Molecule editor (original) (raw)
構造式エディタ（こうぞうしきえでぃた、molecule editor）は分子構造の構造式を作図、編集するコンピュータープログラムである。 作図や化学データベースの検索式を書き表す為に、分子や化学反応の二次元（平面）表現を作成する際に使用される。また、分子構造モデルを構築するために立体構造を編集するエディタも存在し、それは通常、分子構造モデリング・ソフトウエアパッケージの部品として提供される。 多くの構造式エディタはエディタ特有のファイルフォーマットを使用しているが、大抵の場合は他の複数のファイルフォーマットのファイルフォーマットを読み書きできるようになっている。その中には分子をASCII文字列で表現するSMILES記法も含まれる場合がある。 平面あるいは立体構造式エディタが生成するファイルは分子構造ビュワーを使用して表示することも出来、 分子構造ビュワーはWebページ中の短いアプレット言語で実装することで分子構造を表示するものも存在する。
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Un editor de molècules és un programa informàtic per crear i modificant representacions d'estructures químiques. Els editors de molècules poden manipular representacions d'estructures químiques en un espai bidimensional o espai tridimensional simulat, a través de computació gràfica 2D o computació gràfica 3D, respectivament. La sortida bidimensional s'utilitza com il·lustracions o per consultar . La producció tridimensional s'utilitza per construir models moleculars, generalment com a part dels paquets de programari de simulació molecular. Els editors moleculars de bases de dades com Leatherface, RECAP i Molecule Slicer permeten que un gran nombre de molècules es modifiquin automàticament segons regles com ara com "desprotonar àcids carboxílics" o "trencar enllaços exocíclics" que pot especificar un usuari. Els editors de molècules generalment admeten llegir i escriure almenys un format de fitxer o . Els exemples de cadascun inclouen i especificació d'entrada de línia d'entrada molecular simplificada (SMILES), respectivament. Els fitxers generats pels editors de molècules es poden mostrar mitjançant eines de . (ca) Editor molekul je počítačový program na kreslení a editování chemických struktur. Dvourozměrné zobrazení molekuly nebo chemické reakce je důležité pro názornou ilustraci nebo může být užitečné pro vyhledávání v . Existují také trojrozměrné editory molekul pro zobrazení stavby nebo modelu molekuly. Tyto 3D editory bývají součástí programových balíků na . Většina editorů molekul používá vlastní souborový formát, ale většina z nich umí načíst a uložit více souborových formátů, včetně SMILES (Simplified molecular input line entry specification, tj. krátký ASCII vzorec molekuly). Soubory generované 2D nebo 3D molekulovým editorem lze zobrazit pomocí prohlížeče (anglicky: molecule viewer), který může zobrazovat molekuly na webových stránkách pomocí malého appletu. (cs) A molecule editor is a computer program for creating and modifying representations of chemical structures. Molecule editors can manipulate chemical structure representations in either a simulated two-dimensional space or three-dimensional space, via 2D computer graphics or 3D computer graphics, respectively. Two-dimensional output is used as illustrations or to query chemical databases. Three-dimensional output is used to build molecular models, usually as part of molecular modelling software packages. Database molecular editors such as Leatherface, RECAP, and Molecule Slicer allow large numbers of molecules to be modified automatically according to rules such as 'deprotonate carboxylic acids' or 'break exocyclic bonds' that can be specified by a user. Molecule editors typically support reading and writing at least one file format or line notation. Examples of each include Molfile and simplified molecular input line entry specification (SMILES), respectively. Files generated by molecule editors can be displayed by molecular graphics tools. (en) 構造式エディタ（こうぞうしきえでぃた、molecule editor）は分子構造の構造式を作図、編集するコンピュータープログラムである。 作図や化学データベースの検索式を書き表す為に、分子や化学反応の二次元（平面）表現を作成する際に使用される。また、分子構造モデルを構築するために立体構造を編集するエディタも存在し、それは通常、分子構造モデリング・ソフトウエアパッケージの部品として提供される。 