MADS-box (original) (raw)

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MADS box és una seqüència motiu conservada que es troba en una família de factors de transcripció, la família de proteïnes MAD-box. La llargada de la MADS-box segons els informes de l'investigadors varia, però típicament va dels 168 als 180 parells de bases.

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dbo:abstract MADS box és una seqüència motiu conservada que es troba en una família de factors de transcripció, la família de proteïnes MAD-box. La llargada de la MADS-box segons els informes de l'investigadors varia, però típicament va dels 168 als 180 parells de bases. (ca) MADS-box proteiny tvoří rodinu transkripčních faktorů, které obsahují tzv. MADS box. Je to určitá konsensuální sekvence aminokyselin, kterou více či méně sdílí jednotliví zástupci MADS-box bílkovin. Název je odvozen od nejstarších známých genů této rodiny: (z kvasinek), (z huseníčku), (z hledíku) a (u savců). (cs) Die MADS-Box-Proteine sind Proteine in Eukaryoten, die genregulatorische Aufgaben erfüllen, so genannte Transkriptionsfaktoren. Die meisten MADS-Box-Proteine sind an Entwicklungsprozessen beteiligt, so zum Beispiel an der Entwicklung des Blütenstandes von Bedecktsamern. Der Name 'Box' deutet auf einen Genabschnitt in den für die Proteine codierenden Genen hin, der sich im Lauf der Evolution nicht verändert hat; entsprechend ist auch ein Teil der Aminosäuresequenz in allen diesen Proteinen gleich. Dies ist gleichzeitig die für die Funktion der Proteine ausschlaggebende Proteindomäne. (de) MADS-box es una familia de factores de transcripción basada en la similitud de las secuencias de sus genes.​ El nombre «MADS-box» es un acrónimo formado a partir de los nombres de los genes en cuya secuencia fue identificada la caja MADS por primera vez: MCM1 (procedente de Saccharomyces cerevisiae); AGAMOUS (de Arabidopsis thaliana e implicado en su desarrollo floral); DEFICIENS (de Antirrhinum majus, donde interviene también en el desarrollo floral), y SRF (de Homo sapiens).​ Estos factores de transcripción, propios de un buen número de eucariotas, destacándose su presencia en animales, plantas y en levaduras, poseen una gran importancia en su fisiología al regular distintas funciones. Como todos los factores de transcripción, los MADS-box interactúan con el ADN.​ En cuanto a su estructura, las proteínas MADS-box poseen sus de interacción con el ADN en su zona N-terminal (de unos 56 aminoácidos), si bien su zona C-terminal (de 30 aminoácidos) también es esencial para una unión eficiente. Como en el caso de otros factores de transcripción, puede requerir dimerización para ser funcionalmente activo, formando homodímeros o heterodímeros.​ Estos genes tienen múltiples funciones, y están involucrados en el desarrollo floral de muchas plantas. Aunque los genes de caja HOX y MADS estaban presentes en el último ancestro común de plantas y animales, la familia de los genes de caja MADS opera en muchos de los principales procesos regulatorios del desarrollo de las plantas, pero no opera en los correspondientes de los animales. Sin embargo, los genes del tipo HOX son reguladores importantes del desarrollo tanto en plantas como en animales.​ Los genes que sólo son transcritos en la parte vegetativa están localizados en la parte más basal del organismo, mientras que los genes involucrados en el desarrollo floral se expresan después.