Gene family (original) (raw)
Genová rodina je skupina příbuzných genů, které kódují podobné bílkovinné produkty. Každá genová rodina historicky vzniká postupnou a jejich postupnou evolucí (na základě mutací), přičemž mohou kódované proteiny dokonce získávat nové funkce. Geny z jedné genové rodiny jsou buď seřazeny na jednom chromozomu, ale mnohdy jsou dokonce rozptýleny po celém genomu na několika chromozomech. Genové rodiny je někdy možné seskupovat do („superfamilies“). Například mezi členy Ig superrodiny patří imunoglobulinová genová rodina, HLA geny či TCR.
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| dbo:abstract | Una família gènica o família multigènica és un grup de loci cromosòmics la seqüència de nucleòtids és similar i que deriven d'una seqüència comuna ancestral. En alguns casos, les famílies gèniques no només alberguen multitud de còpies en el genoma de gens amb lleugeres diferències, sinó també pseudogens més variables. Aquest fet s'explica per una major acumulació de mutacions a causa de la menor pressió de selecció existent sobre una variant gènica quan hi ha una altra còpia viable en correcte funcionament. Aquest fet es considera un mètode de generació de variabilitat en el cas de les duplicacions gèniques. Per exemple, l'actina, una proteïna clau en les cèl·lules, tot i que està molt conservada en la filogènia, està codificada per una família multigènica que, en plantes, alberga més de 60 elements, entre gens i pseudogens i que, en humans, té més de 30. (ca) Genová rodina je skupina příbuzných genů, které kódují podobné bílkovinné produkty. Každá genová rodina historicky vzniká postupnou a jejich postupnou evolucí (na základě mutací), přičemž mohou kódované proteiny dokonce získávat nové funkce. Geny z jedné genové rodiny jsou buď seřazeny na jednom chromozomu, ale mnohdy jsou dokonce rozptýleny po celém genomu na několika chromozomech. Genové rodiny je někdy možné seskupovat do („superfamilies“). Například mezi členy Ig superrodiny patří imunoglobulinová genová rodina, HLA geny či TCR. (cs) العائلة الجينية (بالإنجليزية: Gene family) هي مجموعة من الجينات المتشابهة التي تكونت من تضاعف جين أصلي واحد، وعادةً ما تكون لديها وظائف حيوية كيميائية متشابهة أيضاً. من الأمثلة على هذه العائلات هي عشرة الجينات المسؤولة عن وحدات الهيموغلوبين في الإنسان، وهذه الجينات مقسمة لمجموعتين في الكروموسومين المختلفين، وتسمى هاتان المجموعتان المواضع الكروموسومية لغلوبين-ألفا وغلوبين-بيتا. تصنف الجينات إلى عائلات استناداً على النكليوتيدات أو تسلسلات البروتين المتشابهة. إن كانت الجينات في عائلة جينية معينة مشفرة للبروتين، فإن المصطلح عائلة بروتينية قد يستخدم للإشارة إليها. توسع أو تقلص العائلات الجينية عبر السلالات قد يكون بسبب الصدفة، أو كنتيجة للاصطفاء الطبيعي. (ar) A gene family is a set of several similar genes, formed by duplication of a single original gene, and generally with similar biochemical functions. One such family are the genes for human hemoglobin subunits; the ten genes are in two clusters on different chromosomes, called the α-globin and β-globin loci. These two gene clusters are thought to have arisen as a result of a precursor gene being duplicated approximately 500 million years ago. Genes are categorized into families based on shared nucleotide or protein sequences. Phylogenetic techniques can be used as a more rigorous test. The positions of exons within the coding sequence can be used to infer common ancestry. Knowing the sequence of the protein encoded by a gene can allow researchers to apply methods that find similarities among protein sequences that provide more information than similarities or differences among DNA sequences. If the genes of a gene family encode proteins, the term protein family is often used in an analogous manner to gene family. The expansion or contraction of gene families along a specific lineage can be due to chance, or can be the result of natural selection. To distinguish between these two cases is often difficult in practice. Recent work uses a combinationof statistical models and algorithmic techniques to detect gene families that are under