GROMACS (original) (raw)
GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) ist ein Softwarepaket für Simulationen und Auswertungen molekulardynamischer Prozesse (MD), das ursprünglich an der Universität Groningen entwickelt wurde. Heute findet die Unterstützung und Weiterentwicklung an verschiedenen Orten und Einrichtungen statt, darunter die Universität Uppsala, Universität Stockholm und das Max-Planck-Institut für Polymerforschung.
| Property | Value |
|---|---|
| dbo:abstract | GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) ist ein Softwarepaket für Simulationen und Auswertungen molekulardynamischer Prozesse (MD), das ursprünglich an der Universität Groningen entwickelt wurde. Heute findet die Unterstützung und Weiterentwicklung an verschiedenen Orten und Einrichtungen statt, darunter die Universität Uppsala, Universität Stockholm und das Max-Planck-Institut für Polymerforschung. (de) GROMACS is a molecular dynamics package mainly designed for simulations of proteins, lipids, and nucleic acids. It was originally developed in the Biophysical Chemistry department of University of Groningen, and is now maintained by contributors in universities and research centers worldwide. GROMACS is one of the fastest and most popular software packages available, and can run on central processing units (CPUs) and graphics processing units (GPUs). It is free, open-source software released under the GNU General Public License (GPL), and starting with version 4.6, the GNU Lesser General Public License (LGPL). (en) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) es un programa de alto rendimiento, de código abierto, multiplataforma utilizado para realizar la simulación de la dinámica molecular de sistemas con cientos de millones de partículas.Gromacs fue originalmente desarrollado en la Universidad de Groningen, pero por ser de código abierto ha sido reimplementado por muchos otros desarrolladores. (es) GROMACS（グローマックス、Groningen Machine for Chemical Simulations、グローニンゲン・マシン・フォー・ケミカル・シミュレーションズ）は、フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージである。現在は世界中の開発者により維持管理されている。分子動力学シミュレーション分野の中で高速かつ利用者の多いソフトウェアパッケージの一つであり、CPUおよびGPU上で動作する。フリー、オープンソースソフトウェアであり、GNU General Public License、GNU Lesser General Public License（バージョン4.6から）の下で公開されている。 (ja) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) est un logiciel de simulation en dynamique moléculaire développé initialement par l'université de Groningue, et à présent maintenu et étendu par différentes organisations, notamment l'université d'Uppsala, l'université de Stockholm et l'Institut Max-Planck de recherche sur les polymères. Il est utilisé notamment par le projet Folding@home. (fr) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) è un software libero per la bioinformatica, specializzato nelle simulazioni dinamiche di proteine, lipidi e acidi nucleici. Sviluppato inizialmente dall'Università di Groninga, il progetto è supportato da altre università e anche dalla comunità europea attraverso il programma Horizon 2020. (it) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) é um pacote de dinâmica molecular projetado principalmente para simulações de proteínas, lipídios e ácidos nucleicos. Foi desenvolvido originalmente no departamento de Química Biofísica da Universidade de Groningen e agora é mantido por contribuintes em universidades e centros de pesquisa em todo o mundo. GROMACS é um dos pacotes mais rápidos e mais populares de software disponíveis, e pode ser executado em CPUs, bem como em GPUs. Ele é livre, de código aberto lançado sob a licença