Protein domain (original) (raw)
Eine Proteindomäne ist ein Bereich eines Proteins mit stabiler, meist kompakter Faltungsstruktur, der funktional und strukturell (quasi-)unabhängig von benachbarten Abschnitten ist.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | نطاق بروتين أو مجالات بروتين (بالإنجليزية: protein domain) هو جزء مكتمل من سلسلة بروتين معين ذات تركيب مجسم (في ثلاثة أبعاد) قد تنشأ، وتكون لها وظيفة حيوية، ويمكنها البقاء منفصلة عن بقية سلسلة البروتين. يكوّن كل نطاق domain من نظام متماسك في ثلاثة أبعاد ويمكنه البقاء مستقرا وقد يتطابق على نفسه. الكثير من البروتينات تكون مكوّنة من نطاقات بنائية. وقد يظهر نطاق معين domain في العديد من البروتينات المختلفة. وتستخدم الجزيئات الكبيرة النطاقات كوحدات بنائية؛ وترتبط ببعضها البعض بأنظمة مختلفة مكونة بروتينات ذات وظائف مختلفة. تختلف المجالات (النطاقات) في طولها بين 25 حمض أميني إلى 500 حمض أميني. ومن أقصر النطقات نجد «أصابع الزنك» zinc fingers وفيه تعمل ذرة معدنية أو «قنطرة سلفيد ثنائية» على استقراره. تشكل النطاقات وحدات وظيفية، مثل النطاق EF hand domain الخاص ب . ونظرا لكون النطاقات تكون مستقرة وغير معتمدة على بعضها البعض، فيمكن استبدال نطاق بنطاق آخر بواسطة التقنية الجينية؛ أي استبدال نطاق بنطاق آخر لإنتاج بروتين اندماجي. (ar) Un domini proteic és una agrupació globular de cadenes polipeptídiques que forma una regió molt conservada d’una proteïna, i que té una estructura terciària que pot existir, funcionar i evolucionar independentment de la resta de la cadena peptídica. Cada domini forma una estructura tridimensional compactada i sovint es troba plegada i estable de forma independent, conferint-li a les proteïnes una aparença bi- o multilobular. De fet, la proteòlisi limitada d'una proteïna amb diversos dominis allibera sovint els seus dominis sense alterar gaire la seva estructura global. No obstant això, l'estructura d'una proteïna amb dominis no sempre és evident, ja que aquests poden establir contactes tan extensos entre si que la proteïna apareix com una entitat globular simple. La majoria dels dominis estan constituïts per entre 50 i 250 aminoàcids, cada un dels quals té un diàmetre aproximat de 25 Å. L’evolució molecular ha utilitzat els dominis com a blocs de construcció, que es poden combinar amb diferents disposicions per crear proteïnes amb una gran varietat funcional. Un mateix domini pot aparèixer en diferents proteïnes. Els dominis més curts, com els dits de zinc (zinc fingers), es poden estabilitzar mitjançant ions metàl·lics o ponts disulfúrics. Els dominis sovint formen unitats funcionals, com el domini EF d’unió al calci de la calmodulina (calcium-binding EF hand domain of calmodulin). Com que són dominis estables de forma independent, poden ser intercanviats mitjançant enginyeria genètica per produir altres proteïnes de fusió o quimèriques. (ca) Doména je část proteinu, definovaná na základě stability a soudržnosti, přítomnosti hydrofobního jádra a schopnosti zaujmout konkrétní tvar nezávisle na zbytku proteinu. Jedná se o základní stavební složku proteinů – ty jsou často vystavěny právě z řady strukturních domén spojených méně uspořádanými ohebnými oblastmi. Doménám je často možno přiřadit konkrétní funkci či schopnost, ale jedna doména může v různých proteinech fungovat v poměrně rozmanitém kontextu. Vznikly rozsáhlé databáze proteinových domén, standardem jsou (Structural Classification of Proteins) a (Class, Architecture, Topology, Homology). Existují i aplikace umožňující předpovědět přítomnost konkrétních domén na základě aminokyselinové sekvence proteinu. (cs) Eine Proteindomäne ist ein Bereich eines Proteins mit stabiler, meist kompakter Faltungsstruktur, der funktional und strukturell (quasi-)unabhängig von benachbarten Abschnitten ist. (de) Un dominio proteico es la zona de la proteína donde se encuentra mayor densidad, es decir, donde hay más plegamientos. Una cadena polipeptídica puede tener uno o más dominios. Si una proteína está formada por más de una cadena polipeptídica, los dominios de cada cadena de polipéptidos son sus dominios. Inclusive una proteína formada por más de una cadena polipeptídica puede tener un solo dominio, compartido por las cadenas de polipéptidos. Un dominio de proteína se autoestabiliza y se pliega independientemente del resto. Cada dominio forma una estructura tridimensional plegada compacta . Muchas proteínas constan de varios dominios. Un dominio puede aparecer en una variedad de proteínas diferentes. La evolución molecular usa dominios como bloques de construcción y estos pueden recombinarse en diferentes arreglos para crear proteínas con diferentes funciones. En general, los dominios varían en longitud desde aproximadamente 50 aminoácidos hasta 250 aminoácidos. (es) In molecular biology, a protein domain is a region of a protein's polypeptide chain that is self-stabilizing and that folds independently from the rest. Each domain forms a compact folded three-dimensional structure. Many