Opine (original) (raw)
Opine (N-Carboxyethyl-Aminosäuren) sind stickstoffhaltige organische Verbindungen aus der Gruppe der Dicarbonsäuren, die durch eine Kondensationsreaktion (Wasserabspaltung) von α-Ketosäuren und Aminosäuren entstehen.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Opine (N-Carboxyethyl-Aminosäuren) sind stickstoffhaltige organische Verbindungen aus der Gruppe der Dicarbonsäuren, die durch eine Kondensationsreaktion (Wasserabspaltung) von α-Ketosäuren und Aminosäuren entstehen. (de) Les opines sont des composés spécifiques d'une tumeur végétale, la galle du collet ou crown gall, ou le broussin de vigne, induite par des bactéries pathogènes du genre Agrobacterium. Les racines induites sous l'action d'Agrobacterium rhizogenes produisent aussi des opines. Les opines résultent le plus souvent de la condensation d'un acide aminé et d'un acide cétonique, ou d'un acide aminé et d'un sucre. Une vingtaine d'opines ont été identifiées. Toutes ces opines ne sont pas présentes en même temps dans une tumeur donnée. Les plus connues des opines sont l'octopine (aussi trouvée dans les muscles du poulpe ou octopus, d'où le nom, lors de la contraction anaérobie) et la nopaline (trouvée dans des tumeurs de figuiers de barbarie ou nopal). La synthèse des opines dans les végétaux transfectés par Agrobacterium s'effectue sous la dépendance des produits de gènes bactériens transférés et exprimés dans les cellules de plantes (gènes de l'ADN-T ou T-DNA, voir l'article sur Agrobacterium). Dans les tumeurs, les opines servent de sources de carbone et - pour certaines - d'azote spécifiques à la bactérie qui a induit cette tumeur, et de signal inducteur du transfert par conjugaison du plasmide Ti d'Agrobacterium, porteur de la plupart des déterminants du pouvoir pathogène. Dans la galle du collet, tout se passe donc comme si la bactérie se créait une niche écologique où la présence d'opines favorisait sa croissance et la dissémination du pouvoir pathogène. Ce phénomène est connu sous le nom de concept d'opine. Les gènes impliqués dans l'utilisation des opines étant portés par le plasmide pathogène d'Agrobacterium, une souche incapable d'utiliser les opines a généralement perdu sa virulence. * Portail de la chimie * Portail de la biochimie (fr) Opines are low molecular weight compounds found in plant crown gall tumors or hairy root tumors produced by pathogenic bacteria of the genus Agrobacterium and Rhizobium. Opine biosynthesis is catalyzed by specific enzymes encoded by genes contained in a small segment of DNA (known as the T-DNA, for 'transfer DNA'), which is part of the Ti plasmid (in Agrobacterium) or (in Rhizobium), inserted by the bacterium into the plant genome. The opines are used by the bacterium as an important energy, carbon and nitrogen source. Each strain of Agrobacterium and Rhizobium induces and catabolizes a specific set of opines, this set typifying the Ti plasmid and . There are some 30 different opines described so far. (en) オパインまたはオピン（Opine）は、アグロバクテリウム属やリゾビウム属の寄生細菌により作られ、植物のや毛状根腫瘍で見られる低分子量化合物である。オパインの生合成は、細菌から植物のゲノムに挿入されたTiプラスミド（アグロバクテリウム属の場合）またはRiプラスミド（リゾビウム属の場合）の一部であると呼ばれる小さなDNAの断片を含む遺伝子にコードされる特異的な酵素によって触媒される。オパインは細菌により、重要な炭素源、窒素源及びエネルギー源として用いられる。アグロバクテリウム属とリゾビウム属の各株は、特定種のオパインを誘導し、異化することができる。この種類はTiプラスミドまたはRiプラスミドによって規定される。これまで、少なくとも30種類のオパインが報告されている。 (ja) Le opine sono amminoacidi inusuali e sono utilizzati dai batteri come nutrienti. La cellula vegetale non è in grado di utilizzarle. Sono prodotte ad esempio da Agrobacterium tumefaciens quando entra in simbiosi con delle dicotiledoni. I geni per la loro codifica sono contenuti nel T-DNA, parte di plasmide Ti, che è integrato appunto da questo genere microbico all'interno della pianta ospite. (it) Opina – metabolit powstający w tkankach roślinnych zakażonych przez bakterię Agrobacterium tumefaciens. Większość opin to połączenia aminokwasu (zwykle argininy) i ketokwasu np. kwasu α-ketoglutarowego lub pirogronowego. Nieliczna grupa opin bezazotowych reprezentowana jest przez agrocynopiny (opiny fosforylowane), które są połączeniami kilku cząsteczek cukrów prostych. Opiny