GNU General Public License. A partir da versão 4.6, GROMACS é liberado sob a licença GNU Lesser General Public License. (pt) GROMACS (англ. groningen machine for chemical simulations, гронингенская машина для химического моделирования) пакет программ для моделирования физико-химических процессов в молекулярной динамике. Разработан командой Германа Берендсена, работающей в отделении биофизической химии университета Гронингена. В настоящее время развивается и поддерживается усилиями энтузиастов, в число которых входят представители университета Уппсалы и королевского технологического института. Пакет предназначен для моделирования биомолекул (например, молекул белков и липидов), имеющих много связанных взаимодействий между атомами. Обеспечивает высокую скорость расчётов для несвязанных взаимодействий. Считается одним из самых быстрых инструментов. Является свободным программным обеспечением с открытым исходным кодом. Исходный код доступен под лицензией GPL. (ru) GROMACS（全称：GROningen MAchine for Chemical Simulations，格罗宁根化学模拟体系）是一套分子动力学模拟程序包，主要用来模拟研究蛋白质、脂质、核酸等生物分子的性质。它起初由荷兰格罗宁根大学生物化学系开发，目前由来自世界各地的大学和研究机构维护。GROMACS是开源免费的软件，4.6版之前的版本使用GNU通用公共许可证(GPL)发行，而4.6版之后使用GNU宽通用公共许可证(LGPL)发行。 (zh) |
| dbo:developer | dbr:University_of_Groningen dbr:Uppsala_University dbr:Royal_Institute_of_Technology |
| dbo:genre | dbr:Molecular_dynamics |
| dbo:latestReleaseDate | 2022-09-02 (xsd:date) |
| dbo:latestReleaseVersion | 2022.3 |
| dbo:license | dbr:GNU_General_Public_License dbr:GNU_Lesser_General_Public_License |
| dbo:operatingSystem | dbr:Unix dbr:Linux dbr:MacOS dbr:Microsoft_Windows |
| dbo:programmingLanguage | dbr:SYCL dbr:C++ dbr:CUDA dbr:C_(programming_language) dbr:OpenCL |
| dbo:wikiPageExternalLink | http://timn.ho.ua/ccs http://www.bwhpc-c5.de/wiki/index.php/Gromacs https://gromacs.bioexcel.eu/ https://www.gromacs.org/ http://www.nvidia.com/object/gromacs_on_tesla.html |
| dbo:wikiPageID | 306766 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageLength | 10042 (xsd:nonNegativeInteger) |
| dbo:wikiPageRevisionID | 1113971986 (xsd:integer) |
| dbo:wikiPageWikiLink | dbr:Rosetta@home dbr:Biochemistry dbr:University_of_Groningen dbr:Unix dbr:Uppsala_University dbr:VOTCA dbr:OPLS dbr:Nucleic_acid dbr:Command-line_interface dbr:Comparison_of_force_field_implementations dbr:SYCL dbr:Estimated_time_of_arrival dbr:GNU_General_Public_License dbr:GNU_Lesser_General_Public_License dbr:GROMOS dbr:Grace_(plotting_tool) dbr:NAMD dbr:Bennett_acceptance_ratio dbr:Linux dbr:MacOS dbr:Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling dbr:Protein_Data_Bank dbc:Free_software_programmed_in_C dbr:C++ dbr:CHARMM dbr:CUDA dbr:C_(programming_language) dbr:Distributed_computing dbr:Lipid dbr:Abalone_(molecular_mechanics) dbr:Folding@home dbr:Force_field_(chemistry) dbr:Fortran_77 dbr:Central_processing_unit dbr:Graphics_processing_unit dbr:Molecular_dynamics dbr:Protein_folding dbr:Protein dbr:Artificial_life dbc:Molecular_dynamics_software dbr:LAMMPS dbr:Sweden dbr:Microsoft_Windows dbr:Netherlands dbr:Open-source_software dbr:OpenCL dbr:OpenMM dbr:Message_Passing_Interface dbr:Royal_Institute_of_Technology dbr:Solvent dbr:VisIt dbr:Yasara dbr:Molecular_design_software dbr:Folding@home_cores dbr:Thread_(computer_science) |
| dbp:developer | dbr:University_of_Groningen dbr:Uppsala_University dbr:Royal_Institute_of_Technology |
| dbp:genre | Molecular dynamics simulation (en) |
| dbp:language | English (en) |
| dbp:latestReleaseDate | 2022-09-02 (xsd:date) |
| dbp:latestReleaseVersion | 2022.300000 (xsd:double) |