proteins consist of several domains, and a domain may appear in a variety of different proteins. Molecular evolution uses domains as building blocks and these may be recombined in different arrangements to create proteins with different functions. In general, domains vary in length from between about 50 amino acids up to 250 amino acids in length. The shortest domains, such as zinc fingers, are stabilized by metal ions or disulfide bridges. Domains often form functional units, such as the calcium-binding EF hand domain of calmodulin. Because they are independently stable, domains can be "swapped" by genetic engineering between one protein and another to make chimeric proteins. (en) Un domaine protéique est une partie d'une protéine capable d'adopter une structure de manière autonome ou partiellement autonome du reste de la molécule. C'est un élément modulaire de la structure des protéines qui peuvent ainsi être composées de l'assemblage de plusieurs de ces domaines. On parle alors de protéine multidomaines. Les domaines protéiques forment en général une structure compacte et stable, et peuvent parfois être produits de manière indépendante (par génie génétique, coupure protéolytique...). Ils peuvent être porteurs de certaines fonctions spécifiques de la protéine complète : liaison de ligands, interaction avec d'autres macromolécules, site catalytique... Un domaine protéique donné est en général caractérisé par sa structure tridimensionnelle et par un certain nombre d'acides aminés conservés dans sa structure primaire. Un même domaine protéique peut être présent dans différentes protéines (voir figure) de fonctions variées. Cette organisation modulaire des protéines en domaines est un des leviers de l'évolution moléculaire qui permet de les utiliser de manière combinée comme briques de base pour construire une grande variété de protéines. La définition d'un domaine protéique s'articule ainsi autour de trois concepts : unité de base de structure, unité de base de fonction, unité de base de repliement. La taille typique d'un domaine protéique varie entre 30 et 500 acides aminés, avec une moyenne autour d'une centaine d'acides aminés. (fr) 단백질 도메인(영어: protein domain)은 주어진 단백질 서열 및 보존된 부분으로 단백질 사슬의 나머지 부분과 독립적으로 진화하고 기능하며 존재할 수 있는 3차 구조이다. 각 도메인은 3차원 구조를 형성하며 종종 독립적으로 안정되고 접힐 수 있다. 많은 단백질이 여러 구조 도메인으로 구성된다. 하나의 도메인은 다양한 다른 단백질로 나타날 수 있다. 분자 진화는 도메인을 빌딩 블록으로 사용하며, 상이한 기능을 갖는 단백질을 생성하기 위해 상이한 배열로 재조합 될 수 있다. 일반적으로, 도메인의 길이는 약 50~250개의 아미노산 길이로 다양하다. 아연 집게와 같은 가장 짧은 도메인은 금속 이온 또는 이황화 브릿지에 의해 안정화된다. 도메인은 종종 칼모듈린의 칼슘-결합 EF 손 도메인과 같은 기능적 단위를 형성한다. 이들이 독립적으로 안정하기 때문에, 도메인은 하나의 단백질과 다른 단백질 사이의 유전 공학에 의해 (domain SWAP)되어 (Chimera protein)을 생성 할 수 있다. (ko) Si definisce dominio strutturale (o dominio o modulo) di una proteina un' o formata da catene polipeptidiche ripiegate in più regioni compatte le quali costituiscono divisioni della struttura terziaria.Sono zone distinguibili della proteina ma unite da segmenti flessibili di catene polipeptiche. I domini sono "strutture supersecondarie complesse" delle proteine, da non confondere con le strutture supersecondarie semplici. Spesso sono sufficientemente stabili da esistere nella stessa conformazione (o essere prodotti) isolatamente dalla proteina a cui appartengono. Si distinguono in: * Dominio tutto α (paralleli o antiparalleli): formati da alfa eliche. * Dominio tutto β: formati da foglietti beta. * Domini misti (o domini α+β): formati da entrambe le strutture secondarie. Spesso domini diversi hanno diverse funzioni. Per piccole proteine a volte il dominio corrisponde all'intera proteina. (it) Domena białka – fragment cząsteczki białka wyodrębniony ze względu na samoistną zdolność zachowania swojej struktury trójwymiarowej niezależnie od całej cząsteczki. Często domeny samoistnie zwijają się (ang. folding) z nowo wyprodukowanego łańcucha białka. Te same domeny często są obserwowane w różnych białkach. Mogą ulegać powieleniu (kilka takich samych domen w tym samym białku położonych jedna za drugą w łańcuchu białkowym). Stanowią podstawowe funkcjonalne cegiełki w cząsteczce białka (np. domena kalmoduliny wiążąca wapń). Do wykrywania domen używane są: * przyrównanie sekwencyjne (ang. sequence alignment), * przyrównanie strukturalne (ang. structural alignment). (pl) タンパク質ドメイン（Protein domains）は、タンパク質の配列、構造の一部で他の部分とは独立に進化し、機能を持った存在である。それぞれのドメインはコンパクトな三次元構造を作り、独立に折り畳まれ、安定化されることが多い。多くのタンパク質がいくつかのドメインより成り立ち、1つのドメインは進化的に関連した多くのタンパク質の中に現れる。ドメインの長さは様々で、25残基程度から500残基以上に及ぶものもある。ジンクフィンガーのような最も短いドメインは金属イオンやジスルフィド結合によって安定化される。カルモジュリンにおけるカルシウム結合性のEFハンドドメインのように、ドメインはしばしばタンパク質の機能ユニットとなっている。また、ドメインは自己安定化されるため、遺伝子工学によってタンパク質間での組み替えを行い、キメラを作ることができる。 (ja) Een eiwitdomein is een geconserveerd onderdeel van een eiwit met een specifieke ruimtelijke structuur dat zelfstandig kan functioneren en evolueren. Een eiwitdomein kan zichzelf stabiliseren en vouwt zich vaak onafhankelijk van de rest van de eiwitketen. De meeste eiwitten bestaan uit meerdere structurele domeinen. Gedurende de moleculaire evolutie worden eiwitdomeinen gerecombineerd en herordend tot nieuwe structuren zodat eiwitten ontstaan met nieuwe functies. Over het algemeen hebben eiwitdomeinen een lengte van tussen de 50 aminozuren tot 250 aminozuren. De kortste domeinen, zoals zinkvingers, worden gestabiliseerd door metaalionen of zwavelbruggen. Veel eiwitdomeinen zijn niet uniek voor het door een gen gecodeerde eiwit en komen voor in veel verschillende eiwitten. Zo kan een domein één functie van een multifunctioneel eiwit faciliteren, bijvoorbeeld een calciumbindend domein in calmoduline. Omdat ze zelfstandig stabiel zijn kunnen domeinen met genetische technologie overgebracht worden van het ene naar het andere eiwit. Domeinen worden vaak genoemd en onderscheiden in overeenstemming met de biologische functie van het eiwit waar ze in voorkomen. Men onderscheidt de onderstaande eiwitdomeinen: * α-helix * β-sheet-domeinen * DNA-bindingsdomeinen * eiwit-helix-domeinen * haarspeldbocht-domeinen * helix-draai-helix * hydrofobe domeinen * -domeinen * Rossman-vouw-domeinen * Zinkvinger-domeinen * bèta-vat-domeinen (nl) Доме́н белка́ — элемент третичной структуры белка, представляющий собой достаточно стабильную и независимую подструктуру белка, фолдинг которой проходит независимо от остальных частей. В состав домена обычно входит несколько элементов вторичной структуры. Сходные по структуре домены встречаются не только в родственных белках (например, в гемоглобинах разных животных), но и в совершенно разных белках. Достаточно часто доменам присваивают отдельные названия, так как их присутствие непосредственно влияет на выполняемые белком биологической функции — к примеру, Ca2+-связывающий домен кальмодулина, гомеодомен, отвечающий за связывание с ДНК в различных факторах транскрипции и др. Так как домены достаточно «автономны» в формировании своей структуры и выполнении своей функции, с помощью генной инженерии можно «пришить» к одному из белков домен, принадлежащий другому (создав таким образом белок-химеру). Такая химера при удаче будет совмещать функции обоих белков. Так, например, путём слияния ДНК-связывающего домена Cas9 c различными регуляторными доменами удалось получить искусственные факторы транскрипции (crisprTF), избирательно направляемые на нужные участки генома с помощью изготовленных на заказ «РНК-гидов». С помощью Cas9-домена можно также сконструировать искусственные эндонуклеазы рестрикции, репрессоры, ферменты, модифицирующие эпигеном, такие как ДНК-метилазы и деметилазы. (ru) En proteindomän är en del av ett protein som utgör en självständig funktionell enhet. Varje domän bildar en kompakt tredimensionell struktur och kan för det mesta veckas ihop till en stabil enhet, oberoende av det övriga proteinet. Proteiner är ofta uppbyggda av flera sammanlänkade domäner. Proteindomäner kan variera i längd från cirka 25 aminosyror till upp till cirka 500. De kortaste domänerna, som , stabiliseras av metalljoner eller svavelbryggor. (sv) Um domínio proteico é a região de uma proteína onde se encontre maior densidade, isto é, onde há mais dobras. Uma cadeia polipeptídica pode ter um ou mais domínios. Se uma proteína é formada por mais de uma cadeia polipeptídica, os domínios de cada cadeia de polipeptídeos são seus domínios. Inclusive uma proteína formada por mais de uma cadeia polipeptídica pode ter um só domínio, compartilhado pelas cadeias de polipeptídeos. Um domínio proteico pode ser funcional se é uma unidade modular da proteína que leva a cabo uma função bioquímica determinada, e estrutural se refere-se a um componente estável da estrutura. (pt) Білковий домен — елемент третинної структури білків (або «надвторинної», бо є проміжним станом між вторинною структурою та повною структурою білка), що є достатньо стабільною і незалежною підструктурою, тобто може самостійно функціонувати, еволюціонувати і чиє згортання часто проходить незалежно від решти частин білка. Багато доменів зустрічаються в дуже великій різноманітності еволюційно пов'язаних білків, що можуть належати до різних функціональних родин білків. Достатньо часто їм надають окремі назви, оскільки їхня присутність безпосередньо впливає на біологічні функції, що виконує білок. Домени мають довжину від приблизно 25-40 амінокислот до 500 амінокислот. Найкоротші домени, такі як «цинкові пальці» стабілізуються іонами металу або дисульфідними містками. Домени часто мають окрему функціональність, наприклад, Ca2+-зв'язуючий домен кальмодуліну або чотири домени глобіну, з яких складений гемоглобін. Оскільки домени бувають достатньо консервативні і стабільні, з допомогою генної інженерії можна «пришити» до одного з білків домен, що належав іншому (створивши таким чином химерний білок). До складу домену зазвичай входить кілька основних елементів вторинної структури. (uk) 蛋白质结构域（英語：protein domain）是蛋白质中的一类结构单元，是构成蛋白质（三级）结构的基本单元。 