DNA base flipping (original) (raw)
قلب قاعدة الحمض النووي، أو قلب النوكليوتيد، هي الآلية المستخدمة في تدوير قاعدة النوكليوتيد، أو القاعدة النووية، خارج الحلزون المزدوج للحمض النووي. يحدث هذا عندما يحتاج إنزيم معالجة الحمض النووي القدرة على الوصول إلى القاعدة لأداء عمله عليها، مثل استئصالها من أجل استبدال قاعدة أخرى بها خلال ترميم الدنا. لوحظت الآلية لأول مرة في عام 1994 باستخدام دراسة البلورات بالأشعة السينية في إنزيم ناقلة الميثيل المحفز لعملية مثيلة قاعدة السايتوسين في الدنا. منذ ذلك الحين، ثبت استخدامها عبر مختلف الإنزيمات في العديد من العمليات الحيوية مثل مثيلة الدنا، وآليات ترميم الدنا المتنوعة وتضاعف الدنا. يمكن حدوثها أيضًا في حلزونات الرنا المزدوجة أو متوسطات الدنا:الرنا المتشكلة خلال نسخ الرنا.
Property | Value |
---|---|
dbo:abstract | قلب قاعدة الحمض النووي، أو قلب النوكليوتيد، هي الآلية المستخدمة في تدوير قاعدة النوكليوتيد، أو القاعدة النووية، خارج الحلزون المزدوج للحمض النووي. يحدث هذا عندما يحتاج إنزيم معالجة الحمض النووي القدرة على الوصول إلى القاعدة لأداء عمله عليها، مثل استئصالها من أجل استبدال قاعدة أخرى بها خلال ترميم الدنا. لوحظت الآلية لأول مرة في عام 1994 باستخدام دراسة البلورات بالأشعة السينية في إنزيم ناقلة الميثيل المحفز لعملية مثيلة قاعدة السايتوسين في الدنا. منذ ذلك الحين، ثبت استخدامها عبر مختلف الإنزيمات في العديد من العمليات الحيوية مثل مثيلة الدنا، وآليات ترميم الدنا المتنوعة وتضاعف الدنا. يمكن حدوثها أيضًا في حلزونات الرنا المزدوجة أو متوسطات الدنا:الرنا المتشكلة خلال نسخ الرنا. يحدث قلب قاعدة الحمض النووي عن طريق تفكيك الروابط الهيدروجينية بين القواعد وفصل القاعدة عن جاراتها. قد يحدث هذا خلال عملية نشطة، يرتبط فيها الإنزيم مع الدنا مسهلًا دوران القاعدة، أو عبر عملية خاملة تدور فيها القاعدة نحو الخارج تلقائيًا، يُعد الإنزيم مسؤولًا عن التعرف على هذه الحالة وربطها. يمكن كشف قلب قاعدة الحمض النووي من خلال دراسة البلورات بالأشعة السينية، أو مطيافية الرنين المغناطيسي النووي، أو المطيافية الفلورية أو مسبار التهجين. (ar) DNA base flipping, or nucleotide flipping, is a mechanism in which a single nucleotide base, or nucleobase, is rotated outside the nucleic acid double helix. This occurs when a nucleic acid-processing enzyme needs access to the base to perform work on it, such as its excision for replacement with another base during DNA repair. It was first observed in 1994 using X-ray crystallography in a methyltransferase enzyme catalyzing methylation of a cytosine base in DNA. Since then, it has been shown to be used by different enzymes in many biological processes such as DNA methylation, various DNA repair mechanisms, and DNA replication. It can also occur in RNA double helices or in the DNA:RNA intermediates formed during RNA transcription. DNA base flipping occurs by breaking the hydrogen bonds between the bases and unstacking the base from its neighbors. This could occur through an active process, where an enzyme binds to the DNA and then facilitates rotation of the base, or a passive process, where the base rotates out spontaneously, and this state is recognized and bound by an enzyme. It can be detected using X-ray crystallography, NMR spectroscopy, fluorescence spectroscopy, or hybridization probes. (en) Переворот оснований ДНК, или переворот нуклеотидов, представляет собой механизм, в котором одиночное основание нуклеотида, или азотистое основание, вращается вне двойной спирали нуклеиновой