BAT1 (original) (raw)
Spliceosome RNA helicase BAT1 is an enzyme that in humans is encoded by the BAT1 gene. This gene encodes a member of the DEAD box family of RNA-dependent ATPases that mediate ATP hydrolysis during pre-mRNA splicing. The encoded protein is an essential splicing factor required for association of U2 small nuclear ribonucleoprotein with pre-mRNA, and also plays an important role in mRNA export from the nucleus to the cytoplasm. A cluster of genes, BAT1-BAT5, is localized in the vicinity of the genes for TNF alpha and TNF beta. These genes are all within the human major histocompatibility complex class III region. Mutations in this gene may be associated with rheumatoid arthritis. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Spliceosome RNA helicase BAT1 is an enzyme that in humans is encoded by the BAT1 gene. This gene encodes a member of the DEAD box family of RNA-dependent ATPases that mediate ATP hydrolysis during pre-mRNA splicing. The encoded protein is an essential splicing factor required for association of U2 small nuclear ribonucleoprotein with pre-mRNA, and also plays an important role in mRNA export from the nucleus to the cytoplasm. A cluster of genes, BAT1-BAT5, is localized in the vicinity of the genes for TNF alpha and TNF beta. These genes are all within the human major histocompatibility complex class III region. Mutations in this gene may be associated with rheumatoid arthritis. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. (en) DDX39B (англ. DExD-box helicase 39B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 48 991. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: Валін Y: Тирозин Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. (uk) |
| dbo:wikiPageExternalLink | https://www.ebi.ac.uk/pdbe/pdbe-kb/proteins/Q13838 |
| dbo:wikiPageID | 14759768 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 8341 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1116899997 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Rheumatoid_arthritis dbr:Cytoplasm dbr:MRNA dbr:RNA_splicing dbr:Enzyme dbr:Gene dbr:Mutations dbr:Major_histocompatibility_complex dbr:DEAD_box dbr:Ribonucleoprotein dbr:ATP_hydrolysis dbr:Lymphotoxin_alpha dbr:TNF_alpha dbr:Splicing_factor dbr:Transcript_variants dbr:ATPases dbr:Pre-mRNA |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Cite_journal dbt:Enzyme-stub dbt:Infobox_gene dbt:PDB_Gallery dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:UCSC_gene_info |
| gold:hypernym | dbr:Enzyme |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule dbo:Gene wikidata:Q206229 wikidata:Q7187 dbo:HumanGene dbo:Protein |
| rdfs:comment | Spliceosome RNA helicase BAT1 is an enzyme that in humans is encoded by the BAT1 gene. This gene encodes a member of the DEAD box family of RNA-dependent ATPases that mediate ATP hydrolysis during pre-mRNA splicing. The encoded protein is an essential splicing factor required for association of U2 small nuclear ribonucleoprotein with pre-mRNA, and also plays an important role in mRNA export from the nucleus to the cytoplasm. A cluster of genes, BAT1-BAT5, is localized in the vicinity of the genes for TNF alpha and TNF beta. These genes are all within the human major histocompatibility complex class III region. Mutations in this gene may be associated with rheumatoid arthritis. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. (en) DDX39B (англ. DExD-box helicase 39B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 48 991. Послідовність амінокислот A: АланінC: ЦистеїнD: Аспарагінова кислотаE: Глутамінова кислотаF: ФенілаланінG: ГліцинH: ГістидинI: ІзолейцинK: ЛізинL: ЛейцинM: МетіонінN: АспарагінP: ПролінQ: ГлутамінR: АргінінS: СеринT: ТреонінV: Валін Y: Тирозин (uk) |
| rdfs:label | BAT1 (en) DDX39B (uk) |
| owl:sameAs | freebase:BAT1 http://www4.wiwiss.fu-berlin.de/drugbank/resource/targets/3043 wikidata:BAT1 dbpedia-cy:BAT1 http://tt.dbpedia.org/resource/DDX39B dbpedia-uk:BAT1 https://global.dbpedia.org/id/jfEp |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:BAT1?oldid=1116899997&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:BAT1 |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:DDX39B_(gene) dbr:UAP56 |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Housekeeping_gene dbr:DDX39B_(gene) dbr:UAP56 |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:BAT1 |