​ En Arabidopsis thaliana se han identificado más de 80 genes diferentes del tipo MADS-Box3. Muchas plantas presentan regiones conservadas, tales como la K-box, que posee de 237 a 259 pb y se cree que está involucrada en la dimerización de proteínas. Aquellos genes MADS-BOX de plantas que posean esa caja K se conocen como genes MIK o MIKC. La estructura MIKC se ha visto en musgos y en otras embriofitas.​ La función más conocida de estos genes es la que da lugar al modelo ABC del desarrollo floral. Hasta ahora se distinguen 5 genes diferentes involucrados en la identidad floral de Arabidopsis: APETALA 1 (AP1), APETALA2 (AP2), APETALA3 (AP3), PISTILLATA (P1) Y AGAMOUS (AG).​La clase A es codificada por APETALA1 y APETALA2. La pérdida de función de la clase A resulta en la formación de carpelos en vez de sépalos en el primer verticilo, y estambres en vez de pétalos en el segundo verticilo. La clase B está compuesta por APETALA3 y PISTILLATA: esta clase, junto con la clase C, da lugar al estambre. La clase C solo incluye el gen AGAMOUS, y da origen al carpelo. (es) La MADS-box est une séquence très conservée et répétée de l'ADN de beaucoup d'organismes vivants, qui code des protéines de la famille des facteurs de transcription. Les gènes qui contiennent ce motif sont appelés la famille des gènes MADS-box. La MADS-box code le domaine MADS de liaison à l'ADN. Le domaine MADS se lie à des séquences d'ADN de grande similitude avec le motif CC[A/T]6GG appelé CArG-box. La longueur de la boîte MADS varie de 168 à 180 paires de bases, c'est-à-dire que le domaine MADS codé a une longueur de 56 à 60 acides aminés. Il existe des preuves que le domaine MADS a évolué à partir d'un tronçon de séquence d'une dans un ancêtre commun de tous les eucaryotes existants. (fr) The MADS box is a conserved sequence motif. The genes which contain this motif are called the MADS-box gene family. The MADS box encodes the DNA-binding MADS domain. The MADS domain binds to DNA sequences of high similarity to the motif CC[A/T]6GG termed the CArG-box. MADS-domain proteins are generally transcription factors. The length of the MADS-box reported by various researchers varies somewhat, but typical lengths are in the range of 168 to 180 base pairs, i.e. the encoded MADS domain has a length of 56 to 60 amino acids. There is evidence that the MADS domain evolved from a sequence stretch of a type II topoisomerase in a common ancestor of all extant eukaryotes. (en) MADSボックス(マッズボックス, 英: MADS-box)は、生物の間で広く保存されたDNA塩基配列()のひとつである。MADSボックスを持つ遺伝子はMADSボックス遺伝子またはMADS遺伝子と呼ばれる遺伝子ファミリーを形成する。MADSボックス遺伝子がコードするタンパク質は通常転写因子として働き、生体内で様々な機能を果たす。特に、ABCモデルの構成要素として植物の花の発生に果たす役割がよく知られている。 (ja) MADS box è una altamente conservata trovata all'interno di una famiglia di fattori di trascrizione, le proteine MADS-box. La lunghezza delle MADS-box riportata dai vari gruppi di ricerca varia in qualche maniera, ma la lunghezza tipica si aggira intorno alle 168 - 180 paia di basi. Questi geni appartengono ad un buon numero di cellule eucariote, sia animali, vegetali che funghi. hanno una grande importanza in fisiologia, poiché regolano diverse attività biologiche. Come tutti i fattori di trascrizione, i MADS-box interagiscono col DNA. Le proteine MADS-box posseggono un dominio di legame al DNA in zona N-terminale (lungo intorno ai 56 aminoacidi), ed in C-terminale (lungo 36 aminoacidi) al fine di un legame efficiente. Come nel caso di altri fattori