Non-coding DNA (original) (raw)
Non-coding DNA (ncDNA) sequences are components of an organism's DNA that do not encode protein sequences. Some non-coding DNA is transcribed into functional non-coding RNA molecules (e.g. transfer RNA, microRNA, piRNA, ribosomal RNA, and regulatory RNAs). Other functional regions of the non-coding DNA fraction include regulatory sequences that control gene expression; scaffold attachment regions; origins of DNA replication; centromeres; and telomeres. Some non-coding regions appear to be mostly nonfunctional such as introns, pseudogenes, intergenic DNA, and fragments of transposons and viruses.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | En genètica, l'ADN no codificant és l'ADN que no conté instruccions per fabricar proteïnes. En els eucariotes, un percentatge elevat de la de molts organismes és ADN no codificant (un enigma conegut com a ""). Una part de l'ADN no codificant està implicat en la regulació de les regions codificants. Tanmateix, la majoria d'aquest ADN no té cap funció coneguda i a vegades hom s'hi refereix com a "ADN escombraries". Proves recents suggereixen que algun ADN no codificant pot ser emprat per proteïnes creades a partir d'ADN codificant. Un experiment sobre la relació entre els introns i les proteïnes codificades oferí proves que part de l'ADN no codificant té la mateixa importància que l'ADN codificant. Aquest experiment consistia a danyar una porció d'ADN no codificant en una planta, cosa que resultà en un canvi significatiu en l'estructura de les fulles, car les proteïnes estructurals depenien d'informació continguda als introns. Algunes parts de l'ADN són "interruptors" genètics que no codifiquen proteïnes, però que regulen quan i on s'expressen els gens. Una part de l'ADN no codificant pot ser una relíquia històrica no fenotípica d'un virus ARN, que per casualitat oferia algun benefici i per tant fou conservada. Recentment es crearen proteïnes artificalment a partir de regions intergèniques no codificants. (ca) الدنا غير المُشفِّر أو الدنا الخردة (بالإنجليزية: noncoding DNA) هي أجزاء من الدنا (DNA) لا تقوم بتشفير وإنتاج متسلسلات البروتين. بعض الدنا غير المشفر ينسخ إلى جزيئات رنا غير مشفرة ذات وظيفة (مثلًا، حمض نووي ريبوزي ناقل، حمض نووي ريبوزي ريبوسومي، والرنا التنظيمي). وتشمل الوظائف الأخرى للدنا غير المشفر، تنظيم نسخ و ترجمة التسلسلات المرمزة للبروتين. ومناطق التصاق الدعامة بالنواة، و أصل التضاعف و قطعة مركزية السنتومير. وتلك الأجزاء غير المشفرة توجد موزعة على الدنا وتحمل بينها الجينات على مسافات مختلفة. عندما اكتشفت في بادئ الأمر كان يعتقد أن ليس لأجزاء الدنا غير المشفرة وظيفة، ولكن البحث الحديث بين أن بعضها له وظيفة تنظيمية بالنسبة للجين الذي بجانبها. ويعكف العلماء على دراسة وظائفها، والنتائج تتراكم في هذا المجال الواسع.تتباين كثيرًا كمية الدنا غير المشفر بين الأنواع الحية، وغالبًا ما تكون نسبة صغيرة من الجينوم مسؤولة عن تشفير اصطناع البروتينات، ولكن توجد نسبة تتزايد معرفتها حاليًا أظهرت أن لها وظائف تنظيمية. وعندما وجد نسبة كبيرة من الحمض النووي غير المشفر، بدى قسم كبير منه دون وظيفة حيوية، كما تم توقع ذلك في ستينيات القرن العشرين، ومنذ ذلك الوقت، دعي ذلك القسم غير الوظيفي «الدنا الخردة».كشفت موسوعة عناصر الحمض النووى (ترميز) ENCODE عبر أساليب كيميائية حيوية مباشرة أن 80% من الجينوم البشري نشط بيوكيميائيًا.وقيل أن هذه النتيجة لم تكن مفاجأة بالضرورة لأن الأبحاث التي أجريت لعقود سابقة قد كشفت الكثير من المناطق الوظيفية وغير المشفرة من الحمض النووي، وانتقد بعض العلماء النتيجة لأنها خلطت بين النشاط الحيوي والوظيفة الحيوية. وتشير التقديرات لنسبة القسم الوظيفي حيويًا من الجينوم البشري اعتمادًا على علم الجينوم المقارن أنه بحدود 8 إلى 15%. لكن علماء آخرين قد جادلوا ضد الاعتماد فقط على علم الجينوم المقارن نظرًا لأن مجاله محدود، وقد وجد أن الدنا غير المشفر يشترك في نشاط الوراثة فوق الجينية epigenetic وفي شبكات من التفاعلات الوراثية المتداخلة، ويتم دراستها في بيولوجيا النماء التطوري. (ar) Nekódující DNA je DNA, která není přepisována v proteiny. Velmi často tvoří podstatný díl genomu eukaryot, např. u člověka až 97 %, naopak u bublinatky opomíjené tvoří jen necelá tři procenta. I když nekódující DNA nekóduje proteiny, řadí se do ní i geny pro nekódující RNA, které mají funkci v dekódování genetické informace a řadu regulačních funkcí. Některé úseky nekódující DNA se nepřekládají, ale mají regulační funkci, pro většinu oblastí nekódující DNA však funkce není známá, v takovém případě se často označuje jako junk DNA, z angličtiny „odpadní DNA“. Termín Junk DNA poprvé použil v roce 1972 . Nicméně platí, že sice často není funkce nekódující DNA známa, ale její odstranění z genomu má obvykle závažné negativní následky. Speciálními případy jsou nekódující DNA přímo uvnitř genů, nazývaná intron, bývalé geny, které však už jsou poškozené a nepřepisují se v RNA, které se označují jako pseudogeny, a repetitivní DNA.I když všechny organismy obsahují nekódující DNA, bakterie mají většinou kolem 2 % DNA nekódujícího geny, jejich DNA prakticky neobsahuje intergenovou nekódující DNA (introny) a jednotlivé geny jsou často přepisovány najednou ze shluku genů tzv. . (cs) Als nichtcodierende Desoxyribonukleinsäure (englisch noncoding DNA, ncDNA) werden diejenigen Teile der Desoxyribonukleinsäure (DNA) bezeichnet, die