BioGRID (original) (raw)
Η BioGRID (Biological General Repository for Interaction Datasets) είναι μια δημόσια βάση δεδομένων με ελεύθερη πρόσβαση, η οποία παρέχει πληροφορίες για γενετικές και πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις για βασικούς οργανισμούς-μοντέλα και για τον άνθρωπο. Δημιουργήθηκε το 2003 από τους Mike Tyers, Bobby-Joe Breitkreutz και Chris Stark στο Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute του Mount Sinai Hospital, με το όνομα GRID και στην πορεία εξελίχθηκε και μετονομάσθηκε σε BioGRID. Οι επισκέπτες της ιστοδελίδας μπορούν να αναζητήσουν ένα σύνολο πληροφοριών για την πρωτεΐνη ή τη δημοσίευση που τους ενδιαφέρει επιλέγοντας τον οργανισμό που επιθυμούν. Συνεργάζεται με βάσεις δεδομένων οργανισμών-μοντελων όπως οι Entrez-Gene, SGD, TAIR, FlyBase κ.α. Αποτελεί μέλος της Κοινοπραξίας Διεθνών Μοριακών Συναλλαγώ
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Η BioGRID (Biological General Repository for Interaction Datasets) είναι μια δημόσια βάση δεδομένων με ελεύθερη πρόσβαση, η οποία παρέχει πληροφορίες για γενετικές και πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις για βασικούς οργανισμούς-μοντέλα και για τον άνθρωπο. Δημιουργήθηκε το 2003 από τους Mike Tyers, Bobby-Joe Breitkreutz και Chris Stark στο Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute του Mount Sinai Hospital, με το όνομα GRID και στην πορεία εξελίχθηκε και μετονομάσθηκε σε BioGRID. Οι επισκέπτες της ιστοδελίδας μπορούν να αναζητήσουν ένα σύνολο πληροφοριών για την πρωτεΐνη ή τη δημοσίευση που τους ενδιαφέρει επιλέγοντας τον οργανισμό που επιθυμούν. Συνεργάζεται με βάσεις δεδομένων οργανισμών-μοντελων όπως οι Entrez-Gene, SGD, TAIR, FlyBase κ.α. Αποτελεί μέλος της Κοινοπραξίας Διεθνών Μοριακών Συναλλαγών (ΙΜΕx) και χρηματοδοτείται από τα BBSRC Αρχειοθετήθηκε 2017-04-23 στο Wayback Machine., NIH και CIHR. (el) The Biological General Repository for Interaction Datasets (BioGRID) is a curated biological database of protein-protein interactions, genetic interactions, chemical interactions, and post-translational modifications created in 2003 (originally referred to as simply the General Repository for Interaction Datasets (GRID) by Mike Tyers, Bobby-Joe Breitkreutz, and Chris Stark at the Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute at Mount Sinai Hospital. It strives to provide a comprehensive curated resource for all major model organism species while attempting to remove redundancy to create a single mapping of data. Users of The BioGRID can search for their protein, chemical or publication of interest and retrieve annotation, as well as curated data as reported, by the primary literature and compiled by in house large-scale curation efforts. The BioGRID is hosted in Toronto, Ontario, Canada and Dallas, Texas, United States and is partnered with the Saccharomyces Genome Database, FlyBase, WormBase, PomBase, and the Alliance of Genome Resources. The BioGRID is funded by the NIH and CIHR. BioGRID is an observer member of the International Molecular Exchange Consortium (IMEx). (en) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Biogrid_logo.png?width=300 |
| dbo:title | BioGRID (en) |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://imex.sourceforge.net/ http://www.iric.ca/ https://downloads.thebiogrid.org/BioGRID https://thebiogrid.org/projectslist.php https://wiki.thebiogrid.org/doku.php/biogridrest https://web.archive.org/web/20100417133520/http:/www.tyerslab.com/ https://web.archive.org/web/20140126142529/http:/www.princeton.edu/main/ http://www.lunenfeld.ca/ https://wiki.thebiogrid.org/doku.php/statistics https://orcs.thebiogrid.org https://thebiogrid.org |
