Tandem repeat (original) (raw)
En bio-informatique, une répétition en tandem est une suite de plusieurs motifs de nucléotides, adjacents dans une séquence d'ADN et qui se répètent à l'identique. Par exemple : ATTCGATTCGATTCG contient trois répétitions en tandem du motif de cinq nucléotides ATTCG. Les répétitions en tandem sont fréquentes dans les génomes des eucaryotes supérieurs et constituent en particulier ce qu'on appelle les séquences satellites, minisatellites et microsatellites. Elles représentent environ 10 à 15% de la composition totale du génome humain.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | Las repeticiones en tándem son secuencias de ADN que se producen cuando se repite un patrón de uno o más nucleótidos y las repeticiones son directamente adyacentes entre sí. Varios dominios de proteínas también forman repeticiones en tándem dentro de su estructura primaria de aminoácidos, como las repeticiones que se dan en el genoma del armadillo. Sin embargo, en las proteínas, las repeticiones en tándem perfectas son poco probables en la mayoría de las proteínas in vivo y las repeticiones más conocidas se encuentran en proteínas que han sido diseñadas. Un ejemplo sería: ATTCG ATTCG ATTCG en el cual la secuencia ATTCG se repite tres veces. (es) En bio-informatique, une répétition en tandem est une suite de plusieurs motifs de nucléotides, adjacents dans une séquence d'ADN et qui se répètent à l'identique. Par exemple : ATTCGATTCGATTCG contient trois répétitions en tandem du motif de cinq nucléotides ATTCG. Les répétitions en tandem sont fréquentes dans les génomes des eucaryotes supérieurs et constituent en particulier ce qu'on appelle les séquences satellites, minisatellites et microsatellites. Elles représentent environ 10 à 15% de la composition totale du génome humain. (fr) Tandem repeats occur in DNA when a pattern of one or more nucleotides is repeated and the repetitions are directly adjacent to each other. Several protein domains also form tandem repeats within their amino acid primary structure, such as armadillo repeats. However, in proteins, perfect tandem repeats are unlikely in most in vivo proteins, and most known repeats are in proteins which have been designed. An example would be: ATTCG ATTCG ATTCG in which the sequence ATTCG is repeated three times. (en) In genetica e biologia molecolare si definiscono ripetizioni in tandem tutte le regioni di DNA costituite da sequenze di due o più nucleotidi ripetute una di seguito all'altra. (it) Тандемные повторы — последовательности повторяющихся фрагментов ДНК. В зависимости от размера подразделяются на три класса: сателлитная ДНК, минисателлиты и микросателлиты. (ru) Тандемні повтори — послідовності повторюваних ділянок ДНК. Залежно від розміру, вони поділяються на три підкласи: сателіти, мінісателіти і мікросателіти. Назва «сателіти» походить від спектру оптичної щільності при розділенні ДНК у градієнті щільності розчинника, що вказує на відмінності відносного середнього вмісту різних нуклеотидів у тандемних повторах у порівнянні з рештою ДНК. Найбільша кількість повторів зустрічається у Eucalyptus grandis. (uk) 串联重复（英語：Tandem repeats）是指DNA中的一个或多个核苷酸前后相连接的重复。 一个例子： ATTCGATTCGATTCG 其中的ATTCG在这里重复了三次。 几种蛋白质结构域也是由串联重复的氨基酸序列产生，如。但很少有串联重复出现在体内的蛋白质中，多数为人工设计的蛋白。 (zh) |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://victoria.biengi.ac.ru/cgi-bin/indelper/index.cgi/ https://dali.crbm.cnrs.fr/index.php%3Froute=tools&tool=2 http://www.rvc.ac.uk/review/DNA_1/4_VNTRs.cfm http://tandem.bu.edu/cgi-bin/trdb/trdb.exe https://www.vital-it.ch/software/tral http://victoria.biengi.ac.ru/splinter/login.php https://web.archive.org/web/20080905145716/http:/tandem.sci.brooklyn.cuny.edu/Tandem/ https://web.archive.org/web/20140606101328/http:/ugene.unipro.ru/documentation/manual/plugins/repeat_finder.html%23tandem-repeats http://www.cstl.nist.gov/div831/strbase/ http://atgc.lirmm.fr/star https://web.archive.org/web/20060404015058/http:/bioinf.dms.med.uniroma1.it/JSTRING/ https://web.archive.org/web/20060709203109/http:/www.biophp.org/minitools/microsatellite_repeats_finder/demo.php https://web.archive.org/web/20060712070732/http:/strand.imb.ac.ru/swan/index.html http://bioinfo.lifl.fr/mreps http://www.rub.de/spezzoo/cm/cm_phobos.htm http://tandem.bu.edu/trf/trf.html https://web.archive.org/web/20141225151444/http:/tandemrepeat.u-psud.fr/ |
