Цикл трикарбоновых кислот | это... Что такое Цикл трикарбоновых кислот? (original) (raw)
Цикл трикарбоновых кислот
Ци́кл трикарбо́новых кисло́т (цикл Кре́бса, цитра́тный цикл) — центральная часть общего пути катаболизма, циклический биохимический аэробный процесс, в ходе которого происходит превращение двух- и трёхуглеродных соединений, образующихся как промежуточные продукты в живых организмах при распаде углеводов, жиров и белков, до CO2. При этом освобождённый водород направляется в цепь тканевого дыхания, где в дальнейшем окисляется до воды, принимая непосредственное участие в синтезе универсального источника энергии — АТФ.
Цикл Кребса — это ключевой этап дыхания всех клеток, использующих кислород, центр пересечения множества метаболических путей в организме. Кроме значительной энергетической роли циклу отводится также и существенная пластическая функция, то есть это важный источник молекул-предшественников, из которых в ходе других биохимических превращений синтезируются такие важные для жизнедеятельности клетки соединения как аминокислоты, углеводы, жирные кислоты и др.
Цикл превращения лимонной кислоты в живых клетках был открыт и изучен немецким биохимиком Хансом Кребсом, за эту работу он (совместно с Ф. Липманом) был удостоен Нобелевской премии (1953 год).
У эукариот все реакции цикла Кребса протекают внутри митохондрий, причём катализирующие их ферменты, кроме одного, находятся в свободном состоянии в митохондриальном матриксе, исключение составляет сукцинатдегидрогеназа, которая локализуется на внутренней митохондриальной мембране, встраиваясь в липидный бислой. У прокариот реакции цикла протекают в цитоплазме.
Стадии цикла Кребса
Субстраты | Продукты | Фермент | Тип реакции | Комментарий | |
---|---|---|---|---|---|
1 | Оксалоацетат +Ацетил-CoA +H2O | Цитрат + CoA-SH | Цитратсинтаза | Альдольная конденсация | лимитирующая стадия,превращает C4 оксалоацетат в С6 |
2 | Цитрат | _цис_-аконитат +H2O | аконитаза | Дегидратация | обратимая изомеризация |
3 | _цис_-аконитат +H2O | изоцитрат | гидратация | ||
4 | Изоцитрат + NAD+ | Оксалосукцинат + NADH + H + | изоцитратдегидрогеназа декарбоксилирующая | Окисление | образуется NADH (эквивалент 2.5 ATP) |
5 | Оксалосукцинат | α-кетоглутарат +CO2 | декарбоксилирование | необратимая стадия,образуется C5 | |
6 | α-кетоглутарат +NAD+ +CoA-SH | сукцинил-CoA +NADH + H+ +CO2 | альфакетоглутаратдегидрогеназный комплекс (3 фермента) | Окислительное декарбоксилирование | образуется NADH (эквивалентно 2.5 АТФ),регенерация C4 цепи (освобождается CoA-SH) |
7 | сукцинил-CoA + GDP + Pi | сукцинат +CoA-SH + GTP | сукцинилкофермент А синтетаза | субстратное фосфорилирование | АДФ->ATP,[1]образуется 1 ATP (или 1 GTF) |
8 | сукцинат + убихинон (Q) | фумарат +убихинол (QH2) | сукцинатдегидрогеназа | Окисление | используется FAD как простетическая группа (FAD->FADH2 на первой стадии реакции) в ферменте,[2]образуется эквивалент 1.5 ATP |
9 | фумарат +H2O | _L_-малат | фумараза | H2O-присоединение(гидратация) | |
10 | _L_-малат +NAD+ | оксалоацетат +NADH + H+ | малатдегидрогеназа | окисление | образуется NADH (эквивалентно 2.5 ATP) |
Общее уравнение одного оборота цикла Кребса:
Ацетил-КоА → 2CO2 + КоА + 8e−
Регуляция цикла
Цикл Кребса регулируется «по механизму отрицательной обратной связи», при наличии большого количества субстратов (ацетил-КоА, оксалоацетат), цикл активно работает, а при избытке продуктов реакции (NADH, ATP) тормозится. Регуляция осуществляется и при помощи гормонов, основным источником ацетил-КоА является глюкоза, поэтому гормоны, способствующие аэробному распаду глюкозы, способствуют работе цикла Кребса. Такими гормонами являются: инсулин и адреналин. Глюкагон стимулирует синтез глюкозы и ингибирует реакции цикла Кребса.