有些球形蛋白的一条肽链，或以共价键相连的两条或多条肽链在空间结构上可以区分为若干个球状的子结构，其中的每一个球状子结构就被称为一个结构域。 同一个蛋白的各个结构域之间是以肽链相互链接的，而链接两个蛋白质结构域的绝大多数都是单股肽链，只有在极个别的情况下会有少数的双股肽链联系不同的结构域。在X射线晶体学衍射实验绘制的电子密度图中，可以清楚地看到有些球状蛋白地的部存在一些裂隙，这些裂隙就是各个结构域之间的链接部分，蛋白质结构域之间的链接虽然是松散的，但他们仍然属于同一条肽链，靠肽链链接这一点和蛋白质的各个亚基之间依靠维系结构有着本质的区别。 蛋白质结构域在空间上具有：即在蛋白质一级结构上相互临近的氨基酸残基，在蛋白质结构域的三维空间结构上也相互临近，在蛋白质一级结构上相互远离的氨基酸残基，在蛋白质结构域的空间结构上也相互远离，甚至分别属于不同的蛋白质结构域。 蛋白质结构域与蛋白质完成生理功能有着密切的关系，有时几个结构域共同完成一项生理功能，有时一个结构域就可以独立完成一项生理功能，但是一个结构不完整的蛋白质结构域是不可能产生生理功能的。因此蛋白质结构域是蛋白质生理功能的结构基础，但必须指出的是，虽然蛋白质结构域与蛋白质的功能关系密切，但是蛋白质结构域和的概念并不相同。 (zh) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Pyruvate_kinase_protein_domains.png?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://supfam.org/SUPERFAMILY/dcGO http://supfam.org/SUPERFAMILY https://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd http://ekhidna.biocenter.helsinki.fi/dali_server/ https://archive.org/details/diffractionmetho0000unse/page/420 http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/ref/1995-jmb-scop.pdf http://www.cathdb.info/ http://www.compbio.dundee.ac.uk/3Dee/ http://SMART.embl-heidelberg.de http://prodom.prabi.fr http://ribfind.ismb.lon.ac.uk http://rigidfinder.molmovdb.org http://webarchive.loc.gov/all/20110506030957/http%3A/pfam.sanger.ac.uk/ http://www.ebi.ac.uk/interpro https://web.archive.org/web/20060911185355/http:/realm.sdsc.edu/pdomains/ https://web.archive.org/web/20120426170732/http:/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/ref/1995-jmb-scop.pdf https://web.archive.org/web/20171204052439/http:/pisqrd.escience-lab.org/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21095/%23A110 http://www.expasy.org/prosite/ http://pfam.xfam.org/clan/browse |
| dbo:wikiPageID | 10130725 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 72019 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1108408232 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Cadherin dbr:Calmodulin dbr:Protein_secondary_structure dbr:Protein_tyrosine_phosphatase dbr:Pyruvate_kinase dbr:Neutron_spin_echo dbr:Short_linear_motif dbr:Structural_motif dbr:Death_effector_domain dbr:Allosteric_regulation dbr:Beta_sheet dbr:Armadillo_repeats dbr:Peptide dbr:Pfam dbr:DNA-binding_domain dbr:DNA_polymerase dbr:CATH dbr:Domine_Database dbr:EF_hand dbr:EGF-like_domain dbr:Structural_alignment dbr:Protein_primary_structure dbr:Protein_dynamics dbr:Protein_structure_prediction dbr:Protein_tandem_repeats dbc:Protein_families dbr:Genome dbr:Protein_tertiary_structure dbr:Christian_B._Anfinsen dbr:Enzyme dbr:Genetic_engineering dbr:Cryogenic_electron_microscopy dbr:Structural_biology dbr:Protein_families dbr:Apoptosis dbr:Archaea dbr:Lysine dbr:Lysozyme dbr:Dendrogram dbr:Zinc_fingers dbr:Kringle_domain dbr:PANDIT_(database) dbr:PTEN_(gene) dbr:Papain dbr:Protein_Data_Bank dbr:Protein_structure dbr:Protein_superfamily dbr:Bacteria dbr:C2_domain dbr:CATH_database dbr:Titin dbr:Drosophila_melanogaster dbr:Families_of_structurally_similar_proteins dbr:Protein_quaternary_structure dbr:Alpha_helix dbr:Amino_acid dbc:Protein_structure dbr:Cysteine dbr:Database_of_Molecular_Motions dbr:Eukaryote dbr:Evolution dbr:Cell_adhesion dbr:Chymotrypsin dbr:Folding_funnel dbr:Kinesin dbr:Protein_dimer dbr:Protein_family dbr:Transcription_factor dbr:Protein_folding dbr:Protease dbr:Protein dbr:Residue_(chemistry) dbc:Protein_domains dbr:Helix-turn-helix dbr:BZIP_domain dbr:EF-hand dbr:Arginine dbc:Protein_superfamilies dbr:Kelch_protein dbr:Binding_domain dbr:TIM_barrel dbr:Hierarchical_clustering dbr:Homologous_recombination dbr:Shoshana_Wodak dbr:Zinc_finger dbr:Disulfide_bond dbr:Auxilin dbr:Phosphotyrosine-binding_domain dbr:Fibronectin_type_III_domain dbr:Insulin dbr:Caspase dbr:Sequence_motif dbr:Src_homology_2_domain-containing dbr:Structural_Classification_of_Proteins dbr:Immune_system dbr:Immunoglobulin_domain dbr:Immunoglobulin_superfamily dbr:Protein_subfamily dbr:Pleckstrin_homology_domain dbr:Tensin dbr:Molecular_biology dbr:Molecular_evolution dbr:Oncogene dbr:Tyrosine_kinase dbr:Serine_protease dbr:SH2_domain dbr:Structural_Classification_of_Proteins_database dbr:Supersecondary_structure dbr:SH3_domain dbr:Protein_structure_prediction_software dbr:Promotor_(biology) dbr:PtdIns(3)P dbr:PtdIns(3,4)P2 dbr:PtdIns(3,4,5)P3 dbr:PtdIns(4,5)P2 dbr:Phosphoinositide dbr:Phosphoribosylamine-glycine_ligase dbr:Eukarya dbr:Flexible_linker dbr:GAR_transformylase dbr:Levinthal_paradox dbr:Signaling_protein dbr:IRS-1 dbr:ABC_transporters dbr:AIR_synthetase dbr:Immunoglobulins dbr:Chimera_(protein) dbr:Troponin-C dbr:NPXpY dbr:Src_homology_2_domain dbr:Structural_domain dbr:Cα-Cα_distance dbr:Cα-Cα_distance_map dbr:File:Domain_Homology.png dbr:File:Pyruvate_kinase_protein_domains.png dbr:PtdIns(4)P |
| dbp:bot | InternetArchiveBot (en) |