nicht — via Transkription in Messenger-RNA (mRNA) — für Proteine codieren.Auch für diese nichtcodierende DNA wurden vielfältige Funktionen gefunden.Einige nichtcodierende DNA wird in funktionelle nichtcodierende RNA umgeschrieben, beispielsweise in Transfer-RNA (tRNA), ribosomale RNA (rRNA) oder regulatorische RNA (RNAi) transkribiert; solche Anteile sind bei allen zellulären Organismen vorhanden. Zum „funktionslosen“ Anteil nichtcodierender DNA (en. junk DNA) gehören die sog. Pseudogene. Bei höheren Organismen (Eukaryonten) wie Menschen, Tieren und Pflanzen ist der ganz überwiegende Teil der DNA im genannten Sinne „nicht codierend“ bzw. funktionslos.Es ist unbekannt, wie groß der Anteil der nichtcodierenden DNA mit Funktion gegenüber dem funktionslosen Anteil ist. (de) Biologia molekularrean, DNA ez-kodetzailea proteinak kodetzen ez dituen DNA zatiari deritzo. DNA osoaren portzentaje handi bat DNA ez-kodetzailea da . DNA ez-kodetzailearen zati batek RNA ez-kodetzailea sortzen du transkribatzen denean (RNA-t, RNA erribosomikoa eta , esaterako). Beste zati handi batek gene-adierazpenaren erregulazioan parte hartzen du . XX. mendeko 60ko hamarkadan, DNA ez-kodetzailea aurkitu zutenean, zientzialariek uste zuten DNA horrek, proteinak sortzen ez dituenez, ez zuela ezertarako balio, eta "DNA zaborra" deitu zioten (junk DNA, ingelesez). Izendapenak arrakasta izan zuen, eta urte luzeetan DNA ez-kodetzailea eta DNA zaborra sinonimoak izan ziren. Ikerketak garatu ahala, ordea, ikusi zen proteinak sortu ez arren DNA ez-kodetzaileak funtsezko zeregina betetzen zuela geneen adierazpen edo espresioan, eta beraz bidegabea zela DNA zati horri "zaborra" deitzea, DNA ez-kodetzailearen zati handi bat funtzionala delako . DNA ez-kodetzailearen ehuneko zehatza ez da ezagutzen: zientzialari askok %98 dela baieztatzen duten bitartean , beste batzuek ehuneko hori nabarmen jaisten dute. Edozein kasutan, giza genomaren gehiena ez-kodetzailea da. Prokariotoetan, aldiz, alderantziz gertatzen da. Gizakian, esan bezala, DNA ez-kodetzailearen zati handi batek gene-adierazpenaren erregulazioan parte hartzen du. DNA zaborra, beraz, inongo funtziorik ez duen DNA ez-kodetzaileren zatia, hasiera batean uste zen baino askoz txikiagoa da, antza. (eu) Las secuencias de ADN no codificante son componentes del ácido desoxirribonucleico de un organismo que no codifican secuencias de proteínas. Parte del ADN no codificante se transcribe en moléculas de ARN no codificantes funcionales (por ejemplo, ARN de transferencia, ARN ribosómico y ARN regulador). Otras funciones del ADN no codificante incluyen: la regulación transcripcional y traduccional de secuencias codificantes de proteínas, las , los orígenes de replicación de ADN, los centrómeros y los telómeros. La cantidad de ADN no codificante varía mucho entre especies. A menudo, solo un pequeño porcentaje del genoma es responsable de codificar las proteínas, pero se muestra que un porcentaje creciente de ese ADN tiene funciones reguladoras. Cuando hay mucho ADN no codificante, una gran proporción de él parecería no tener función biológica, como se postuló en la década de 1960. Desde entonces, esta porción no funcional ha sido controvertidamente llamada "ADN basura". El proyecto internacional Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) descubrió, mediante enfoques bioquímicos directos, que al menos el 80% del ADN del genoma humano tiene actividad bioquímica. Aunque esto no fue inesperado debido a décadas anteriores de investigación que descubrieron muchas regiones no codificantes funcionales, algunos científicos criticaron la conclusión por combinar la actividad bioquímica con la función biológica. Las estimaciones para la fracción biológicamente funcional del genoma humano basadas en genómica comparativa oscilan entre 8 y 15%. Sin embargo, otros han argumentado en contra de confiar únicamente en estimaciones de genómica comparativa debido a su alcance limitado. Se ha descubierto que el ADN no codificante, está involucrado en la actividad epigenética y en redes complejas de interacciones genéticas y se está explorando en la biología evolutiva del desarrollo. (es) Non-coding DNA (ncDNA) sequences are components of an organism's DNA that do not encode protein sequences. Some non-coding DNA is transcribed into functional non-coding RNA molecules (e.g. transfer RNA, microRNA, piRNA, ribosomal RNA, and regulatory RNAs). Other functional regions of the non-coding DNA fraction include regulatory sequences that control gene expression; scaffold attachment regions; origins of DNA replication; centromeres; and telomeres. Some non-coding regions appear to be mostly nonfunctional such as introns, pseudogenes, intergenic DNA, and fragments of transposons and viruses. (en) L’ADN non codant, parfois appelé improprement ADN poubelle ou ADN satellite (junk DNA en anglais, terme inventé par le chercheur Susumu Ohno en 1972), désigne l’ensemble des séquences du génome qui ne sont pas traduites en protéines. Une proportion très importante de la plupart des génomes eucaryotes est composée de cette classe d’ADN dont les fonctions biologiques sont mal