do some simulations to illustrate and to compare with the constant case.
Orientadores: Gláucia Maria Pastore, Rosângela dos SantosDissertação (mestrado) - Universidade Es... more Orientadores: Gláucia Maria Pastore, Rosângela dos SantosDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de AlimentosResumo: Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinação deles; sao varios os fatores que envolvem os beneficios que estes em combinacao podem agregar para a saude dos consumidores. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar o comportamento simbiotico in vitro das linhagens probioticas Bifidobacterium animalis (Bb-12) e Lactobacillus acidophillus (LA-05), em substratos enriquecidos com oligossacarideos, ou seja, avaliar se esses potencializavam a capacidade probiotica das linhagens estudadas. Os oligossacarideos utilizados no estudo foram o galactooligossacarideo (GOS) sintetizado pela ?-galactosidase de Scopulariops sp., frutooligossacarideo (FOSOrafti) e extrato bruto de Yacon. Avaliou-se o efeito bifidogenico de diferentes concentracoes de GOS, FOS e Yacon utilizando as culturas probioticas e sua capacidade d...
Editora Direitos para esta edição cedidos à Atena Editora pelos autores. Open access publication ... more Editora Direitos para esta edição cedidos à Atena Editora pelos autores. Open access publication by Atena Editora Todo o conteúdo deste livro está licenciado sob uma Licença de Atribuição Creative Commons. Atribuição-Não-Comercial-NãoDerivativos 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0). O conteúdo dos artigos e seus dados em sua forma, correção e confiabilidade são de responsabilidade exclusiva dos autores, inclusive não representam necessariamente a posição oficial da Atena Editora. Permitido o download da obra e o compartilhamento desde que sejam atribuídos créditos aos autores, mas sem a possibilidade de alterála de nenhuma forma ou utilizá-la para fins comerciais. Todos os manuscritos foram previamente submetidos à avaliação cega pelos pares, membros do Conselho Editorial desta Editora, tendo sido aprovados para a publicação com base em critérios de neutralidade e imparcialidade acadêmica. A Atena Editora é comprometida em garantir a integridade editorial em todas as etapas do processo de publicação, evitando plágio, dados ou resultados fraudulentos e impedindo que interesses financeiros comprometam os padrões éticos da publicação. Situações suspeitas de má conduta científica serão investigadas sob o mais alto padrão de rigor acadêmico e ético.
Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinacao deles; sao varios os fato... more Estudos sao realizados com oligossacarideos, probioticos e a combinacao deles; sao varios os fatores que envolvem os beneficios que estes em combinacao podem agregar para a saude dos consumidores. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar o comportamento simbiotico in vitro das linhagens probioticas Bifidobacterium animalis (Bb-12) e Lactobacillus acidophillus (LA-05), em substratos enriquecidos com oligossacarideos, ou seja, avaliar se esses potencializavam a capacidade probiotica das linhagens estudadas. Os oligossacarideos utilizados no estudo foram o galactooligossacarideo (GOS) sintetizado pela ?-galactosidase de Scopulariops sp., frutooligossacarideo (FOSOrafti) e extrato bruto de Yacon. Avaliou-se o efeito bifidogenico de diferentes concentracoes de GOS, FOS e Yacon utilizando as culturas probioticas e sua capacidade de acidificacao do meio. Foi avaliado o perfil hidrofobico e acido da membrana celular dos probioticos usando meio enriquecido com GOS, FOS e controle meio MRS (Man Rogosa e Sharpe) sem fonte de dextrose; pelo metodo MATH (aderencia microbiana de hidrocarbonetos). Realizou-se tambem a producao, extracao e quantificacao de exopolissacarideos (EPS) por Lactobacillus acidophillus (LA-05) em meios enriquecidos com FOS e GOS, a quantificacao foi pelo metodo fenol-sulfurico seguida de leitura de absorbancia a 490nm, os resultados foram submetidos a uma curva padrao de glicose. Verificou-se ainda o antagonismo das linhagens probioticas cultivadas em meios suplementados com GOS, FOS, Yacon, MRS sem fonte de dextrose e controle MRS adicionado de NaOH, sobre linhagens patogenicas; o antagonismo foi avaliado atraves do metodo de difusao em agar. Avaliou tambem a capacidade de producao de acido latico. Na avaliacao bifidogenica os resultados revelaram que os substratos estimularam o metabolismo dos probioticos estudados. A melhor atividade para as linhagem de Lactobacillus acidophillus (LA-05) foi com o substrato GOS com atividade de 11,56 LogUFC (na concentracao de 200mg de GOS, em 12 horas de incubacao), e para e Bifidobacterium animalis (Bb12) foi com o substrato FOS com atividade de 11,3 LogUFC (na concentracao de 100mg FOS, em 12 horas de incubacao), na medida que se aumentou a concentracao dos substratos, houve a reducao da atividade bifidogenica. Os resultados revelaram