| dbo:wikiPageID | 4400671 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 19162 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1028785374 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Caenorhabditis_elegans dbr:Canadian_Institutes_of_Health_Research dbr:Canis_familiaris dbr:Princeton_University dbr:Proteasome dbr:Publication dbr:Epistasis dbr:Middle_East_respiratory_syndrome–related_coronavirus dbr:NIH dbr:Bos_taurus dbr:Anopheles_gambiae dbr:Apis_mellifera dbr:Homo_sapiens dbr:House_mouse dbr:Human dbr:Ricinus_communis dbr:Université_de_Montréal dbr:Ustilago_maydis dbr:Nicotiana_tomentosiformis dbr:Saccharomyces_cerevisiae dbr:Nuclease dbr:Pediculus_humanus dbr:Protein–protein_interaction dbr:Meleagris_gallopavo dbr:Chemical_substance dbr:Chlorocebus_sabaeus dbr:Gallus_gallus dbr:Gene dbr:Glioblastoma dbr:Glycine_max dbr:Arabidopsis_thaliana dbr:Louse dbr:Macaca_mulatta dbr:Chlamydomonas_reinhardtii dbr:Simian_immunodeficiency_virus dbr:Zea_mays dbr:Ovis_aries dbr:Plasmodium_falciparum dbr:Post-translational_modification dbr:Schizosaccharomyces_pombe dbr:Mus_musculus dbr:COVID-19 dbr:Cavia_porcellus dbr:Cell_(biology) dbr:Tobacco_Mosaic_Virus dbr:Toronto dbr:Drosophila_melanogaster dbr:Cricetulus_griseus dbr:HIV dbc:Biological_databases dbr:Dallas dbr:Equus_caballus dbr:Escherichia_coli dbr:Fanconi_anemia dbr:Felis_catus dbr:Pan_troglodytes dbr:Chromatin_remodeling dbr:Danio_rerio dbr:Dictyostelium_discoideum dbr:FlyBase dbr:Vitis_vinifera dbr:Leishmania_major dbr:Chemical dbr:Severe_acute_respiratory_syndrome_coronavirus_2 dbr:Protein dbr:Hepatitis_C dbr:Bacillus_subtilis dbr:Texas dbr:Streptococcus_pneumoniae dbr:Solanum_lycopersicum dbc:Online_databases dbr:Abiotic_stress dbr:Biological_database dbr:Sus_scrofa dbr:Herpes_simplex_virus dbr:Model_organism dbr:Monodelphis_domestica dbr:Autophagy dbc:Systems_biology dbr:CRISPR dbr:Phenotype dbr:Solanum_tuberosum dbr:Grid_computing dbr:Human_papillomavirus_infection dbr:National_Institutes_of_Health dbr:Ontario dbr:Organism dbr:Oryctolagus_cuniculus dbr:Oryza_sativa dbr:Candida_albicans dbr:Cas9 dbr:Severe_acute_respiratory_syndrome_coronavirus dbr:WormBase dbr:Xenopus_laevis dbr:Saccharomyces_Genome_Database dbr:Species dbr:Sorghum_bicolor dbr:Ubiquitin dbr:Neurospora_crassa dbr:Immortalised_cell_line dbr:Lunenfeld-Tanenbaum_Research_Institute dbr:Mycobacterium_tuberculosis dbr:Mycoplasma_pneumoniae dbr:Mount_Sinai_Hospital_(Toronto) dbr:PomBase dbr:Selaginella_moellendorffii dbr:Text_mining dbr:Rattus_norvegicus dbr:Vaccinia dbr:Strongylocentrotus_purpuratus dbr:File:Biogrid_logo.png dbr:Emericella_nidulans dbr:General_Repository_for_Interaction_Datasets dbr:CIHR |
| dbp:author | Lorrie Boucher, Ashton Breitkreutz, Bobby-Joe Breitkreutz, Christie Chang, Andrew Chatr-Aryamontri, Kara Dolinski, Sven Heinicke, Nadine Kolas, Lara O'Donnell, Sara Oster, Rose Oughtred, Jennifer Rust, Adnane Sellam, Chris Stark, Jean Tang, Chandra Theesfeld, Mike Tyers. (en) |
| dbp:bookmark | Yes - both individual results and searches, (en) |
| dbp:center | dbr:Princeton_University dbr:Université_de_Montréal dbr:Mount_Sinai_Hospital_(Toronto) |
| dbp:citation | Stark & al. (en) |
| dbp:curation | Yes - manual; Also focused curation efforts. (en) |
| dbp:description | BioGRID is a biomedical interaction repository with data compiled through comprehensive curation efforts. (en) |
| dbp:download | https://downloads.thebiogrid.org/BioGRID |
| dbp:format | Custom flat files, PSI-MI, MITAB (en) |
| dbp:frequency | Monthly (en) |
| dbp:laboratory | Institut de Recherche en Immunologie et en Cancérologie, Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics, Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (en) |
| dbp:logo | dbr:File:Biogrid_logo.png |
| dbp:organism | 80 (xsd:integer) |
| dbp:scope | Protein Interactions, Genetic Interactions, Chemical Interactions, Post-Translational Modifications. (en) |
