В 2003 году стал победителем соревнования среди любительских футбольных клубов МФС Приволжье, после чего получил статус профессионального футбольного клуба и право выступать во втором дивизионе ПФЛ, зона «Урал-Поволжье». Несмотря на занятое в сезоне 2007 года последнее, 14-е, место, клуб не вылетел вылетел в ЛФЛ, а в связи с расширением турнира, сохранил за собой право выступать на профессиональном уровне. В недавнем прошлом тренером клуба являлся легендарный игрок казанского «Рубина»Рустем Хузин, в своё время выступавший так же за футбольный клуб «Амкар» из города Пермь. В 2010 году команду возглавлял Олег Стогов, бывший полузащитник футбольного клуба «Ротор» из Волгограда, завоевавший с ним «серебро» российского чемпионата. В 2010 клуб выступил неуверенно, занял последнее место в зоне «Урал-Поволжье» второго дивизиона и должен был вылететь в ЛФЛ, но остался во втором дивизионе.
В 2011 году состав клуба был практически полностью обновлен и пополнился воспитанниками собственной ДЮСШ юного футболиста «Рубин». В основном это перспективные игроки 1993 года рождения. Возглавил команду Радик Гадеев.
Состав
№ Позиция Имя Год рождения Вр Малашенко, Анатолий 1994 Вр Панчин, Сергей 1993 Вр Черемисин, Евгений 1988 Защ Айметдинов, Артур 1991 Защ Кабардин, Денис 1994 Защ Седельников, Евгений 1994 Защ Туршаков, Александр 1990 Защ Хайрутдинов, Альберт 1993 ПЗ Зайцев, Иван 1993 ПЗ Коренюгин, Иван 1993
№ Позиция Имя Год рождения ПЗ Косянчук, Иван 1993 ПЗ Петролай, Михаил 1994 ПЗ Федосеев, Максим 1992 ПЗ Шадрин, Павел 1993 Нап Галиакберов, Руслан 1989 Нап Пайбаршев, Даниил 1994 Нап Петухов, Артём 1990 Нап Тимофеев, Александр 1992 Нап Хасанов, Камиль 1993
Рубин-2
Основная форма 
Переход в Второй дивизион
Футбольный клуб «Рубин»