DNA-binding protein (original) (raw)
البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين أو البروتينات المرتبطة بالدنا (بالإنجليزية: DNA-binding proteins) هي بروتينات تتكون مِن ، وبالتالي تمتلك تقارب خاص أو عام مع سلسلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين المُفردة أو المزدوجة. بشكلٍ عام تتفاعل البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين خاصة السلسلة مع التلم الرئيسي للحمض النووي منقوص الأكسجين ب؛ وذلك بسبب إظهارها مجموعاتٍ وظيفية كثيرة تُحدد زوج القاعدة. على الرغم من ذلك، يوجد هُناك ربيطات مرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين في التلم الفرعي مثل وبينتاميدين ودابي وغيرها.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين أو البروتينات المرتبطة بالدنا (بالإنجليزية: DNA-binding proteins) هي بروتينات تتكون مِن ، وبالتالي تمتلك تقارب خاص أو عام مع سلسلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين المُفردة أو المزدوجة. بشكلٍ عام تتفاعل البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين خاصة السلسلة مع التلم الرئيسي للحمض النووي منقوص الأكسجين ب؛ وذلك بسبب إظهارها مجموعاتٍ وظيفية كثيرة تُحدد زوج القاعدة. على الرغم من ذلك، يوجد هُناك ربيطات مرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين في التلم الفرعي مثل وبينتاميدين ودابي وغيرها. (ar) Les proteïnes d'unió a ADN (també DNAbp, sigles del terme anglès DNA binding-protein) són les proteïnes que són capaces d' amb l'ADN. (ca) Ein DNA-bindendes Protein ist ein Protein, das an DNA bindet. (de) DNA-binding proteins are proteins that have DNA-binding domains and thus have a specific or general affinity for single- or double-stranded DNA. Sequence-specific DNA-binding proteins generally interact with the major groove of B-DNA, because it exposes more functional groups that identify a base pair. However, there are some known minor groove DNA-binding ligands such as netropsin, distamycin, Hoechst 33258, pentamidine, DAPI and others. (en) Las proteínas de unión al ADN son proteínas que tienen dominios de unión al ADN y, por lo tanto, tienen una afinidad específica o general por el ADN monocatenario o bicatenario. Las proteínas de unión a secuencias específicas del ADN generalmente interactúan con el surco mayor del ADN-B, porque expone más grupos funcionales que identifican un par de bases. Sin embargo, existen algunos ligandos de unión al surco menor del ADN conocidos como , , Hoechst 33258, pentamidina, DAPI y otros. (es) Une protéine de liaison à l'ADN est une protéine comportant un domaine de liaison à l'ADN et qui possède donc une affinité pour l'ADN monocaténaire ou bicaténaire (en double hélice). Les protéines de liaison à l'ADN spécifiques d'une séquence nucléotidique interagissent généralement avec le grand sillon de l'ADN B car ce dernier expose davantage les paires de bases, ce qui permet de mieux les identifier. Il existe cependant des ligands qui interagissent avec le petit sillon, comme la nétropsine (un polyamide), la , le colorant Hoechst 33258, la pentamidine (un trypanicide), le DAPI et d'autres encore. Parmi les protéines de liaison à l'ADN, on compte notamment les facteurs de transcription, qui modulent la transcription de l'ADN en ARN, diverses polymérases, des nucléases, qui clivent les molécules d'ADN, ainsi que les histones, qui interviennent dans le conditionnement des chromosomes et dans la régulation de la transcription au sein du noyau des cellules. Les protéines de liaison à l'ADN peuvent contenir des motifs structurels tels que doigt de zinc, hélice-coude-hélice, glissière à leucine, et d'autres encore, qui facilitent la liaison aux molécules d'acide nucléique. Il existe également des exemples de telles protéines moins classiques, comme les (en). (fr) DNA結合タンパク質とはDNA結合ドメインを有するタンパク質である。