Dicer (original) (raw)

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Dicer (výslovnost [daɪsə]) je ribonukleáza, která katalyzuje hydrolytické štěpení jistých RNA, čímž umožňuje vznik 20–30 nukleotidů dlouhých molekul, známých jako miRNA a siRNA. Účastní se tedy procesu RNA interference. Patří do rodiny , které všechny účinkují na dvouvláknové RNA (dsRNA), což je zcela ve shodě s poznatky o enzymu dicer – prekurzorovými molekulami jsou dvouvláknové buď či jisté (např. virové) dsRNA. U C. elegans je jediný zástupce dicerové rodiny proteinů, u drozofily dva (jeden na siRNA, druhý na miRNA) a u huseníčku čtyři. Po odstranění jednoho vlákna se dicer (spolu s jedním z vláken sestříhaného siRNA nebo miRNA) stává součástí RISC komplexu.

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dbo:abstract Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip ( i ) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat. El nom Dicer fou donat per , qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima. Les enzimes Dicer contenen: * un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal * un domini DUF283 de funció desconeguda * un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3' * dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu * un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA. (ca) Dicer (výslovnost [daɪsə]) je ribonukleáza, která katalyzuje hydrolytické štěpení jistých RNA, čímž umožňuje vznik 20–30 nukleotidů dlouhých molekul, známých jako miRNA a siRNA. Účastní se tedy procesu RNA interference. Patří do rodiny , které všechny účinkují na dvouvláknové RNA (dsRNA), což je zcela ve shodě s poznatky o enzymu dicer – prekurzorovými molekulami jsou dvouvláknové buď či jisté (např. virové) dsRNA. U C. elegans je jediný zástupce dicerové rodiny proteinů, u drozofily dva (jeden na siRNA, druhý na miRNA) a u huseníčku čtyři. Po odstranění jednoho vlákna se dicer (spolu s jedním z vláken sestříhaného siRNA nebo miRNA) stává součástí RISC komplexu. (cs) دايسر (بالإنجليزية: Dicer)‏ هو إنزيم يدخل في تشكيل الميكرو حمض ريبي نووي لدى حقيقيات النوى العليا، لديه أربع مجالات بروتينية. (ar) Dicer [ˈdaɪsɚ] (wörtlich etwa „Würfelschneider“, von engl.: to dice: „in Würfel schneiden“) ist eine Endoribonuklease, die doppelsträngige RNA in kurze, doppelsträngige Fragmente schneidet. Je nach Substrat werden diese Produkte unterschiedlich bezeichnet. Diese Fragmente sind etwa 20 bis 25 Nukleotide lang und spielen bei dem Mechanismus der RNA-Interferenz die zentrale Rolle. Mutationen des DICER1-Gens wurden bei kindlichen Tumoren wie dem Pleuro-pulmonalen Blastom oder seltenen kindlichen Tumoren des zentralen Nervensystems beschrieben. Auch Schilddrüsenveränderungen (mehrknotige Struma) kommen in diesem Kontext vor. Dicer ist ein RNase-III-ähnliches Enzym. Es enthält zwei RNase-III-Domänen und eine PAZ-Domäne. Der Abstand zwischen diesen beiden Domänen wird durch einen Helixbereich bestimmt, dessen Länge die Länge der entstehenden siRNAs bestimmt. Dicer katalysiert den ersten Schritt der RNA-Interferenz und initiiert die Bildung des RNA-induced silencing complex (RISC), dessen Endonuklease „argonaute“ in der Lage ist, mRNA abzubauen, deren Sequenz komplementär zu der entstandenen siRNA ist. Mithilfe von Knockout-Moosen konnte gezeigt werden, dass DCL1b, eines von vier Dicer-Proteinen von Physcomitrella, nicht für die miRNA Biogenese, sondern für das Schneiden der Zieltranskripte notwendig ist. Dies führte zur Aufklärung eines neuen Mechanismus der Genregulation. Der Name Dicer wurde von Emily Bernstein vergeben, einer Doktorandin in der Arbeitsgruppe von Greg Hannon am Cold Spring Harbor Laboratory, die als erste Ribonuklease-Aktivität des Dicers an dsRNA zeigen konnte. (de) Dicer, also known as endoribonuclease Dicer or helicase with RNase motif, is an enzyme that in humans