Cis-regulatory element (original) (raw)

dbo:abstract

Als cis-Element oder cis-wirkendes Element (von lat. cis ‚diesseits‘) wird in der Biologie ein bestimmter Abschnitt in der Erbinformation bezeichnet, der für die Regulation eines Gens eine Rolle spielt, das auf demselben DNA-Molekül liegt wie dieser (molekular betrachtet diesseits). Dieser regulatorische Sequenzabschnitt muss weder RNA noch Protein kodieren und kann in Leserichtung vor oder nach der codierenden Sequenz des zugehörigen Gens liegen, oder auch innerhalb (auch in einem Intron). Cis-Elemente stromaufwärts vor einem Gen stellen oft Bindungsmotive dar für (besondere) Transkriptionsfaktoren, die hier als trans-wirkende Faktoren (von lat. trans ‚jenseits‘) molekular gesehen von anderer Seite her in die Regulierung der Transkription dieses Gens eingreifen. Führen cis-Elemente darüber zu einer Hemmung der Transkription, werden sie als Silencer bezeichnet. Cis-Elemente, die zu einer Verstärkung der Transkription führen und nicht Bestandteil von Promotoren sind, werden Enhancer genannt. Ein Beispiel hierfür ist die DNAse-hypersensitive Stelle des Lysozymgens, die (6.1 kb) vor dem Transkriptionsstart liegt und durch Interaktion mit Transkriptionsfaktoren die Genexpression verstärkt.Die Gesamtheit der cis-/trans-Aktivitäten in einem Genlocus bestimmt die Intensität, mit der die RNA-Polymerase die Transkription durchführt. Von cis-Elementen spricht man ebenso bei biologischen Prozessen wie der Rekombination. Beispielsweise sind im tumorinduzierenden Ti-Plasmid von Agrobakterien cis-Elemente in Form repetitiver Sequenzen (Wiederholungsmotiv von 25 Basen) zu finden, welche in dem ringförmigen Plasmid als linke bzw. rechte Grenze (left border [lb] bzw. right border [rb]) die t-DNA flankieren.Diese werden als essentielle cis-Elemente für die Übertragung der t-DNA beim Transfer in die Pflanzenzelle angesehen. (de)
Cis-regulatory elements (CREs) or Cis-regulatory modules (CRMs) are regions of non-coding DNA which regulate the transcription of neighboring genes. CREs are vital components of genetic regulatory networks, which in turn control morphogenesis, the development of anatomy, and other aspects of embryonic development, studied in evolutionary developmental biology. CREs are found in the vicinity of the genes that they regulate. CREs typically regulate gene transcription by binding to transcription factors. A single transcription factor may bind to many CREs, and hence control the expression of many genes (pleiotropy). The Latin prefix cis means "on this side", i.e. on the same molecule of DNA as the gene(s) to be transcribed. CRMs are stretches of DNA, usually 100–1000 DNA base pairs in length, where a number of transcription factors can bind and regulate expression of nearby genes and regulate their transcription rates. They are labeled as cis because they are typically located on the same DNA strand as the genes they control as opposed to trans, which refers to effects on genes not located on the same strand or farther away, such as transcription factors. One cis-regulatory element can regulate several genes, and conversely, one gene can have several cis-regulatory modules. Cis-regulatory modules carry out their function by integrating the active transcription factors and the associated co-factors at a specific time and place in the cell where this information is read and an output is given. CREs are often but not always upstream of the transcription site. CREs contrast with trans-regulatory elements (TREs). TREs code for transcription factors. (en)
Los elementos reguladores en cis son regiones no codificantes del ADN que regulan la transcripción de los genes cercanos. El concepto surge para diferenciarlos de los elementos reguladores en trans. Los elementos reguladores cis están presentes en la misma molécula de ADN como gen regulador, mientras que los elementos reguladores en trans pueden regular genes distantes a partir del gen por las que fueron transcritas. El prefijo latino cis se traduce como "de este lado". Estos elementos reguladores se encuentran en las proximidades del gen, o genes, que regulan. Normalmente regulan la transcripción de genes al funcionar como sitios de unión para factores transcripción (es)