кислоты. Это происходит, когда ферменту, обрабатывающему нуклеиновую кислоту, требуется доступ к основанию для выполнения работы с ним, например, для его вырезания для замены другим основанием во время репарации ДНК. Впервые он был обнаружен в 1994 году с помощью рентгеновской кристаллографии фермента , катализирующего метилирование цитозинового основания в ДНК. С тех пор было показано, что он используется различными ферментами во многих биологических процессах, таких как метилирование ДНК, различные механизмы восстановления ДНК и репликация ДНК. Это также может происходить в двойных спиралях РНК или в интермедиатах «ДНК:РНК», образующихся во время транскрипции РНК. Переворот оснований ДНК происходит путем разрыва водородных связей между основаниями и отделения основания от его соседей. Это может происходить в результате активного процесса, когда фермент связывается с ДНК, а затем способствует вращению основания, или пассивного процесса, когда основание спонтанно вращается, и это состояние распознается и связывается ферментом. Его можно обнаружить с помощью рентгеновской кристаллографии, ЯМР-спектроскопии, флуоресцентной спектроскопии или . (ru) |
dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Dna-base-flipping.svg?width=300 |
dbo:wikiPageID | 42177410 (xsd:integer) |
dbo:wikiPageLength | 30235 (xsd:nonNegativeInteger) |
dbo:wikiPageRevisionID | 1106233116 (xsd:integer) |
dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Cancer dbr:Potassium_permanganate dbr:Epigenetics dbr:Epigenomics dbr:Mutation dbr:Nucleic_acid_analogue dbr:Nucleotide dbr:DNA dbr:DNA_glycosylase dbr:DNA_methylation dbr:DNA_methyltransferase dbr:DNA_repair dbr:DNA_replication dbr:NMR_spectroscopy dbc:DNA dbr:Chemical_kinetics dbr:Chemical_probe dbr:Gene_expression dbr:Genetic_recombination dbr:X-PLOR dbr:Palindromic_sequence dbr:Enzyme dbr:Gibbs_free_energy dbr:Crystal_structure dbr:Tn10 dbr:MERLOT dbr:Haemophilus_haemolyticus dbr:Nucleobase dbr:Transposase dbr:2-Aminopurine dbr:Thymine dbr:Transcription_(genetics) dbr:8-Oxoguanine dbr:Adenine dbc:Molecular_biology dbr:Cytosine dbr:Flucytosine dbr:Base_excision_repair dbr:Nucleotides dbr:Fast_protein_liquid_chromatography dbr:Fluorescence_spectroscopy dbr:Isotopes_of_fluorine dbr:Protein_conformation dbr:Promoter_(genetics) dbr:Restriction_enzyme dbr:Atomic_nucleus dbr:Major_groove dbr:Atoms dbr:Chemical_bonds dbr:Chloroacetaldehyde dbr:Homologous_recombination dbr:Homology_(biology) dbr:Helicases dbr:Type_II_topoisomerase dbr:Dna dbr:Double_helix dbr:Hydrogen_bonds dbr:DNA_polymerases dbr:RNA_polymerase dbr:RecA dbr:X-ray_crystallography dbr:Methyl_group dbr:Methyltransferase dbr:Uracil-DNA_glycosylase dbr:Minor_groove dbr:Nucleoside_triphosphate dbr:V(D)J_recombination dbr:Time-resolved_spectroscopy dbr:Proteinaceous dbr:RNA_transcription dbr:Thymine_dimer dbr:File:Uracil_base_glycosidase.jpg dbr:File:DNA_methylation.jpg dbr:File:Dna-base-flipping.svg dbr:File:LightCycler_Probes.jpg dbr:File:Model_of_the_EhMeth-DNA_complex.jpg dbr:File:X_ray_diffraction.png |
dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Use_American_English |
dct:subject | dbc:DNA dbc:Molecular_biology |
gold:hypernym | dbr:Mechanism |
rdf:type | dbo:Organisation |