is encoded by the DICER1 gene. Being part of the RNase III family, Dicer cleaves double-stranded RNA (dsRNA) and pre-microRNA (pre-miRNA) into short double-stranded RNA fragments called small interfering RNA and microRNA, respectively. These fragments are approximately 20–25 base pairs long with a two-base overhang on the 3′-end. Dicer facilitates the activation of the RNA-induced silencing complex (RISC), which is essential for RNA interference. RISC has a catalytic component Argonaute, which is an endonuclease capable of degrading messenger RNA (mRNA). (en) Dicer es una ribonucleasa miembro de la familia de las ARNasa III (EC 3.1.26.3).​ Es una gran proteína (>200 kD) monomérica presente en el citoplasma celular. Dicer cataliza el primer paso del mecanismo de RNAi: corta ARN doble banda ( o dsRNA) y pre-microARN (pre-miARN) en fragmentos de ARN de interferencia pequeños llamados ARNip (siRNAs y miRNAs) de 20-25 nucleótidos, con dos bases libres en los extremos 3' hidroxilo y un extremo 5' fosfato. El nombre Dicer fue dado por Emily Bernstein, quien fue la primera en demostrar la actividad catalítica de ARNdb de la enzima.​ Las enzimas Dicer contienen: * un dominio ATPasa/ARN helicasa en el extremo N-terminal * un dominio DUF283 de función desconocida * un dominio PAZ, responsable del reconocimiento de los nucleótidos libres en el extremo 3' * dos dominios catalíticos ARNasa III (RIIIa y RIIIb) que constituyen el centro activo * un dominio dsRBD (en inglés, double strand RNA binding domain) en el extremo C-terminal Cada uno de los dominios ARNasa corta una hebra de ARN de manera polarizada: el dominio RIIIb corta la hebra ascendente del dsRNA, que contiene el 5' fosfato, mientras que el dominio RIIIa corta la hebra descendente, que contiene el extremo 3' OH. El dominio RIIIa mide la distancia al sitio de corte del dsRNA, tal vez con la ayuda del dominio PAZ. Por este motivo, el dsRNA se corta a una distancia aproximada de 20 pares de bases contadas desde el extremo de la molécula: la hélice entre el dominio PAZ y el dominio RIIIa mide 65 Angstroms, que corresponde a 2 vueltas de hélice de dsRNA = alrededor de 21 nt (Zhang et al.​ 2004, Pham y Sontheimer​ 2004). Los eucariontes, C. elegans y Schizosaccharomices pombe (una levadura muy utilizada como organismo modelo) expresan una única forma de Dicer. Sin embargo, Drosophila y Arabidopsis expresan dos o más tipos de Dicer, cada una con funciones especializadas: por ejemplo dDicer-1 produce los miRNAs y dDicer-2 produce los siRNAs.​ Para poder unirse a las moléculas de dsRNA, Dicer necesita formar un complejo con otras proteínas que la asisten en sus funciones, como la proteína R2D2 en Drosophila o RDE-4 y RDE-1 en C.elegans.​ (es) Dicer est une enzyme impliquée dans le processus d'ARN interférence. Ses quatre domaines protéiques sont encodés par le gène DICER1. La protéine dicer composée de 1922 acides aminés, aussi connue sous le nom d’endoribonucléase dicer, est une ribonucléase de classe 3 qui clive les fragments doubles brins d’ARN et les pré-microARN afin d’obtenir des petits ARN interférant et des microARN. Ces fragments ont une longueur d’environ 25 paires de bases et la coupure laisse une extrémité cohésive 3’ débordante de deux bases. La protéine dicer sert à faciliter l’activation du complexe RISC qui est essentiel à une activité d’ARN interférente. Le complexe RISC possède le composant argonaute qui est capable de dégrader les ARN messager. Son gène, DICER1, est situé sur le chromosome 14 humain. (fr) 엔도리보뉴클레이스 효소 다이서(Dicer)는 인간에서 다이서1 유전자에 의해 암호화되는 효소이다. RNase III 그룹 제품군의 일부인 다이서는 이중가닥 RNA (dsRNA) 및 pre-microRNA(pre-miRNA)를 각각 small interfering RNA 및 microRNA라고 하는 짧은 이중가닥 RNA 단편으로 절단한다. 이 단편은 길이가 약 20 – 25개 염기쌍이고 3'-말단에 2개 염기 돌출부가 있다. 