| dbp:license | GPL versions < 4.6 (en) LGPL versions >= 4.6, (en) |
| dbp:name | GROMACS (en) |
| dbp:operatingSystem | Linux, macOS, Windows, any other Unix variety (en) |
| dbp:platform | Many (en) |
| dbp:programmingLanguage | dbr:SYCL dbr:C++ dbr:CUDA dbr:C_(programming_language) dbr:OpenCL |
| dbp:website | https://www.gromacs.org/ |
| dbp:wikiPageUsesTemplate | dbt:As_of dbt:Citation_needed dbt:Columns-list dbt:Infobox_software dbt:Official_website dbt:Portal dbt:Reflist dbt:Short_description dbt:Start_date_and_age dbt:Chemistry_software |
| dcterms:subject | dbc:Free_software_programmed_in_C dbc:Molecular_dynamics_software |
| gold:hypernym | dbr:Package |
| rdf:type | owl:Thing dbo:Software schema:CreativeWork dbo:Work wikidata:Q386724 wikidata:Q7397 yago:Abstraction100002137 yago:Code106355894 yago:CodingSystem106353757 yago:Communication100033020 yago:Writing106359877 yago:WrittenCommunication106349220 yago:Software106566077 umbel-rc:SoftwareObject |
| rdfs:comment | GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) ist ein Softwarepaket für Simulationen und Auswertungen molekulardynamischer Prozesse (MD), das ursprünglich an der Universität Groningen entwickelt wurde. Heute findet die Unterstützung und Weiterentwicklung an verschiedenen Orten und Einrichtungen statt, darunter die Universität Uppsala, Universität Stockholm und das Max-Planck-Institut für Polymerforschung. (de) GROMACS is a molecular dynamics package mainly designed for simulations of proteins, lipids, and nucleic acids. It was originally developed in the Biophysical Chemistry department of University of Groningen, and is now maintained by contributors in universities and research centers worldwide. GROMACS is one of the fastest and most popular software packages available, and can run on central processing units (CPUs) and graphics processing units (GPUs). It is free, open-source software released under the GNU General Public License (GPL), and starting with version 4.6, the GNU Lesser General Public License (LGPL). (en) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) es un programa de alto rendimiento, de código abierto, multiplataforma utilizado para realizar la simulación de la dinámica molecular de sistemas con cientos de millones de partículas.Gromacs fue originalmente desarrollado en la Universidad de Groningen, pero por ser de código abierto ha sido reimplementado por muchos otros desarrolladores. (es) GROMACS（グローマックス、Groningen Machine for Chemical Simulations、グローニンゲン・マシン・フォー・ケミカル・シミュレーションズ）は、フローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのソフトウェアパッケージである。現在は世界中の開発者により維持管理されている。分子動力学シミュレーション分野の中で高速かつ利用者の多いソフトウェアパッケージの一つであり、CPUおよびGPU上で動作する。フリー、オープンソースソフトウェアであり、GNU General Public License、GNU Lesser General Public License（バージョン4.6から）の下で公開されている。 (ja) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) est un logiciel de simulation en dynamique moléculaire développé initialement par l'université de Groningue, et à présent maintenu et étendu par différentes organisations, notamment l'université d'Uppsala, l'université de Stockholm et l'Institut Max-Planck de recherche sur les polymères. Il est utilisé notamment par le projet Folding@home. (fr) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) è un software libero per la bioinformatica, specializzato nelle simulazioni dinamiche di proteine, lipidi e acidi nucleici. Sviluppato inizialmente dall'Università di Groninga, il progetto è supportato da altre università e anche dalla comunità europea attraverso il programma Horizon 2020. (it) GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations) é