rdfs:comment | قلب قاعدة الحمض النووي، أو قلب النوكليوتيد، هي الآلية المستخدمة في تدوير قاعدة النوكليوتيد، أو القاعدة النووية، خارج الحلزون المزدوج للحمض النووي. يحدث هذا عندما يحتاج إنزيم معالجة الحمض النووي القدرة على الوصول إلى القاعدة لأداء عمله عليها، مثل استئصالها من أجل استبدال قاعدة أخرى بها خلال ترميم الدنا. لوحظت الآلية لأول مرة في عام 1994 باستخدام دراسة البلورات بالأشعة السينية في إنزيم ناقلة الميثيل المحفز لعملية مثيلة قاعدة السايتوسين في الدنا. منذ ذلك الحين، ثبت استخدامها عبر مختلف الإنزيمات في العديد من العمليات الحيوية مثل مثيلة الدنا، وآليات ترميم الدنا المتنوعة وتضاعف الدنا. يمكن حدوثها أيضًا في حلزونات الرنا المزدوجة أو متوسطات الدنا:الرنا المتشكلة خلال نسخ الرنا. (ar) DNA base flipping, or nucleotide flipping, is a mechanism in which a single nucleotide base, or nucleobase, is rotated outside the nucleic acid double helix. This occurs when a nucleic acid-processing enzyme needs access to the base to perform work on it, such as its excision for replacement with another base during DNA repair. It was first observed in 1994 using X-ray crystallography in a methyltransferase enzyme catalyzing methylation of a cytosine base in DNA. Since then, it has been shown to be used by different enzymes in many biological processes such as DNA methylation, various DNA repair mechanisms, and DNA replication. It can also occur in RNA double helices or in the DNA:RNA intermediates formed during RNA transcription. (en) Переворот оснований ДНК, или переворот нуклеотидов, представляет собой механизм, в котором одиночное основание нуклеотида, или азотистое основание, вращается вне двойной спирали нуклеиновой кислоты. Это происходит, когда ферменту, обрабатывающему нуклеиновую кислоту, требуется доступ к основанию для выполнения работы с ним, например, для его вырезания для замены другим основанием во время репарации ДНК. Впервые он был обнаружен в 1994 году с помощью рентгеновской кристаллографии фермента , катализирующего метилирование цитозинового основания в ДНК. С тех пор было показано, что он используется различными ферментами во многих биологических процессах, таких как метилирование ДНК, различные механизмы восстановления ДНК и репликация ДНК. Это также может происходить в двойных спиралях РНК или в (ru) |
rdfs:label | قلب قاعدة الحمض النووي (ar) DNA base flipping (en) Переворот оснований ДНК (ru) |
owl:sameAs | freebase:DNA base flipping wikidata:DNA base flipping dbpedia-ar:DNA base flipping dbpedia-ru:DNA base flipping https://global.dbpedia.org/id/f8x7 |
prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:DNA_base_flipping?oldid=1106233116&ns=0 |
foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Dna-base-flipping.svg wiki-commons:Special:FilePath/LightCycler_Probes.jpg wiki-commons:Special:FilePath/Model_of_the_EhMeth-DNA_complex.jpg wiki-commons:Special:FilePath/DNA_methylation.jpg wiki-commons:Special:FilePath/X_ray_diffraction.png wiki-commons:Special:FilePath/Uracil_base_glycosidase.jpg |
foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:DNA_base_flipping |
is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:DNA_Base_Flipping |
is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:DNA-3-methyladenine_glycosylase dbr:DNA_glycosylase dbr:DNA_Base_Flipping dbr:Base_excision_repair |
is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:DNA_base_flipping |