R-loop (original) (raw)

About DBpedia

Rループ（英: R-loop）は、DNA:RNAハイブリッドとそれに結合した非鋳型一本鎖DNAという3本の核酸鎖から構成される構造である。Rループはさまざまな状況で形成される可能性があり、その存在が許容される場合も細胞の構成要素によって除去される場合もある。「Rループ」という名称はとの構造的な類似性から命名されたものであり、「R」はRNAが関係する構造であることを表している。 実験室的には、DNA:RNAハイブリッドの形成が好まれる条件下で成熟mRNAと二本鎖DNAのハイブリダイゼーションを行うことでRループは形成される。こうしたケースでは、DNAのイントロン領域（スプライシングによってmRNAから除去される領域）はmRNAの相補的配列とハイブリダイゼーションを行うことができないため、一本鎖のループを形成する。

thumbnail

Property Value
dbo:abstract Ein R-Loop ist eine dreisträngige Nukleinsäure-Struktur, die aus einem DNA:RNA-Hybrid und der zugehörigen einzelsträngigen, nicht übersetzten DNA besteht. R-Loops können unter verschiedenen Umständen gebildet werden und von zellulären Komponenten toleriert oder freigegeben werden. Der Begriff "R-Loop" wurde verwendet, um die Ähnlichkeit dieser Strukturen mit D-Loops widerzuspiegeln; das "R" stellt in diesem Fall die Beteiligung einer RNA-Einheit dar. Im Labor können R-Loops auch durch Hybridisierung reifer mRNA mit doppelsträngiger DNA unter Bedingungen erzeugt werden, die die Bildung eines DNA-RNA-Hybrids begünstigen; in diesem Fall bilden die Intronbereiche (die aus der mRNA herausgespleißt wurden) einzelsträngige Schleifen, da sie nicht mit komplementärer Sequenz in der mRNA hybridisieren können. (de) An R-loop is a three-stranded nucleic acid structure, composed of a DNA:RNA hybrid and the associated non-template single-stranded DNA. R-loops may be formed in a variety of circumstances, and may be tolerated or cleared by cellular components. The term "R-loop" was given to reflect the similarity of these structures to D-loops; the "R" in this case represents the involvement of an RNA moiety. In the laboratory, R-loops may also be created by the hybridization of mature mRNA with double-stranded DNA under conditions favoring the formation of a DNA-RNA hybrid; in this case, the intron regions (which have been spliced out of the mRNA) form single-stranded DNA loops, as they cannot hybridize with complementary sequence in the mRNA. (en) Rループ（英: R-loop）は、DNA:RNAハイブリッドとそれに結合した非鋳型一本鎖DNAという3本の核酸鎖から構成される構造である。Rループはさまざまな状況で形成される可能性があり、その存在が許容される場合も細胞の構成要素によって除去される場合もある。「Rループ」という名称はとの構造的な類似性から命名されたものであり、「R」はRNAが関係する構造であることを表している。 実験室的には、DNA:RNAハイブリッドの形成が好まれる条件下で成熟mRNAと二本鎖DNAのハイブリダイゼーションを行うことでRループは形成される。こうしたケースでは、DNAのイントロン領域（スプライシングによってmRNAから除去される領域）はmRNAの相補的配列とハイブリダイゼーションを行うことができないため、一本鎖のループを形成する。 (ja) R-петля — особая структурная конформация нуклеиновых кислот, образующаяся при гибридизации РНК с комплементарной нитью двунитевой ДНК, образование дуплекса РНК:ДНК при этом приводит к вытеснению некомплементарной нити ДНК с образованием петли. R-петли часто формируются во время транскрипции, особенно в промоторных областях, когда только что синтезированный транскрипт гибридизуется с матричной цепью ДНК. По некоторым оценкам R-петли могут занимать до 5 % генома у млекопитающих. R-петли играют роль в стабильности генома и хорошо известных функциях, связанных с регуляцией генов, репликацией ДНК, формированием паттерна хроматина, рекомбинацией генов иммуноглобулинов и репарацией двухцепочечных разрывов ДНК. (ru)
dbo:thumbnail wiki-commons:Special:FilePath/R-loop_promoting_factors.jpg?width=300
dbo:wikiPageID 42558215 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength 14105 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID 1073729256 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink dbr:Prader–Willi_syndrome dbr:Primer_(molecular_biology) dbr:Moiety_(chemistry) dbr:Methylation dbr:Primary_transcript dbr:Richard_J._Roberts dbr:D-loop dbr:DNA dbr:DNA_damage_(naturally_occurring) dbr:DNA_replication dbr:DRIP-seq dbr:Intron dbr:Nucleic_acid_hybridization dbc:DNA dbr:Genetic_recombination dbr:RNA_splicing dbr:Electron_microscopy dbr:Endogeny_(biology) dbr:Gene