um pacote de dinâmica molecular projetado principalmente para simulações de proteínas, lipídios e ácidos nucleicos. Foi desenvolvido originalmente no departamento de Química Biofísica da Universidade de Groningen e agora é mantido por contribuintes em universidades e centros de pesquisa em todo o mundo. GROMACS é um dos pacotes mais rápidos e mais populares de software disponíveis, e pode ser executado em CPUs, bem como em GPUs. Ele é livre, de código aberto lançado sob a licença GNU General Public License. A partir da versão 4.6, GROMACS é liberado sob a licença GNU Lesser General Public License. (pt) GROMACS（全称：GROningen MAchine for Chemical Simulations，格罗宁根化学模拟体系）是一套分子动力学模拟程序包，主要用来模拟研究蛋白质、脂质、核酸等生物分子的性质。它起初由荷兰格罗宁根大学生物化学系开发，目前由来自世界各地的大学和研究机构维护。GROMACS是开源免费的软件，4.6版之前的版本使用GNU通用公共许可证(GPL)发行，而4.6版之后使用GNU宽通用公共许可证(LGPL)发行。 (zh) GROMACS (англ. groningen machine for chemical simulations, гронингенская машина для химического моделирования) пакет программ для моделирования физико-химических процессов в молекулярной динамике. Разработан командой Германа Берендсена, работающей в отделении биофизической химии университета Гронингена. В настоящее время развивается и поддерживается усилиями энтузиастов, в число которых входят представители университета Уппсалы и королевского технологического института. Пакет предназначен для моделирования биомолекул (например, молекул белков и липидов), имеющих много связанных взаимодействий между атомами. Обеспечивает высокую скорость расчётов для несвязанных взаимодействий. Считается одним из самых быстрых инструментов. Является свободным программным обеспечением с открытым исходным код (ru) |
| rdfs:label | GROMACS (de) GROMACS (en) GROMACS (es) GROMACS (fr) Gromacs (it) GROMACS (ja) GROMACS (pt) GROMACS (ru) GROMACS (zh) |
| owl:sameAs | freebase:GROMACS wikidata:GROMACS dbpedia-de:GROMACS dbpedia-es:GROMACS dbpedia-fa:GROMACS dbpedia-fr:GROMACS dbpedia-it:GROMACS dbpedia-ja:GROMACS dbpedia-pt:GROMACS dbpedia-ru:GROMACS dbpedia-sh:GROMACS dbpedia-sr:GROMACS dbpedia-zh:GROMACS https://global.dbpedia.org/id/54FTv |
| prov:wasDerivedFrom | wikipedia-en:GROMACS?oldid=1113971986&ns=0 |
| foaf:homepage | https://www.gromacs.org/ |
| foaf:isPrimaryTopicOf | wikipedia-en:GROMACS |
| foaf:name | GROMACS (en) |
| is dbo:wikiPageDisambiguates of | dbr:GRO |
| is dbo:wikiPageRedirects of | dbr:Gromacs dbr:Gromacs_MD dbr:Gromacs_MD_code |
| is dbo:wikiPageWikiLink of | dbr:Q-Chem dbr:Q_(software) dbr:List_of_free_and_open-source_software_packages dbr:VOTCA dbr:Index_of_physics_articles_(G) dbr:Interface_force_field dbr:GRO dbr:List_of_open-source_bioinformatics_software dbr:OPLS dbr:Preprocessor dbr:Chemical_file_format dbr:General-purpose_computing_on_graphics_processing_units dbr:GROMOS dbr:Grace_(plotting_tool) dbr:Molecular_mechanics dbr:MARTINI dbr:MBN_Explorer dbr:MDynaMix dbr:MacroModel dbr:Comparison_of_force-field_implementations dbr:Comparison_of_software_for_molecular_mechanics_modeling dbr:Computational_materials_science dbr:Transition_path_sampling dbr:BOSS_(molecular_mechanics) dbr:CHARMM dbr:AMBER dbr:Abalone_(molecular_mechanics) dbr:Advanced_Vector_Extensions dbr:Folding@home dbr:PLUMED dbr:Isoenthalpic–isobaric_ensemble dbr:List_of_Folding@home_cores dbr:List_of_OpenCL_applications dbr:Gromacs dbr:Free_energy_perturbation dbr:OpenMM dbr:Metadynamics dbr:WeNMR dbr:Molecular_modeling_on_GPUs dbr:Polish_Grid_Infrastructure_PL-Grid dbr:Parallel_tempering dbr:Rare_event_sampling dbr:Gromacs_MD dbr:Gromacs_MD_code |
| is foaf:primaryTopic of | wikipedia-en:GROMACS |