connues et qui a été en partie sous-estimée. L’ADN non codant peut se décomposer en différentes catégories. Certaines régions non codantes jouent un rôle dans la régulation de la transcription et la maturation des ARN ou dans l’organisation et la maintenance du génome. Certaines séquences sont transcrites en ARN mais ne sont pas traduites en protéines, et c’est l’ARN qui a un rôle fonctionnel dans la cellule. Certaines régions non codantes sont constituées de séquences répétées qui peuvent être issus d'éléments d'ADN mobiles, à réplication autonome à l'intérieur de la cellule. Enfin, certaines séquences n'ont probablement aucun rôle. La proportion de ces différentes catégories d'ADN varie d'une espèce à l'autre et la proportion d'ADN "non fonctionnel" dans les génomes est encore un sujet de débat. La plupart des différences dans les sites de restriction concernent des changements dans les séquences non codantes qui n'ont d'effet ni sur l'expression des gènes ni sur le phénotype. Les cartes de restriction sont indépendantes de l'expression des gènes. (fr) DNA nonpenyandi adalah urutan asam nukleat (sekuens DNA) yang tidak memberikan intruksi untuk melakukan sintesis protein. Pada manusia, terdapat 98% DNA nonpenyandi dari seluruh urutan genom yang dimiliki. DNA nonpenyandi berisi sekuens yang bertindak sebagai elemen pengatur, menentukan waktu, dan lokasi dimana gen akan dihidupkan atau dimatikan. DNA nonpenyandi juga berperan dalam memproduksi komponen RNA nonpenyandi antara lain : RNA transfer (tRNA), RNA ribosom (rRNA), microRNAs (miRNAs), dan long noncoding RNAs (lncRNAs). Selain itu, beberapa DNA nonpenyandi lain belum diketahui fungsinya. (in) Niet-coderend DNA (Engels: non-coding) bestaat uit componenten van DNA die geen eiwit coderen. (nl) 유전체학에서 비부호화 DNA(Noncoding DNA)는 코돈 단백질이 일정한 순서 없이 무작위로 구성되어 있는 상태의 DNA를 일컫는 용어이며, 주로 에 유전정보를 전사하거나 에 따라 단백질의 부호 순서 및 , , 를 번역하는 역할을 담당한다. (ko) In biologia molecolare si definisce DNA non codificante (noncoding DNA) ogni sequenza di DNA in un genoma che non porta informazioni per proteine, quindi che non verrà tradotto. Tali sequenze possiedono varie funzioni (es. vengono trascritte in rRNA, tRNA, ecc.). In passato, ignorata la funzione, era identificato come DNA spazzatura (junk DNA). (it) As sequências de ADN não codificante são componentes do ácido desoxirribonucleico de um organismo que não codificam sequências de proteínas. Parte do ADN não codificante é transcrito em moléculas de ARN não codificante funcionais (por exemplo, ARN transportador, ARN ribossomal e ARN interferente). Outras funções do ADN não codificante incluem: regulação transcricional e translacional de sequências codificantes de proteínas, regiões de ligação em andaime, origens de replicação de ADN, centrômeros e telômeros. A quantidade de ADN não codificante varia muito entre as espécies. Frequentemente, apenas uma pequena porcentagem do genoma é responsável pela codificação de proteínas, mas uma porcentagem significativa possui funções regulatórias. Quando há muito ADN não codificador, uma grande proporção parece não ter função biológica, como previsto na década de 1960. Desde então, essa porção não funcional foi controversamente chamada de "ADN lixo". (pt) Inom genetiken är icke-kodande DNA områden på en organisms DNA-sekvens som inte kodar för proteingenererande mRNA-transkript. Icke-kodande DNA utgör ett brett område av DNA-kod som antingen påverkar DNA-kedjans struktur, eller uttrycket av olika gener genom att producera reglerande RNA-transkript. Ribosomalt DNA och tRNA-kod hör även de till icke-kodande DNA. Mycket av de icke-kodande DNA-sekvensernas funktion är dock ännu inte klarlagd men teorin är att dessa områden ger evolutionära fördelar genom att gynna mutationsfrekvensen av användbara gener, samt bidra till mer komplex genreglering. (sv) Некодуюча ДНК — ділянки ДНК, послідовність яких не переводиться безпосередньо в амінокислотну послідовність білків. Частина некодуючої ДНК переводиться у рибонуклеотидну послідовність некодуючої РНК, але є ділянки ДНК функції яких ще не з'ясовані або відсутні. Значний відсоток розміру геному (C-значення) більшості еукаріотів складається з некодуючої ДНК (це явище інколи називається «загадкою C-значення»). Частина некодуючої ДНК безпосередньо задіяна в регулювання активності кодуючих ділянок. Проте, функції більшої частини некодуючої ДНК невідомі, через що її раніше називали «сміттєвою ДНК» (англ. junk DNA). Однак дані останнього ENCODE проекту 2012 року свідчать про те, що більшість геному (80.4 %) бере участь у РНК-хроматин взаємодіях, тоді як 95 % ДНК послідовності лежить на відстані 8 тис. пар основ від ДНК-білкової взаємодії, а 99 % геному лежить на відстані 1,7 тисяч пар основ від принаймні однієї біохімічної взаємодії, що зафіксована ENCODE (така відстань вважається відносно недовгою, для порівняння розмір ділянки гену ACTB людини, що кодує невеликий білок бета актин — 3,45 тис. пар основ, гену TBP людини — 18,54 тис. пар основ). В зв'язку з такими даними в науковій літературі дедалі менше зустрічається термін «сміттєва ДНК». Мутації некодуючої ДНК у деяких випадках викликають ефект, порівнянний з мутаціями важливих генів. (uk) 非編碼DNA（non-coding DNA，ncDNA）谑称“垃圾DNA”，是指不包含製造蛋白質的指令，或是只能製造出無轉譯能力RNA的DNA序列。