Сравнительный анализ генотипов штаммов Helicobacter pylori в Ростовской и Астраханской областях. Медицинский вестник Юга Рос-сии (original) (raw)
Related papers
Филогенетический анализ геномов штаммов Vibrio cholerae, выделенных на территории Ростовской области
Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, 2013
научно-исследовательский противочумный институт, Ростов-на-Дону; 3 НИИ медицины труда, Москва Цель. Определение происхождения двух штаммов Vibrio cholerae, выделенных на территории Ростовской области, с использованием данных полногеномного секвенирования. Материалы и методы. Исследовали токсигенный штамм 2011EL-301-V. cholerae O1 Эль-Тор Inaba №301 (ctxAB + , tcpA +) и нетоксигенный штамм V. cholerae О1 Ogawa P-18785 (ctxAB-, tcpA +). Секвенирование проводили на платформе MiSeq. Филогенетический анализ полученных геномов проведен на основе сравнения консервативной части исследуемых и ранее секвенированных 54 геномов. Результаты. Геном штамма 2011EL-301 был представлен 164 контигами со средним покрытием 100, показатель N50 составил 132 тыс. п.о., для штамма P-18785-159 контигами с покрытием 69, N50-83 тыс. п.о. Полученные контиги для штамма 2011EL-301 депонированы в базах данных DDBJ/EMBL/GenBank с номером доступа AJFN02000000, для штамма P-18785-ANHS00000000. Было выявлено 716 белок-кодирующих ортологичных генов. По результатам филогенетического анализа штамм P-18785 относится к субгруппе PG-1 (группа штаммов-предшественников 7 пандемии). Штамм 2011EL-301 относится к группе штаммов 7 пандемии и включается в кластер с поздними изолятами, которые ассоциированы со случаями холеры в ЮАР и случаями заноса холеры в США из Пакистана. Заключение. Полученные данные позволили установить филогенетические связи с ранее выделенными штаммами V. cholerae.
2013
Numerous studies have shown that Helicobacter pylori (H. pylori) is a leading etiologic factor in the development of chronic atrophic gastritis, one gastric ulcer and duodenal ulcer, and gastric cancer. Effective prevention of gastroduodenal pathology requires the right information about its prevalence in the population and risk factors. The most reliable information can be obtained during medical examination of the able-bodied population, which provides in-depth clinical examination of contingents with the identification of asymptomatic pathology, detection of risk groups, the substantiation of prophylactic measures and tracking their efficacy. Material and methods. During the clinical examination of the manufacturing contingents there was performed a study of the presence of infection Helicobacter pylori (H. pylori) in 2414 people aged 19 to 74 years. For more details on the presence of gastroduodenal pathology 991 people were examined with the use of clinical methods and intervie...
2016
Aim of investigation. To determine antimicrobial susceptibility of H. pylori in Smolensk in 2015-2016. Material and methods. Overall 248 adult patients with positive rapid urease test at the time of gastroscopy were included in the study. Antimicrobial susceptibility testing of H. pylori isolates to clarithromycin, amoxicillin, metronidazole, levofloxacin, rifampicin, tetracycline was performed by the agar dilution method. Results. H. pylori was isolated in 33% (n=82) of patients (24 isolates were nonviable after freezing). The rates of resistance among tested isolates of H. pylori were: 3,5% (2/58) for clarithromycin, 3,5% (2/58) for amoxicillin, 10.3% (6/58) for metronidazole, 27,6% (16/58) for levofloxacin, 8.6% (5/58) for rifampicin. No isolates showed resistance to tetracycline. Among 58 H. pylori isolates 29% (17 isolates) were resistant to one antimicrobial agent, 12,1% (7 isolates) were resistant to two antimicrobial agents. Associated resistance was observed for levofloxaci...
Геномно-протеомная характеристика вариабельности Helicobacter pylori
2009
Ведущая организация: Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова Защита диссертации состоится «14» мая 2009 года в часов на заседании Диссертационного совета Д 001.010.01 при Учреждении Российской академии медицинских наук Научно-исследовательском институте биомедициской химии им. В.Н. Ореховича РАМН (ИБМХ РАМН) по адресу: 119121, г. Москва, Погодинская ул., д. 10. С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке НИИ биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН Автореферат разослан « _» 2009 г. Учёный секретарь диссертационного совета кандидат химических наук ' f t" "/^" Елена Анатольевна Карпова ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ Актуальность проблемы Helicobacter pylori-грамотрицательная, микроаэрофильная бактерия, колонизирую щая слизистую оболочку желудка и ассоциированная с язвенной болезнью желудка и двенадцатиперстной кишки, атрофическими гастритами, аденокарциномой или экстранодалыюй В-клеточной MALT-лимфомой (Mucosa Associated Lymphoid Tissue). Я. pylori является одним из самых распространенных возбудителей инфекционных заболеваний. Согласно некоторым оценкам, более половины населения мира инфицированы этим микроорганизмом. Инфекция Н. pylori часто не имеет клинических проявлений. Только у определенной части инфицированных (10-15%) с течением времени появляются клинически значимые симптомы болезни: развивается хронический гастрит, язвенная болезнь желудка и двенадцатиперстной кишки, рак желудка. В 2005 г. первооткрыватели бактерии, Робин Уоррен (Robin Warren) и Барри Маршалл (Barry Marshall), были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине «за открытие бактерии Helicobacter pylori и ее роли в развитии гастрита и язвы желудка»