di trascrizione, le proteine MADS-box necessitano a volte di unirsi in dimeri (formando o ). (it) MADS-boxen är ett konserverat DNA-sekvenselement som återfinns i en genfamilj som kodar för transkriptionsfaktorer, MADS-boxgenerna. På proteinnivå kallas motsvarande sekvens aminosyror för en MADS-domän. Namnet MADS är en förkortning som syftar på de fyra gener i vilken man först identifierade MADS-boxen: MCM1 från jäst (Saccharomyces cerevisiae), AGAMOUS från backtrav (Arabidopsis thaliana), DEFICIENS från lejongap (Antirrhinum majus) och SRF från människa. Hos växter har MADS-boxgenerna genomgått många duplikationer och inkluderar bland annat gener som reglerar blomorganidentitet och som leder till homeotiska förändringar i blommor då de muteras. (sv) MADS-box (MADS-бокс) — консервативная последовательность нуклеотидов, кодирующая MADS-домен, при помощи которого белки связываются с ДНК. MADS-домен белков связывается с ДНК, в которой есть последовательность CC[A/T]6GG, коротко обозначаемая как CArG-box. Большинство белков, содержащих этот домен, являются транскрипционными факторами и влияют на экспрессию генов. Разные исследователи приводят разные данные относительно длины MADS-box, но обычно она составляет около 168—180 пар оснований, то есть закодированный в ней MADS-домен состоит из 56—60 аминокислот. Существуют данные, согласно которым MADS-домен эволюционировал из последовательности белка , который, как полагают, был у общего предка всех ныне живущих эукариот. Все гены, содержащие последовательность MADS-box, объединены в единое семейство генов MADS-box. (ru) MADS盒蛋白(英語:MADS-box)基因是一大类与高等植物花器发育有关的调控基因,具有同源异形框基因的功能。MADS的命名由四个基因的第一个第1个字母组合而成,即酵母MCMI,拟南芥(Arabidopsis thaliana)AG(Agamous),金鱼草DEFA和动物血清应激因子(SRF,serum response factor),它们都是转录调控蛋白,在结构上具有同源性。 MADS盒基因可分为三大类群,即A、B和C三组,它们均有典型的MADS盒顺序,在高等植物花器发育的不同位置起作用。植物花朵的结构大同小异,均有四轮器官,第一轮为花萼,第二轮为花瓣,第三轮为雄蕊,第四轮为心皮。A类基因控制外侧2轮花器的分化,B类涉及第二和第三轮花器的发育,C类基因负责内部2轮花器的确定性。若发生MADS盒基因突变,花旗的位置将发生互换。这就是经典的ABC模型理论。 植物的MADS盒蛋白有四个特征区,分别为MADS盒,I,K,C域。MADS盒含57个氨基酸,可与DNA双螺旋的小沟专一性结合。I区为间隔顺序,K区因含类角蛋白(keratin)而取名,长约70个氨基酸。C区为羧基端,顺序变化较大,可与辅助因子结合启动基因转录。 (zh)
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Der Name 'Box' deutet auf einen Genabschnitt in den für die Proteine codierenden Genen hin, der sich im Lauf der Evolution nicht verändert hat; entsprechend ist auch ein Teil der Aminosäuresequenz in allen diesen Proteinen gleich. Dies ist gleichzeitig die für die Funktion der Proteine ausschlaggebende Proteindomäne. (de) La MADS-box est une séquence très conservée et répétée de l'ADN de beaucoup d'organismes vivants, qui code des protéines de la famille des facteurs de transcription. Les gènes qui contiennent ce motif sont appelés la famille des gènes MADS-box. La MADS-box code le domaine MADS de liaison à l'ADN. Le domaine MADS se lie à des séquences d'ADN de grande similitude avec le motif CC[A/T]6GG appelé CArG-box. La longueur de la boîte MADS varie de 168 à 180 paires de bases, c'est-à-dire que le domaine MADS codé a une longueur de 56 à 60 acides aminés. Il existe des preuves que le domaine MADS a évolué à partir d'un tronçon de séquence d'une dans un ancêtre commun de tous les eucaryotes existants. (fr) The MADS box is a conserved sequence motif. The genes which contain this motif are called the MADS-box gene family. The MADS box encodes the DNA-binding MADS domain. The MADS domain binds to DNA sequences of high similarity to the motif CC[A/T]6GG termed the CArG-box. MADS-domain proteins are generally transcription factors. The length of the MADS-box reported by various researchers varies somewhat, but typical lengths are in the range of 168 to 180 base pairs, i.e. the encoded MADS domain has a length of 56 to 60 amino acids. There is evidence that the MADS domain evolved from a sequence stretch of a type II topoisomerase in a common ancestor of all extant eukaryotes. (en) MADSボックス(マッズボックス, 英: MADS-box)は、生物の間で広く保存されたDNA塩基配列()のひとつである。