Een cis-element of cis-regulatie-element is een regio van het DNA of RNA die de genexpressie reguleert en op hetzelfde chromosoom van het DNA ligt. Dit cis-element is vaak een voor één of meer . Een cis-element kan zitten bij het 5'-eind van de coderende sequentie van het gen dat het reguleert (in de promotorregio of verder bovenstrooms), in een intron of 3' van de coderende sequentie van het gen, zowel in de niet-getransleerde als in de niet-getranscribeerde regio. Cis-elementen die de transcriptie remmen worden silencers genoemd en die de transcriptie bevorderen heten enhancers. De gezamenlijke cis-/trans-activiteiten in de promotor bepalen uiteindelijk de intensiteit waarmee de RNA-polymerase de transcriptie uitvoert. In het Ti-plasmide van agrobacteriën zijn aan de linker- en rechtergrens (left border (LB), right border (RB)), die in het plasmide het t-DNA (transfer-DNA) flankeren, herhalingen van 25 basen te vinden.Deze worden als essentiële cis-elementen voor het overdragen van het t-DNA gezien. Een ander voorbeeld van een cis-element is de riboswitch. Ook de operator in het lac-operon is een cis-element. Deze DNA-sequentie wordt gebonden door de lac-onderdrukker, dat op zijn beurt de transcriptie van aanliggende genen op hetzelfde DNA-molecuul voorkomt. De lac-operator wordt dus beschouwd als cis-werkend bij de regulatie van de nabijgelegen genen. De operator zelf codeert niet voor een proteïne of RNA. (nl)
シスエレメント（cis-element、cis-regulatory element またはcis-acting element）は同一分子上の遺伝子発現を調節するDNA またはRNA の領域を指す。シス（cis）はラテン語で「同じ側」の意味であり、「同じ側で発現調節する要素（因子）」がシスエレメントの原義。一般にシスエレメントは遺伝子上流部の転写因子が結合する領域を指す場合が多い。転写因子はタンパク質であり細胞内に拡散して特定のDNA 配列（シスエレメント）に結合して転写を調節するため、同じ場所に留まらずトランス（trans）に作用する。一方、シスエレメントはDNA またはRNA 分子内の転写因子等に認識される塩基配列で、同一分子に即ちシスに作用し、遺伝子発現を調節する。古典的なラクトースオペロンを例にとると、オペレーターがシスエレメントであり、トランス因子であるラックリプレッサーがここに結合することで同じDNA 分子上の近隣にある遺伝子の転写が抑制される。ただしシスエレメントと標的遺伝子との位置的関係は様々である。例えば転写開始に直接関与するプロモーターは遺伝子の上流に当たる特定の位置に決まった方向で存在する必要があるが、転写を促進するエンハンサーは制御する遺伝子から離れて位置する場合が多い。またエンハンサーの及ぶ範囲を制御するためInsulator が存在している。 mRNA 分子上でその安定性や翻訳に影響を与えるシスエレメントもある。またPre-mRNA スプライシングの際には、切断する酵素の結合するシスエレメントが正確な切断位置の決定や特異的な選択的スプライシングに重要な役割を持っている。生物間のゲノムの比較から、シスエレメントの位置の検索が試みられ、シスエレメントを検索するアルゴリズムは幾つか作成されている。シスエレメントの再編成は生物の形態を変える能力を持っており、生物進化に大きな役割を果たしていることが推定されている。またシスエレメントの異常は遺伝病の原因となっている場合がある。 (ja)
Med begreppet Cis-regulativa element syftar man på DNA-kod med transkriptionsreglerande funktion, såsom enhancersekvenser samt insulatorsekvenser. Dessa kan vara proximala, det vill säga nära promotorsekvensen, eller distala, dvs längre bort på DNA:t. Dessa står i motsats till de trans-agerande faktorerna, som är lösliga faktorer som påverkar transkriptionen genom att binda till de cis-regulativa elementen. (sv)
Цис-регуляторные элементы (или цис-элементы) — участки ДНК или РНК, регулирующие экспрессию генов, находящихся на той же молекуле (обычно хромосоме). Цис-регуляторные элементы часто являются сайтами связывания одного или нескольких транс-факторов. Цис-элементы могут быть расположены upstream (то есть до) от кодирующей последовательности нуклеотидов регулируемого гена (например, таковы последовательности промоторных участков), в интроне, или downstream (то есть после) регулируемой последовательности нуклеотидов, либо в нетранслируемой или нетранскрибируемой области. Примером цис-регуляторного элемента является операторный участок лактозного оперона. Последовательность ДНК связывается репрессором лактозного оперона, что предотвращает транскрипцию близлежащих генов. Сам по себе операторный участок не кодирует белки или РНК. Другими примерами цис-элементов могут служить IRES, ТАТА-бокс, фреймшифт-элемент. В отличие от цис-элементов, транс-регуляторные элементы это диссоциирующие молекулы, обычно белки, которые изменяют активность генов, значительно удаленных от места транскрипции соответствующих мРНК. (ru)
顺式作用元件（cis-regulatory element，CRE），是与结构基因串联的一段非编码DNA序列，一般位于转录点上游，作用是调节邻近基因的转录。CREs是遗传调控网络的重要组成部分，进而控制形态发生、解剖学的发展以及胚胎发育的其他方面。（顺式作用元件是DNA序列，而反式作用因子是调控蛋白） CREs存在于它们调节的基因附近。CRE通常通过与转录因子结合来调节基因转录。单个转录因子可以与许多CRE结合，因此控制许多基因的表达（多效性）。拉丁语前缀顺式意指“在这一侧”，即在与要转录的基因相同的DNA分子上。CRE通常但不总是位于转录位点的上游。 CRE与（trans-regulatory element，TRE）形成对比。 TRE编码转录因子。 (zh)

