Gene expression profiling (original) (raw)
Die Genexpressionsanalyse ist eine Untersuchung der Umsetzung der genetischen Information (Genexpression) mit molekularbiologischen und biochemischen Methoden. Sie kann sowohl für einzelne Transkripte als auch für das ganze Transkriptom angewendet werden und ermöglicht qualitative und quantitative Aussagen über die Aktivität der Gene. Während im ersten Fall nur die Sequenzinformation des zu untersuchenden Transkripts bekannt sein muss, wird für die Transkriptom-Analyse die gesamte Sequenzinformation des Transkriptoms gebraucht.
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dbo:abstract | في مجال البيولوجيا الجزيئية، يعد تنميط التعبير الجيني هو قياس نشاط (التعبير) لآلاف الجينات في وقت واحد، لتكوين صورة عامة للوظيفة الخلوية. على سبيل المثال يمكن لهذه الملامح التمييز بين الخلايا التي تنقسم بنشاط، أو إظهار كيفية تفاعل الخلايا مع علاج معين. العديد من التجارب من هذا النوع تقيس الجينوم بأكمله في وقت واحد، أي كل جين موجود في خلية معينة. يمكن استخدام العديد من تقنيات النسخ لتوليد البيانات اللازمة للتحليل. المصفوفات الدقيقة للحمض النووي تقيس النشاط النسبي للجينات المستهدفة المحددة مسبقًا. توفر التقنيات القائمة على التسلسل -كـ RNA-Seq مثلًا- معلومات عن تسلسل الجينات بالإضافة إلى نمط تعبيرها. (ar) Die Genexpressionsanalyse ist eine Untersuchung der Umsetzung der genetischen Information (Genexpression) mit molekularbiologischen und biochemischen Methoden. Sie kann sowohl für einzelne Transkripte als auch für das ganze Transkriptom angewendet werden und ermöglicht qualitative und quantitative Aussagen über die Aktivität der Gene. Während im ersten Fall nur die Sequenzinformation des zu untersuchenden Transkripts bekannt sein muss, wird für die Transkriptom-Analyse die gesamte Sequenzinformation des Transkriptoms gebraucht. (de) En el campo de la biología molecular, el perfil de expresión génica es la medida de la actividad (de la expresión génica) de miles de genes simultáneamente, para crear una imagen global de la función celular. Estos perfiles pueden, por ejemplo, distinguir entre las células que se están dividiendo activamente, o mostrar cómo las células reaccionan a un tratamiento en particular. Muchos experimentos de este tipo analizan un genoma completo simultáneamente, es decir, cada gen presente en una célula en particular. La tecnología de chip de ADN mide la actividad relativa de los genes diana previamente identificados. También se utilizan para perfiles de expresión génica las técnicas basadas en la secuenciación, como el análisis en serie de la expresión génica SuperSAGE. La técnica SuperSage es especialmente precisa y puede medir cualquier gen activo y no solo un conjunto predeterminado. La llegada de tecnologías de nueva generación de secuenciación ha hecho del análisis de expresión basado en la secuencia una alternativa “digital” llamada tecnología RNA-Seq (secuenciación masiva de transcriptoma), cada vez más popular comparada con la tecnología de microarreglos. Sin embargo la tecnología de microarreglos es mucho más común, considerando los 17 000 artículos PubMed de 2006. (es) In the field of molecular biology, gene expression profiling is the measurement of the activity (the expression) of thousands of genes at once, to create a global picture of cellular function. These profiles can, for example, distinguish between cells that are actively dividing, or show how the cells react to a particular treatment. Many experiments of this sort measure an entire genome simultaneously, that is, every gene present in a particular cell. Several transcriptomics technologies can be used to generate the necessary data to analyse. DNA microarrays measure the relative activity of previously identified target genes. Sequence based techniques, like RNA-Seq, provide information on the sequences of genes in addition to their expression level. (en) Nel campo della biologia molecolare, gene expression profiling (tradotto come analisi di espressione genica) è la misura dell'attività (l'espressione) di migliaia di geni alla volta, per creare una immagine globale della funzione cellulare. Questi profili possono, per esempio, distinguere tra cellule che sono in proliferazione, o mostrare come le cellule reagiscono ad un particolare trattamento. Molti esperimenti di questo tipo misurano un intero genoma simultaneamente. La tecnologia DNA Microarray misura l'attività relativa dei geni target identificati precedentemente. Anche tecniche basate sulla sequenza, come la serial analysis of gene expression (tradotto come analisi seriale di espressione genica e abbreviata come SAGE oppure SuperSAGE) sono usate per la gene expression profiling. La SuperSAGE è molto accurata e può misurare ogni gene attivo, non solo un gruppo predefinito. L'avvento di sequenziatori di ultima generazione ha reso l'analisi di espressione fondata sulla sequenza, un'alternativa digitale ai microarray sempre più popolare. Ad ogni modo, i microarray sono molto più comuni, infatti sono citati in 17.000 articoli PubMed del 2006. (it) Количественный анализ экспрессии генов — анализ транскриптома, измерение транскрипционной активности гена с помощью определения количества его продукта, матричной РНК (мРНК), универсальной для большей части генов. При этом конечным продуктом экспрессии генов как правило являются белки, а не мРНК. (ru) 基因表达谱是一种在分子生物学领域,借助cDNA、(EST)或来测定细胞基因表达情况(包括特定基因是否表达、、不同组织、不同发育阶段以及不同生理状态下的表达差异)的方法。通过一次性测定大量基因构建起细胞功能的总体态势图,可以从图谱中区分出正在分裂的细胞,以及细胞对于特征性治疗的反应。基因表达谱还有助于了解疾病的发病机制、药物的生理反应和治疗效果。 (zh) |
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