MADSボックスを持つ遺伝子はMADSボックス遺伝子またはMADS遺伝子と呼ばれる遺伝子ファミリーを形成する。MADSボックス遺伝子がコードするタンパク質は通常転写因子として働き、生体内で様々な機能を果たす。特に、ABCモデルの構成要素として植物の花の発生に果たす役割がよく知られている。 (ja) MADS-boxen är ett konserverat DNA-sekvenselement som återfinns i en genfamilj som kodar för transkriptionsfaktorer, MADS-boxgenerna. På proteinnivå kallas motsvarande sekvens aminosyror för en MADS-domän. Namnet MADS är en förkortning som syftar på de fyra gener i vilken man först identifierade MADS-boxen: MCM1 från jäst (Saccharomyces cerevisiae), AGAMOUS från backtrav (Arabidopsis thaliana), DEFICIENS från lejongap (Antirrhinum majus) och SRF från människa. Hos växter har MADS-boxgenerna genomgått många duplikationer och inkluderar bland annat gener som reglerar blomorganidentitet och som leder till homeotiska förändringar i blommor då de muteras. (sv) MADS盒蛋白(英語:MADS-box)基因是一大类与高等植物花器发育有关的调控基因,具有同源异形框基因的功能。MADS的命名由四个基因的第一个第1个字母组合而成,即酵母MCMI,拟南芥(Arabidopsis thaliana)AG(Agamous),金鱼草DEFA和动物血清应激因子(SRF,serum response factor),它们都是转录调控蛋白,在结构上具有同源性。 MADS盒基因可分为三大类群,即A、B和C三组,它们均有典型的MADS盒顺序,在高等植物花器发育的不同位置起作用。植物花朵的结构大同小异,均有四轮器官,第一轮为花萼,第二轮为花瓣,第三轮为雄蕊,第四轮为心皮。A类基因控制外侧2轮花器的分化,B类涉及第二和第三轮花器的发育,C类基因负责内部2轮花器的确定性。若发生MADS盒基因突变,花旗的位置将发生互换。这就是经典的ABC模型理论。 植物的MADS盒蛋白有四个特征区,分别为MADS盒,I,K,C域。MADS盒含57个氨基酸,可与DNA双螺旋的小沟专一性结合。I区为间隔顺序,K区因含类角蛋白(keratin)而取名,长约70个氨基酸。C区为羧基端,顺序变化较大,可与辅助因子结合启动基因转录。 (zh) MADS-box es una familia de factores de transcripción basada en la similitud de las secuencias de sus genes.​ El nombre «MADS-box» es un acrónimo formado a partir de los nombres de los genes en cuya secuencia fue identificada la caja MADS por primera vez: MCM1 (procedente de Saccharomyces cerevisiae); AGAMOUS (de Arabidopsis thaliana e implicado en su desarrollo floral); DEFICIENS (de Antirrhinum majus, donde interviene también en el desarrollo floral), y SRF (de Homo sapiens).​ (es) MADS box è una altamente conservata trovata all'interno di una famiglia di fattori di trascrizione, le proteine MADS-box. La lunghezza delle MADS-box riportata dai vari gruppi di ricerca varia in qualche maniera, ma la lunghezza tipica si aggira intorno alle 168 - 180 paia di basi. Questi geni appartengono ad un buon numero di cellule eucariote, sia animali, vegetali che funghi. hanno una grande importanza in fisiologia, poiché regolano diverse attività biologiche. Come tutti i fattori di trascrizione, i MADS-box interagiscono col DNA. Le proteine MADS-box posseggono un dominio di legame al DNA in zona N-terminale (lungo intorno ai 56 aminoacidi), ed in C-terminale (lungo 36 aminoacidi) al fine di un legame efficiente. Come nel caso di altri fattori di trascrizione, le proteine MADS-box n (it) MADS-box (MADS-бокс) — консервативная последовательность нуклеотидов, кодирующая MADS-домен, при помощи которого белки связываются с ДНК. MADS-домен белков связывается с ДНК, в которой есть последовательность CC[A/T]6GG, коротко обозначаемая как CArG-box. 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