Analysis of molecular variance (original) (raw)
Analysis of molecular variance (AMOVA), is a statistical model for the molecular algorithm in a single species, typically biological. The name and model are inspired by ANOVA. The method was developed by , and at Rutgers University in 1992.
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| dbo:abstract | Analysis of molecular variance (AMOVA), is a statistical model for the molecular algorithm in a single species, typically biological. The name and model are inspired by ANOVA. The method was developed by , and at Rutgers University in 1992. Since developing AMOVA, Excoffier has written a program for running such analyses. This program, which runs on Windows, is called Arlequin and is freely available on Excoffier's website. There are also implementations in R language in the ade4 and the pegas packages, both available on CRAN (Comprehensive R Archive Network). Another implementation is in , which also runs on Windows. The student version is free and fully functional. Native language of the application is Spanish but an English version is also available. An additional free statistical package, GenAlEx, is geared toward teaching as well as research and allows for complex genetic analyses to be employed and compared within the commonly used Microsoft Excel interface. This software allows for calculation of analyses such as AMOVA, as well as comparisons with other types of closely related statistics including F-statistics and Shannon's index, and more. (en) El análisis de la varianza molecular (AMOVA) es un modelo estadístico para el algoritmo molecular en una sola especie, típicamente biológica. El nombre y el modelo están inspirados en ANOVA. El método fue desarrollado por Laurent Excoffier, Peter Smouse y Joseph Quattro en la Universidad de Rutgers en 1992. Desde el desarrollo de AMOVA, Excoffier ha escrito un programa para ejecutar dichos análisis. Este programa, que se ejecuta en Windows, se llama Arlequin y está disponible gratuitamente en el sitio web de Excoffier. También hay una implementación de Sandrine Pavoine en lenguaje R en el paquete ade4 disponible en CRAN (Red Integral de Archivo R). Otra implementación está en Info-Gen, que también se ejecuta en Windows. La versión para estudiantes es gratuita y totalmente funcional. El idioma nativo de la aplicación es el español, pero también está disponible una versión en inglés. Un paquete estadístico gratuito adicional, GenAlEx, está orientado a la enseñanza, así como a la investigación, y permite la utilización y comparación de análisis genéticos complejos dentro de la interfaz de Microsoft Excel comúnmente utilizada. Este software permite el cálculo de análisis como AMOVA, así como las comparaciones con otros tipos de estadísticas estrechamente relacionadas, incluidas las estadísticas F y el índice de Shannon, y más. (es) |
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