Ribosomal frameshift (original) (raw)
Ribosomal frameshifting, also known as translational frameshifting or translational recoding, is a biological phenomenon that occurs during translation that results in the production of multiple, unique proteins from a single mRNA. The process can be programmed by the nucleotide sequence of the mRNA and is sometimes affected by the secondary, 3-dimensional mRNA structure. It has been described mainly in viruses (especially retroviruses), retrotransposons and bacterial insertion elements, and also in some cellular genes.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | انزياح الإطار الريبوسومي أو تغيُّر الإطار الريبوسومي (بالإنجليزية: Ribosomal frameshift) ويُعرف كذلك بإعادة التشفير الترجمي (بالإنجليزية: translational recoding) هي عملية بيولوجية تحدث أثناء الترجمة تقوم فيها (في العادة تسلسل زلق وبنية رنا ثانوية) بإعادة توجية الريبوسوم إلى إطار قراءة جديد (-1 أو +1 نوكليوتيد)، يُستخدم انزياح الإطار: لترجمة العديد من البروتينات من نفس التسلسل وبالتالي زيادة السعة التخزينية للجينومات الصغيرة وبشكل خاص الفيروسات مثل فيروس الإيدز-1، ، وفيروس الإنفلونزا. لأمور تنظيمية مثل تنظيم مستويات عديد الأمين بواسطة الذي يثبط عمل . لتصحيح مشاكل الترجمة أو الإنديلات المفيدة للفيروسات. أشهر أنواع انزياح الإطار هو انزياح الإطار -1 ويسمى كذلك بازياح الإطار المبرمج -1 (−1 PRF) وفيه يرجع الريبوسوم بنوكليوتيد واحد إلى الخلف، توجد انزياحات إطار أخرى نادرة مثل +1 (القفز إلى الأمام بنوكليوتيد واحد) و-2 (نوكليوتيدين إلى الخلف وهو نفسه إطار القراءة +1 ناقص كودون واحد). تتحكم آليات مختلفة في انزياحي الإطار -1 و+1 وكلاهما يحدث عبر مسارات . (ar) En génétique, le décalage du cadre de lecture, parfois également appelé décalage ribosomique, résulte d'un changement du positionnement relatif du ribosome par rapport à la séquence de l'ARN messager d'un nombre de nucléotides non multiple de 3 conduisant à un changement d'interprétation des codons du cadre de lecture lors de la traduction génétique. En effet, le code génétique repose sur la lecture séquentielle par les ribosomes de triplets de nucléotides sur l'ARN messager, chacun de ces triplets, appelés codons, correspondant à un acide aminé déterminé : si l'on décale l'association de ces triplets d'un ou deux nucléotides dans un sens ou dans l'autre, la traduction de la séquence d'ARNm en polypeptide est totalement modifiée sur toute la longueur de la protéine synthétisée ; si l'on décale la lecture de trois nucléotides, en revanche, la protéine résultante ne différera que d'un seul acide aminé, en plus ou en moins par rapport à la protéine normale — elle différera de deux acides aminés si le cadre de lecture est décalé de six nucléotides. Ceci peut être illustré par l'exemple suivant montrant l'effet de l'insertion d'un résidu d'adénine (marqué en rouge) sur la traduction d'un oligopeptide : 5’ AUG CCA UCA GUU UGA CGC UUC CCA UAU AUU AG- 3’ Met-Pro-Ser-Val Stop5’ AUG CCA UCA*AGU UUG ACG CUU CCC AUA UAU UAG 3’ Met-Pro-Ser-Ser-Leu-Thr-Leu-Pro-Ile-Tyr Stop La séquence protéique produite après insertion du nucléotide supplémentaire est complètement différente de la première : le premier codon-STOP est ignoré par le décalage du cadre de lecture de sorte qu'au lieu d'un tétrapeptide, c'est un oligopeptide de dix acides aminés qui est produit. Ceci peut survenir lors de la traduction de l'ARN messager par le ribosome et peut être induit par la séquence nucléotidique de cet ARN ou être affecté par la structure secondaire ou tertiaire de cet ARN. Ce phénomène s'observe essentiellement chez les virus (notamment les rétrovirus), les rétrotransposons et les éléments génétiques mobiles bactériens, ainsi que dans certains gènes cellulaires. Le virus Ebola, qui est un virus à ARN monocaténaire à polarité négative, possède ainsi un gène, celui de la glycoprotéine virale, qui peut être traduit en trois protéines différentes, dont les 295 résidus N-terminaux sont cependant identiques, selon que zéro, un ou deux résidus d'adénosine sont insérés par l'ARN polymérase ARN-dépendante au niveau d'une séquence glissante qui la fait patiner (polymerase stuttering) : * une glycoprotéine sécrétée de 364 résidus d'acides aminés ; * une grosse glycoprotéine de 676 résidus d'acides aminés