| dbp:title | BioGRID (en) |
| dbp:url | https://thebiogrid.org |
| dbp:version | 2021-01-01 (xsd:date) |
| dbp:versioning | Yes (en) |
| dbp:webapp | Advanced search, integrated network viewer, custom downloads, bulk retrieval/download (en) |
| dbp:webservice | Yes - (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Infobox_biodatabase dbt:As_of dbt:Div_col dbt:Div_col_end dbt:Reflist dbt:Start_date_and_age dbt:Bioinformatics |
| dbp:wordnet_type | http://www.w3.org/2006/03/wn/wn20/instances/synset-software-noun-1 |
| dc:description | BioGRID is a biomedical interaction repository with data compiled through comprehensive curation efforts. |
| dct:subject | dbc:Biological_databases dbc:Online_databases dbc:Systems_biology |
| gold:hypernym | dbr:Database |
| rdf:type | owl:Thing schema:CreativeWork dbo:Work wikidata:Q386724 dbo:Database dul:InformationObject dbo:BiologicalDatabase umbel-rc:SoftwareObject |
| rdfs:comment | Η BioGRID (Biological General Repository for Interaction Datasets) είναι μια δημόσια βάση δεδομένων με ελεύθερη πρόσβαση, η οποία παρέχει πληροφορίες για γενετικές και πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις για βασικούς οργανισμούς-μοντέλα και για τον άνθρωπο. Δημιουργήθηκε το 2003 από τους Mike Tyers, Bobby-Joe Breitkreutz και Chris Stark στο Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute του Mount Sinai Hospital, με το όνομα GRID και στην πορεία εξελίχθηκε και μετονομάσθηκε σε BioGRID. Οι επισκέπτες της ιστοδελίδας μπορούν να αναζητήσουν ένα σύνολο πληροφοριών για την πρωτεΐνη ή τη δημοσίευση που τους ενδιαφέρει επιλέγοντας τον οργανισμό που επιθυμούν. Συνεργάζεται με βάσεις δεδομένων οργανισμών-μοντελων όπως οι Entrez-Gene, SGD, TAIR, FlyBase κ.α. Αποτελεί μέλος της Κοινοπραξίας Διεθνών Μοριακών Συναλλαγώ (el) The Biological General Repository for Interaction Datasets (BioGRID) is a curated biological database of protein-protein interactions, genetic interactions, chemical interactions, and post-translational modifications created in 2003 (originally referred to as simply the General Repository for Interaction Datasets (GRID) by Mike Tyers, Bobby-Joe Breitkreutz, and Chris Stark at the Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute at Mount Sinai Hospital. It strives to provide a comprehensive curated resource for all major model organism species while attempting to remove redundancy to create a single mapping of data. Users of The BioGRID can search for their protein, chemical or publication of interest and retrieve annotation, as well as curated data as reported, by the primary literature and compiled (en) |
| rdfs:label | BioGRID (en) BioGRID (el) |
| owl:sameAs | freebase:BioGRID wikidata:BioGRID dbpedia-el:BioGRID https://global.dbpedia.org/id/4Ymzb |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:BioGRID?oldid=1028785374&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Biogrid_logo.png |
| foaf:homepage | https://thebiogrid.org |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:BioGRID |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:General_Repository_for_Interaction_Datasets dbr:Bioinformatics/General_Repository_For_Interaction_Datasets |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:List_of_biological_databases dbr:HitPredict dbr:Protein–protein_interaction dbr:ConsensusPathDB dbr:STRING dbr:MatrixDB dbr:Database_of_Interacting_Proteins dbr:EsyN dbr:BioCreative dbr:Biological_network dbr:C14orf80 dbr:C22orf31 dbr:Human_interactome dbr:USP27X dbr:Metascape dbr:Candida_albicans dbr:Network_medicine dbr:IRefIndex dbr:Transmembrane_protein_151b dbr:General_Repository_for_Interaction_Datasets dbr:Bioinformatics/General_Repository_For_Interaction_Datasets |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:BioGRID |