多くの構造式エディタはエディタ特有のファイルフォーマットを使用しているが、大抵の場合は他の複数のファイルフォーマットのファイルフォーマットを読み書きできるようになっている。その中には分子をASCII文字列で表現するSMILES記法も含まれる場合がある。 平面あるいは立体構造式エディタが生成するファイルは分子構造ビュワーを使用して表示することも出来、 分子構造ビュワーはWebページ中の短いアプレット言語で実装することで分子構造を表示するものも存在する。 (ja) Молекуля́рный реда́ктор — специализированная программа для электронно-вычислительных машин, позволяющая вводить, редактировать и выводить на внешние носители информации (на бумагу, на экран) информацию о составе и структуре молекул веществ. (ru) |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://metamolecular.com/chemwriter/articles/the-chemical-structure-editor-bridging-chemistry-and-cheminformatics/ https://dx.doi.org/10.1186/1758-2946-2-1 |
| dbo:wikiPageID | 1111552 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 6612 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1118805297 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Bioclipse dbr:Deneb dbr:Two-dimensional_space dbr:Cross-platform dbr:SAMSON dbr:ChemSpider dbr:Chemical_database dbr:Chemical_structure dbr:GNU_Lesser_General_Public_License dbr:Gabedit dbr:Molecular_Operating_Environment dbr:Molecular_graphics dbr:Android_(operating_system) dbr:Linux dbr:MacOS dbr:Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling dbr:Computer_program dbr:Zuse_Institute_Berlin dbr:OpenBabel dbr:Avogadro_(software) dbr:Three-dimensional_space dbr:Wiley_(publisher) dbr:Windows_Phone dbr:Line_notation dbr:2D_computer_graphics dbr:Advanced_Chemistry_Development dbr:Amira_(software) dbr:3D_computer_graphics dbr:File_format dbr:Rich_Client_Platform dbr:JChemPaint dbr:JME_Molecule_Editor dbr:Java_(programming_language) dbr:Ascalaph_Designer dbr:ACD/ChemSketch dbc:Chemistry_software dbc:Computational_chemistry dbr:ChemDraw dbr:ChemWindow dbr:Chemical_Computing_Group dbr:Kekulé_Program dbr:Eclipse_Public_License dbr:Spartan_(chemistry_software) dbr:Freeware dbr:IPad dbr:IPhone dbr:XDrawChem dbr:Molecular_design_software dbr:Molecular_modelling dbr:BALLView dbr:Simplified_molecular_input_line_entry_specification dbr:Molfile dbr:Agile_Molecule dbr:Kekule.js_Lab dbr:Molinspiration dbr:Visage_Imaging dbr:Wavefunction,_Inc. |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Free dbt:BSD-lic dbt:LGPL-lic dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Yes dbt:GPL-lic dbt:Proprietary dbt:Unk |
| dcterms:subject | dbc:Chemistry_software dbc:Computational_chemistry |
| gold:hypernym | dbr:Program |
| rdf:type | dbo:Work dbo:MusicGenre |
| rdfs:comment | 構造式エディタ（こうぞうしきえでぃた、molecule editor）は分子構造の構造式を作図、編集するコンピュータープログラムである。 作図や化学データベースの検索式を書き表す為に、分子や化学反応の二次元（平面）表現を作成する際に使用される。また、分子構造モデルを構築するために立体構造を編集するエディタも存在し、それは通常、分子構造モデリング・ソフトウエアパッケージの部品として提供される。 多くの構造式エディタはエディタ特有のファイルフォーマットを使用しているが、大抵の場合は他の複数のファイルフォーマットのファイルフォーマットを読み書きできるようになっている。その中には分子をASCII文字列で表現するSMILES記法も含まれる場合がある。 平面あるいは立体構造式エディタが生成するファイルは分子構造ビュワーを使用して表示することも出来、 分子構造ビュワーはWebページ中の短いアプレット言語で実装することで分子構造を表示するものも存在する。 (ja) Молекуля́рный реда́ктор — специализированная программа для электронно-вычислительных машин, позволяющая вводить, редактировать и выводить на внешние носители информации (на бумагу, на экран) информацию о составе и структуре молекул веществ. (ru) Un editor de molècules és un programa informàtic per crear i modificant representacions d'estructures químiques. Els editors de molècules poden manipular representacions d'estructures químiques en un espai bidimensional o espai tridimensional simulat, a través de computació gràfica 2D o computació gràfica 3D, respectivament. La sortida bidimensional s'utilitza com il·lustracions o per consultar . La producció tridimensional s'utilitza per construir models moleculars, generalment com a part dels paquets de programari de simulació molecular. (ca) Editor molekul je počítačový program