résultant de l'insertion d'un résidu d'adénine dans l'ARN messager produit par la polymérase et responsable de la pénétration du virion dans la cellule cible ; * une petite glycoprotéine sécrétée de 298 résidus d'acides aminés résultant de l'insertion de deux résidus d'adénine dans l'ARN messager produit par la polymérase. (fr) Ribosomal frameshifting, also known as translational frameshifting or translational recoding, is a biological phenomenon that occurs during translation that results in the production of multiple, unique proteins from a single mRNA. The process can be programmed by the nucleotide sequence of the mRNA and is sometimes affected by the secondary, 3-dimensional mRNA structure. It has been described mainly in viruses (especially retroviruses), retrotransposons and bacterial insertion elements, and also in some cellular genes. (en) A mudança da matriz de leitura ribossomal, também conhecida como mudança da matriz de tradução ou recodificação traducional, é um fenômeno biológico que ocorre durante a tradução que resulta na produção de múltiplas proteínas únicas a partir de um único mRNA. O processo pode ser programado pela sequência nucleotídica do mRNA, e às vezes é afetado pela estrutura secundária tridimensional do mRNA. O fenômeno foi descrito principalmente em vírus (especialmente retrovírus), retrotransposons e elementos de inserção bacteriana, e também em alguns genes celulares. (pt) 核糖體移碼（Ribosomal frameshift）又稱轉譯移碼（Translational frameshift），是生物細胞中核糖體進行轉譯時，mRNA上的特定序列與二級結構使核糖體發生位移而破壞開放閱讀框的現象。由於mRNA上的密碼子是由3個核苷酸對應一個氨基酸，+1、-1等核糖體移碼會影響下游的開放閱讀框，進而轉譯出完全不同的蛋白質。核糖體移碼可使一個mRNA得以轉譯出數種不同的蛋白質產物，此機制主要在病毒（反轉錄病毒、（RSV）、冠狀病毒、流感病毒、反轉錄轉座子等）的mRNA中發現，但也見於一些真核生物細胞基因的mRNA，可能為細胞調控基因表現的機制之一。 最常見的核糖體移碼為-1核糖體移碼（programmed −1 ribosomal frameshifting, −1 PRF），此外還有較罕見的+1核糖體移碼與-2核糖體移碼。發生-1核糖體移碼的序列通常包含、間隔序列（spacer）與莖環等三個元件，典型的滑動序列為X_XXY_YYH（X可為任意核苷酸、Y為A或U、H則為ACU三者之一），-1移碼發生時，原與XXY密碼子結合的核糖體P位點與其上的tRNA向前位移，改與XXX結合，同時原與YYH結合的A位點與其tRNA也改與YYY結合，新的反密碼子/密碼子配對除密碼子三號位的核苷酸外，一號位與二號位的核苷酸皆與原本的相同，而三號位因有搖擺鹼基對，反密碼子/密碼子的結合力本就較弱，不對兩者的結合造成嚴重影響。 發生+1核糖體移碼的序列則沒有特定基序，一般機制為使用一較罕見（對應tRNA的量較少）的密碼子使轉譯發生停滯，增加核糖體發生移碼的機會。 (zh) Рибосомальний зсув рамки зчитування (англ. ribosomal frameshifting), також відомий як трансляційний зсув рамки зчитування (англ. translational frameshifting) або трансляційне перекодування (англ. translational recoding) — це біологічне явище, що виникає під час трансляції, й внаслідок якого продукується декілька унікальних білків з однієї мРНК. Процес може бути запрограмований нуклеотидною послідовністю мРНК і іноді впливає на вторинну, тривимірну структуру мРНК. Це явище описане здебільшого у вірусів (особливо у ретровірусів), ретротранспозонах, бактеріальних вставних елементах, а також у деяких клітинних генах. (uk) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Tandem_slippage_model.jpg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00042.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00043.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00044.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00046.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00080.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00107.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00128.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00218.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00233.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00240.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00257.HTML http://www.ekevanbatenburg.nl/PKBASE/PKB00258.HTML http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01074 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01076 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01079 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01090 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01093 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01094 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01097 http://rfam.sanger.ac.uk/family/RF01098 http://rfam.sanger.ac.uk http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_www.cgi%3Frm=select&pgm=fy http://www.ebi.ac.uk/Tools/Wise2/index.htm http://bioinfo.lifl.fr/path/ http://recode.ucc.ie/ |