| dbp:caption | Attractin-like protein 1 is a multi-domain protein found in animals, including humans. Each unit is one domain, e.g. the EGF or Kelch domains. (en) |
| dbp:date | 2006-09-11 (xsd:date) 2011-05-06 (xsd:date) May 2020 (en) |
| dbp:fixAttempted | yes (en) |
| dbp:height | 100 (xsd:integer) |
| dbp:title | Pfam (en) Definition and assignment of structural domains in proteins (en) |
| dbp:url | http://webarchive.loc.gov/all/20110506030957/http%3A/pfam.sanger.ac.uk/ https://web.archive.org/web/20060911185355/http:/realm.sdsc.edu/pdomains/ |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Anchor dbt:Cite_book dbt:Cite_journal dbt:Commons_category dbt:Dead_link dbt:Further dbt:Hatnote dbt:Main dbt:Panorama dbt:Portal dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Use_dmy_dates dbt:Webarchive dbt:PDB dbt:Protein_tertiary_structure dbt:Biomolecular_structure dbt:Protein_domains dbt:Protein_topics |
| dcterms:subject | dbc:Protein_families dbc:Protein_structure dbc:Protein_domains dbc:Protein_superfamilies |
| gold:hypernym | dbr:Part |
| rdf:type | yago:Abstraction100002137 yago:Attribute100024264 yago:Chemical114806838 yago:Compound114818238 yago:Environment113934596 yago:Macromolecule114944888 yago:Material114580897 yago:Matter100020827 yago:Molecule114682133 yago:OrganicCompound114727670 yago:Part113809207 yago:PhysicalEntity100001930 yago:Protein114728724 yago:Relation100031921 yago:Situation113927383 yago:Sphere114514039 yago:State100024720 yago:Substance100019613 yago:Thing100002452 yago:Unit109465459 yago:WikicatProteinDomains yago:WikicatProteins |
| rdfs:comment | Eine Proteindomäne ist ein Bereich eines Proteins mit stabiler, meist kompakter Faltungsstruktur, der funktional und strukturell (quasi-)unabhängig von benachbarten Abschnitten ist. (de) 단백질 도메인(영어: protein domain)은 주어진 단백질 서열 및 보존된 부분으로 단백질 사슬의 나머지 부분과 독립적으로 진화하고 기능하며 존재할 수 있는 3차 구조이다. 각 도메인은 3차원 구조를 형성하며 종종 독립적으로 안정되고 접힐 수 있다. 많은 단백질이 여러 구조 도메인으로 구성된다. 하나의 도메인은 다양한 다른 단백질로 나타날 수 있다. 분자 진화는 도메인을 빌딩 블록으로 사용하며, 상이한 기능을 갖는 단백질을 생성하기 위해 상이한 배열로 재조합 될 수 있다. 일반적으로, 도메인의 길이는 약 50~250개의 아미노산 길이로 다양하다. 아연 집게와 같은 가장 짧은 도메인은 금속 이온 또는 이황화 브릿지에 의해 안정화된다. 도메인은 종종 칼모듈린의 칼슘-결합 EF 손 도메인과 같은 기능적 단위를 형성한다. 이들이 독립적으로 안정하기 때문에, 도메인은 하나의 단백질과 다른 단백질 사이의 유전 공학에 의해 (domain SWAP)되어 (Chimera protein)을 생성 할 수 있다. (ko) タンパク質ドメイン（Protein domains）は、タンパク質の配列、構造の一部で他の部分とは独立に進化し、機能を持った存在である。それぞれのドメインはコンパクトな三次元構造を作り、独立に折り畳まれ、安定化されることが多い。多くのタンパク質がいくつかのドメインより成り立ち、1つのドメインは進化的に関連した多くのタンパク質の中に現れる。ドメインの長さは様々で、25残基程度から500残基以上に及ぶものもある。ジンクフィンガーのような最も短いドメインは金属イオンやジスルフィド結合によって安定化される。カルモジュリンにおけるカルシウム結合性のEFハンドドメインのように、ドメインはしばしばタンパク質の機能ユニットとなっている。また、ドメインは自己安定化されるため、遺伝子工学によってタンパク質間での組み替えを行い、キメラを作ることができる。 (ja) En proteindomän är en del av ett protein som utgör en självständig funktionell enhet. Varje domän bildar en kompakt tredimensionell struktur och kan för det mesta veckas ihop till en stabil enhet, oberoende av det övriga proteinet. Proteiner är ofta uppbyggda av flera sammanlänkade domäner. Proteindomäner kan variera i längd från cirka 25 aminosyror till upp till cirka 500. De kortaste domänerna, som , stabiliseras av metalljoner eller svavelbryggor. (sv) 蛋白质结构域（英語：protein domain）是蛋白质中的一类结构单元，是构成蛋白质（三级）结构的基本单元。 有些球形蛋白的一条肽链，或以共价键相连的两条或多条肽链在空间结构上可以区分为若干个球状的子结构，其中的每一个球状子结构就被称为一个结构域。 同一个蛋白的各个结构域之间是以肽链相互链接的，而链接两个蛋白质结构域的绝大多数都是单股肽链，只有在极个别的情况下会有少数的双股肽链联系不同的结构域。在X射线晶体学衍射实验绘制的电子密度图中，可以清楚地看到有些球状蛋白地的部存在一些裂隙，这些裂隙就是各个结构域之间的链接部分，蛋白质结构域之间的链接虽然是松散的，但他们仍然属于同一条肽链，靠肽链链接这一点和蛋白质的各个亚基之间依靠维系结构有着本质的区别。 蛋白质结构域在空间上具有：即在蛋白质一级结构上相互临近的氨基酸残基，在蛋白质结构域的三维空间结构上也相互临近，在蛋白质一级结构上相互远离的氨基酸残基，在蛋白质结构域的空间结构上也相互远离，甚至分别属于不同的蛋白质结构域。 蛋白质结构域与蛋白质完成生理功能有着密切的关系，有时几个结构域共同完成一项生理功能，有时一个结构域就可以独立完成一项生理功能，但是一个结构不完整的蛋白质结构域是不可能产生生理功能的。因此蛋白质结构域是蛋白质生理功能的结构基础，但必须指出的是，虽然蛋白质结构域与蛋白质的功能关系密切，但是蛋白质结构域和的概念并不相同。 (zh) نطاق بروتين أو مجالات بروتين (بالإنجليزية: protein domain) هو جزء مكتمل من سلسلة بروتين معين ذات تركيب مجسم (في ثلاثة أبعاد) قد تنشأ، وتكون لها وظيفة حيوية، ويمكنها البقاء منفصلة عن بقية سلسلة البروتين. يكوّن كل نطاق domain من نظام متماسك في ثلاثة أبعاد ويمكنه البقاء مستقرا وقد يتطابق على نفسه. الكثير من البروتينات تكون مكوّنة من نطاقات بنائية. وقد يظهر نطاق معين domain في العديد من البروتينات المختلفة. وتستخدم الجزيئات الكبيرة النطاقات كوحدات بنائية؛ وترتبط ببعضها البعض بأنظمة مختلفة مكونة بروتينات ذات وظائف مختلفة. (ar) Un domini proteic és una agrupació globular de cadenes polipeptídiques que forma una regió molt conservada d’una proteïna, i que té una estructura terciària que pot existir, funcionar i evolucionar independentment de la resta de la cadena peptídica. Cada domini forma una estructura tridimensional compactada i sovint es troba plegada i estable de forma independent, conferint-li a les proteïnes una aparença bi- o multilobular. De fet, la proteòlisi limitada d'una proteïna amb diversos dominis allibera sovint els seus dominis sense alterar gaire la seva estructura global. No obstant això, l'estructura d'una proteïna amb dominis no sempre és evident, ja que aquests poden