| dbo:wikiPageID | 519473 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageInterLanguageLink | dbpedia-de:Tandemwiederholung |
| dbo:wikiPageLength | 6380 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1112992799 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:ProRepeat dbr:Tandem_Repeats_Database dbr:DNA dbr:Protein_tandem_repeats dbr:Computer_Science dbr:Gene_conversion dbr:Genealogical_DNA_test dbr:Armadillo_repeat dbr:Suffix_array dbr:Suffix_tree dbr:Medical_Subject_Headings dbr:Microsatellite_instability dbc:Repetitive_DNA_sequences dbr:Variable_number_tandem_repeat dbr:Dog dbr:Microsatellite dbr:Minisatellite dbr:Satellite_DNA dbr:Short_tandem_repeat dbr:Replication_slippage dbr:Tandem_repeat_locus dbr:Microsatellite_(genetics) dbr:Parentage dbr:Unequal_crossover dbr:Hereditary_nonpolyposis_colon_cancer dbr:Trinucleotide_repeat_disorders dbr:MLVA |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:Distinguish dbt:Reflist dbt:Repeated_sequence dbt:Organisms_et_al. dbt:Self-replicating_organic_structures |
| dcterms:subject | dbc:Repetitive_DNA_sequences |
| rdf:type | owl:Thing yago:Abstraction100002137 yago:Arrangement107938773 yago:Group100031264 yago:Ordering108456993 yago:Sequence108459252 yago:Series108457976 yago:WikicatRepetitiveDNASequences |
| rdfs:comment | En bio-informatique, une répétition en tandem est une suite de plusieurs motifs de nucléotides, adjacents dans une séquence d'ADN et qui se répètent à l'identique. Par exemple : ATTCGATTCGATTCG contient trois répétitions en tandem du motif de cinq nucléotides ATTCG. Les répétitions en tandem sont fréquentes dans les génomes des eucaryotes supérieurs et constituent en particulier ce qu'on appelle les séquences satellites, minisatellites et microsatellites. Elles représentent environ 10 à 15% de la composition totale du génome humain. (fr) Tandem repeats occur in DNA when a pattern of one or more nucleotides is repeated and the repetitions are directly adjacent to each other. Several protein domains also form tandem repeats within their amino acid primary structure, such as armadillo repeats. However, in proteins, perfect tandem repeats are unlikely in most in vivo proteins, and most known repeats are in proteins which have been designed. An example would be: ATTCG ATTCG ATTCG in which the sequence ATTCG is repeated three times. (en) In genetica e biologia molecolare si definiscono ripetizioni in tandem tutte le regioni di DNA costituite da sequenze di due o più nucleotidi ripetute una di seguito all'altra. (it) Тандемные повторы — последовательности повторяющихся фрагментов ДНК. В зависимости от размера подразделяются на три класса: сателлитная ДНК, минисателлиты и микросателлиты. (ru) Тандемні повтори — послідовності повторюваних ділянок ДНК. Залежно від розміру, вони поділяються на три підкласи: сателіти, мінісателіти і мікросателіти. Назва «сателіти» походить від спектру оптичної щільності при розділенні ДНК у градієнті щільності розчинника, що вказує на відмінності відносного середнього вмісту різних нуклеотидів у тандемних повторах у порівнянні з рештою ДНК. Найбільша кількість повторів зустрічається у Eucalyptus grandis. (uk) 串联重复（英語：Tandem repeats）是指DNA中的一个或多个核苷酸前后相连接的重复。 一个例子： ATTCGATTCGATTCG 其中的ATTCG在这里重复了三次。 几种蛋白质结构域也是由串联重复的氨基酸序列产生，如。