Phi X 174 (original) (raw)
El fag Φ-X174 és un fag conegut per ser la primera entitat genètica de la que se'n va poder obtenir la seqüenciació sencera del seu ADN el 28 d'abril del 1993. La raó és que té molt poca quantitat d'ADN. Només té 11 gens en 5.386 parells de bases. Diversos d'ells expressant funcions semblants en dos grups. Està format per ssDNA i conté un 44% de GC. El 2003, el grup de recerca de Craig Venter aconseguí sintetitzar in vitro el genoma de ΦX174 a partir essent així mateix el primer genoma a ser enterament sintetitzat a partir de fragments d'oligonucleòtids.
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| dbo:abstract | El fag Φ-X174 és un fag conegut per ser la primera entitat genètica de la que se'n va poder obtenir la seqüenciació sencera del seu ADN el 28 d'abril del 1993. La raó és que té molt poca quantitat d'ADN. Només té 11 gens en 5.386 parells de bases. Diversos d'ells expressant funcions semblants en dos grups. Està format per ssDNA i conté un 44% de GC. El 2003, el grup de recerca de Craig Venter aconseguí sintetitzar in vitro el genoma de ΦX174 a partir essent així mateix el primer genoma a ser enterament sintetitzat a partir de fragments d'oligonucleòtids. (ca) Der Enterobakteriophage PhiX174, offiziell Escherichia virus phiX174, veraltet Enterobacteria phage phiX174, deutsch auch Bakteriophage Phi X 174 oder Coliphage φX174, kurz ΦX174 genannt, ist ein einzelsträngiges DNA-Virus (ssDNA) positiver Polarität, das Bakterien der Art Escherichia coli infiziert. Es ist die einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell anerkannte Spezies in der Virusgattung Sinsheimervirus (veraltet Phix174microvirus, auch Bakteriophage PhiX174 sensu lato oder ΦX174-Gruppe genannt), es gibt jedoch weitere Vorschläge (Phage MED1). (de) El bacteriófago Phi-X174 es un bacteriófago de ADN monocatenario de la familia Microviridae que infecta a Escherichia. El genoma del bacteriófago Phi-X174 fue el primer ácido nucleico en ser secuenciado, en 1977, por Frederick Sanger. En 1962, Walter Fiers había ya demostrado la circularidad física, covalente del ADN de Phi X 174. Este bacteriófago tiene una cantidad muy pequeña de ADN. Se identificaron 11 genes en 5.386 bases; conformado por un solo cromosoma, en una topología circular. Muchas de sus expresiones tiene similares funciones en los dos grupos. El contenido GC es del 44 % y el 95 % de los nucleótidos corresponde a genes codificantes. (es) The phi X 174 (or ΦX174) bacteriophage is a single-stranded DNA (ssDNA) virus that infects Escherichia coli, and the first DNA-based genome to be sequenced. This work was completed by Fred Sanger and his team in 1977. In 1962, Walter Fiers and Robert Sinsheimer had already demonstrated the physical, covalently closed circularity of ΦX174 DNA. Nobel prize winner Arthur Kornberg used ΦX174 as a model to first prove that DNA synthesized in a test tube by purified enzymes could produce all the features of a natural virus, ushering in the age of synthetic biology. In 1972–1974, Jerard Hurwitz, Sue Wickner, and Reed Wickner with collaborators identified the genes required to produce the enzymes to catalyze conversion of the single stranded form of the virus to the double stranded replicative form. In 2003, it was reported by Craig Venter's group that the genome of ΦX174 was the first to be completely assembled in vitro from synthesized oligonucleotides. The ΦX174 virus particle has also been successfully assembled in vitro. In 2012, it was shown how its highly overlapping genome can be fully decompressed and still remain functional. (en) Le phage phiX174 (ou ΦX174) est un virus bactériophage de la famille des Microviridae. C'est un virus très simple dont le génome est composé d'une molécule d'ADN simple-brin circulaire longue de 5386 nucléotides et comportant onze gènes. Ce virus a été isolé en 1935 par Nicolas Boulgakov (le frère de l'écrivain Mikhaïl Boulgakov)dans le laboratoire de Félix d'Hérelle à l'Institut Pasteur, à partir d'échantillons collectés dans les égouts de Paris. Sa caractérisation et l'étude de son mécanisme de réplication ont