establir contactes tan extensos entre si que la proteïna apareix com una entitat globular simple. (ca) Doména je část proteinu, definovaná na základě stability a soudržnosti, přítomnosti hydrofobního jádra a schopnosti zaujmout konkrétní tvar nezávisle na zbytku proteinu. Jedná se o základní stavební složku proteinů – ty jsou často vystavěny právě z řady strukturních domén spojených méně uspořádanými ohebnými oblastmi. Doménám je často možno přiřadit konkrétní funkci či schopnost, ale jedna doména může v různých proteinech fungovat v poměrně rozmanitém kontextu. (cs) Un domaine protéique est une partie d'une protéine capable d'adopter une structure de manière autonome ou partiellement autonome du reste de la molécule. C'est un élément modulaire de la structure des protéines qui peuvent ainsi être composées de l'assemblage de plusieurs de ces domaines. On parle alors de protéine multidomaines. La définition d'un domaine protéique s'articule ainsi autour de trois concepts : unité de base de structure, unité de base de fonction, unité de base de repliement. (fr) Un dominio proteico es la zona de la proteína donde se encuentra mayor densidad, es decir, donde hay más plegamientos. Una cadena polipeptídica puede tener uno o más dominios. Si una proteína está formada por más de una cadena polipeptídica, los dominios de cada cadena de polipéptidos son sus dominios. Inclusive una proteína formada por más de una cadena polipeptídica puede tener un solo dominio, compartido por las cadenas de polipéptidos. (es) In molecular biology, a protein domain is a region of a protein's polypeptide chain that is self-stabilizing and that folds independently from the rest. Each domain forms a compact folded three-dimensional structure. Many proteins consist of several domains, and a domain may appear in a variety of different proteins. Molecular evolution uses domains as building blocks and these may be recombined in different arrangements to create proteins with different functions. In general, domains vary in length from between about 50 amino acids up to 250 amino acids in length. The shortest domains, such as zinc fingers, are stabilized by metal ions or disulfide bridges. Domains often form functional units, such as the calcium-binding EF hand domain of calmodulin. Because they are independently stable, (en) Si definisce dominio strutturale (o dominio o modulo) di una proteina un' o formata da catene polipeptidiche ripiegate in più regioni compatte le quali costituiscono divisioni della struttura terziaria.Sono zone distinguibili della proteina ma unite da segmenti flessibili di catene polipeptiche. I domini sono "strutture supersecondarie complesse" delle proteine, da non confondere con le strutture supersecondarie semplici. Spesso sono sufficientemente stabili da esistere nella stessa conformazione (o essere prodotti) isolatamente dalla proteina a cui appartengono. Si distinguono in: (it) Domena białka – fragment cząsteczki białka wyodrębniony ze względu na samoistną zdolność zachowania swojej struktury trójwymiarowej niezależnie od całej cząsteczki. Często domeny samoistnie zwijają się (ang. folding) z nowo wyprodukowanego łańcucha białka. Te same domeny często są obserwowane w różnych białkach. Mogą ulegać powieleniu (kilka takich samych domen w tym samym białku położonych jedna za drugą w łańcuchu białkowym). Stanowią podstawowe funkcjonalne cegiełki w cząsteczce białka (np. domena kalmoduliny wiążąca wapń). Do wykrywania domen używane są: (pl) Een eiwitdomein is een geconserveerd onderdeel van een eiwit met een specifieke ruimtelijke structuur dat zelfstandig kan functioneren en evolueren. Een eiwitdomein kan zichzelf stabiliseren en vouwt zich vaak onafhankelijk van de rest van de eiwitketen. De meeste eiwitten bestaan uit meerdere structurele domeinen. Gedurende de moleculaire evolutie worden eiwitdomeinen gerecombineerd en herordend tot nieuwe structuren zodat eiwitten ontstaan met nieuwe functies. (nl) Доме́н белка́ — элемент третичной структуры белка, представляющий собой достаточно стабильную и независимую подструктуру белка, фолдинг которой проходит независимо от остальных частей. В состав домена обычно входит несколько элементов вторичной структуры. Сходные по структуре домены встречаются не только в родственных белках (например, в гемоглобинах разных животных), но и в совершенно разных белках. (ru) Um domínio proteico é a região de uma proteína onde se encontre maior densidade, isto é, onde há mais dobras. Uma cadeia polipeptídica pode ter um ou mais domínios. Se uma proteína é formada por mais de uma cadeia polipeptídica, os domínios de cada cadeia de polipeptídeos são seus domínios. Inclusive uma proteína formada por mais de uma cadeia polipeptídica pode ter um só domínio, compartilhado pelas cadeias de polipeptídeos. (pt) Білковий домен — елемент третинної структури білків (або «надвторинної», бо є проміжним станом між вторинною структурою та повною структурою білка), що є достатньо стабільною і незалежною підструктурою, тобто може самостійно функціонувати, еволюціонувати і чиє згортання часто проходить незалежно від решти частин білка. Багато доменів зустрічаються в дуже великій різноманітності еволюційно пов'язаних білків, що можуть належати до різних функціональних родин білків. Достатньо часто їм надають окремі назви, оскільки їхня присутність безпосередньо впливає на біологічні функції, що виконує білок. Домени мають довжину від приблизно 25-40 амінокислот до 500 амінокислот. Найкоротші домени, такі як «цинкові пальці» стабілізуються іонами металу або дисульфідними містками. Домени часто мають окрему ф (uk) |
