ФК «Вологда» создан в 2010 году на базе воспитанников «СДЮСШОР-3» по футболу города Вологды. До профессионального статуса участвовал в региональных турнирах. В 2010 году клуб впервые принял участие в любительском первенстве России в зоне «Золотое кольцо», где занял третье место. В сезоне 2011—2012 годов принимал участие в Первенстве России среди команд Третьего дивизиона. В 2011 году команда стала обладателем Кубка России среди команд Третьего дивизиона зоны «Золотое кольцо», переиграв в двух матчах «Кооператор» из Вичуги. 30 мая 2012 года аттестационная комиссия РФС присвоила клубу профессиональный статус и допустила к участию в первенстве России среди команд второго дивизиона в зоне «Запад» в сезоне 2012-13.
Участие в турнирах
Год
Соревнование
Место
И
В
Н
П
М
Тренер
2010
Первенство России, третий дивизион
3
16
7
6
3
24-11
Санталов Руслан Викторович
2011
Кубок России, третий дивизион, зона «Золотое кольцо»
1
8
5
3
0
10-2
Санталов Руслан Викторович
2011-2012
Первенство России, третий дивизион, зона «Золотое кольцо»
4
27
12
11
4
40-31
Санталов Руслан Викторович
2012-2013
Первенство России, Второй дивизион, зона «Запад»
4
27
12
11
4
40-31
Санталов Руслан Викторович
Достижения
Обладатель Кубка России среди команд 3 дивизиона в зоне «Золотое кольцо» 2011 г.
Бронзовый призёр первенства России среди команд 3 дивизиона в зоне «Золотое кольцо» 2010 г.
Победитель Первенства Вологодской области по футболу 2010, 2011 гг.
Обладатель Кубка Вологодской области по футболу 2011 г.
Руководство
Административный состав
Президент: Сидоров Игорь Евгеньевич
Сотрудник по обеспечению безопасности и работе с болельщиками: Иолоб Роман Иванович
Начальник команды: Рачков Андрей Георгиевич
Администратор: Булькотин Александр Александрович
Пресс-атташе: Родионов Сергей Александрович
Тренерский состав
Главный тренер: Санталов Руслан Викторович
Тренер: Зернов Александр Сергеевич
Тренер по работе с вратарями: Григорьев Владимир Евгеньевич
Врач: Комель Валерий Александрович
Массажист: Санталов Андрей Викторович
Массажист: Ваенский Алексей Геннадьевич
Состав 2012—2013 гг
№ Позиция Имя Год рождения 1 Вр Рудольф Чесалов 1989 22 Вр Антон Симкачев 1988 4 Защ Евгений Сидоров 1993 23 Защ Максим Киров 1992 3 Защ Евгений Останин 1993 17 Защ Максим Тихов 1990 25 Защ Александр Молчанов 1992 6 Защ Дмитрий Курочкин 1990 10 ПЗ Денис Санталов 1993 11 ПЗ Роман Устюжанин 1984
№ Позиция Имя Год рождения 14 ПЗ Максим Кустов 1989 18 ПЗ Дмитрий Перкалев 1988 7 ПЗ Денис Горбунов 1993 15 ПЗ Артур Малыгин 1991 8 ПЗ Максим Мешалкин 1993 99 Нап Андрей Корелкин 1990
Вологда
Основная форма 
Футбольные клубы Второго дивизиона России сезона 2012/13