dbr:Angelman_syndrome dbr:Antibody dbr:Activation-induced_cytidine_deaminase dbr:Aicardi–Goutières_syndrome dbr:Topoisomerase dbr:Sequencing dbr:Amyotrophic_lateral_sclerosis dbr:Eukaryote dbr:Nobel_Prize_in_Physiology_or_Medicine dbr:Chromatin dbr:Promoter_(genetics) dbr:Protein dbr:RNA dbr:Adenovirus dbr:B_cell dbc:RNA_splicing dbr:Hexon_protein dbr:Tetrahymena_thermophila dbr:Exon dbr:Extrachromosomal_DNA dbr:Immunofluorescence dbr:Immunoglobulin_class_switching dbr:Oculomotor_apraxia dbr:Ribonuclease_H dbr:Phillip_A._Sharp dbr:RRNA dbr:Splicing_(genetics) dbr:File:R-loop_promoting_factors.jpg dbr:File:R_loop.jpg
dbp:wikiPageUsesTemplate dbt:Reflist dbt:Short_description
dct:subject dbc:DNA dbc:RNA_splicing
gold:hypernym dbr:Structure
rdf:type dbo:Building
rdfs:comment Rループ（英: R-loop）は、DNA:RNAハイブリッドとそれに結合した非鋳型一本鎖DNAという3本の核酸鎖から構成される構造である。Rループはさまざまな状況で形成される可能性があり、その存在が許容される場合も細胞の構成要素によって除去される場合もある。「Rループ」という名称はとの構造的な類似性から命名されたものであり、「R」はRNAが関係する構造であることを表している。 実験室的には、DNA:RNAハイブリッドの形成が好まれる条件下で成熟mRNAと二本鎖DNAのハイブリダイゼーションを行うことでRループは形成される。こうしたケースでは、DNAのイントロン領域（スプライシングによってmRNAから除去される領域）はmRNAの相補的配列とハイブリダイゼーションを行うことができないため、一本鎖のループを形成する。 (ja) R-петля — особая структурная конформация нуклеиновых кислот, образующаяся при гибридизации РНК с комплементарной нитью двунитевой ДНК, образование дуплекса РНК:ДНК при этом приводит к вытеснению некомплементарной нити ДНК с образованием петли. R-петли часто формируются во время транскрипции, особенно в промоторных областях, когда только что синтезированный транскрипт гибридизуется с матричной цепью ДНК. По некоторым оценкам R-петли могут занимать до 5 % генома у млекопитающих. R-петли играют роль в стабильности генома и хорошо известных функциях, связанных с регуляцией генов, репликацией ДНК, формированием паттерна хроматина, рекомбинацией генов иммуноглобулинов и репарацией двухцепочечных разрывов ДНК. (ru) Ein R-Loop ist eine dreisträngige Nukleinsäure-Struktur, die aus einem DNA:RNA-Hybrid und der zugehörigen einzelsträngigen, nicht übersetzten DNA besteht. R-Loops können unter verschiedenen Umständen gebildet werden und von zellulären Komponenten toleriert oder freigegeben werden. Der Begriff "R-Loop" wurde verwendet, um die Ähnlichkeit dieser Strukturen mit D-Loops widerzuspiegeln; das "R" stellt in diesem Fall die Beteiligung einer RNA-Einheit dar. (de) An R-loop is a three-stranded nucleic acid structure, composed of a DNA:RNA hybrid and the associated non-template single-stranded DNA. R-loops may be formed in a variety of circumstances, and may be tolerated or cleared by cellular components. The term "R-loop" was given to reflect the similarity of these structures to D-loops; the "R" in this case represents the involvement of an RNA moiety. (en)
rdfs:label R-Loop (de) Rループ (ja) R-loop (en) R-петля (ru)
owl:sameAs freebase:R-loop wikidata:R-loop dbpedia-de:R-loop dbpedia-ja:R-loop dbpedia-ru:R-loop https://global.dbpedia.org/id/n59A
prov:wasDerivedFrom wikipedia-en:R-loop?oldid=1073729256&ns=0
foaf:depiction wiki-commons:Special:FilePath/R-loop_promoting_factors.jpg wiki-commons:Special:FilePath/R_loop.jpg
foaf:isPrimaryTopicOf wikipedia-en:R-loop
is dbo:wikiPageRedirects of dbr:R-Looping
is dbo:wikiPageWikiLink of dbr:Ronald_W._Davis dbr:FANCM dbr:Structural_motif dbr:Primary_transcript dbr:D-loop dbr:DNA_replication_stress dbr:DRIP-seq dbr:Double-strand_break_repair_model dbr:Intron dbr:Frataxin dbr:MicroDNA dbr:Microprocessor_complex dbr:H3K9me2 dbr:H3S10P dbr:Histone dbr:SETX dbr:C9orf72 dbr:CUT&RUN_sequencing dbr:CUT&Tag_sequencing dbr:ChIL-sequencing dbr:Serine/arginine-rich_splicing_factor_1 dbr:Negative_elongation_factor dbr:Ribonuclease_H dbr:Transcription-translation_coupling dbr:R-Looping dbr:Spinocerebellar_ataxia_type_1
is foaf:primaryTopic of wikipedia-en:R-loop