此類DNA在真核生物的基因組中佔有大多數。有很长的一段时间科学家认为非编码DNA没有作用，因此这些重复的DNA片段曾被冠以「垃圾DNA」的称号。随着时间的推移，科学家对垃圾DNA的认识逐渐深入，慢慢地发现很多垃圾DNA有其独特的作用，它们在基因剪切等方面起重要的作用。 近年的證據顯示，非編碼DNA可被編碼DNA製造出來的蛋白質利用。一項實驗發現某些非編碼DNA與編碼DNA同樣重要，因為當植物體內某一段非編碼DNA遭受損傷時，會使葉片結構發生顯著改變，原因在於某些與葉片結構有關的蛋白質，需要來自非編碼DNA片段（內含子）的訊息；還有一些非編碼DNA是可以控制基因何時何地表現的基因開關。 此外，有些非編碼DNA，可能是一些RNA病毒感染後所遺留下來的痕跡。 (zh) Некодирующая ДНК, или Мусорская ДНК (англ. Non-coding DNA англ. junk DNA) — части геномной ДНК организмов, которые не кодируют последовательности белков. Некоторые некодирующие ДНК переводятся в функциональные некодирующие РНК-молекулы. Другие функции некодирующей ДНК включают регуляцию последовательностей, кодирующих белки, центромер и теломер.Термин «мусорная ДНК» стал популярным в 1960-х. В соответствии с , геномным биологом, первое явное обсуждение природы «мусорной» ДНК было сделано David Comings в 1972 году и он применил этот термин ко всем некодирующим ДНК. Термин был формализован Сусуму Оно в 1972 году, который заметил, что генетический груз нейтральных мутаций находится на верхнем пределе значений для функционирующих локусов, которые могли быть ожидаемыми исходя из типичной частоты мутаций. Сусуму предсказал, что геномы млекопитающих не могут содержать более чем 30 000 локусов из-за давления естественного отбора, так как «стоимость» мутационной нагрузки вызвала бы неизбежное снижение приспособленности, и в конечном счете вымирание. Этот прогноз остается верным, геном человека содержит приблизительно 20 000 генов. Другим подтверждением теории Оно служит наблюдение, что даже близкородственные виды могут иметь очень разные (отличающиеся на порядок) по размеру геномы, которое окрестили C-парадокс (избыточность генома) в 1971 году. Хотя плодотворность термина «мусорная ДНК» была поставлена под сомнение на том основании, что он вызывает, априори, предположение о полном отсутствии функций, и хотя рекомендовано использовать более нейтральный термин, такой как «некодирующая ДНК»; термин «мусорная ДНК» остается наименованием для той части геномной последовательности, для которой не обнаружено значимой и в которой при не выявляются консервативные элементы служащие признаком того, что она может обеспечивать адаптивное преимущество. В конце 70-х стало очевидным, что большая часть некодирующей ДНК в больших геномах берут свое начало от размножающихся подвижных элементов, которые и Carmen Sapienza в 1980 описали в журнале Nature: «Показано, что если данная ДНК или класс ДНК, с недоказанным фенотипическим проявлением выработала стратегию (такую как транспозиция), которая обеспечивает её выживание в геноме, то никакое другое объяснение её существования не требуется.» Можно ожидать, что количество мусорной ДНК будет зависеть от скорости амплификации этих элементов и скорости потери нефункциональной ДНК. В том же номере Nature, Орджел, Лесли Илизер и Крик, Фрэнсис написали, что мусорная ДНК имеет «небольшую специфичность и мало или вовсе не обладает селективным преимуществом для организма». Этот термин встречается, в основном, в научно-популярной литературе и в разговорном стиле в научных публикациях, и было высказано предположение, что его коннотации могут сдерживать интерес к установлению биологических функций некодирующей ДНК. Несколько линий доказательств показывают, что некоторые последовательности «мусорной ДНК», скорее всего, должны иметь неизвестную нам функциональную активность и что процесс экзаптации фрагментов первоначально эгоистичной или нефункциональной ДНК было обычным явлением на протяжении всей эволюции. В 2012, проект ENCODE, являющийся исследовательской программой, поддерживаемой , сообщил, что 76 % некодирующей ДНК генома человека подвержено транскрипции и что около половины генома каким-то образом связывает регуляторные белки, такие как факторы транскрипции. Ранее считалось, что около 95 % последовательностей ДНК генома человека можно отнести к мусорной ДНК. Такие последовательности включают в себя последовательности интронов и участки ДНК между генами, а также повторенные участки. Однако в 2012 году в публикациях проекта «Энциклопедия элементов ДНК» (ENCODE) было показано, что доля мусорной ДНК сильно завышена, и до 80 % генома имеет биохимические функции. Хотя, сообщение ENCODE о том, что свыше 80 % генома человека биохимически функционально, подвергнуто критике другими учеными, которые утверждают, что ни доступность последовательностей генома для факторов транскрипции, ни их транскрипция не гарантирует, что эти последовательности имеют биохимическую функцию и что их транскрипция дает селективное преимущество. Более того, значительно более низкие оценки функциональности до ENCODE были основаны на оценках консервативности генома млекопитающих. В ответ на такую точку зрения, другие исследователи утверждают, что широко распространённые транскрипция и сплайсинг, которые наблюдаются в геноме человека непосредственно при биохимических анализах, являются более точными показателями генетической функции, чем консервативность генома, потому что оценка консервативности относительна из-за невероятных различий