但很少有串联重复出现在体内的蛋白质中，多数为人工设计的蛋白。 (zh) Las repeticiones en tándem son secuencias de ADN que se producen cuando se repite un patrón de uno o más nucleótidos y las repeticiones son directamente adyacentes entre sí. Varios dominios de proteínas también forman repeticiones en tándem dentro de su estructura primaria de aminoácidos, como las repeticiones que se dan en el genoma del armadillo. Sin embargo, en las proteínas, las repeticiones en tándem perfectas son poco probables en la mayoría de las proteínas in vivo y las repeticiones más conocidas se encuentran en proteínas que han sido diseñadas. Un ejemplo sería: (es) |
| rdfs:label | Repeticiones en tándem (es) Répétition en tandem (fr) Ripetizione in tandem (it) Tandem repeat (en) Тандемные повторы (ru) Тандемні повтори (uk) 串联重复 (zh) |
| owl:differentFrom | dbr:Tandemly_arrayed_genes |
| owl:sameAs | freebase:Tandem repeat yago-res:Tandem repeat wikidata:Tandem repeat dbpedia-es:Tandem repeat dbpedia-et:Tandem repeat dbpedia-fr:Tandem repeat dbpedia-he:Tandem repeat dbpedia-it:Tandem repeat dbpedia-ru:Tandem repeat dbpedia-simple:Tandem repeat dbpedia-th:Tandem repeat dbpedia-uk:Tandem repeat dbpedia-zh:Tandem repeat https://global.dbpedia.org/id/3ByEq |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:Tandem_repeat?oldid=1112992799&ns=0 |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:Tandem_repeat |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:Tandem_(disambiguation) |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Tandem_Repetitive_Dna dbr:Tandem_repeat_sequence dbr:Tandem_repeat_sequences dbr:Tandem_repeats dbr:Dinucleotide_Repeat dbr:Dinucleotide_repeat dbr:Dinucleotide_repeats |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Proteasome dbr:ProRepeat dbr:Tandem_Repeats_Database dbr:Allantoicase dbr:Cyanovirin-N dbr:Dopamine_receptor_D5 dbr:Internal_transcribed_spacer dbr:Interspersed_repeat dbr:Inverted_repeat dbr:Perilipin-4 dbr:Colorectal_cancer dbr:Nucleolus_organizer_region dbr:Teneurin dbr:RASGRP2 dbr:RNA_polymerase_I dbr:Edward_Trifonov dbr:Elizabeth_Blackburn dbr:Gelsolin dbr:Gilbert's_syndrome dbr:Glossary_of_genetics dbr:Glossary_of_genetics_(M−Z) dbr:Constitutive_heterochromatin dbr:Copy_number_variation dbr:LINE1 dbr:Bernard_Dujon dbr:Calx-beta_motif dbr:Small_nucleolar_RNA_SNORD116 dbr:Fungal_DNA_barcoding dbr:Haemolymph_juvenile_hormone-binding_protein dbr:Spacer_DNA dbr:Tandem_(disambiguation) dbr:Transposon_mutagenesis dbr:2'-5'-oligoadenylate_synthase dbr:Adenosine_deaminase_z-alpha_domain dbr:U11_spliceosomal_RNA dbr:UGENE dbr:Galactose_binding_lectin_domain dbr:Laminin dbr:Lamprin dbr:LdrD-RdlD_toxin-antitoxin_system dbr:Misato_segment_II_myosin-like_domain dbr:NXF1 dbr:Facioscapulohumeral_muscular_dystrophy dbr:Cell_nucleus dbr:Cell_wall dbr:Chromomere dbr:Direct_repeat dbr:Kazal_domain dbr:Repeated_sequence_(DNA) dbr:BRCA1 dbr:BRCA2 dbr:Hypervariable dbr:Variable_number_tandem_repeat dbr:ABM_domain dbr:ATP:guanido_phosphotransferase_family dbr:Zein dbr:Reg_prop dbr:B1_domain dbr:BAG_domain dbr:CDC48_N-terminal_domain dbr:CENPH dbr:Circular_permutation_in_proteins dbr:Human_genetic_variation dbr:TATA-binding_protein dbr:Microsatellite dbr:Minisatellite dbr:Satellite_DNA dbr:Slipped_strand_mispairing dbr:Second_Generation_Multiplex_Plus dbr:SLC46A3 dbr:WWE_protein_domain dbr:Importin dbr:Outer_membrane_polysaccharide_transporter dbr:TPSB2 dbr:Y_Y_Y dbr:OGFr dbr:Mucin-16 dbr:Mucin_7 dbr:Y-STR dbr:Sex_chromosome dbr:Toxin-antitoxin_system dbr:Non-Mendelian_inheritance dbr:Non-coding_DNA dbr:TPX2 dbr:Paramutation dbr:Tandem_Repetitive_Dna dbr:Tandem_repeat_sequence dbr:Tandem_repeat_sequences dbr:Tandem_repeats dbr:Dinucleotide_Repeat dbr:Dinucleotide_repeat dbr:Dinucleotide_repeats |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:Tandem_repeat |