| dbo:wikiPageID | 14547183 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 26234 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1121904905 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Proteins dbr:Purine dbr:Pyrimidine dbr:Messenger_RNA dbr:MicroRNA dbr:MT-ATP6 dbr:MT-ATP8 dbr:Retroviruses dbr:Cytosol dbr:DNA dbr:Uracil dbr:Viruses dbr:Intron dbr:Nucleic_acid_secondary_structure dbr:Pseudoknot dbr:0 dbr:Coronavirus dbr:Coronavirus_frameshifting_stimulation_element dbr:Nonsense_mutation dbr:Vertebrate_mitochondrial_code dbr:Gene dbr:Antizyme_RNA_frameshifting_stimulation_element dbr:Ketone dbr:Bacteria dbr:Thymine dbr:Translation_(genetics) dbr:Eukaryota dbr:Nonsense-mediated_decay dbr:Adenine dbr:Amine dbr:Amino_acid dbc:Cis-regulatory_RNA_elements dbc:Gene_expression dbr:Cytosine dbr:Nucleotides dbr:Frameshift_mutation dbr:Reading_frame dbr:Protein dbr:Recode_(database) dbr:Rous_sarcoma_virus dbc:RNA dbr:Guanine dbr:HIV-1 dbr:HIV_ribosomal_frameshift_signal dbr:Invertebrate dbr:Stem-loop dbr:ALIL_pseudoknot dbc:Genetics dbr:Translation_(biology) dbr:Wobble_base_pair dbr:IUPAC dbr:Thermodynamic_versus_kinetic_reaction_control dbr:DnaX_ribosomal_frameshifting_element dbr:Influenza dbr:Insertion_sequence_IS1222_ribosomal_frameshifting_element dbr:Ribosomal_pause dbr:Polyadenylation dbr:Polyamine dbr:Slippery_sequence dbr:TRNA dbr:Frameshift dbr:Human_mitochondrial_genome dbr:Retrotransposons dbr:Codons dbr:Overlapping_genes dbr:File:RNA_structure.001.jpg dbr:File:+1_translational_frameshift_mechanism.jpg dbr:File:Tandem_slippage_model.jpg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:MeshName dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Use_dmy_dates dbt:Navbox |
| dct:subject | dbc:Cis-regulatory_RNA_elements dbc:Gene_expression dbc:RNA dbc:Genetics |
| rdf:type | yago:WikicatCis-regulatoryRNAElements yago:Abstraction100002137 yago:Cognition100023271 yago:Component105868954 yago:Concept105835747 yago:Content105809192 yago:Idea105833840 yago:Part105867413 yago:PsychologicalFeature100023100 |
| rdfs:comment | Ribosomal frameshifting, also known as translational frameshifting or translational recoding, is a biological phenomenon that occurs during translation that results in the production of multiple, unique proteins from a single mRNA. The process can be programmed by the nucleotide sequence of the mRNA and is sometimes affected by the secondary, 3-dimensional mRNA structure. It has been described mainly in viruses (especially retroviruses), retrotransposons and bacterial insertion elements, and also in some cellular genes. (en) A mudança da matriz de leitura ribossomal, também conhecida como mudança da matriz de tradução ou recodificação traducional, é um fenômeno biológico que ocorre durante a tradução que resulta na produção de múltiplas proteínas únicas a partir de um único mRNA. O processo pode ser programado pela sequência nucleotídica do mRNA, e às vezes é afetado pela estrutura secundária tridimensional do mRNA. O fenômeno foi descrito principalmente em vírus (especialmente retrovírus), retrotransposons e elementos de inserção bacteriana, e também em alguns genes celulares. (pt) Рибосомальний зсув рамки зчитування (англ. ribosomal frameshifting), також відомий як трансляційний зсув рамки зчитування (англ. translational frameshifting) або трансляційне перекодування (англ. translational recoding) — це біологічне явище, що виникає під час трансляції, й внаслідок якого продукується декілька унікальних білків з однієї мРНК. Процес може бути запрограмований нуклеотидною послідовністю мРНК і іноді впливає на вторинну, тривимірну структуру мРНК. Це явище описане здебільшого у вірусів (особливо у ретровірусів), ретротранспозонах, бактеріальних вставних елементах, а також у деяких клітинних генах. (uk) انزياح الإطار الريبوسومي أو تغيُّر الإطار الريبوسومي (بالإنجليزية: Ribosomal frameshift) ويُعرف كذلك بإعادة التشفير الترجمي (بالإنجليزية: translational recoding) هي عملية بيولوجية تحدث أثناء الترجمة تقوم فيها (في العادة تسلسل زلق وبنية رنا ثانوية) بإعادة توجية الريبوسوم إلى إطار قراءة جديد (-1 أو +1 نوكليوتيد)، يُستخدم انزياح الإطار: لترجمة العديد من البروتينات من نفس التسلسل