są tworzone przez roślinne komórki w wyniku ekspresji genów otrzymanych od Agrobacterium. Rodzaj tworzonej opiny jest podstawą do klasyfikowania szczepów Agrobacterium. Zwykle dany szczep wymusza produkcję jednego rodzaju opiny, niektóre szczepy narzucają roślinom produkcję kilku opin. Opiny są nieprzyswajalne dla roślin i większości innych organizmów, natomiast są metabolizowane i wykorzystywane jako pokarm przez Agrobacterium. Przykłady opin: * nopalina (1,3-dikarboksypropylo-L-arginina), * oktopina (N-α-(D-1-karboksyetylo)-L-arginina), * leucynopina (dikarboksypropyloleucyna) * agrocynopiny A, B, C, D, * agropina, * sukcynamopina, * chryzopina, * mannopina (pl) Опіни — це унікальні продукти конденсації аміно- та кетокислот або амінокислот та цукрів. Наприклад, при конденсації аргініну та піровиноградної кислоти утворюється октопін, аргініну та α — кетоглутаральдегіду — нопалін, а біциклічного похідного глутамінової кислоти та цукру — агропін. Опіни синтезуються в корончастому галі, а далі секретуються. Вони можуть використовуватися як джерело вуглецю (а іноді і як джерело азоту) будь-якою Agrobacterium tumefaciens або Agrobacterium rhizogenes, яка має Ті-плазміду (англ. tumor-inducing plasmid) з геном, або генами (локалізовані поза T-ДНК (англ. transferred DNA)) катаболізму даного опіну. Більшість інших досліджуваних мікроорганізмів не здатні використовувати опіни як джерело вуглецю. Отже, в процесі еволюції виник унікальний набір механізмів, під впливом яких кожний штам Agrobacterium tumefaciens генетично трансформує рослинні клітини в «біологічні фабрики» по виробництву сполук вуглецю, використовувати які можуть самі ці бактерії. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Synthesis_opines.svg?width=300 |
| dbo:wikiPageID | 7196431 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 10263 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1033348785 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Callus dbr:Carbon dbr:Nitrogen dbr:Rhizobium dbr:DNA dbr:Saccharopine dbr:Genome dbr:Chrysanthemum dbr:Clitocybe_acromelalga dbr:Fungus dbr:Mollusk dbr:Lactone dbr:Arabinose dbr:Lysine dbr:Stylopine dbr:Sucrose dbr:Sugar dbr:Hairy_root_culture dbr:Keto_acid dbr:Gastropod dbr:Agrobacterium dbr:Tobacco dbr:Grapevine dbr:Amine dbr:Amino_acid dbr:Fig_tree dbr:Nopaline dbr:Oxford_English_Dictionary dbc:Amino_acid_derivatives dbr:Arginine dbr:Atropine dbr:Mannose dbr:Octopine dbr:Octopus dbr:Opuntia dbr:Imine dbr:Ti_plasmid dbr:Europine dbr:File:Mannopine.svg dbr:File:Nopaline.svg dbr:File:Octopine_structure.svg dbr:File:Synthesis_opines.svg dbr:Lycopine dbr:Ri_plasmid dbr:Crown_Gall dbr:Alpha-ketoglutarate dbr:Lactamization dbr:Pyruvate |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist dbt:Wiktionary |
| dcterms:subject | dbc:Amino_acid_derivatives |
| gold:hypernym | dbr:Compounds |
| rdf:type | yago:WikicatAminoAcidDerivatives yago:WikicatAminoAcids yago:Abstraction100002137 yago:Acid114607521 yago:AminoAcid114601829 yago:Calculation105802185 yago:Chemical114806838 yago:Cognition100023271 yago:Compound114818238 yago:DerivedFunction106014730 yago:HigherCognitiveProcess105770664 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:ProblemSolving105796750 yago:Process105701363 yago:PsychologicalFeature100023100 yago:Relation100031921 dbo:ChemicalCompound yago:Substance100019613 yago:Thinking105770926 yago:WikicatDicarboxylicAcids |
| rdfs:comment | Opine (N-Carboxyethyl-Aminosäuren) sind stickstoffhaltige organische Verbindungen aus der Gruppe der Dicarbonsäuren, die durch eine Kondensationsreaktion (Wasserabspaltung) von α-Ketosäuren und Aminosäuren entstehen. (de) Opines are low molecular weight compounds found in plant crown gall tumors or hairy root tumors produced by pathogenic bacteria of the genus Agrobacterium and Rhizobium. Opine biosynthesis is catalyzed by specific enzymes encoded by genes contained in a small segment of DNA (known as the T-DNA, for 'transfer DNA'), which is part of the Ti plasmid (in Agrobacterium) or (in Rhizobium), inserted by the bacterium into the plant genome. The opines are used by the bacterium as an important energy, carbon and nitrogen source. Each strain of Agrobacterium and Rhizobium induces and catabolizes a specific set of opines, this set typifying the Ti plasmid and . There are some 30 different opines described so far. (en) オパインまたはオピン（Opine）は、アグロバクテリウム属やリゾビウム属の寄生細菌により作られ、植物のや毛状根腫瘍で見られる低分子量化合物である。