в размерах генома даже среди близкородственных видов. Оценка консервативности может быть использована для облегчения поиска функциональных элементов генома, но не для отсева или сохранения при оценке общего количества функциональных элементов которые могли бы находится в геноме, поскольку элементы которые что-то делают на молекулярном уровне могут быть пропущены методами сравнительной геномики. Более того, большая часть известной мусорной ДНК участвует в эпигенетической регуляции, по-видимому, необходима для развития сложных организмов. В статье 2014 года, ENCODE исследователи попытались ответить на «вопрос о том, действительно ли неконсервативные, но биохимически активные области действительно функциональны». Они заметили, что в литературе, функциональные части генома были определены по-разному в предыдущих исследованиях в зависимости от используемых подходов. Существует три общих подхода, используемых для идентификации функциональных частей генома человека: генетические методы (основанные на изменении фенотипа), эволюционные подходы (основанные на консервативности) и биохимические методы (основанные на биохимических исследованиях и использующиеся ENCODE). Все три метода имеют свои ограничения: генетические методы могут терять функциональные элементы которые физически не проявляются в организме, эволюционные подходы испытывают трудности с использованием точных множественных выравниваний последовательностей, поскольку геномы, даже близко родственных видов значительно отличаются, а биохимические исследования, хотя и обладают высокой воспроизводимостью, но биохимический сигнал не всегда автоматически означает функциональность. Они заметили, что 70 % транскрибирующихся последовательностей имело менее 1 транскрипта на клетку. Они отметили что это «является сложной задачей выбора между тем, чем является воспроизводимый, но низкий уровень биохимического сигнала, присущей большей доли генома с малой эволюционной консервативностью, специфической функцией или биологическим шумом». Кроме того, разрешающая способность анализа часто намного больше, чем лежащие в его основе функциональные составляющие поэтому некоторые из воспроизводимых «биохимически активных но селективно нейтральных» последовательностей вряд ли выполняют значимые функции, особенно те, у которых низкий уровень биохимического сигнала. К этому они добавили, «Однако мы также признаем существенные ограничения в нашем текущем определении границ, учитывая, что некоторые специфические для человека функции являются важными, но не консервативными и что регионы, имеющие отношение к заболеваниям не обязательно должны быть выборочно отсеяны, чтобы быть функциональными.» С другой стороны, они утверждали что 12-15 % чаcть функционально ограниченной ДНК человека, по оценке различных экстраполяционных эволюционных методов, все ещё может быть недооцененной. Они пришли к выводу, что в отличие от эволюционных и генетических данных биохимические данные дают представление как о молекулярной функции, которую обслуживают лежащие в основе элементы ДНК, так как и типы клеток, в которых они действуют. В конечном счете генетические, эволюционные и биохимические подходы могут быть использованы как дополняющие друг друга для выявления областей, которые могут функционировать в биологии и болезнях человека. Некоторые критики утверждают, что функциональность может быть оценена только в отношении соответствующей нулевой гипотезы. В этом случае, нулевая гипотеза будет заключаться в том, что эти части генома нефункциональны и обладают свойствами, будь то на основе их консервативности или биохимической активности, которые ожидались бы от них на основе нашего общего понимания молекулярной эволюции и биохимии. Согласно этим критикам, до тех пор, пока не будет показано, что область, о которой идет речь, имеет дополнительные функции, помимо ожидаемой при нулевой гипотезе, её условно следует обозначать как нефункциональную. Единой концепции эволюционной роли и возникновения «мусорной» ДНК пока нет, однако существует мнение о том, что некодирующая ДНК эукариот представляет собой остатки некодирующих последовательностей ДНК, возникших при становлении жизни. Прокариоты были вынуждены сократить размер своих геномов для того, чтобы уменьшить количество ДНК, в которой могут происходить мутации, в то время как эукариоты «пошли по пути» диплоидности и регулярного полового процесса. (ru) |
| dbo:thumbnail | wiki-commons:Special:FilePath/Pre-mRNA.svg?width=300 |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://www.zbi.ee/fungal-genomesize/index.php https://web.archive.org/web/20050901105257/http:/www.rbgkew.org.uk/cval/homepage.html http://www.nature.com/encode/%23/threads https://books.google.com/books%3Fid=8HtPZP9VSiMC&pg=PA89 |