다이서는 RNA 간섭에 필수적인 RNA 유도 침묵 복합체(RISC)의 활성화를 촉진한다. RISC에는 전령 RNA (mRNA)를 분해할 수 있는 엔도뉴클레아 제인 촉매 성분인 Argonaute가 있다. RNAi(RNA 간섭현상)는 유전자의 발현을 조절하는 기작으로, 세포 안에 생성되거나 외부에서 유입된 이중 나선 RNA (dsRNA)나, miRNA 전구체가 siRNA나 miRNA로 만들어지고, 이렇게 만들어진 siRNA, miRNA 가 유전자의 전사를 조절하거나, mRNA를 분해 또는 단백질의 전사를 제어하여 유전자의 발현을 조절하는 기작이다. (ko) Le ribonucleasi III sono enzimi della classe delle idrolasi, che catalizzano il taglio endonucleolitico di un 5'-fosfomonoestere. Dicer, anche conosciuto come endoribonucleasi Dicer, è un Enzima che negli umani è codificato dal gene DICER1. Fa parte della famiglia delle RNAsi III, Dicer cliva RNA a doppio filamento (dsRNA) e pre-microRNA (pre-miRNA), in piccoli frammenti di dsRNA chiamati small interfering RNA (siRNA) e microRNA (mi-RNA). Questi frammenti sono approssimativamente 20-25pb. Dicer facilita l'attivazione di un complesso ribonucleoproteico denominato RISC (RNA-induced silencing complex). Questo complesso è essenziale poiché può portare all'eliminazione dell'mRNA.Il suo nome (che in italiano potrebbe essere tradotto come "che taglia finemente"), deriva proprio dalla sua capacità di ridurre molecole di dimensione eterogenea in piccoli blocchi di dimensione omogenea. Il nome fu coniato da , una ricercatrice del Cold Spring Harbor Laboratory che per prima individuò tale particolarità nell'enzima. (it) Dicerは、ヒトではDICER1遺伝子によってコードされる酵素である。Dicerはファミリーに属し、二本鎖RNA(dsRNA)とpre-miRNAをそれぞれsiRNA、miRNAと呼ばれる短いdsRNA断片へと切断する。これらの断片は約20–25塩基対の長さであり、3'末端に2塩基のオーバーハングが存在する。DicerはRNAiに必要不可欠なRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)の活性化を促進する。RISCは触媒を担う構成要素としてArgonauteを持ち、ArgonauteはmRNAを分解するエンドヌクレアーゼである。 (ja) Dicer é uma enzima nuclease que cliva moléculas de RNA dupla fita (dsRNA). A atividade enzimática da Dicer é responsável pela formação de miRNAs e de siRNA: dois tipos de pequenas moléculas de RNA envolvidas em mecanismos de RNA de interferência (RNAi). (pt) Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце. Dicer содержит два домена RNase III и один . Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA. (ru) Dicer蛋白在人體內由DICER1基因編碼,是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶,屬於III型RNA酶。在RNA誘導沉默複合體(RISC)的激活中,Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中,Dicer可以將shRNA(小髮卡RNA)切割、加工爲siRNA(小干擾RNA),將miRNA前體加工爲miRNA(微RNA)。 (zh) Дайсер (англ. Dicer) – фермент, що каталізує розщеплення РНК при формуванні зрілих некодуючих РНК, що беруть участь у РНК інтерференції (мікроРНК, міРНК, ). Дайсер є РНКазою III. (uk)
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Being part of the RNase III family, Dicer cleaves double-stranded RNA (dsRNA) and pre-microRNA (pre-miRNA) into short double-stranded RNA fragments called small interfering RNA and microRNA, respectively. These fragments are approximately 20–25 base pairs long with a two-base overhang on the 3′-end. Dicer facilitates the activation of the RNA-induced silencing complex (RISC), which is essential for RNA interference. RISC has a catalytic component Argonaute, which is an endonuclease capable of degrading messenger RNA (mRNA). (en) Dicer est une enzyme impliquée dans le processus d'ARN interférence. Ses quatre domaines protéiques sont encodés par le gène DICER1. La protéine dicer composée de 1922 acides aminés, aussi connue sous le nom d’endoribonucléase dicer, est une ribonucléase de classe 3 qui clive les fragments doubles brins d’ARN et les pré-microARN afin d’obtenir des petits ARN interférant et des microARN. Ces fragments ont une longueur d’environ 25 paires de bases et la coupure laisse une extrémité cohésive 3’ débordante de deux bases. La protéine dicer sert à faciliter l’activation du complexe RISC qui est essentiel à une activité d’ARN interférente. Le complexe RISC possède le composant argonaute qui est capable de dégrader les ARN messager. Son gène, DICER1, est situé sur le chromosome 14 humain. (fr) 엔도리보뉴클레이스 효소 다이서(Dicer)는 인간에서 다이서1 유전자에 의해 암호화되는 효소이다. RNase III 그룹 제품군의 일부인 다이서는 이중가닥 RNA (dsRNA) 및 pre-microRNA(pre-miRNA)를 각각 small interfering RNA 및 microRNA라고 하는 짧은 이중가닥 RNA 단편으로 절단한다. 