été réalisées à partir des années 1950, en particulier par Robert Sinsheimer à Caltech en Californie et (en), de l'Université de Gand en Belgique. Le caractère simple-brin du génome de ΦX174 a permis à Frederick Sanger et à ses collaborateurs d'en réaliser le séquençage dès 1977, faisant ainsi de ce virus le premier organisme dont la séquence génomique a été connue. Sanger a obtenu un second prix Nobel de chimie en 1980 pour ce travail. En 2003, le génome de ϕX174 a été reconstitué de manière artificielle par l'équipe de Craig Venter, par assemblage d'oligonucléotides obtenus par synthèse chimique. Le virus synthétique ainsi obtenu s'est avéré fonctionnel, constituant un premier pas vers une nouvelle ingénierie du vivant. Le protéine E est produite par phiX174 lui permet de décomposer la membrane cellulaire d'Escherichia coli par un phénomène appelé lyse provoquant la destruction de la cellule . (fr) Il batteriofago phi X 174 (o ΦX174) è un virus a DNA a filamento singolo (ssDNA) che infetta l'Escherichia coli e il primo genoma a base di DNA ad essere sequenziato. Questo lavoro è stato completato da Fred Sanger e dal suo team nel 1977. Nel 1962, Walter Fiers e Robert Sinsheimer avevano già dimostrato la circolarità fisica, chiusa in modo covalente del DNA ΦX174. Arthur Kornberg, vincitore del premio Nobel, ha utilizzato ΦX174 come modello per dimostrare innanzitutto che il DNA sintetizzato in una provetta da enzimi purificati potrebbe produrre tutte le caratteristiche di un virus naturale, inaugurando l'era della biologia sintetica. Nel 1972-1974, Jerard Hurwitz, Sue Wickner e Reed Wickner con i collaboratori identificarono i geni necessari per produrre gli enzimi per catalizzare la conversione della forma a singolo filamento del virus nella forma replicativa a doppio filamento.Nel 2003, il gruppo di Craig Venter riferì che il genoma di 17X174 fu il primo ad essere completamente assemblato in vitro da oligonucleotidi sintetizzati. Anche la particella del virus ΦX174 è stata assemblata con successo in vitro. Recentemente, è stato dimostrato come il suo genoma altamente sovrapposto possa essere completamente decompresso e rimanere ancora funzionale. (it) Bakteriofag ΦX174 lub Fag Fi-X174 - wirus atakujący bakterie (bakteriofag) i pierwszy wirus DNA, którego materiał genetyczny udało się zsekwencjonować w całości, czego dokonał Fred Sanger wraz ze swoim zespołem w roku 1977. Już w 1962 r. Walter Fiers zademonstrował zamkniętą, kolistą strukturę DNA bakteriofaga Fi-X174. Jest to wirus o bardzo małej ilości materiału genetycznego. Zawiera pojedynczą, kolistą nić DNA, którego sekwencja obejmuje 11 genów o długości 5386 nukleotydów (co stanowi 95% całego DNA). Charakterystyczną cechą ekspresji tego faga jest to, że kod genetyczny jest zachodzący, tzn. odczytywanie informacji genetycznej przebiega w dwóch różnych ramkach odczytu, co wynika z małego genomu tego faga i ekonomii jego wykorzystania. (pl) Phi-X174 eller Φ-X174 är ett virus (en bakteriofag) som var den första organismen vars genom sekvensbestämdes. Viruset har väldigt lite DNA, 11 gener i 5386 baspar. Flera av dessa uttrycker liknande funktioner i två grupper. Denna molekylärbiologi-relaterade artikel saknar väsentlig information. Du kan hjälpa till genom att lägga till den. (sv) Бактеріофаг ΦX174 (читається «фі десять сто сімдесят чотири») — коліфаг (вірус, що паразитує у клітинах кишкової палички) родини , віріони мають ікосаедричну симетрію, геном представлений одноланцюговою кільцевою ДНК. 1977 року завдяки праці Фредеріка Сенгера та його співробітників фаг ΦX174 став першим біологічним об'єктом, ДНК-геном якого було секвеновано. Групі Крейга Вентера у 2003 році вдалось синтезувати хімічним шляхом ДНК цього вірусу, що здатна викликати інфекцію у бактерій і забезпечувати утворення повноцінних вірусних частинок. (uk) |
