BioPerl (original) (raw)
BioPerl is a collection of Perl modules that facilitate the development of Perl scripts for bioinformatics applications. It has played an integral role in the Human Genome Project.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | BioPerl is a collection of Perl modules that facilitate the development of Perl scripts for bioinformatics applications. It has played an integral role in the Human Genome Project. (en) BioPerl es un software de código abierto diseñado a partir de la colaboración entre bioinformáticos, biólogos y científicos del área de la computación, ante la necesidad de analizar y resolver problemas de la bioinformática. BioPerl es un proyecto activo financiado por la Open Bioinformatics Foundation, basado en módulos de Perl con el fin de facilitar la administración y manipulación de información relacionada con ciencias de la vida . Tales módulos son interfaces de tipos de datos de secuencias, alineamientos (BLAST, Clustal), características y localizaciones génicas y bases de datos (GenBank), entre otras. Con el fin de aprovechar BioPerl, el usuario necesita una comprensión básica del lenguaje de programación Perl que incluya una comprensión del uso de referencias, módulos, objetos y métodos. La primera versión estable fue lanzada el 11 de junio de 2002; la última estable (en términos de la API) es la 1.6.9, lanzada en abril de 2011. También hay lanzamientos periódicos producidos por desarrolladores. La versión 1.6.0 es considerada la más estable (en términos de errores) y la versión de BioPerl se recomienda para el uso diario, se basa en Nightly Builds, también estable. BioPerl ha desempeñado un papel integral en el Proyecto Genoma Humano. (es) 바이오펄(BioPerl)은 1994년부터 시작된 펄 언어에서도 생명과학분야 모듈 구축 프로젝트 이름이다. 인간 게놈 프로젝트에서 필수적인 역할을 하고 있다. 바이오펄은 라는 무료/공개 라이선스를 사용한다. BSD와 비슷하고 누구나 상업적 목적으로 아무런 조건 없이 활용할 수 있다. 1995~1996년부터 독일의 게오르그 푸엘런이 주도적으로 모듈개발을 지휘했고 2000년대에 와서는 국제적인 프로젝트로 널리 알려졌다. (ko) Il Bioperl è un insieme di moduli Perl che semplificano lo sviluppo di script Perl per le applicazioni bioinformatiche.Ha avuto un ruolo importante nell'ambito del Progetto Genoma Umano. Si tratta di un progetto software open source tuttora in continuo sviluppo.La prima versione stabile venne pubblicata l'11 giugno del 2002, la versione stabile più recente è la 1.6.0, pubblicata a gennaio 2009. Esistono anche versioni per gli sviluppatori pubblicate periodicamente. Per sfruttare adeguatamente le possibilità del BioPerl, lo sviluppatore deve comunque conoscere le basi del linguaggio Perl. (it) BioPerl é uma coleção de módulos Perl que facilitam o desenvolvimentode scripts Perl para aplcações de bioinformática. Ele desempenhou um papel integral no Projeto Genoma Humano. O projeto fornece kits de ferramentas com múltiplas funções que tornam mais fácil a criação de análises ou pipelines customizados. É um projeto de software ativo de código aberto apoiado pela Open Bioinformatics Foundation. Sua história pode ser traçada desde uma lista de discussão em setembro 1996 discussion. A primeira versão estável foi lançada em 11 de Junho de 2002; a versão estável mais recente (em termos de API) é a release 1.6.1 de outubro de 2009. Há também versões de desenvolvedores produzidas periodicamente. A versão 1.6.0 é considerada a mais estável versão (em termos de bugs) de BioPerl e é recomendada para uso diário, mas a versão "nightly builds" também é extremamente estável, e muitos usuários BioPerl ficam atualmente com esta. A fim de tirar vantagem do BioPerl, o usuário precisa de um entendimento básico da linguagem de programação Perl, incluindo uma compreensão de como usar referências Perl, módulos, objetos e métodos. (pt) BioPerl— большая коллекция модулей Perl, которые облегчают разработку скриптов Perl для задач биоинформатики. BioPerl сыграл важную роль в Проекте «Геном человека». BioPerl написан на языке программирования Perl, благодаря этому поддерживается кросплатформенность готовых решений (Linux, большинство UNIX-подобных систем, Mac OS X, Microsoft Windows). Разрабатывается и распространяется свободно и открыто. Обладает активным международным сообществом разработчиков и учёных. (ru) |
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