que os prebioticos GOS e FOS estimularam o perfil de adesao e acidez da membrana celular das linhagens probioticas estudadas, quando comparado com o controle meio MRS sem fonte de dextrose. Quanto a producao de EPS, o maior valor (13,53 \g.mL) foi obtido apos 48 horas de cultivo em caldo MRS suplementado com GOS (25% v/v), enquanto que o FOS (25% v/v) tambem estimulou a producao (7,68 \g.mL) em 12 horas, seguida da queda de producao apos este periodo. Verificou-se que os oligossacarideos estimularam a acao antagonica dos probioticos sobre os micro-organismos patogenicos, e que esta inibicao do crescimento pode estar ligada com a producao de acidos pelos probioticos em conjunto com os oligossacarideos. Em sintese, os resultados revelaram que os oligossacarideos estimularam o potencial probiotico das linhagens estudadas Abstract
Enciclopédia Biosfera, 2021
trabalho licenciado sob licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Inte... more trabalho licenciado sob licença Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License. RESUMO A pandemia causada pelo vírus SARS-CoV-2, conhecida como Covid-19, ocasionou uma nova realidade em todo planeta. Das grandes indústrias alimentícias, restaurantes comerciais, mercados até chegar ao pequeno agricultor, todos vivenciaram adaptação à mudanças, como distanciamento social, adequação ao uso de máscaras, novas práticas de trabalhos, uso frequente de álcool em gel, entre outras. O objetivo deste estudo foi verificar, por meio de relatos, como os empreendedores se ajustaram às condições impostas para a reabertura dos serviços oferecidos em restaurantes comerciais durante a pandemia da Covid-19. A coleta de dados foi realizada mediante informações fornecidas por empresários do ramo de restaurantes por meio de uma empresa de Consultoria de Nutrição,localizada no Sul de Minas Gerais. Foram relatadas as experiências e desafios de cada empresário acerca das restrições impostas pela Vigilância Sanitária para a reabertura dos estabelecimentos. Os resultados mostraram que as normas implementadas pela Agência Nacional de Vigilância Sanitária referente a Covid-19 foram aplicadas corretamente, garantindo a prevenção do contágio e a segurança dos clientes e mantendo a seguridade alimentar,fazendo com que assim os riscos de contágio sejam minimizados, fazendo parte de um processo evolutivo que visa reorganizar todas as ações dos estabelecimentos.
ICES Journal of Marine Science, 2018
In this article, we present the first use of genetic assignment to determine the origins of farme... more In this article, we present the first use of genetic assignment to determine the origins of farmed Atlantic salmon (Salmo salar L.) escaping directly into freshwater. Juvenile fish (n ¼ 220) sampled from rotary screw traps operating on tributaries of Loch Shin in Scotland had characteristics suggesting they were of farm origin (scale losses, fin damage, and vaccination marks). To investigate their origins, baseline samples (n ¼ 1200) were collected from the two freshwater smolt rearing facilities on the Loch. Baseline analysis with 186 single-nucleotide polymorphic (SNP) markers identified three assignment units associated with the aquaculture strains in production, Mowi and Aquagen at Site A and Fanad at Site B. Exclusion analysis identified at least 37% of the suspected escapees as being of farmed origin, 95% from Site A and 5% from B. The non-random nature of fish collection and trapping locations prevented determination of either absolute proportions of escapees in the entire Shin system or escape proportions from each site. However, it was clear that fish from both sources had escaped. The study demonstrates that genetic assignment to farm origin is possible in a novel situation in which fish have escaped at the smolt stage directly into freshwater.
Revista Agrogeoambiental, 2016
Este trabalho teve como objetivo avaliar a possível influência da cafeicultura implantada em Sist... more Este trabalho teve como objetivo avaliar a possível influência da cafeicultura implantada em Sistema Agroflorestal (SAF) e em Sistema Convencional de Produção (SCP), sobre os FMA’s. As amostragens das áreas de estudo, foram coletadas em Agosto de 2012 (época seca do ano). Os esporos foram extraídos pelo método do peneiramento úmido, e suas respectivas contagens foram realizadas 24 horas depois de realizada a técnica de extração dos mesmos, com o auxílio de microscópio estereoscópico. Os dados estatísticos foram tratados no software Statistica 2009, através da avaliação do DP (desvio padrão) dos valores e relação das médias através do Teste de Tukey (p<0,05). O menor número de esporos encontrados sob o cultivo de SCP foi de 103 unidades/50 mL de solo, e o maior foi de 142 unidades/50 mL de solo. O menor número de esporos encontrados sob o cultivo de SAF foi de 275 unidades/50 mL de solo, e o maior foi de 319 unidades/50 mL de solo. Os números de esporos de FMA’s encontrados neste ...