オパインの生合成は、細菌から植物のゲノムに挿入されたTiプラスミド（アグロバクテリウム属の場合）またはRiプラスミド（リゾビウム属の場合）の一部であると呼ばれる小さなDNAの断片を含む遺伝子にコードされる特異的な酵素によって触媒される。オパインは細菌により、重要な炭素源、窒素源及びエネルギー源として用いられる。アグロバクテリウム属とリゾビウム属の各株は、特定種のオパインを誘導し、異化することができる。この種類はTiプラスミドまたはRiプラスミドによって規定される。これまで、少なくとも30種類のオパインが報告されている。 (ja) Le opine sono amminoacidi inusuali e sono utilizzati dai batteri come nutrienti. La cellula vegetale non è in grado di utilizzarle. Sono prodotte ad esempio da Agrobacterium tumefaciens quando entra in simbiosi con delle dicotiledoni. I geni per la loro codifica sono contenuti nel T-DNA, parte di plasmide Ti, che è integrato appunto da questo genere microbico all'interno della pianta ospite. (it) Les opines sont des composés spécifiques d'une tumeur végétale, la galle du collet ou crown gall, ou le broussin de vigne, induite par des bactéries pathogènes du genre Agrobacterium. Les racines induites sous l'action d'Agrobacterium rhizogenes produisent aussi des opines. Dans la galle du collet, tout se passe donc comme si la bactérie se créait une niche écologique où la présence d'opines favorisait sa croissance et la dissémination du pouvoir pathogène. Ce phénomène est connu sous le nom de concept d'opine. * Portail de la chimie * Portail de la biochimie (fr) Opina – metabolit powstający w tkankach roślinnych zakażonych przez bakterię Agrobacterium tumefaciens. Większość opin to połączenia aminokwasu (zwykle argininy) i ketokwasu np. kwasu α-ketoglutarowego lub pirogronowego. Nieliczna grupa opin bezazotowych reprezentowana jest przez agrocynopiny (opiny fosforylowane), które są połączeniami kilku cząsteczek cukrów prostych. Opiny są tworzone przez roślinne komórki w wyniku ekspresji genów otrzymanych od Agrobacterium. Rodzaj tworzonej opiny jest podstawą do klasyfikowania szczepów Agrobacterium. Zwykle dany szczep wymusza produkcję jednego rodzaju opiny, niektóre szczepy narzucają roślinom produkcję kilku opin. Opiny są nieprzyswajalne dla roślin i większości innych organizmów, natomiast są metabolizowane i wykorzystywane jako pokarm przez Agr (pl) Опіни — це унікальні продукти конденсації аміно- та кетокислот або амінокислот та цукрів. Наприклад, при конденсації аргініну та піровиноградної кислоти утворюється октопін, аргініну та α — кетоглутаральдегіду — нопалін, а біциклічного похідного глутамінової кислоти та цукру — агропін. Опіни синтезуються в корончастому галі, а далі секретуються. Вони можуть використовуватися як джерело вуглецю (а іноді і як джерело азоту) будь-якою Agrobacterium tumefaciens або Agrobacterium rhizogenes, яка має Ті-плазміду (англ. tumor-inducing plasmid) з геном, або генами (локалізовані поза T-ДНК (англ. transferred DNA)) катаболізму даного опіну. Більшість інших досліджуваних мікроорганізмів не здатні використовувати опіни як джерело вуглецю. Отже, в процесі еволюції виник унікальний набір механізмів, під (uk) |
| rdfs:label | Opine (de) Opine (fr) Opine (it) オパイン (ja) Opine (en) Opina (pl) Опіни (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Opine yago-res:Opine wikidata:Opine dbpedia-de:Opine dbpedia-fr:Opine dbpedia-gl:Opine dbpedia-it:Opine dbpedia-ja:Opine dbpedia-pl:Opine dbpedia-tr:Opine dbpedia-uk:Opine https://global.dbpedia.org/id/3oMWU |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Opine?oldid=1033348785&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Mannopine.svg wiki-commons:Special:FilePath/Nopaline.svg wiki-commons:Special:FilePath/Octopine_structure.svg wiki-commons:Special:FilePath/Synthesis_opines.svg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Opine |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Opines |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Allorhizobium_vitis dbr:Nopaline dbr:Ti_plasmid dbr:Opines |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Opine |