| rdfs:label | نطاق بروتين (ar) Domini proteic (ca) Doména (protein) (cs) Proteindomäne (de) Dominio proteico (es) Domaine protéique (fr) Dominio (biochimica) (it) 단백질 도메인 (ko) タンパク質ドメイン (ja) Eiwitdomein (nl) Protein domain (en) Domena białka (pl) Domínio proteico (pt) Домен белка (ru) Proteindomän (sv) Білковий домен (uk) 蛋白质结构域 (zh) |
| owl:sameAs | freebase:Protein domain yago-res:Protein domain wikidata:Protein domain dbpedia-ar:Protein domain http://bs.dbpedia.org/resource/Proteinski_domen dbpedia-ca:Protein domain dbpedia-cs:Protein domain dbpedia-da:Protein domain dbpedia-de:Protein domain dbpedia-es:Protein domain dbpedia-et:Protein domain dbpedia-fa:Protein domain dbpedia-fr:Protein domain dbpedia-gl:Protein domain dbpedia-he:Protein domain dbpedia-hr:Protein domain dbpedia-hu:Protein domain dbpedia-it:Protein domain dbpedia-ja:Protein domain dbpedia-ko:Protein domain http://lt.dbpedia.org/resource/Domenas_(biochemija) dbpedia-mk:Protein domain dbpedia-nl:Protein domain dbpedia-pl:Protein domain dbpedia-pt:Protein domain dbpedia-ru:Protein domain dbpedia-sh:Protein domain dbpedia-sr:Protein domain dbpedia-sv:Protein domain dbpedia-uk:Protein domain dbpedia-vi:Protein domain dbpedia-zh:Protein domain https://global.dbpedia.org/id/53bja |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Protein_domain?oldid=1108408232&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Pyruvate_kinase_protein_domains.png wiki-commons:Special:FilePath/Domain_Homology.png wiki-commons:Special:FilePath/ATRNL1_Bitmap.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Protein_domain |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Domain |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Protein_domains dbr:Protein_module dbr:Domain-swapping dbr:Domain_swapping dbr:Conserved_domains dbr:Domain_(protein) dbr:Enzyme_domain dbr:Enzyme_domains dbr:Conserved_domain dbr:Multi-domain dbr:Multi-domain_protein dbr:Structural_domain |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Aminoacyl_tRNA_synthetase dbr:Aminoacylase dbr:Bcl-2-associated_death_promoter dbr:Bcl-2_family dbr:Bcl-x_interacting_domain dbr:Bcr-Abl_tyrosine-kinase_inhibitor dbr:BLUF dbr:Protein_C dbr:Protein_design dbr:Proto-oncogene_tyrosine-protein_kinase_Src dbr:Pseudo_amino_acid_composition dbr:Pseudofolliculitis_barbae dbr:Pyrin_domain dbr:Rosetta@home dbr:Rubicon_homology_domain dbr:Saxitoxin dbr:SbtB_protein dbr:Elastin dbr:Ena/Vasp_homology_proteins dbr:Encephalitozoon_cuniculi dbr:Endoribonuclease_XendoU dbr:Enterotoxin_type_B dbr:EnvZ/OmpR_two-component_system dbr:Eosinophil_peroxidase dbr:Epoxide_hydrolase_3 dbr:FAM49A dbr:Module dbr:Mutation dbr:NACHT_domain dbr:NLN_(gene) dbr:Neutron_spin_echo dbr:M1_protein dbr:MACPF dbr:MKI67IP dbr:MYND_zinc_finger dbr:HNRPDL dbr:HTRA1 dbr:HYAL1 dbr:Mercury(II)_reductase dbr:Metalloprotein dbr:Methyl-CpG-binding_domain dbr:OmpA_domain dbr:Parthanatos dbr:Small-conductance_mechanosensitive_channel dbr:Thimet_oligopeptidase dbr:PrimPol dbr:Proline-rich_protein_30 dbr:STX10 dbr:YopR_bacterial_protein_domain dbr:YqaJ_protein_domain dbr:Beta-lactamase_inhibitor_protein dbr:Biotin_attachment_domain dbr:Anion_exchanger_family dbr:Anthranilate_phosphoribosyltransferase dbr:Anti-MAG_peripheral_neuropathy dbr:Antibody_mimetic dbr:Apolipoprotein_H dbr:Arginine_decarboxylase dbr:Beta-galactosidase dbr:Beta-glucuronidase dbr:Beta-ketoacyl-ACP_synthase dbr:Beta-secretase_1 dbr:Beta2-adaptin_C-terminal_domain dbr:Pentraxins dbr:Phage_P22_tailspike_protein dbr:Rel_homology_domain dbr:Representative_sequences dbr:Response_regulator dbr:RhoGAP_domain dbr:Riboflavin_synthase dbr:Ribonucleotide_reductase dbr:Richard_M._Durbin dbr:Ricin dbr:Cyanase dbr:Cyclase-associated_protein_family dbr:Cyclic_nucleotide–gated_ion_channel dbr:Cyclodeaminase_domain dbr:Cytotoxic_necrotising_factor_family dbr:D-stereospecific_aminopeptidase dbr:DARPin dbr:DEP_domain dbr:DFFA dbr:DHR1_domain dbr:DHR2_domain dbr:DIMA_(database) dbr:DIRAS3_(gene) dbr:DNA-binding_domain dbr:DNA_beta-glucosyltransferase dbr:DNA_methyltransferase dbr:DNA_photolyase_N-terminal_domain dbr:Ubiquitin-like_protein dbr:UniProt dbr:Upshaw–Schulman_syndrome