従って、一本鎖または二本鎖DNAに対して特異的または非特異的な親和性を有する 。配列特異的DNA結合タンパク質は一般に、塩基対を識別する官能基が比較的多いB-DNAの主溝と相互作用する。一方で、ネトロプシン 、ジスタマイシン、ヘキスト33258 、 ペンタミジン 、 DAPIなどのDNA副溝結合リガンドもいくつか知られている。 (ja) DNA 결합 단백질(DNA-binding protein)은 DNA 결합 도메인과 단일 또는 이중 가닥 DNA에 특이적 또는 비특이적 친화력을 가진 단백질이다. 일반적으로 서열 특이적 DNA 결합 단백질은 B-DNA의 Major Groove와 상호 작용하는데, 이는 염기쌍을 식별하는데 더 많은 작용기를 노출시키기 때문이다. 그러나 네트롭신(netropsin), 다이스타마이신(distamycin), Hoechst 33258, 펜타미딘(pentamidine), DAPI 등과 같은 몇몇 Minor Groove와 결합하는 DNA 결합 리간드가 알려져있다. (ko) Con il nome di DNA-binding protein (dall'inglese proteina che lega il DNA, spesso abbreviato in DNAbp) si intende una proteina in grado di instaurare legami con il DNA. (it) Białka wiążące DNA – szeroka klasa białek posiadających strukturalne pozwalające im na wiązanie się do dwu- lub jednoniciowego DNA. Przykładem takich białek mogą być czynniki transkrypcyjne, których funkcją jest regulacja ekspresji genów oraz niektóre polimerazy zależne od kwasów nukleinowych, zaangażowane w replikację DNA i transkrypcję na mRNA. (pl) ДНК-зв’язуючі білки - це Білки, які утворені з , а отже мають специфічну чи загальну спорідненість до одно- або двониткових ДНК. ДНК-зв’язуючі білки, які є сайт-специфічними, в основному взаємодіють із великою борозенкою B-ДНКа, тому що вона експонує більше функціональних груп, які ідентифікують пару основ. Однак відомі і до ДНК-зв’язуючі ліганди, такі як Нетропсин, Дістаміцин, , Пентамідин, ДАФІ(4.6-диамідо-2-фенол-індол) та інші. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Cro_protein_complex_with_DNA.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | https://generegulation.org/protein-dna-binding/ https://web.archive.org/web/20100307211109/http:/www.biomolecular-modeling.com/Abalone/index.html http://transcriptionfactor.org/ |
| dbo:wikiPageID | 966654 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 21828 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1110821865 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:B-DNA dbr:Electrophoretic_mobility_shift_assay dbr:Methylation dbr:Prokaryote dbr:Pentamidine dbr:Replication_protein_A dbr:DNA dbr:DNA-binding_domain dbr:DNA_repair dbr:DNase_footprinting_assay dbr:Leucine_zipper dbr:Lexitropsin dbr:Nuclease dbr:Nucleosome dbr:Protein–DNA_interaction_site_predictor dbc:Molecular_genetics dbc:Biophysics dbr:Gene_expression dbr:Enzyme dbr:Gene dbr:Comparison_of_nucleic_acid_simulation_software dbr:Deoxyribonucleoprotein dbr:Function_(biology) dbr:Functional_group dbr:TAL_effector dbr:Type_three_secretion_system dbr:Transcription_factors dbr:Lattice_model_(biophysics) dbr:Xanthomonas dbr:Amino_acid dbr:DAPI dbr:Eukaryote dbr:Base_pair dbr:Cell_nucleus dbr:Cellular_differentiation dbr:Chromatin dbr:Chromatin_immunoprecipitation dbr:Chromosome dbr:Histone dbr:Chemical dbr:Transcription_factor dbr:Protein dbr:HMG-box dbr:Helix-loop-helix dbr:Helix-turn-helix dbc:DNA_replication