| dbo:abstract |
Simple Modular Architecture Research Tool, ou SMART, est une base de données bio-informatique utilisée pour l'identification et l'analyse de domaines protéiques au sein de séquences peptidiques. SMART utilise des modèles de Markov cachés construits à partir d' (en) afin de détecter des domaines protéiques sur ces séquences. La version de SMART publiée en 2012 contenait 1 009 modèles de domaines. Les données de SMART ont été utilisées pour constituer la Conserved Domain Database et sont également distribuées au sein de la base de données InterPro. SMART est hébergée par le Laboratoire européen de biologie moléculaire situé à Heidelberg, en Bade-Wurtemberg. (fr) Simple Modular Architecture Research Tool (SMART) is a biological database that is used in the identification and analysis of protein domains within protein sequences. SMART uses profile-hidden Markov models built from multiple sequence alignments to detect protein domains in protein sequences. The most recent release of SMART contains 1,204 domain models. Data from SMART was used in creating the Conserved Domain Database collection and is also distributed as part of the InterPro database. The database is hosted by the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg. (en) SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) — база данных, используемая при идентификации и анализе белковых доменов в белковых последовательностях . SMART использует для обнаружения доменов в белковых последовательностях алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов . Данные SMART использовались при создании Базы Консервативных Доменов (CDD, Conserved Domain Database) и также представляются как часть базы данных . База данных организована Европейской молекулярно-биологической лабораторией в Гейдельберге. (ru) |
| dbo:title |
SMART (en) |
| dbo:wikiPageExternalLink |
http://smart.embl-heidelberg.de/ http://smart.embl-heidelberg.de |
| dbo:wikiPageID |
31099283 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength |
2982 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID |
1045144469 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink |
dbr:Conserved_Domain_Database dbr:Protein_domains dbr:Identification_scheme dbc:Biological_databases dbc:Protein_structure dbr:European_Molecular_Biology_Laboratory dbr:Protein_domain dbc:Protein_classification dbr:Biological_database dbr:Hidden_Markov_model dbr:InterPro dbr:Multiple_sequence_alignment |
| dbp:center |
dbr:European_Molecular_Biology_Laboratory |
| dbp:curation |
Yes (en) |
| dbp:description |
Identification scheme for protein domains. (en) |
| dbp:license |
Free to academics, but not commercial users (en) |
| dbp:organism |
all (en) |
| dbp:pmid |
18978020 (xsd:integer) |
| dbp:scope |
Protein domains (en) |
| dbp:title |
SMART (en) |
| dbp:url |
http://smart.embl-heidelberg.de |
| dbp:version |
7 (xsd:integer) |
| dbp:wikiPageUsesTemplate |
dbt:Infobox_biodatabase dbt:Primary_sources dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Database-stub dbt:Bioinformatics-stub |
| dc:description |
Identification schemeforprotein domains. |
| dct:subject |
dbc:Biological_databases dbc:Protein_structure dbc:Protein_classification |
| gold:hypernym |
dbr:Database |
| rdf:type |
owl:Thing schema:CreativeWork dbo:Work wikidata:Q386724 dbo:Database dul:InformationObject dbo:BiologicalDatabase yago:Abstraction100002137 yago:AngularShape113864763 yago:Attribute100024264 yago:Fold113907415 yago:Shape100027807 yago:WikicatProteinFolds |
| rdfs:comment |
Simple Modular Architecture Research Tool (SMART) is a biological database that is used in the identification and analysis of protein domains within protein sequences. SMART uses profile-hidden Markov models built from multiple sequence alignments to detect protein domains in protein sequences. The most recent release of SMART contains 1,204 domain models. Data from SMART was used in creating the Conserved Domain Database collection and is also distributed as part of the InterPro database. The database is hosted by the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg. (en) Simple Modular Architecture Research Tool, ou SMART, est une base de données bio-informatique utilisée pour l'identification et l'analyse de domaines protéiques au sein de séquences peptidiques. SMART utilise des modèles de Markov cachés construits à partir d' (en) afin de détecter des domaines protéiques sur ces séquences. La version de SMART publiée en 2012 contenait 1 009 modèles de domaines. Les données de SMART ont été utilisées pour constituer la Conserved Domain Database et sont également distribuées au sein de la base de données InterPro. (fr) SMART (Simple Modular Architecture Research Tool) — база данных, используемая при идентификации и анализе белковых доменов в белковых последовательностях . SMART использует для обнаружения доменов в белковых последовательностях алгоритм, основанный на применении скрытых марковских моделей ко множественным выравниваниям. По данным на январь 2012 года SMART содержала модели 1009 доменов . Данные SMART использовались при создании Базы Консервативных Доменов (CDD, Conserved Domain Database) и также представляются как часть базы данных . (ru) |
| rdfs:label |
Simple Modular Architecture Research Tool (fr) Simple Modular Architecture Research Tool (en) SMART (база данных) (ru) |
| owl:sameAs |
freebase:Simple Modular Architecture Research Tool wikidata:Simple Modular Architecture Research Tool dbpedia-fr:Simple Modular Architecture Research Tool dbpedia-gl:Simple Modular Architecture Research Tool dbpedia-ru:Simple Modular Architecture Research Tool dbpedia-sh:Simple Modular Architecture Research Tool dbpedia-sr:Simple Modular Architecture Research Tool https://global.dbpedia.org/id/JT9K yago-res:Simple Modular Architecture Research Tool |
| prov:wasDerivedFrom |
wikipedia-en:Simple_Modular_Architecture_Research_Tool?oldid=1045144469&ns=0 |
| foaf:homepage |
http://smart.embl-heidelberg.de |
| foaf:isPrimaryTopicOf |
wikipedia-en:Simple_Modular_Architecture_Research_Tool |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of |
dbr:Smart |
| is dbo:wikiPageRedirects of |
dbr:SMART_(database) |
| is dbo:wikiPageWikiLink of |
dbr:Short_linear_motif dbr:Bioinformatic_Harvester dbr:Death_Domain_database dbr:MicrobesOnline dbr:Biomolecular_Object_Network_Databank dbr:Ferlins dbr:InterPro dbr:Smart dbr:Stichodactyla_toxin dbr:Eukaryotic_Linear_Motif_resource dbr:Transforming_growth_factor_beta dbr:Multiple_Epidermal_Growth_Factor-like_Domains_8 dbr:SMART_(database) |
| is foaf:primaryTopic of |
wikipedia-en:Simple_Modular_Architecture_Research_Tool |