وبالتالي زيادة السعة التخزينية للجينومات الصغيرة وبشكل خاص الفيروسات مثل فيروس الإيدز-1، ، وفيروس الإنفلونزا. لأمور تنظيمية مثل تنظيم مستويات عديد الأمين بواسطة الذي يثبط عمل . لتصحيح مشاكل الترجمة أو الإنديلات المفيدة للفيروسات. (ar) En génétique, le décalage du cadre de lecture, parfois également appelé décalage ribosomique, résulte d'un changement du positionnement relatif du ribosome par rapport à la séquence de l'ARN messager d'un nombre de nucléotides non multiple de 3 conduisant à un changement d'interprétation des codons du cadre de lecture lors de la traduction génétique. En effet, le code génétique repose sur la lecture séquentielle par les ribosomes de triplets de nucléotides sur l'ARN messager, chacun de ces triplets, appelés codons, correspondant à un acide aminé déterminé : si l'on décale l'association de ces triplets d'un ou deux nucléotides dans un sens ou dans l'autre, la traduction de la séquence d'ARNm en polypeptide est totalement modifiée sur toute la longueur de la protéine synthétisée ; si l'on dé (fr) 核糖體移碼（Ribosomal frameshift）又稱轉譯移碼（Translational frameshift），是生物細胞中核糖體進行轉譯時，mRNA上的特定序列與二級結構使核糖體發生位移而破壞開放閱讀框的現象。由於mRNA上的密碼子是由3個核苷酸對應一個氨基酸，+1、-1等核糖體移碼會影響下游的開放閱讀框，進而轉譯出完全不同的蛋白質。核糖體移碼可使一個mRNA得以轉譯出數種不同的蛋白質產物，此機制主要在病毒（反轉錄病毒、（RSV）、冠狀病毒、流感病毒、反轉錄轉座子等）的mRNA中發現，但也見於一些真核生物細胞基因的mRNA，可能為細胞調控基因表現的機制之一。 發生+1核糖體移碼的序列則沒有特定基序，一般機制為使用一較罕見（對應tRNA的量較少）的密碼子使轉譯發生停滯，增加核糖體發生移碼的機會。 (zh) |
| rdfs:label | انزياح الإطار الريبوسومي (ar) Décalage du cadre de lecture (fr) Ribosomal frameshift (en) Mudança da matriz de leitura ribossomal (pt) 核糖體移碼 (zh) Рибосомальний зсув рамки зчитування (uk) |
| owl:sameAs | freebase:Ribosomal frameshift yago-res:Ribosomal frameshift wikidata:Ribosomal frameshift wikidata:Ribosomal frameshift dbpedia-ar:Ribosomal frameshift dbpedia-fa:Ribosomal frameshift dbpedia-fr:Ribosomal frameshift dbpedia-pt:Ribosomal frameshift dbpedia-uk:Ribosomal frameshift dbpedia-zh:Ribosomal frameshift https://global.dbpedia.org/id/4txDq |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Ribosomal_frameshift?oldid=1121904905&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/RF00381.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF00382.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF00383.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF00480.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RNA_structure.001.jpg wiki-commons:Special:FilePath/+1_translational_frameshift_mechanism.jpg wiki-commons:Special:FilePath/ALIL_pk.png wiki-commons:Special:FilePath/RF00507.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site1_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site2_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site3_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site4_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site5_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site6_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site8_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/RF_site9_secondary_structure.jpg wiki-commons:Special:FilePath/Tandem_slippage_model.jpg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Ribosomal_frameshift |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Translational_frameshift dbr:Off-frame dbr:Off_frame dbr:Translational_frameshifting dbr:Frame_shift dbr:Frameshift dbr:Ribosomal_frameshifting dbr:Ribosome_frameshifting dbr:Programmed_ribosomal_frameshift |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Ambush_hypothesis dbr:Enzootic_nasal_tumor_virus dbr:Mesoniviridae dbr:Inverted_repeat dbr:Potyvirus dbr:Coronavirus dbr:Coronavirus_frameshifting_stimulation_element dbr:SARS-related_coronavirus dbr:Genetic_code dbr:Proteolysis dbr:PRF dbr:Alphacoronavirus dbr:Artificial_gene_synthesis dbr:Merafloxacin dbr:Nidovirales dbr:Translational_frameshift dbr:SLC46A3 dbr:Ribosomal_pause dbr:Polymerase_stuttering dbr:Reuven_Agami dbr:USH1C dbr:Slippery_sequence dbr:Off-frame dbr:Off_frame dbr:Translational_frameshifting dbr:Frame_shift dbr:Frameshift dbr:Ribosomal_frameshifting dbr:Ribosome_frameshifting dbr:Programmed_ribosomal_frameshift |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Ribosomal_frameshift |