| dbo:wikiPageID | 44284 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 55397 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1122639008 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Pseudogenes dbr:Royal_Botanic_Gardens,_Kew dbr:Endogenous_retrovirus dbr:Enhancer_(genetics) dbr:MicroRNA dbr:Onion_Test dbr:Biochemistry dbr:Bladderwort dbr:DNA dbr:DNA-binding_protein dbr:DNA_profiling dbr:DNA_replication dbr:Viruses dbr:Intergenic_region dbr:Intragenomic_conflict dbr:Alu_sequence dbr:RNA_interference dbr:Null_hypothesis dbr:Pseudogene dbc:DNA dbr:Gene-centered_view_of_evolution dbr:Gene_desert dbr:Gene_regulatory_network dbr:Genetic_code dbr:Genome_size dbr:Natural_selection dbr:Nature_(journal) dbr:Origin_of_replication dbr:Transfer_RNA dbr:Takifugu dbr:RNA_splicing dbr:Gene dbr:Conserved_non-coding_sequence dbr:Leslie_Orgel dbr:Comparative_genomics dbr:Susumu_Ohno dbr:Tandem_repeat dbr:Transposable_element dbr:Transposon dbr:Small_nuclear_RNA dbr:Phylogenetic_footprinting dbr:Transcription_(genetics) dbr:G-value_paradox dbr:Linkage_disequilibrium dbr:Locus_(genetics) dbr:Utricularia_gibba dbr:Paleopolyploidy dbc:Gene_expression dbr:ENCODE dbr:Estonian_Institute_of_Zoology_and_Botany dbr:Ford_Doolittle dbr:Francis_Crick dbr:Centromere dbr:Chromosome dbr:Germ_cell dbr:Epigenetic dbr:Transcription_factor dbr:Protein dbr:Pufferfish dbr:Repeated_sequence_(DNA) dbr:Introns dbr:Telomere dbr:Small_nucleolar_RNA dbr:Selfish_DNA dbr:Regulatory_sequence dbr:C-value dbr:Popular_science dbc:Non-coding_DNA dbr:Cis-regulatory_element dbr:Human_genome dbr:RNA_polymerase dbr:Genome-wide_association_studies dbr:Long_non-coding_RNA dbr:Mobile_genetic_elements dbr:Microsatellite dbr:Satellite_DNA dbr:Scaffold/matrix_attachment_region dbr:Nearly_neutral_theory_of_molecular_evolution dbr:Eukaryotic_chromosome_fine_structure dbr:Retrotransposon dbr:Small_interfering_RNA dbr:Piwi-interacting_RNA dbr:Evolutionary_developmental_biology dbr:Molecular_evolution dbr:Polychaos_dubium dbr:Non-coding_RNA dbr:Retrovirus dbr:Ribosomal_RNA dbr:Transcriptome dbr:Reverse_transcription dbr:Promoter_(biology) dbr:Scaffold_attachment_region dbr:Transposons dbr:Mutational_load dbr:Single-nucleotide_polymorphisms dbr:Intergenic_DNA dbr:Biological_function dbr:File:Pre-mRNA.svg dbr:Precursor_RNA dbr:File:Bacterial_mobile_elements.svg |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Authority_control dbt:Citation_needed dbt:Cite_book dbt:Cite_journal dbt:Further dbt:Main dbt:Refbegin dbt:Refend dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Self-replicating_organic_structures |
| dct:subject | dbc:DNA dbc:Gene_expression dbc:Non-coding_DNA |
| rdf:type | owl:Thing |
| rdfs:comment | Non-coding DNA (ncDNA) sequences are components of an organism's DNA that do not encode protein sequences. Some non-coding DNA is transcribed into functional non-coding RNA molecules (e.g. transfer RNA, microRNA, piRNA, ribosomal RNA, and regulatory RNAs). Other functional regions of the non-coding DNA fraction include regulatory sequences that control gene expression; scaffold attachment regions; origins of DNA replication; centromeres; and telomeres. Some non-coding regions appear to be mostly nonfunctional such as introns, pseudogenes, intergenic DNA, and fragments of transposons and viruses. (en) DNA nonpenyandi adalah urutan asam nukleat (sekuens DNA) yang tidak memberikan intruksi untuk melakukan sintesis protein. Pada manusia, terdapat 98% DNA nonpenyandi dari seluruh urutan genom yang dimiliki. DNA nonpenyandi berisi sekuens yang bertindak sebagai elemen pengatur, menentukan waktu, dan lokasi dimana gen akan dihidupkan atau dimatikan. DNA nonpenyandi juga berperan dalam memproduksi komponen RNA nonpenyandi antara lain : RNA transfer (tRNA), RNA ribosom (rRNA), microRNAs (miRNAs), dan long noncoding RNAs (lncRNAs). Selain itu, beberapa DNA nonpenyandi lain belum diketahui fungsinya. (in) Niet-coderend DNA (Engels: non-coding) bestaat uit componenten van DNA die geen eiwit coderen. (nl) 유전체학에서 비부호화 DNA(Noncoding DNA)는 코돈 단백질이 일정한 순서 없이 무작위로 구성되어 있는 상태의 DNA를 일컫는 용어이며, 주로 에 유전정보를 전사하거나 에 따라 단백질의 부호 순서 및 , , 를 번역하는 역할을 담당한다. (ko) In biologia molecolare si definisce DNA non codificante (noncoding DNA) ogni sequenza di DNA in un genoma che non porta informazioni per proteine, quindi che non verrà tradotto. Tali sequenze possiedono varie funzioni (es. vengono trascritte in rRNA, tRNA, ecc.). In passato, ignorata la funzione, era identificato come DNA spazzatura (junk DNA). (it) Inom genetiken är icke-kodande DNA områden på en organisms DNA-sekvens som inte kodar för proteingenererande mRNA-transkript. Icke-kodande DNA utgör ett brett område av DNA-kod som antingen påverkar DNA-kedjans struktur, eller uttrycket av olika gener genom att producera reglerande RNA-transkript. Ribosomalt DNA och tRNA-kod hör även de till icke-kodande DNA. Mycket av de icke-kodande DNA-sekvensernas funktion är dock ännu inte klarlagd men teorin är att dessa områden ger evolutionära fördelar genom att gynna mutationsfrekvensen av användbara gener, samt bidra till mer komplex genreglering. (sv) 非編碼DNA（non-coding DNA，ncDNA）谑称“垃圾DNA”，是指不包含製造蛋白質的指令，或是只能製造出無轉譯能力RNA的DNA序列。此類DNA在真核生物的基因組中佔有大多數。有很长的一段时间科学家认为非编码DNA没有作用，因此这些重复的DNA片段曾被冠以「垃圾DNA」的称号。随着时间的推移，科学家对垃圾DNA的认识逐渐深入，慢慢地发现很多垃圾DNA有其独特的作用，它们在基因剪切等方面起重要的作用。 近年的證據顯示，非編碼DNA可被編碼DNA製造出來的蛋白質利用。一項實驗發現某些非編碼DNA與編碼DNA同樣重要，因為當植物體內某一段非編碼DNA遭受損傷時，會使葉片結構發生顯著改變，原因在於某些與葉片結構有關的蛋白質，需要來自非編碼DNA片段（內含子）的訊息；還有一些非編碼DNA是可以控制基因何時何地表現的基因開關。 此外，有些非編碼DNA，可能是一些RNA病毒感染後所遺留下來的痕跡。 (zh) الدنا غير المُشفِّر أو الدنا الخردة (بالإنجليزية: noncoding DNA) هي أجزاء من الدنا (DNA) لا تقوم بتشفير وإنتاج متسلسلات البروتين. بعض الدنا غير المشفر ينسخ إلى جزيئات رنا غير مشفرة ذات وظيفة (مثلًا، حمض نووي ريبوزي ناقل، حمض نووي ريبوزي ريبوسومي، والرنا التنظيمي). وتشمل الوظائف الأخرى للدنا غير المشفر، تنظيم نسخ و ترجمة التسلسلات المرمزة للبروتين. ومناطق التصاق الدعامة بالنواة، و أصل التضاعف و قطعة مركزية السنتومير. وتلك الأجزاء غير المشفرة توجد موزعة على الدنا وتحمل بينها الجينات على مسافات مختلفة. عندما اكتشفت في بادئ الأمر كان يعتقد أن ليس لأجزاء الدنا غير المشفرة وظيفة، ولكن البحث الحديث بين أن بعضها له وظيفة تنظيمية بالنسبة للجين الذي بجانبها. ويعكف العلماء على دراسة وظائفها، والنتائج تتراكم في هذا المجال الواسع.تتباين كثيرًا كمية الدنا غير المشفر بين الأنواع الحية، وغالبًا ما تكون ن (ar) En genètica, l'ADN no codificant és l'ADN que no conté instruccions per fabricar proteïnes. En els eucariotes, un percentatge elevat de la de molts organismes és ADN no codificant (un enigma conegut com a ""). Una part de l'ADN no codificant està implicat en la regulació de les regions codificants. Tanmateix, la majoria d'aquest ADN no té cap funció coneguda i a vegades hom s'hi refereix com a "ADN escombraries". Una part de l'ADN no codificant pot ser una relíquia històrica no fenotípica d'un virus ARN, que per casualitat oferia algun benefici i per tant fou conservada. (ca) Nekódující DNA je DNA, která není přepisována v proteiny. Velmi často tvoří podstatný díl genomu eukaryot, např. u člověka až 97 %, naopak u bublinatky opomíjené tvoří jen necelá tři procenta. I když nekódující DNA nekóduje proteiny, řadí se do ní i geny pro nekódující RNA, které mají funkci v dekódování genetické informace a řadu regulačních funkcí. Některé úseky nekódující DNA se nepřekládají, ale mají regulační funkci, pro většinu oblastí nekódující DNA však funkce není známá, v takovém případě se často označuje jako junk DNA, z angličtiny „odpadní DNA“. Termín Junk DNA poprvé použil v roce 1972 . Nicméně platí, že sice často není funkce nekódující DNA známa, ale její odstranění z genomu má obvykle závažné negativní následky. (cs) Als nichtcodierende Desoxyribonukleinsäure (englisch noncoding DNA, ncDNA) werden diejenigen Teile der Desoxyribonukleinsäure (DNA) bezeichnet, die nicht — via Transkription in Messenger-RNA (mRNA) — für Proteine codieren.Auch für diese nichtcodierende DNA wurden vielfältige Funktionen gefunden.Einige nichtcodierende DNA wird in funktionelle nichtcodierende RNA umgeschrieben, beispielsweise in Transfer-RNA (tRNA), ribosomale RNA (rRNA) oder regulatorische RNA (RNAi) transkribiert; solche Anteile sind bei allen zellulären Organismen vorhanden. Zum „funktionslosen“ Anteil nichtcodierender DNA (en. junk DNA) gehören die sog. Pseudogene. Bei höheren Organismen (Eukaryonten) wie Menschen, Tieren und Pflanzen ist der ganz überwiegende Teil der DNA im genannten Sinne „nicht codierend“ bzw. funkti (de) Biologia molekularrean, DNA ez-kodetzailea proteinak kodetzen ez dituen DNA zatiari deritzo. DNA osoaren portzentaje handi bat DNA ez-kodetzailea da . DNA ez-kodetzailearen zati batek RNA ez-kodetzailea sortzen du transkribatzen denean (RNA-t, RNA erribosomikoa eta , esaterako). Beste zati handi batek gene-adierazpenaren erregulazioan parte hartzen du . Gizakian, esan bezala, DNA ez-kodetzailearen zati handi batek gene-adierazpenaren erregulazioan parte hartzen du. DNA zaborra, beraz, inongo funtziorik ez duen DNA ez-kodetzaileren zatia, hasiera batean uste zen baino askoz txikiagoa da, antza. (eu) L’ADN non codant, parfois appelé improprement ADN poubelle ou ADN satellite (junk DNA en anglais, terme inventé par le chercheur Susumu Ohno en 1972), désigne l’ensemble des séquences du génome qui ne sont pas traduites en protéines. Une proportion très importante de la plupart des génomes eucaryotes est composée de cette classe d’ADN dont les fonctions biologiques sont mal connues et qui a été en partie sous-estimée. La proportion de ces différentes catégories d'ADN varie d'une espèce à l'autre et la proportion d'ADN "non fonctionnel" dans les génomes est encore un sujet de débat. (fr) Las secuencias de ADN no codificante son componentes del ácido desoxirribonucleico de un organismo que no codifican secuencias de proteínas. Parte del ADN no codificante se transcribe en moléculas de ARN no codificantes funcionales (por ejemplo, ARN de transferencia, ARN ribosómico y ARN regulador). Otras funciones del ADN no codificante incluyen: la regulación transcripcional y traduccional de secuencias codificantes de proteínas, las , los orígenes de replicación de ADN, los centrómeros y los telómeros. (es) As sequências de ADN não codificante são componentes do ácido desoxirribonucleico de um organismo que não codificam sequências de proteínas. Parte do ADN não codificante é transcrito em moléculas de ARN não codificante funcionais (por exemplo, ARN transportador, ARN ribossomal e ARN interferente). Outras funções do ADN não codificante incluem: regulação transcricional e translacional de sequências codificantes de proteínas, regiões de ligação em andaime, origens de replicação de ADN, centrômeros e telômeros. (pt) Некодирующая ДНК, или Мусорская ДНК (англ. Non-coding DNA англ. junk DNA) — части геномной ДНК организмов, которые не кодируют последовательности белков. Некоторые некодирующие ДНК переводятся в функциональные некодирующие РНК-молекулы. Другие функции некодирующей ДНК включают регуляцию последовательностей, кодирующих белки, центромер и теломер.