na kreslení a editování chemických struktur. Dvourozměrné zobrazení molekuly nebo chemické reakce je důležité pro názornou ilustraci nebo může být užitečné pro vyhledávání v . Existují také trojrozměrné editory molekul pro zobrazení stavby nebo modelu molekuly. Tyto 3D editory bývají součástí programových balíků na . Většina editorů molekul používá vlastní souborový formát, ale většina z nich umí načíst a uložit více souborových formátů, včetně SMILES (Simplified molecular input line entry specification, tj. krátký ASCII vzorec molekuly). (cs) A molecule editor is a computer program for creating and modifying representations of chemical structures. Molecule editors can manipulate chemical structure representations in either a simulated two-dimensional space or three-dimensional space, via 2D computer graphics or 3D computer graphics, respectively. Two-dimensional output is used as illustrations or to query chemical databases. Three-dimensional output is used to build molecular models, usually as part of molecular modelling software packages. Files generated by molecule editors can be displayed by molecular graphics tools. (en) |
| rdfs:label | Editor de molècules (ca) Editor molekul (cs) Molecule editor (en) 構造式エディタ (ja) Молекулярный редактор (ru) |
| owl:sameAs | freebase:Molecule editor wikidata:Molecule editor dbpedia-ca:Molecule editor dbpedia-cs:Molecule editor dbpedia-ja:Molecule editor dbpedia-ru:Molecule editor https://global.dbpedia.org/id/srwm |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Molecule_editor?oldid=1118805297&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Molecule_editor |
| is dbo:genre of | dbr:Avogadro_(software) dbr:JME_Molecule_Editor dbr:XyMTeX dbr:JME_Molecule_Editor__JSME_Molecule_Editor__1 |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:List_of_molecule_editors dbr:Comparison_of_molecule_editors dbr:Molecule_editors dbr:Chemical_structure_drawing_program dbr:Molecular_editor dbr:Molecule_viewer |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Scigress dbr:List_of_molecule_editors dbr:Molecular_geometry dbr:List_of_molecular_graphics_systems dbr:List_of_quantum_chemistry_and_solid-state_physics_software dbr:PubChem dbr:Comparison_of_molecule_editors dbr:Molecular_graphics dbr:Molecular_mechanics dbr:MDynaMix dbr:MacroModel dbr:Sirius_visualization_software dbr:Comparison_of_force-field_implementations dbr:Comparison_of_nucleic_acid_simulation_software dbr:Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling dbr:Markush_structure dbr:Avogadro_(software) dbr:BALL dbr:BOSS_(molecular_mechanics) dbr:UCSF_Chimera dbr:WHAT_IF_software dbr:Abalone_(molecular_mechanics) dbr:Folding@home dbr:Graph_theory dbr:Molecular_dynamics dbr:International_Chemical_Identifier dbr:JChemPaint dbr:JME_Molecule_Editor dbr:JOELib dbr:TeraChem dbr:Ascalaph_Designer dbr:ACD/ChemSketch dbr:ChemDraw dbr:ChemWindow dbr:Chemaxon dbr:Chemistry_Development_Kit dbr:Jmol dbr:Hierarchical_editing_language_for_macromolecules dbr:Dotmatics dbr:Spartan_(chemistry_software) dbr:RasMol dbr:XyMTeX dbr:List_of_computer-assisted_organic_synthesis_software dbr:Simplified_molecular-input_line-entry_system dbr:ISIS/Draw dbr:List_of_software_for_Monte_Carlo_molecular_modeling dbr:List_of_software_for_nanostructures_modeling dbr:Structure_editor dbr:Ghemical dbr:Molecular_design_software dbr:Molecular_modeling_on_GPUs dbr:Molecular_modelling dbr:SMILES_arbitrary_target_specification dbr:Molecule_editors dbr:Chemical_structure_drawing_program dbr:Molecular_editor dbr:Molecule_viewer |
| is dbp:genre of | dbr:Avogadro_(software) dbr:JME_Molecule_Editor dbr:XyMTeX |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Molecule_editor |