dbr:BZIP_domain dbr:Bacterial_one-hybrid_system dbc:DNA-binding_proteins dbr:Histones dbr:Stem-loop dbr:Major_groove dbc:Transcription_factors dbr:Acetylation dbr:Signal_transduction dbr:Zinc_finger dbr:Distamycin dbr:Plant dbr:Netropsin dbr:RNA-binding_protein dbr:ChIP-exo dbr:X-ray_crystallography dbr:ChIP-Seq dbr:Single-strand_binding_protein dbr:Uracil-DNA_glycosylase dbr:Minor_groove dbr:Two-hybrid_screening dbr:Phosphorylation dbr:Polymerase dbr:Microarrays dbr:Ionic_bond dbr:Hoechst_33258 dbr:ChIP-chip dbr:Tal_effector_nuclease dbr:Gene_modulation dbr:Zinc_finger_nucleases dbr:DNA-Protein-Interaction_-_Enzyme-Linked_ImmunoSorbant_Assay_(DPI-ELISA) dbr:File:Cro_protein_complex_with_DNA.png dbr:File:EcoRV_1RVA.png dbr:File:Lambda_repressor_1LMB.png dbr:File:Nucleosome1.png dbr:File:Transcription_factors_DNA_binding_sites.svg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Further dbt:MeshName dbt:Portal_bar dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:DNA-binding_proteins |
| dct:subject | dbc:Molecular_genetics dbc:Biophysics dbc:DNA_replication dbc:DNA-binding_proteins dbc:Transcription_factors |
| gold:hypernym | dbr:Proteins |
| rdf:type | yago:WikicatDNA-bindingProteins yago:WikicatTranscriptionFactors yago:Abstraction100002137 yago:Beginning107290905 yago:Cause107326557 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Event100029378 yago:Factor107327805 yago:Happening107283608 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Origin107323922 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:PsychologicalFeature100023100 yago:Relation100031921 yago:YagoPermanentlyLocatedEntity dbo:Protein yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين أو البروتينات المرتبطة بالدنا (بالإنجليزية: DNA-binding proteins) هي بروتينات تتكون مِن ، وبالتالي تمتلك تقارب خاص أو عام مع سلسلة الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين المُفردة أو المزدوجة. بشكلٍ عام تتفاعل البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين خاصة السلسلة مع التلم الرئيسي للحمض النووي منقوص الأكسجين ب؛ وذلك بسبب إظهارها مجموعاتٍ وظيفية كثيرة تُحدد زوج القاعدة. على الرغم من ذلك، يوجد هُناك ربيطات مرتبطة بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين في التلم الفرعي مثل وبينتاميدين ودابي وغيرها. (ar) Les proteïnes d'unió a ADN (també DNAbp, sigles del terme anglès DNA binding-protein) són les proteïnes que són capaces d' amb l'ADN. (ca) Ein DNA-bindendes Protein ist ein Protein, das an DNA bindet. (de) DNA-binding proteins are proteins that have DNA-binding domains and thus have a specific or general affinity for single- or double-stranded DNA. Sequence-specific DNA-binding proteins generally interact with the major groove of B-DNA, because it exposes more functional groups that identify a base pair. However, there are some known minor groove DNA-binding ligands such as netropsin, distamycin, Hoechst 33258, pentamidine, DAPI and others. (en) Las proteínas de unión al ADN son proteínas que tienen dominios de unión al ADN y, por lo tanto, tienen una afinidad específica o general por el ADN monocatenario o bicatenario. Las proteínas de unión a secuencias específicas del ADN generalmente interactúan con el surco mayor del ADN-B, porque expone más grupos funcionales que identifican un par de bases. Sin embargo, existen algunos ligandos de unión al surco menor del ADN conocidos como , , Hoechst 33258, pentamidina, DAPI y otros. (es) DNA結合タンパク質とはDNA結合ドメインを有するタンパク質である。