dbo:wikiPageExternalLink

dbo:wikiPageWikiLink

rdfs:comment

Med begreppet Cis-regulativa element syftar man på DNA-kod med transkriptionsreglerande funktion, såsom enhancersekvenser samt insulatorsekvenser. Dessa kan vara proximala, det vill säga nära promotorsekvensen, eller distala, dvs längre bort på DNA:t. Dessa står i motsats till de trans-agerande faktorerna, som är lösliga faktorer som påverkar transkriptionen genom att binda till de cis-regulativa elementen. (sv)
顺式作用元件（cis-regulatory element，CRE），是与结构基因串联的一段非编码DNA序列，一般位于转录点上游，作用是调节邻近基因的转录。CREs是遗传调控网络的重要组成部分，进而控制形态发生、解剖学的发展以及胚胎发育的其他方面。（顺式作用元件是DNA序列，而反式作用因子是调控蛋白） CREs存在于它们调节的基因附近。CRE通常通过与转录因子结合来调节基因转录。单个转录因子可以与许多CRE结合，因此控制许多基因的表达（多效性）。拉丁语前缀顺式意指“在这一侧”，即在与要转录的基因相同的DNA分子上。CRE通常但不总是位于转录位点的上游。 CRE与（trans-regulatory element，TRE）形成对比。 TRE编码转录因子。 (zh)
Cis-regulatory elements (CREs) or Cis-regulatory modules (CRMs) are regions of non-coding DNA which regulate the transcription of neighboring genes. CREs are vital components of genetic regulatory networks, which in turn control morphogenesis, the development of anatomy, and other aspects of embryonic development, studied in evolutionary developmental biology. CREs are often but not always upstream of the transcription site. CREs contrast with trans-regulatory elements (TREs). TREs code for transcription factors. (en)
Als cis-Element oder cis-wirkendes Element (von lat. cis ‚diesseits‘) wird in der Biologie ein bestimmter Abschnitt in der Erbinformation bezeichnet, der für die Regulation eines Gens eine Rolle spielt, das auf demselben DNA-Molekül liegt wie dieser (molekular betrachtet diesseits). Dieser regulatorische Sequenzabschnitt muss weder RNA noch Protein kodieren und kann in Leserichtung vor oder nach der codierenden Sequenz des zugehörigen Gens liegen, oder auch innerhalb (auch in einem Intron). (de)
Los elementos reguladores en cis son regiones no codificantes del ADN que regulan la transcripción de los genes cercanos. El concepto surge para diferenciarlos de los elementos reguladores en trans. Los elementos reguladores cis están presentes en la misma molécula de ADN como gen regulador, mientras que los elementos reguladores en trans pueden regular genes distantes a partir del gen por las que fueron transcritas. (es)
シスエレメント（cis-element、cis-regulatory element またはcis-acting element）は同一分子上の遺伝子発現を調節するDNA またはRNA の領域を指す。シス（cis）はラテン語で「同じ側」の意味であり、「同じ側で発現調節する要素（因子）」がシスエレメントの原義。一般にシスエレメントは遺伝子上流部の転写因子が結合する領域を指す場合が多い。転写因子はタンパク質であり細胞内に拡散して特定のDNA 配列（シスエレメント）に結合して転写を調節するため、同じ場所に留まらずトランス（trans）に作用する。一方、シスエレメントはDNA またはRNA 分子内の転写因子等に認識される塩基配列で、同一分子に即ちシスに作用し、遺伝子発現を調節する。古典的なラクトースオペロンを例にとると、オペレーターがシスエレメントであり、トランス因子であるラックリプレッサーがここに結合することで同じDNA 分子上の近隣にある遺伝子の転写が抑制される。ただしシスエレメントと標的遺伝子との位置的関係は様々である。例えば転写開始に直接関与するプロモーターは遺伝子の上流に当たる特定の位置に決まった方向で存在する必要があるが、転写を促進するエンハンサーは制御する遺伝子から離れて位置する場合が多い。またエンハンサーの及ぶ範囲を制御するためInsulator が存在している。 (ja)
Een cis-element of cis-regulatie-element is een regio van het DNA of RNA die de genexpressie reguleert en op hetzelfde chromosoom van het DNA ligt. Dit cis-element is vaak een voor één of meer . Een cis-element kan zitten bij het 5'-eind van de coderende sequentie van het gen dat het reguleert (in de promotorregio of verder bovenstrooms), in een intron of 3' van de coderende sequentie van het gen, zowel in de niet-getransleerde als in de niet-getranscribeerde regio. Een ander voorbeeld van een cis-element is de riboswitch. (nl)
Цис-регуляторные элементы (или цис-элементы) — участки ДНК или РНК, регулирующие экспрессию генов, находящихся на той же молекуле (обычно хромосоме). Цис-регуляторные элементы часто являются сайтами связывания одного или нескольких транс-факторов. Цис-элементы могут быть расположены upstream (то есть до) от кодирующей последовательности нуклеотидов регулируемого гена (например, таковы последовательности промоторных участков), в интроне, или downstream (то есть после) регулируемой последовательности нуклеотидов, либо в нетранслируемой или нетранскрибируемой области. (ru)

rdfs:label

Cis-regulatory element (en)
Cis-Element (de)
Elemento regulador en cis (es)
シスエレメント (ja)
Cis-element (nl)
Цис-регуляторные элементы (ru)
Cis-regulativa element (sv)
顺式作用元件 (zh)

is dbo:wikiPageWikiLink of