The alimentary tract of a healthy human being is a special ecosystem and stomach with its acid environment occupies a unique place in this system. According to the statistical data of last ten years, about 5-10 % of population in developed world is suffering from Chronic Gastritis and Peptic Ulcer. These diseases are among main diseases also in Georgia, especially in Samegrelo Region. They affect both men and women almost with the same frequency. According to the research of both foreign and our scientists of last ten years, Helicobacter pylori plays crucial role in the etiology and pathogenesis of these diseases. There is a link in 85-90 % of cases. Due to action of H. pylori defense mechanisms of mucous membranes deteriorate and aggressive factors increase. At the International Congress of Gastroenterologists (Australia, 1990) so called " Sydney Classification " was adopted for different types of Gastritis. This classification names a special form of Gastritis – H. pylori-associated Chronic Gastritis or " B Gastritis ". European Research Group for H. pylori and distinguished European gastroenterologists adopted so called " Maastricht Agreement " in 1996 (Maastricht, Netherlands). This agreement was principally new and it covers essential aspects of H. pylori eradication. The etiology of Chronic Piloro-Antral Gastritis is completely It is true that the role of infection in etiology of Peptic Ulcer is doubtless, but up to now the experimental model of Peptic Ulcer does not exist; development of ulcer does need presence of other co-factors; H. pylori is a semi-pathogenic microbe which is often accustomed to life in acid gastric environment. During evolution long time ago a human being and H. pylori met each other and in contrast to other microbes it managed to adapt to the living conditions in acid gastric environment. It colonized gastric epithelium and built a symbiotic relationship with the human being; Peptic Ulcer should be regarded as a gastroenterological and not an infectious disease and H. pylori should be considered as an important factor, especially as a local important factor; H. pylori or any other infectious agent cannot be a sole cause of Peptic Ulcer. This microbe can reveal its pathologic nature only if gastric mucosa is damaged by other factors; Epidemiological as well as experimental data show that one of the causes of Chronic Gastritis and Peptic Ulcer among others is alimentary factor.
Антибиотикорезистентность Helicobacter pylori в Смоленске
2018
Цель. Изучить динамику резистентности штаммов H. pylori к кларитромицину, амоксициллину, ме тронидазолу, левофлоксацину и тетрациклину у взрослых пациентов в Смоленской области за пе риод с 2009 по 2017 гг. Материалы и методы. Было обследовано 573 взрослых пациентов в 20152017 гг. и 210 пациен тов в 20092010 гг. с положительным быстрым уреазным тестом, проходивших эзофагогастродуо деноскопию по поводу диспепсических жалоб. Определялась чувствительность выделенных штам мов H. pylori к кларитромицину, амоксициллину, метронидазолу, левофлоксацину и тетрациклину методом разведения в агаре. Результаты. Было протестировано 143 штамма Н. pylori, выделенных в 20152017 гг., и 133 штам ма Н. pylori, выделенных в 20092010 гг. Уровень резистентности штаммов Н. pylori, выделенных в 20152017 гг., к кларитромицину составил 6,3%, амоксициллину-1,4%, метронидазолу-23,8%, левофлоксацину-24,5%, тетрациклину-0,7%. Уровень резистентности штаммов Н. pylori, выде ленных в 20092010 гг., к кларитромицину составил 5,3%, амоксициллину-4,5%, метронидазо лу-3,8%, левофлоксацину-8,3%, тетрациклину-0%. При оценке динамики антибиотикорези стентности H. pylori в Смоленской области за последние 9 лет не выявлено значимого роста числа устойчивых штаммов к кларитромицину, амоксициллину и тетрациклину (p>0,05), однако отмечен достоверный рост уровня резистентности H. pylori к метронидазолу и левофлоксацину (p<0,01). При этом устойчивость H. pylori к метронидазолу не превысила критического значения в 40%. Выводы. Распространенность резистентных штаммов H. pylori к кларитромицину и метронидазолу в Смоленской области остается низкой, поэтому стандартная тройная терапия рекомендуется как эм пирическая терапия инфекции H. pylori первой линии у взрослых. Предпочтение при выборе эмпи рической терапии второй линии между квадротерапией с препаратом висмута и тройной терапией с левофлоксацином целесообразно отдавать квадротерапии с препаратом висмута изза высокого уровня резистентности H. pylori к левофлоксацину.
Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология, 2017
Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь шифр по МКБ-10: К 21 (Гастроэзофагеальный рефлюкс [ГЭР]) ГЭР с эзофагитом-К 21.0, ГЭР без эзофагита-К 21.9 Гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь (ГЭРБ)хроническое рецидивирующее заболевание, характеризующееся забросом в пищевод желудочного и/ или дуоденального содержимого, возникающим вследствие нарушений моторно-эвакуаторной функции эзофагогастродуоденальной зоны и проявляющимся симптомами, беспокоящими больного, и/или развитием осложнений. Наиболее характерными симптомами ГЭРБ являются изжога и регургитация, а наиболее распространенным клинико-эндоскопическим проявлением-рефлюкс-эзофагит.
2019
Currently, features of the host immune response against Helicobacter pylori (Hp) both regarding establishment of chronic carriage after primary infection as well as a role of impaired immune and inflammatory response in the mechanisms of developing erosive-ulcerative lesions remain poorly investigated. Only few molecules are known to activate the complement activation lectin pathway including human ficolins and mannose-binding lectin (MBL). A substantial part of the human population bears an intrinsically low MBL and ficolin production level and/or low functional activity due to the carriage of various MBL2 genetic variants potentially elevating susceptibility to a more severe course of a wide range of infectious diseases. It has been shown that the MBL2 gene polymorphisms are associated with a risk of developing in Hp-infected patients more severe gastric mucosal atrophy and gastric cancer risk. An impact of the MBL2 and L-ficolin (FNC2) gene variants on Hp infection rate in Russia...