| dbo:abstract |
Single-cell transcriptomics examines the gene expression level of individual cells in a given population by simultaneously measuring the RNA concentration (conventionally only messenger RNA (mRNA)) of hundreds to thousands of genes. Single-cell transcriptomics makes it possible to unravel heterogeneous cell populations, reconstruct cellular developmental pathways, and model transcriptional dynamics — all previously masked in bulk RNA sequencing. (en) Транскрипто́мика одино́чных кле́ток (англ. single-cell transcriptomics) — область биологических исследований, в которой основным инструментом служат методы количественного анализа экспрессии генов в индивидуальных клетках. Изучение транскриптома отдельных клеток позволяет решить проблему «усреднённых» данных, которые получаются при анализе тотальной РНК, выделенной из образца.Секвенирование РНК одиночных клеток сделало возможными анализ клеточного многообразия в популяциях клеток, считавшихся ранее однородными, например, были получены новые данные в областях иммунологических, эмбриологических и онкологических исследований. Развитие технологий с 2009 года, когда впервые было произведено секвенирование транскриптома одиночных клеток, по наше время позволило увеличить производительность эксперимента от единиц до сотен тысяч клеток, что существенно повысило точность получаемых данных. (ru) |
| dbo:thumbnail |
wiki-commons:Special:FilePath/Fluorescence_Assisted_Cell_Sorting_(FACS)_B2.jpg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink |
http://www.single-cell-analysis.com/tag/cytoplasmic-aspiration/ https://www.scdiscoveries.com/single-cell-sequencing-ultimate-guide/ https://www.youtube.com/watch%3Fv=2-N3SPPHt6o |
| dbo:wikiPageID |
53576321 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength |
30818 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID |
1123484359 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink |
dbr:Amplicon dbr:Primer_(molecular_biology) dbr:Messenger_RNA dbr:Variance dbr:Polymerase_chain_reaction dbr:Northern_blot dbc:Biotechnology dbr:Confounding dbr:Correlation dbr:Gene dbr:Gene_ontology dbr:Mutual_information dbr:T-SNE dbr:Stochastic dbr:Actin dbr:Cell_(biology) dbr:Transcription_(biology) dbr:K-means_clustering dbr:Laser_capture_microdissection dbr:Subgroup_analysis dbr:RNA-Seq dbc:DNA_sequencing dbc:Molecular_biology_techniques dbr:Cellular_differentiation dbr:Batch_effects dbr:Dimensionality_reduction dbr:Flow_cytometry dbr:Principal_component_analysis dbr:Endogenous dbr:Reporter_gene dbr:Heterogenous dbr:CDNA dbr:Assays dbr:Biclustering dbr:Biomarker dbr:Hierarchical_clustering dbr:Canonical_correlation_analysis dbr:Single_cell_sequencing dbr:Vertex_(graph_theory) dbr:Non-linear dbr:Polyadenylation dbr:Single-cell_analysis dbr:Microarrays dbr:Microfluidic dbr:Unimodal dbr:Unique_molecular_identifiers dbr:Transcriptome dbr:Next_generation_sequencing dbr:Transcriptomics_technologies dbr:Reverse_transcription dbr:Housekeeping_genes dbr:GAPDH dbr:Transcriptomics dbr:Gene_regulatory_networks dbr:Quantitative_PCR dbr:Fluorescent_dyes dbr:Minimal_spanning_tree dbr:RNA_sequencing dbr:Principal_components dbr:Lysate dbr:Bimodal dbr:Dimensional_space dbr:Extrinsic dbr:File:7n_graph_with_minimal_spanning_tree.svg dbr:File:Fluorescence_Assisted_Cell_Sorting_(FACS)_B2.jpg dbr:File:KMeans-Gaussian-data.svg dbr:File:PCA_of_Guinean_and_other_African_...chromosome_haplogroup_frequencies.jpg dbr:File:RNA_Seq_Experiment.png dbr:Gene_Ontology_(GO)_term_enrichment dbr:Micropipetting dbr:File:Iris_dendrogram.png |
| dbp:wikiPageUsesTemplate |
dbt:Main dbt:Reflist dbt:Toclimit |
| dct:subject |
dbc:Biotechnology dbc:DNA_sequencing dbc:Molecular_biology_techniques |
| rdfs:comment |
Single-cell transcriptomics examines the gene expression level of individual cells in a given population by simultaneously measuring the RNA concentration (conventionally only messenger RNA (mRNA)) of hundreds to thousands of genes. Single-cell transcriptomics makes it possible to unravel heterogeneous cell populations, reconstruct cellular developmental pathways, and model transcriptional dynamics — all previously masked in bulk RNA sequencing. (en) Транскрипто́мика одино́чных кле́ток (англ. single-cell transcriptomics) — область биологических исследований, в которой основным инструментом служат методы количественного анализа экспрессии генов в индивидуальных клетках. Изучение транскриптома отдельных клеток позволяет решить проблему «усреднённых» данных, которые получаются при анализе тотальной РНК, выделенной из образца.Секвенирование РНК одиночных клеток сделало возможными анализ клеточного многообразия в популяциях клеток, считавшихся ранее однородными, например, были получены новые данные в областях иммунологических, эмбриологических и онкологических исследований. Развитие технологий с 2009 года, когда впервые было произведено секвенирование транскриптома одиночных клеток, по наше время позволило увеличить производительность экспе (ru) |
| rdfs:label |
Single-cell transcriptomics (en) Транскриптомика одиночных клеток (ru) |
| owl:sameAs |
yago-res:Single-cell transcriptomics wikidata:Single-cell transcriptomics dbpedia-ru:Single-cell transcriptomics https://global.dbpedia.org/id/miDJ |
| prov:wasDerivedFrom |
wikipedia-en:Single-cell_transcriptomics?oldid=1123484359&ns=0 |
| foaf:depiction |
wiki-commons:Special:FilePath/Iris_dendrogram.png wiki-commons:Special:FilePath/KMeans-Gaussian-data.svg wiki-commons:Special:FilePath/7n_graph_with_minimal_spanning_tree.svg wiki-commons:Special:FilePath/Fluorescence_Assisted_Cell_Sorting_(FACS)_B2.jpg wiki-commons:Special:FilePath/PCA_of_Guinean_and_ot...chromosome_haplogroup_frequencies.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RNA_Seq_Experiment.png |
| foaf:isPrimaryTopicOf |
wikipedia-en:Single-cell_transcriptomics |
| is dbo:wikiPageRedirects of |
dbr:Single-cell_transcriptome |
| is dbo:wikiPageWikiLink of |
dbr:Stephen_Quake dbr:Muzlifah_Haniffa dbr:Katalin_Susztak dbr:RNA-Seq dbr:Cellular_deconvolution dbr:Fluorescence_in_situ_hybridization dbr:Superior_colliculus dbr:Manolis_Kellis dbr:Single_cell dbr:Single_cell_sequencing dbr:Trajectory_inference dbr:Monoallelic_gene_expression dbr:Single-cell_analysis dbr:Transcriptome dbr:Transcriptomics_technologies dbr:Spatial_transcriptomics dbr:Single-cell_transcriptome |
| is foaf:primaryTopic of |
wikipedia-en:Single-cell_transcriptomics |