dbr:Uup_RNA_motif dbr:C11orf1 dbr:C3orf70 dbr:C6orf58 dbr:CD300LF dbr:Vancomycin dbr:Viomycin dbr:Vitamin_K_epoxide_reductase dbr:DcGO dbr:Death_fold dbr:Death_regulator_Nedd2-like_caspase dbr:Decapping_complex dbr:Desmocollin dbr:Desulfovibrio_magneticus dbr:Deubiquitinating_enzyme dbr:Domine_Database dbr:Doublecortin dbr:Duplodnaviria dbr:DyP-type_peroxidase_family dbr:Dynamin_superfamily dbr:Dysfibrinogenemia dbr:E2F dbr:EAL_domain dbr:EF-G dbr:EF-Tu dbr:EF1_guanine_nucleotide_exchange_domain dbr:EGF-like_domain dbr:EHD3 dbr:EIF-W2_protein_domain dbr:ELK1 dbr:EMI_domain dbr:ETV6 dbr:EamA dbr:Index_of_genetics_articles dbr:Indole-3-glycerol-phosphate_synthase dbr:Inhibitor_of_DNA-binding_protein dbr:Inhibitor_of_apoptosis dbr:Inner_nuclear_membrane_protein dbr:Integral_membrane_protein dbr:Interferon_gamma_receptor_(IFNGR1)_family dbr:Interleukin_15 dbr:Intimin dbr:Intrinsically_disordered_proteins dbr:L-fucose_isomerase dbr:L-type_lectin_domain dbr:LDL_receptor dbr:Structural_alignment dbr:Vesicular_transport_adaptor_protein dbr:Leucine-rich_repeat dbr:GLIPR1 dbr:GPD1L dbr:GSDMD dbr:Galectin-4 dbr:P53 dbr:RNase_D dbr:TACI-CRD2_protein_domain dbr:OR51E1 dbr:ORF1ab dbr:ORF7a dbr:Nuclease dbr:Nuclease_S1 dbr:Nucleobindin_1 dbr:Scavenger_receptor_cysteine-rich_protein_domain dbr:C12orf29 dbr:SWI/SNF dbr:Promyelocytic_leukemia_protein dbr:Proteases_in_angiogenesis dbr:Protein_disulfide-isomerase dbr:Protein_function_prediction dbr:Protein_kinase_C_zeta_type dbr:Protein_structure_prediction dbr:Protein_tandem_repeats dbr:Protein–protein_interaction dbr:SoxC_group dbr:UNC_(biology) dbr:PITRM1 dbr:Sucrose-phosphate_synthase dbr:Coronavirus dbr:Coronavirus_nucleocapsid_protein dbr:Coronavirus_spike_protein dbr:Membranome_database dbr:Runt_domain dbr:S1_domain dbr:SARS-related_coronavirus dbr:SERPIN_A12 dbr:Saccharide_transporter dbr:Safingol dbr:Escherichia_virus_CC31 dbr:Gaussian_network_model dbr:Nuclear_prelamin_A_recognition_factor dbr:Serine_hydroxymethyltransferase dbr:The_Proteolysis_Map dbr:Var1_protein_domain dbr:Vitronectin dbr:NLRX1 dbr:RNase_R dbr:Variant_surface_glycoprotein dbr:Teneurin dbr:Trappin_protein_transglutaminase_binding_domain dbr:YjeF_N_terminal_protein_domain dbr:Phospholipase_A2 dbr:Registry_of_Standard_Biological_Parts dbr:Ydc2_protein_domain dbr:Protein_tertiary_structure dbr:SpAB_protein_domain dbr:WNK1 dbr:Pulmonary_surfactant_protein_D dbr:RNase_PH dbr:RUN_domain dbr:Sda_protein_domain dbr:ZC3H11B dbr:Zinc_transporter_ZIP9 dbr:Edward_Trifonov dbr:Enzyme dbr:Freshwater-2_RNA_motif dbr:GHKL_domain dbr:Gideon_Davies dbr:Mupirocin dbr:NLPC-P60_RNA_motif dbr:Condensation_domain dbr:Conserved_Domain_Database dbr:Conserved_sequence dbr:Critical_Assessment_of_protein_Structure_Prediction dbr:Crp_domain dbr:Equilibrium_unfolding dbr:LRRIQ3 dbr:La_domain dbr:Lactoferrin dbr:Retinal_dehydrogenase dbr:WH1_domain dbr:XPG_I_protein_domain dbr:Orange_carotenoid_N-terminal_domain dbr:Orange_carotenoid_protein dbr:Stirrup_protein_domain dbr:Protein_domains dbr:Protein_module dbr:TMEM211 dbr:TMEM242 dbr:TMEM70 dbr:Androgen_insensitivity_syndrome dbr:Antibody dbr:Arabidopsis_thaliana dbr:Arabinogalactan_protein dbr:Luciferase dbr:Lysin dbr:MAM_domain dbr:MDR-NUDIX_RNA_motif dbr:Maltose-binding_protein dbr:Cache_domain dbr:Calbindin dbr:Calcium-binding_EGF_domain dbr:Calcium-binding_mitochondrial_carrier_protein_Aralar1 dbr:Calcium_buffering dbr:Calcium_pump dbr:Calmodulin-regulated_spectrin-associated_CKK_domain dbr:Calmodulin_binding_domain dbr:Calnexin dbr:Calponin_family_repeat dbr:Calx-beta_motif dbr:Chloroplast_DNA dbr:Cholecystokinin_A_receptor dbr:Cholesterol_oxidase dbr:Signal_recognition_particle_RNA dbr:Skipping-rope_RNA_motif dbr:Sterile_alpha_motif dbr:Sul1_RNA_motif dbr:Complement_component_1q dbr:Demethylase dbr:Zymogen dbr:Fatty_acid_metabolism_regulator_protein_FadR dbr:Frataxin-like_domain dbr:Fructose-bisphosphate_aldolase dbr:Haemadin dbr:Haemagglutination_activity_domain dbr:Haemolysin_expression_modulating_protein_family dbr:Haloacid_dehydrogenase_superfamily dbr:Haloarcula_marismortui dbr:Hemagglutinin_esterase dbr:Dock11 dbr:Dock3 dbr:Domain dbr:Kringle_domain dbr:PANDIT_(database) dbr:Papain-like_protease dbr:Perlecan dbr:Photoactivated_adenylyl_cyclase dbr:Protease_inhibitor_(biology) dbr:Protein_inhibitor_of_activated_STAT dbr:Protein_kinase_B dbr:Macro_domain dbr:Macrophage_migration_inhibitory_factor_domain dbr:Major_histocompatibility_complex,_class_II,_DQ_alpha_1 dbr:Protein_structure dbr:SWAP_protein_domain dbr:SpoT dbr:Superfamily_database dbr:TBC_domain dbr:TOC1_(gene) dbr:Tat_(HIV) dbr:Thermolysin dbr:Thyroid_hormone_receptor dbr:Tissue_factor dbr:Transferrin dbr:Tyrosine_hydroxylase dbr:Mechanosensation dbr:MicrobesOnline dbr:Microevolution |
| is rdfs:seeAlso of | dbr:Protein_family |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Protein_domain |