従って、一本鎖または二本鎖DNAに対して特異的または非特異的な親和性を有する 。配列特異的DNA結合タンパク質は一般に、塩基対を識別する官能基が比較的多いB-DNAの主溝と相互作用する。一方で、ネトロプシン 、ジスタマイシン、ヘキスト33258 、 ペンタミジン 、 DAPIなどのDNA副溝結合リガンドもいくつか知られている。 (ja) DNA 결합 단백질(DNA-binding protein)은 DNA 결합 도메인과 단일 또는 이중 가닥 DNA에 특이적 또는 비특이적 친화력을 가진 단백질이다. 일반적으로 서열 특이적 DNA 결합 단백질은 B-DNA의 Major Groove와 상호 작용하는데, 이는 염기쌍을 식별하는데 더 많은 작용기를 노출시키기 때문이다. 그러나 네트롭신(netropsin), 다이스타마이신(distamycin), Hoechst 33258, 펜타미딘(pentamidine), DAPI 등과 같은 몇몇 Minor Groove와 결합하는 DNA 결합 리간드가 알려져있다. (ko) Con il nome di DNA-binding protein (dall'inglese proteina che lega il DNA, spesso abbreviato in DNAbp) si intende una proteina in grado di instaurare legami con il DNA. (it) Białka wiążące DNA – szeroka klasa białek posiadających strukturalne pozwalające im na wiązanie się do dwu- lub jednoniciowego DNA. Przykładem takich białek mogą być czynniki transkrypcyjne, których funkcją jest regulacja ekspresji genów oraz niektóre polimerazy zależne od kwasów nukleinowych, zaangażowane w replikację DNA i transkrypcję na mRNA. (pl) ДНК-зв’язуючі білки - це Білки, які утворені з , а отже мають специфічну чи загальну спорідненість до одно- або двониткових ДНК. ДНК-зв’язуючі білки, які є сайт-специфічними, в основному взаємодіють із великою борозенкою B-ДНКа, тому що вона експонує більше функціональних груп, які ідентифікують пару основ. Однак відомі і до ДНК-зв’язуючі ліганди, такі як Нетропсин, Дістаміцин, , Пентамідин, ДАФІ(4.6-диамідо-2-фенол-індол) та інші. (uk) Une protéine de liaison à l'ADN est une protéine comportant un domaine de liaison à l'ADN et qui possède donc une affinité pour l'ADN monocaténaire ou bicaténaire (en double hélice). Les protéines de liaison à l'ADN spécifiques d'une séquence nucléotidique interagissent généralement avec le grand sillon de l'ADN B car ce dernier expose davantage les paires de bases, ce qui permet de mieux les identifier. Il existe cependant des ligands qui interagissent avec le petit sillon, comme la nétropsine (un polyamide), la , le colorant Hoechst 33258, la pentamidine (un trypanicide), le DAPI et d'autres encore. (fr) |
| rdfs:label | بروتين مرتبط بالحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (ar) Proteïna d'unió a ADN (ca) DNA-bindende Proteine (de) Proteínas de unión al ADN (es) DNA-binding protein (en) Protéine de liaison à l'ADN (fr) DNA-binding protein (it) DNA 결합 단백질 (ko) DNA結合タンパク質 (ja) Białka wiążące DNA (pl) ДНК-зв'язувальні білки (uk) |
| owl:sameAs | dbpedia-it:DNA-binding protein freebase:DNA-binding protein yago-res:DNA-binding protein wikidata:DNA-binding protein dbpedia-ar:DNA-binding protein dbpedia-az:DNA-binding protein http://bs.dbpedia.org/resource/DNK-vezujući_protein dbpedia-ca:DNA-binding protein dbpedia-de:DNA-binding protein dbpedia-es:DNA-binding protein dbpedia-fa:DNA-binding protein dbpedia-fr:DNA-binding protein dbpedia-ja:DNA-binding protein dbpedia-ko:DNA-binding protein dbpedia-pl:DNA-binding protein dbpedia-uk:DNA-binding protein https://global.dbpedia.org/id/28AW1 |
