Pentatricopeptide repeat (original) (raw)
Les protéines PPR (pour pentatricopeptide repeat) sont des protéines possédant plusieurs motifs dégénérés d’environ 35 acides aminés, appelés motifs PPR. Cette famille de protéines est très présente chez les Eucaryotes, particulièrement chez les Embryophytes. Les protéines PPR se distinguent par la présence de plusieurs motifs PPR (de 2 à 30) répétés en tandem. Les protéines PPR sont capables de lier des ARN de façon séquence spécifique.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Les protéines PPR (pour pentatricopeptide repeat) sont des protéines possédant plusieurs motifs dégénérés d’environ 35 acides aminés, appelés motifs PPR. Cette famille de protéines est très présente chez les Eucaryotes, particulièrement chez les Embryophytes. Les protéines PPR se distinguent par la présence de plusieurs motifs PPR (de 2 à 30) répétés en tandem. Les protéines PPR sont capables de lier des ARN de façon séquence spécifique. (fr) The pentatricopeptide repeat (PPR) is a 35-amino acid sequence motif. Pentatricopeptide-repeat-containing proteins are a family of proteins commonly found in the plant kingdom. They are distinguished by the presence of tandem degenerate PPR motifs and by the relative lack of introns in the genes coding for them. Approximately 450 such proteins have been identified in the Arabidopsis genome, and another 477 in the rice genome. Despite the large size of the protein family, genetic data suggest that there is little or no redundancy of function between the PPR proteins in Arabidopsis. The purpose of PPR proteins is currently under dispute. It has been shown that a good deal of those in Arabidopsis interact (often essentially) with mitochondria and other organelles and that they are possibly involved in RNA editing. However many trans proteins are required for this editing to occur and research continues to look at which proteins are needed. The structure of the PPR has been resolved. It folds into a helix-turn-helix structure similar to those found in the tetratricopeptide repeat. Several repeats of the protein forms a ring around a molecule in a sequence-sensitive way reminiscent of TAL effectors. (en) PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах. Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів. (uk) |
| dbo:symbol | PPR |
| dbo:wikiPageID | 14666804 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 4462 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1003701674 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Proteins dbr:Mitochondria dbr:Arabidopsis_thaliana dbr:TAL_effector dbr:DENND4A dbr:Tetratricopeptide dbr:Amino_acid dbc:Amino_acid_motifs dbr:Rice dbr:Helix-turn-helix dbr:Introns dbr:LRPPRC dbr:Plant dbr:Organelles dbr:Sequence_motif dbr:RNA_editing dbr:PTCD1 dbr:MRPS27 dbr:DENND4B dbr:DENND4C dbr:PTCD2 dbr:PTCD3 dbr:Single-strand_RNA |
| dbp:interpro | IPR002885 (en) |
| dbp:name | Pentatricopeptide repeat (en) |
| dbp:pfam | PF01535 (en) |
| dbp:pfamClan | CL0020 (en) |
| dbp:prosite | PS51375 (en) |
| dbp:symbol | PPR (en) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Reflist dbt:Molecular-biology-stub dbt:Pfam_box |
| dcterms:subject | dbc:Amino_acid_motifs |
| gold:hypernym | dbr:Motif |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Biomolecule wikidata:Q206229 wikidata:Q8054 yago:WikicatAminoAcidMotifs yago:Artifact100021939 yago:Decoration103169390 yago:Design103178782 yago:Motif103789014 yago:Object100002684 yago:PhysicalEntity100001930 dbo:Protein yago:Whole100003553 |
| rdfs:comment | Les protéines PPR (pour pentatricopeptide repeat) sont des protéines possédant plusieurs motifs dégénérés d’environ 35 acides aminés, appelés motifs PPR. Cette famille de protéines est très présente chez les Eucaryotes, particulièrement chez les Embryophytes. Les protéines PPR se distinguent par la présence de plusieurs motifs PPR (de 2 à 30) répétés en tandem. Les protéines PPR sont capables de lier des ARN de façon séquence spécifique. (fr) PPR-білки (англ. Pentatricopeptide repeat), білки з пентатрикопептидним повтором — родина білків, які мають у своїй структурі мотив з 35 амінокислотних залишків. Гени цієї родини наявні у всіх гілках евкаріотів, але найбільш поширені в рослин, де виконують різноманітні функції, включно з редагуванням РНК у мітохондріях та хлоропластах. Також виявляються в окремих прокаріотів, але, скоріш за все, набуті шляхом горизонтального перенесення генів. (uk) The pentatricopeptide repeat (PPR) is a 35-amino acid sequence motif. Pentatricopeptide-repeat-containing proteins are a family of proteins commonly found in the plant kingdom. They are distinguished by the presence of tandem degenerate PPR motifs and by the relative lack of introns in the genes coding for them. Approximately 450 such proteins have been identified in the Arabidopsis genome, and another 477 in the rice genome. Despite the large size of the protein family, genetic data suggest that there is little or no redundancy of function between the PPR proteins in Arabidopsis. (en) |
| rdfs:label | Protéine à motifs PPR (fr) Pentatricopeptide repeat (en) PPR-білки (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Pentatricopeptide repeat yago-res:Pentatricopeptide repeat wikidata:Pentatricopeptide repeat dbpedia-fr:Pentatricopeptide repeat dbpedia-uk:Pentatricopeptide repeat https://global.dbpedia.org/id/2LKQF |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Pentatricopeptide_repeat?oldid=1003701674&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Pentatricopeptide_repeat |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:PPR_protein dbr:Pentatricopeptide_Repeat_Protein |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:PPR dbr:Maureen_Hanson dbr:Transplastomic_plant dbr:PPR_protein dbr:Pentatricopeptide_Repeat_Protein |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Pentatricopeptide_repeat |