Термин «мусорная ДНК» стал популярным в 1960-х. В соответствии с , геномным биологом, первое явное обсуждение природы «мусорной» ДНК было сделано David Comings в 1972 году и он применил этот термин ко всем некодирующим ДНК. Термин был формализован Сусуму Оно в 1972 году, который заметил, что генетический груз нейтральных мутаций находится на верхнем пределе значений для функционирующих локусов, которые могли быть ожидаемыми исходя из типичной частот (ru) Некодуюча ДНК — ділянки ДНК, послідовність яких не переводиться безпосередньо в амінокислотну послідовність білків. Частина некодуючої ДНК переводиться у рибонуклеотидну послідовність некодуючої РНК, але є ділянки ДНК функції яких ще не з'ясовані або відсутні. (uk) |
| rdfs:label | Non-coding DNA (en) دي أن إيه غير مشفر (ar) ADN no codificant (ca) Nekódující DNA (cs) Nichtcodierende Desoxyribonukleinsäure (de) DNA ez-kodetzaile (eu) ADN no codificante (es) DNA nonpenyandi (in) ADN non codant (fr) DNA non codificante (it) 비부호화 DNA (ko) Niet-coderend DNA (nl) ADN não codificante (pt) Мусорная ДНК (ru) Icke-kodande DNA (sv) Некодуюча ДНК (uk) 非編碼DNA (zh) |
| owl:sameAs | wikidata:Non-coding DNA dbpedia-ar:Non-coding DNA http://bs.dbpedia.org/resource/Nekodirajuća_DNK dbpedia-ca:Non-coding DNA dbpedia-cs:Non-coding DNA dbpedia-da:Non-coding DNA dbpedia-de:Non-coding DNA dbpedia-es:Non-coding DNA dbpedia-et:Non-coding DNA dbpedia-eu:Non-coding DNA dbpedia-fa:Non-coding DNA dbpedia-fi:Non-coding DNA dbpedia-fr:Non-coding DNA dbpedia-gl:Non-coding DNA dbpedia-he:Non-coding DNA dbpedia-id:Non-coding DNA dbpedia-it:Non-coding DNA dbpedia-ko:Non-coding DNA dbpedia-nl:Non-coding DNA dbpedia-no:Non-coding DNA dbpedia-pt:Non-coding DNA dbpedia-ru:Non-coding DNA dbpedia-sh:Non-coding DNA dbpedia-simple:Non-coding DNA dbpedia-sk:Non-coding DNA dbpedia-sr:Non-coding DNA dbpedia-sv:Non-coding DNA http://tl.dbpedia.org/resource/Hindi_nagkokodigong_DNA dbpedia-tr:Non-coding DNA dbpedia-uk:Non-coding DNA dbpedia-zh:Non-coding DNA https://global.dbpedia.org/id/TZ2D |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Non-coding_DNA?oldid=1122639008&ns=0 |
| foaf:depiction | wiki-commons:Special:FilePath/Bacterial_mobile_elements.svg wiki-commons:Special:FilePath/Pre-mRNA.svg |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Non-coding_DNA |
| is dbo:knownFor of | dbr:John_Mattick |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Non-coding_dna dbr:Non-coding_region dbr:Non-coding_sequence dbr:Non_coding_DNA dbr:Non_coding_dna dbr:Noncoding_region dbr:Junk_DNA dbr:NcDNA dbr:Non-coding dbr:Noncoding dbr:Noncoding_DNA dbr:Genetic_regulatory_elements |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Endless_Forms_Most_Beautiful_(book) dbr:Mutation dbr:Neotenic_complex_syndrome dbr:Onion_Test dbr:Non-coding_dna dbr:Non-coding_region dbr:Non-coding_sequence dbr:Non_coding_DNA dbr:Non_coding_dna dbr:Noncoding_region dbr:Belgica_antarctica dbr:Biology dbr:Aquifex dbr:Hominini dbr:List_of_University_of_Sydney_people dbr:DNA dbr:Ultramicrobacteria dbr:De_novo_gene_birth dbr:Index_of_genetics_articles dbr:Index_of_molecular_biology_articles dbr:Intergenic_region dbr:Pinus_lambertiana dbr:List_of_omics_topics_in_biology dbr:Genome dbr:Genome_size dbr:Genome_survey_sequence dbr:Overlapping_gene dbr:Organization_and_expression_of_immunoglobulin_genes dbr:Edward_Trifonov dbr:GENCODE dbr:Glossary_of_genetics dbr:Glossary_of_genetics_(M−Z) dbr:Molecular_clock dbr:Müllerian_mimicry dbr:Convergent_evolution dbr:Lagunaria dbr:Origin_of_transfer dbr:Ant dbr:Life dbr:Phene dbr:Spacer_DNA dbr:Marlene_Belfort dbr:Phylogenetic_footprinting dbr:B_chromosome dbr:Adaptive_evolution_in_the_human_genome dbr:Through_the_Wormhole dbr:Thylacine dbr:G-value_paradox dbr:GC-content dbr:Hawaiian_Drosophila dbr:Joanna_Masel dbr:K-mer dbr:Large_tumor_antigen dbr:Linear_chromosome dbr:Utricularia_gibba dbr:Drosophila dbr:Exome dbr:Palmitoylethanolamide dbr:Chromosome_jumping dbr:Karenia_(dinoflagellate) dbr:Kelly_A._Frazer dbr:MtDNA_control_region dbr:List_of_Monash_University_people dbr:Isoetes dbr:John_Mattick dbr:Junk_DNA dbr:Biological_dark_matter dbr:Coding_region dbr:BCKDHB dbr:C-value dbr:Cis-regulatory_element dbr:Human_genome dbr:Klaus_Scherrer dbr:NcDNA dbr:Neanderthal dbr:Ceramide_kinase dbr:Satellite_DNA dbr:Short_interspersed_nuclear_element dbr:Selfish_genetic_element dbr:Zieria dbr:Non-coding dbr:Noncoding dbr:Noncoding_DNA dbr:Evolution_of_biological_complexity dbr:Evolution_of_the_brain dbr:Evolvability dbr:Nanoarchaeum_equitans dbr:Molecular_evolution dbr:Multiomics dbr:Polyomaviridae dbr:Semantide dbr:LMO2 dbr:Personalized_onco-genomics dbr:Retrozyme dbr:Outline_of_genetics dbr:Viral_pathogenesis dbr:Genetic_regulatory_elements |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Non-coding_DNA |