PLOS ONE, 2016
Understanding the habitat use patterns of migratory fish, such as Atlantic salmon (Salmo salar L.... more Understanding the habitat use patterns of migratory fish, such as Atlantic salmon (Salmo salar L.), and the natural and anthropogenic impacts on them, is aided by the ability to identify individuals to their stock of origin. Presented here are the results of an analysis of informative single nucleotide polymorphic (SNP) markers for detecting genetic structuring in Atlantic salmon in Scotland and NE England and their ability to allow accurate genetic stock identification. 3,787 fish from 147 sites covering 27 rivers were screened at 5,568 SNP markers. In order to identify a cost-effective subset of SNPs, they were ranked according to their ability to differentiate between fish from different rivers. A panel of 288 SNPs was used to examine both individual assignments and mixed stock fisheries and eighteen assignment units were defined. The results improved greatly on previously available methods and, for the first time, fish caught in the marine environment can be confidently assigned to geographically coherent units within Scotland and NE England, including individual rivers. As such, this SNP panel has the potential to aid understanding of the various influences acting upon Atlantic salmon on their marine migrations, be they natural environmental variations and/or anthropogenic impacts, such as mixed stock fisheries and interactions with marine power generation installations.
Journal of Applied Microbiology, 2010
Revista Agrogeoambiental, 2015
Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the... more Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the crops located in the south of Minas Gerais State, Brazil. The leaves of the plants were severely attacked by an uncommon fungus in the regional crops, mainly in 2005 and 2006. The non-immediate identification of the microorganism resulted in catastrophic pathogen control processes performed by farmers who, eagerly trying to save their crops ended up using a series of toxic agrochemicals that had been previously purchased for the control of other types of diseases. Due to these events, the present paper aims at identifying the pathogen and put chemical as well as biological products into test that might help control the disease. Results showed that no fungicide under test in the present experiment was able to inhibit the isolate at a 100% rate, even under in vitro conditions. Pathogen identification revealed a fungi known as Pestalotiopsis longisetula.
Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the... more Over the past seven years, pestalotiopsis has been the main strawberry disease found all over the crops located in the south of Minas Gerais State, Brazil. The leaves of the plants were severely attacked by an uncommon fungus in the regional crops, mainly in 2005 and 2006. The non-immediate identification of the microorganism resulted in catastrophic pathogen control processes performed by farmers who, eagerly trying to save their crops ended up using a series of toxic agrochemicals that had been previously purchased for the control of other types of diseases. Due to these events, the present paper aims at identifying the pathogen and put chemical as well as biological products into test that might help control the disease. Results showed that no fungicide under test in the present experiment was able to inhibit the isolate at a 100% rate, even under in vitro conditions. Pathogen identification revealed a fungi known as Pestalotiopsis longisetula. Palavras-chave: Morango. Doenças do...
Two areas of coffee were evaluated, an implanted one in Agroforestry System (AFS) and another in ... more Two areas of coffee were evaluated, an implanted one in Agroforestry System (AFS) and another in Production Conventional System (PCS) on the arbuscular mycorrhizal fungi (AMFs). Soil samples in the areas of study were collected at a 0-20 cm depth with Dutch auger type in 10 random points with a limitation of 30 x 5 m; four replicates of each point were removed from the plant crown projection of four coffee plant quadrants in August 2012 (dry season). The spores were extracted by the wet sieving method and their respective scores of systems were performed 24 hours after its extraction with the aid of a stereoscopic microscope. The results were submitted to 2009 Statistic software,
through the evaluation of SD (standard deviation) values and ratio of averages by Tukey test (p < 0.05). In PCS, the number of spores ranged between 103 and 142 units/50 ml soil, whereas in the SAF, it ranged between 275 and 319 units/50 ml soil. The AMF spore numbers found were higher in the area under AFS cultivation than in the area under PCS cultivation; therefore, there was influence on the type of management
conducted in coffee areas.
Palavras-chave: Agrofloresta. Microbiologia. Micorrizas. Esporos.