| skos:closeMatch | http://www.springernature.com/scigraph/things/subjects/dna-binding-proteins |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:DNA-binding_protein?oldid=1110821865&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/EcoRV_1RVA.png wiki-commons:Special:FilePath/Lambda_repressor_1LMB.png wiki-commons:Special:FilePath/Nucleosome1.png wiki-commons:Special:FilePath/Transcription_factors_DNA_binding_sites.svg wiki-commons:Special:FilePath/Cro_protein_complex_with_DNA.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:DNA-binding_protein |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Binding_protein |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Protein–DNA_interaction dbr:DNA-binding_proteins dbr:DNA-protein_binding_specificity dbr:DNA-protein_interaction dbr:DNA_binding_ligand dbr:DNA_binding_protein dbr:Protein-DNA_interaction dbr:Dna-binding_proteins |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Cameron_Neylon dbr:Robert_T._Sauer dbr:Prokaryotic_cytoskeleton dbr:XDNA dbr:Deinococcus dbr:Androgen_receptor dbr:Response_regulator dbr:Cytosol dbr:DNA-binding_domain dbr:DNA_binding_site dbr:DNA_damage-inducible_transcript_3 dbr:Early_protein dbr:Index_of_biochemistry_articles dbr:GCM1 dbr:List_of_proteins dbr:Nucleoprotein dbr:Protein–DNA_interaction_site_predictor dbr:Southwestern_blot dbr:STAT_protein dbr:Gcn4 dbr:Genetic_linkage dbr:RUNX2 dbr:Glossary_of_genetics dbr:Glossary_of_genetics_(0–L) dbr:NFIA dbr:Epstein–Barr_virus_nuclear_antigen_2 dbr:LOC101928193 dbr:Lac_operon dbr:Single-stranded_binding_protein dbr:Kruppel-like_factors dbr:Macromolecular_crowding dbr:Magnetic_tweezers dbr:TATA_box dbr:Maxam–Gilbert_sequencing dbr:Regulon dbr:Activator_(genetics) dbr:Agnoprotein dbr:Transcription_activator-like_effector dbr:HUH-tag dbr:DACH1 dbr:Helix_bundle dbr:Last_universal_common_ancestor dbr:Protein–DNA_interaction dbr:Dinoflagellate_viral_nucleoprotein dbr:Granzyme_B dbr:Histone_H2B dbr:Locus_control_region dbr:Upstream_and_downstream_(transduction) dbr:Z-DNA dbr:Transcription_factor dbr:PURA dbr:Protein dbr:RAGE_(receptor) dbr:Regulation_of_gene_expression dbr:Helix-turn-helix dbr:Atrophin_1 dbr:Bacterial_DNA_binding_protein dbr:Bacterial_transcription dbr:Jeffrey_Glassberg dbr:POLG2 dbr:Bimolecular_fluorescence_complementation dbr:Binding_protein dbr:Hoechst_stain dbr:Homeotic_selector_gene dbr:Zeus_(gene) dbr:Zinc_finger dbr:BEND2_(protein) dbr:CREB1 dbr:HspQ_protein_domain dbr:ZNF337 dbr:DNA-binding_proteins dbr:DNA-protein_binding_specificity dbr:DNA-protein_interaction dbr:DNA_binding_ligand dbr:DNA_binding_protein dbr:ID4 dbr:Netropsin dbr:RNA-binding_protein dbr:WRKY_transcription_factor dbr:Nicolas_H._Thomä dbr:Single-strand_DNA-binding_protein dbr:Transactivation_domain dbr:FLYWCH_zinc_finger dbr:FOXP2 dbr:Immediate_early_gene dbr:Obsolete_models_of_DNA_structure dbr:NFATC2 dbr:Therapeutic_gene_modulation dbr:TALE-likes dbr:Two-hybrid_screening dbr:Photobacterium_profundum dbr:Sex-determining_region_Y_protein dbr:Toxin-antitoxin_system dbr:Non-coding_DNA dbr:Period_4_element dbr:Repressor dbr:Two-component_regulatory_system dbr:SATB2 dbr:PKNOX2 dbr:Trithorax-group_proteins dbr:Small_tumor_antigen dbr:SAE2_(yeast) dbr:Transcription_factor_binding_site_databases dbr:Spiraviridae dbr:Protein-DNA_interaction dbr:Dna-binding_proteins |
| is rdfs:seeAlso of | dbr:DNA-binding_domain |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:DNA-binding_protein |