Как правило работа цикла Кребса не прерывается за счёт анаплеротических реакций, которые пополняют цикл субстратами: Пируват + СО2 + АТФ = Оксалоацетат (субстрат Цикла Кребса) + АДФ + Фн.
Функции
- Интегративная функция — цикл является связующим звеном между реакциями анаболизма и катаболизма.
- Катаболическая функция — превращение различных веществ в субстраты цикла:
- Жирные кислоты, пируват,Лей,Фен — Ацетил-КоА.
- Арг, Гис, Глу — α-кетоглутарат.
- Фен, тир — фумарат.
- Анаболическая функция — использование субстратов цикла на синтез органических веществ:
- Оксалацетат — глюкоза, Асп, Асн.
- Сукцинил-КоА — синтез гема.
- CО2 — реакции карбоксилирования.
- Водорододонорная функция — цикл Кребса поставляет на дыхательную цепь митохондрий протоны в виде трех НАДН.Н+ и одного ФАДН2.
- Энергетическая функция — 3 НАДН.Н+ дает 7.5 моль АТФ, 1 ФАДН2 дает 1.5 моль АТФ на дыхательной цепи. Кроме того в цикле путем субстратного фосфорилирования синтезируется 1 ГТФ, а затем из него синтезируется АТФ посредствам трансфосфорилирования: ГТФ + АДФ = АТФ + ГДФ.
Мнемонические правила
Для более легкого запоминания кислот, участвующих в цикле Кребса, существует мнемоническое правило:
Целый Ананас И Кусочек Суфле Сегодня Фактически Мой Обед, что соответствует ряду — цитрат, (цис-)аконитат, изоцитрат, (альфа-)кетоглутарат, сукцинил-CoA, сукцинат, фумарат, малат, оксалоацетат.
Существует также следующее мнемоническое стихотворение (его автором является ассистент кафедры биохимии КГМУ Е. В. Паршкова[3]):
Щуку ацетил лимонил,
Но нарцисса конь боялся,
Он над ним изолимонно
Альфа-кетоглутарался.
Сукцинился коэнзимом,
Янтарился фумарово,
Яблочек припас на зиму,
Обернулся щукой снова.
(щавелевоуксусная кислота, лимонная кислота, цис-аконитовая кислота, изолимонная кислота, α-кетоглутаровая кислота, сукцинил-KoA, янтарная кислота, фумаровая кислота, яблочная кислота, щавелевоуксусная кислота).
Другой вариант стихотворения
ЩУКа съела ацетат, получается цитрат
через цис-аконитат будет он изоцитрат
водороды отдав НАД, он теряет СО2
этому безмерно рад альфа-кетоглутарат
окисление грядет — НАД похитил водород
ТДФ, коэнзимА забирают СО2
а энергия едва в сукциниле появилась
сразу ГТФ родилась и остался сукцинат
вот добрался он до ФАДа — водороды тому надо
фумарат воды напился, и в малат он превратился
тут к малату НАД пришел, водороды приобрел
ЩУКа снова объявилась и тихонько затаилась
Караулить ацетат...
Примечания
- ↑ Berg JM Biochemistry - 5th Edition. — WH Freeman and Company, 2002. — P. 476. — ISBN 0-7167-4684-0
- ↑ Berg et al (2002), page 501
- ↑ К. А. Ефетов, Е. В. Паршкова. Цикл Кребса и мнемоническое правило для запоминания последовательности его реакций (рус.) // Таврический медико-биологический вестник. — 2012. — Т. 15. — № 1 (57). — С. 338-340. — ISSN 2070-8092.
Ссылки
- Цикл трикарбоновых кислот (англ.)