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Es ist die einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell anerkannte Spezies in der Virusgattung Sinsheimervirus (veraltet Phix174microvirus, auch Bakteriophage PhiX174 sensu lato oder ΦX174-Gruppe genannt), es gibt jedoch weitere Vorschläge (Phage MED1). (de) Phi-X174 eller Φ-X174 är ett virus (en bakteriofag) som var den första organismen vars genom sekvensbestämdes. Viruset har väldigt lite DNA, 11 gener i 5386 baspar. Flera av dessa uttrycker liknande funktioner i två grupper. Denna molekylärbiologi-relaterade artikel saknar väsentlig information. Du kan hjälpa till genom att lägga till den. (sv) Бактеріофаг ΦX174 (читається «фі десять сто сімдесят чотири») — коліфаг (вірус, що паразитує у клітинах кишкової палички) родини , віріони мають ікосаедричну симетрію, геном представлений одноланцюговою кільцевою ДНК. 1977 року завдяки праці Фредеріка Сенгера та його співробітників фаг ΦX174 став першим біологічним об'єктом, ДНК-геном якого було секвеновано. Групі Крейга Вентера у 2003 році вдалось синтезувати хімічним шляхом ДНК цього вірусу, що здатна викликати інфекцію у бактерій і забезпечувати утворення повноцінних вірусних частинок. (uk) El bacteriófago Phi-X174 es un bacteriófago de ADN monocatenario de la familia Microviridae que infecta a Escherichia. El genoma del bacteriófago Phi-X174 fue el primer ácido nucleico en ser secuenciado, en 1977, por Frederick Sanger. En 1962, Walter Fiers había ya demostrado la circularidad física, covalente del ADN de Phi X 174. (es) The phi X 174 (or ΦX174) bacteriophage is a single-stranded DNA (ssDNA) virus that infects Escherichia coli, and the first DNA-based genome to be sequenced. This work was completed by Fred Sanger and his team in 1977. In 1962, Walter Fiers and Robert Sinsheimer had already demonstrated the physical, covalently closed circularity of ΦX174 DNA. Nobel prize winner Arthur Kornberg used ΦX174 as a model to first prove that DNA synthesized in a test tube by purified enzymes could produce all the features of a natural virus, ushering in the age of synthetic biology. In 1972–1974, Jerard Hurwitz, Sue Wickner, and Reed Wickner with collaborators identified the genes required to produce the enzymes to catalyze conversion of the single stranded form of the virus to the double stranded replicative for (en) Le phage phiX174 (ou ΦX174) est un virus bactériophage de la famille des Microviridae. C'est un virus très simple dont le génome est composé d'une molécule d'ADN simple-brin circulaire longue de 5386 nucléotides et comportant onze gènes. Ce virus a été isolé en 1935 par Nicolas Boulgakov (le frère de l'écrivain Mikhaïl Boulgakov)dans le laboratoire de Félix d'Hérelle à l'Institut Pasteur, à partir d'échantillons collectés dans les égouts de Paris. Sa caractérisation et l'étude de son mécanisme de réplication ont été réalisées à partir des années 1950, en particulier par Robert Sinsheimer à Caltech en Californie et (en), de l'Université de Gand en Belgique. (fr) Il batteriofago phi X 174 (o ΦX174) è un virus a DNA a filamento singolo (ssDNA) che infetta l'Escherichia coli e il primo genoma a base di DNA ad essere sequenziato. Questo lavoro è stato completato da Fred Sanger e dal suo team nel 1977. Nel 1962, Walter Fiers e Robert Sinsheimer avevano già dimostrato la circolarità fisica, chiusa in modo covalente del DNA ΦX174. Arthur Kornberg, vincitore del premio Nobel, ha utilizzato ΦX174 come modello per dimostrare innanzitutto che il DNA sintetizzato in una provetta da enzimi purificati potrebbe produrre tutte le caratteristiche di un virus naturale, inaugurando l'era della biologia sintetica. Nel 1972-1974, Jerard Hurwitz, Sue Wickner e Reed Wickner con i collaboratori identificarono i geni necessari per produrre gli enzimi per catalizzare la co (it) Bakteriofag ΦX174 lub Fag Fi-X174 - wirus atakujący bakterie (bakteriofag) i pierwszy wirus DNA, którego materiał genetyczny udało się zsekwencjonować w całości, czego dokonał Fred Sanger wraz ze swoim zespołem w roku 1977. Już w 1962 r. Walter Fiers zademonstrował zamkniętą, kolistą strukturę DNA bakteriofaga Fi-X174. Jest to wirus o bardzo małej ilości materiału genetycznego. Zawiera pojedynczą, kolistą nić DNA, którego sekwencja obejmuje 11 genów o długości 5386 nukleotydów (co stanowi 95% całego DNA). (pl) |
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