Docking@Home | это... Что такое Docking@Home? (original) (raw)

Docking@Home

Тип	Распределённые вычисления
Операционная система	Кроссплатформенное ПО
Аппаратная платформа	x86
Последняя версия	• Charmm 34a2: 6.23
Состояние	Активное
Сайт	http://docking.cis.udel.edu/

Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1]

Докинг

Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[2] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]

Детали проекта и статистика

Графика из программы-клиента

Научные достижения

Примечания

1. ↑ 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 pdf
2. ↑ Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Träff, Jesper; Achim Streit; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1

См. также

• Добровольные вычисления
• BOINC

Ссылки

• Официальный сайт проекта
• Российский сайт распределённых вычислений
• Научные публикации

Проекты добровольных вычислений
Астрономия	Albert@Home • Asteroids@home • Constellation • Cosmology@home • Einstein@Home • MilkyWay@home • Orbit@home • PlanetQuest • SETI@home • theSkyNet POGS
Биология имедицина	Biochemical Library • Cels@Home • CommunityTSC • Correlizer • Docking@Home • DrugDiscovery@Home • DNA@Home • evo@home • evolution@home • FightAIDS@Home • FightMalaria@Home • Folding@home • GPUGrid • Lattice Project • Malariacontrol.net • Neurona@Home • NRG • Poem@Home • Predictor@home • Proteins@Home • QMC@Home • RALPH@Home • RNA World • Rosetta@home • SIMAP@home • SimOne@home • Superlink@Technion • United Devices Cancer Research Project • Volpex@UH • Wildlife@Home
Когнитивные	Artificial Intelligence System • MindModeling@Home
Климат	APS@Home • BBC Climate Change Experiment • ClimatePrediction.net • Seasonal Attribution Project • Quake Catcher Network - Seismic Monitoring • Virtual Prairie
Математика	ABC@home • AQUA@home • Chess960@home • Collatz Conjecture • distributed.net • Enigma@Home • EulerNet • GIMPS • NFSNET • NQueens Project • NumberFields@Home • OProject@Home • PiHex • PrimeGrid • Ramsey@Home • Rectilinear Crossing Number • SAT@home • SHA-1 Collision Search Graz • SubsetSum@Home • RainbowCrack • Seventeen or Bust • SZTAKI Desktop Grid • WEP-M+2 Project • Wieferich@Home • VGTU@Home
Физико-технические	BRaTS@Home • CuboidSimulation • eOn • Hydrogen@Home • Leiden Classical • LHC@home • Magnetism@home • µFluids@home • Muon1 DPAD • NanoHive@Home • SLinCA@Home • Solar@Home • Spinhenge@home • QuantumFIRE
Многоцелевые	AlmereGrid • CAS@Home • EDGeS@Home • Ibercivis • Optima@home • World Community Grid • Yoyo@home
Прочие	Africa@HOME • BURP • DepSpid • DIMES • Ideologias@Home • FreeHAL@home • Gerasim@Home • Pirates@Home • RenderFarm@Home • RND@home • Surveill@Home • YAFU
Утилиты	BOINC (Account Manager • Manager • client-server technology • Credit System • Wrapper • WUProp)