이 단편은 길이가 약 20 – 25개 염기쌍이고 3'-말단에 2개 염기 돌출부가 있다. 다이서는 RNA 간섭에 필수적인 RNA 유도 침묵 복합체(RISC)의 활성화를 촉진한다. RISC에는 전령 RNA (mRNA)를 분해할 수 있는 엔도뉴클레아 제인 촉매 성분인 Argonaute가 있다. RNAi(RNA 간섭현상)는 유전자의 발현을 조절하는 기작으로, 세포 안에 생성되거나 외부에서 유입된 이중 나선 RNA (dsRNA)나, miRNA 전구체가 siRNA나 miRNA로 만들어지고, 이렇게 만들어진 siRNA, miRNA 가 유전자의 전사를 조절하거나, mRNA를 분해 또는 단백질의 전사를 제어하여 유전자의 발현을 조절하는 기작이다. (ko) Dicerは、ヒトではDICER1遺伝子によってコードされる酵素である。Dicerはファミリーに属し、二本鎖RNA(dsRNA)とpre-miRNAをそれぞれsiRNA、miRNAと呼ばれる短いdsRNA断片へと切断する。これらの断片は約20–25塩基対の長さであり、3'末端に2塩基のオーバーハングが存在する。DicerはRNAiに必要不可欠なRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)の活性化を促進する。RISCは触媒を担う構成要素としてArgonauteを持ち、ArgonauteはmRNAを分解するエンドヌクレアーゼである。 (ja) Dicer é uma enzima nuclease que cliva moléculas de RNA dupla fita (dsRNA). A atividade enzimática da Dicer é responsável pela formação de miRNAs e de siRNA: dois tipos de pequenas moléculas de RNA envolvidas em mecanismos de RNA de interferência (RNAi). (pt) Dicer蛋白在人體內由DICER1基因編碼,是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶,屬於III型RNA酶。在RNA誘導沉默複合體(RISC)的激活中,Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中,Dicer可以將shRNA(小髮卡RNA)切割、加工爲siRNA(小干擾RNA),將miRNA前體加工爲miRNA(微RNA)。 (zh) Дайсер (англ. Dicer) – фермент, що каталізує розщеплення РНК при формуванні зрілих некодуючих РНК, що беруть участь у РНК інтерференції (мікроРНК, міРНК, ). Дайсер є РНКазою III. (uk) Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip ( i ) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat. El nom Dicer fou donat per , qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima. Les enzimes Dicer contenen: (ca) Dicer [ˈdaɪsɚ] (wörtlich etwa „Würfelschneider“, von engl.: to dice: „in Würfel schneiden“) ist eine Endoribonuklease, die doppelsträngige RNA in kurze, doppelsträngige Fragmente schneidet. Je nach Substrat werden diese Produkte unterschiedlich bezeichnet. Diese Fragmente sind etwa 20 bis 25 Nukleotide lang und spielen bei dem Mechanismus der RNA-Interferenz die zentrale Rolle. Mutationen des DICER1-Gens wurden bei kindlichen Tumoren wie dem Pleuro-pulmonalen Blastom oder seltenen kindlichen Tumoren des zentralen Nervensystems beschrieben. Auch Schilddrüsenveränderungen (mehrknotige Struma) kommen in diesem Kontext vor. (de) Dicer es una ribonucleasa miembro de la familia de las ARNasa III (EC 3.1.26.3).​ Es una gran proteína (>200 kD) monomérica presente en el citoplasma celular. Dicer cataliza el primer paso del mecanismo de RNAi: corta ARN doble banda ( o dsRNA) y pre-microARN (pre-miARN) en fragmentos de ARN de interferencia pequeños llamados ARNip (siRNAs y miRNAs) de 20-25 nucleótidos, con dos bases libres en los extremos 3' hidroxilo y un extremo 5' fosfato. El nombre Dicer fue dado por Emily Bernstein, quien fue la primera en demostrar la actividad catalítica de ARNdb de la enzima.​ (es) Le ribonucleasi III sono enzimi della classe delle idrolasi, che catalizzano il taglio endonucleolitico di un 5'-fosfomonoestere. Dicer, anche conosciuto come endoribonucleasi Dicer, è un Enzima che negli umani è codificato dal gene DICER1. Fa parte della famiglia delle RNAsi III, Dicer cliva RNA a doppio filamento (dsRNA) e pre-microRNA (pre-miRNA), in piccoli frammenti di dsRNA chiamati small interfering RNA (siRNA) e microRNA (mi-RNA). Questi frammenti sono approssimativamente 20-25pb. Dicer facilita l'attivazione di un complesso ribonucleoproteico denominato RISC (RNA-induced silencing complex). Questo complesso è essenziale poiché può portare all'eliminazione dell'mRNA.Il suo nome (che in italiano potrebbe essere tradotto come "che taglia finemente"), deriva proprio dalla sua capacità (it) Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце. (ru)
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