the effect of natural selection. The HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) creates nomenclature schemes using a "stem" (or "root") symbol for members of a gene family (by homology or function), with a hierarchical numbering system to distinguish the individual members. For example, for the peroxiredoxin family, PRDX is the root symbol, and the family members are PRDX1, PRDX2, PRDX3, PRDX4, PRDX5, and PRDX6. (en) Una familia génica o familia multigénica es un grupo de loci cromosómicos cuya secuencia de nucleótidos es similar y que derivan de una secuencia común ancestral. En algunos casos, las familias génicas no sólo albergan multitud de copias en el genoma de genes con ligeras diferencias, sino también pseudogenes más variables. Este hecho se explica por una mayor acumulación de mutaciones debido a la menor presión de selección existente sobre una variante génica cuando existe otra copia viable en correcto funcionamiento. Este hecho se considera un método de generación de variabilidad en el caso de las duplicaciones génicas. Por ejemplo, la actina, una proteína clave en las células, si bien está muy conservada en la filogenia, está codificada por una familia multigénica que, en plantas, alberga más de 60 elementos, entre genes y pseudogenes y que, en humanos, posee más de 30. (es) Une famille multigénique est un ensemble de gènes, au sein d'un même génome, qui présentent des homologies de séquences (on ne peut déterminer un pourcentage de ressemblance à partir duquel les gènes seront considérés comme homologues, contrairement aux protéines homologues qui doivent présenter au moins 20 % de similitude) issues d'un gène ancestral ayant subi une duplication, mutation et transposition (→ les protéines codées par ces gènes ont les mêmes fonctions, ex : opsines bleues, vertes, rouges). Ainsi les protéines produites par ces gènes auront globalement les mêmes fonctions, comme c'est par exemple le cas de l'hémoglobine et du CMH ou encore pour les différentes opsines constituant les différentes cellules photosensibles tapissant notre rétine (plus de 40 % de similitudes entre elles). Voici un tableau représentant la séquence d'ADN de différents gènes (attention, on ne parle pas ici d'allèles) codant trois hormones : la (AVT), l'ocytocine (OT) et la vasopressine (AVP ou ADH) qui sont toutes trois localisées sur le chromosome 20 humain. Les changements entre ces gènes sont dus à des mutations ponctuelles dérivées d'un gène ancestral commun. Dans ce cas, ces mutations sont appelées substitutions. Ainsi, ces trois gènes font partie de la même famille multigénique. L'émergence de familles multigéniques est généralement due à des crossing over inégaux. Ceux-ci sont en fait des anomalies qui se déroulent lors de la prophase (à la première division de la méiose). Il y a alors échange de fragments asymétriques entre deux chromosomes homologues. Ce phénomène peut alors conduire à l'obtention d'une chromatide recombinée qui porte deux exemplaires du même gène et est donc à l'origine de la duplication des gènes.Avec le temps, un gène ancestral et ses différentes copies vont accumuler des mutations différentes et parfois coder des protéines à fonctions différentes, à l'origine des familles multigéniques (exemple: les globines) (fr) 遺伝子ファミリー（いでんしファミリー、遺伝子族、英: Gene family）とは、たった一つの遺伝子の複製によって形成された、幾つかの類似遺伝子の組み合わせである。一般的に同じ族の遺伝子は類似の生化学的機能を有する。ヒトヘモグロビンサブユニットは、異なる染色体に2つの族（α-グロビン遺伝子座とβ-グロビン遺伝子座）と10個の遺伝子にコードされている。これら2つの遺伝子族は5億年前に1つの遺伝子が複製され続けた結果、生じたと考えられている。 ある遺伝子がどの遺伝子族に属しているかはヌクレオチド配列や、被コードタンパク質のアミノ酸配列における類似部分から判断される。特にアミノ酸配列は類似性に関してより多くの情報を提供する。分類は更に厳密には系統発生解析により行われる。コード領域におけるエクソンの位置は共通の祖先を推測するのに役立つ。 特定の方向を伴った遺伝子族の拡大または縮小は偶然の結果でも、自然選択の結果でもあり得る。どちらの結果なのかを判断することは難しいが、統計モデルとアルゴリズム技術による解析による試みが行われている。 HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC)は、遺伝子族の成員を階層ごとに区別して表記するための幹と根のシンボルを用いた命名法案を作成した。例えば、ペルオキシレドキシン族においてはPRDXが根のシンボルであり、そこから他の族成員のPRDX1、PRDX2、PRDX3、PRDX4、PRDX5、およびPRDX6が広がる。 (ja) Una famiglia genica è un gruppo di geni che mostrano una certa similarità di sequenza di DNA e derivano tutti da un gene ancestrale comune. L'evento biologico che sta alla base delle famiglie geniche è la duplicazione genica seguita da fenomeni di divergenza. Tra queste famiglie quella più studiata è quella delle globine, i cui geni codificano per le catene polipeptidiche delle emoglobine fetali ed adulte. (it) Een genfamilie is een homologe groep genen waarvan ook de functies vaak, maar niet altijd, sterke onderlinge overeenkomsten vertonen. Leden van een genfamilie zijn in biochemisch opzicht gelijkaardig. Ze worden categorisch gerangschikt op basis van gedeelde nucleotide- of . Wanneer het specifiek om de codering van eiwitten gaat, wordt vaak van een eiwit- of gesproken wanneer men een genfamilie aan wil duiden. Om de gemeenschappelijke herkomst van bepaalde genen te achterhalen, wordt veelal gebruikgemaakt van fylogenetische technieken, waarbij de positie van intronen binnen de codesequentie kan worden gebruikt om een gemeenschappelijke herkomst af te leiden. Ook de secundaire structuur van de eiwitten waarvoor de genen coderen, kan nadere informatie verschaffen. (nl) Uma família de genes é um conjunto de vários genes semelhantes, formados pela duplicação de um único gene original e geralmente com funções bioquímicas semelhantes. Os genes são categorizados em famílias com base em seqüências compartilhadas de nucleotídeos ou proteínas. Técnicas filogenéticas podem ser usadas como um teste mais rigoroso. As posições dos exons na sequência de codificação podem ser usadas para inferir ancestralidade comum. O conhecimento da sequência da proteína codificada por um gene pode permitir que os pesquisadores apliquem métodos que encontrem semelhanças entre as seqüências de proteínas que forneçam mais informações do que semelhanças ou diferenças entre as seqüências de DNA. Se os genes de uma família de genes codificam proteínas, o termo família de proteínas é frequentemente usado de maneira análoga à família de genes. Uma dessas famílias são os genes das subunidades da hemoglobina humana; os dez genes estão em dois grupos em diferentes cromossomos, chamados loci e . Pensa-se que estes dois agrupamentos de genes tenham surgido como resultado de um gene precursor duplicado aproximadamente 500 milhões de anos atrás. (pt) 基因家族（英語：Gene family），是来源于同一个祖先，由一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，它们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。一个这样的家族是人类血红蛋白亚基的基因，10个基因在不同染色体上的两个簇中，称为α-珠蛋白和β-珠蛋白基因座。这两个基因簇被认为是由于前体基因在大约5亿年前被复制而产生的。 同一家族基因可以紧密排列在一起，形成一个基因簇，但多数时候，它们是分散在同一染色体的不同位置，或者存在于不同的染色体上的，各自具有不同的表达调控模式。 如果基因家族的基因编码蛋白质，术语蛋白质家族通常以与基因家族类似的方式使用。 (zh) |
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| rdfs:comment | Genová rodina je skupina příbuzných genů, které kódují podobné bílkovinné produkty. Každá genová rodina historicky vzniká postupnou a jejich postupnou evolucí (na základě mutací), přičemž mohou kódované proteiny dokonce získávat nové funkce. Geny z jedné genové rodiny jsou buď seřazeny na jednom chromozomu, ale mnohdy jsou dokonce rozptýleny po celém genomu na několika chromozomech. Genové rodiny je někdy možné seskupovat do („superfamilies“). Například mezi členy Ig superrodiny patří imunoglobulinová genová rodina, HLA geny či TCR. (cs) Una famiglia genica è un gruppo di geni che mostrano una certa similarità di sequenza di DNA e derivano tutti da un gene ancestrale comune. L'evento biologico che sta alla base delle famiglie geniche è la duplicazione genica seguita da fenomeni di divergenza. Tra queste famiglie quella più studiata è quella delle globine, i cui geni codificano per le catene polipeptidiche delle emoglobine fetali ed adulte. (it) 基因家族（英語：Gene family），是来源于同一个祖先，由一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，它们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。一个这样的家族是人类血红蛋白亚基的基因，10个基因在不同染色体上的两个簇中，称为α-珠蛋白和β-珠蛋白基因座。这两个基因簇被认为是由于前体基因在大约5亿年前被复制而产生的。 同一家族基因可以紧密排列在一起，形成一个基因簇，但多数时候，它们是分散在同一染色体的不同位置，或者存在于不同的染色体上的，各自具有不同的表达调控模式。 如果基因家族的基因编码蛋白质，术语蛋白质家族通常以与基因家族类似的方式使用。 (zh) العائلة الجينية (بالإنجليزية: Gene family) هي مجموعة من الجينات المتشابهة التي تكونت من تضاعف جين أصلي واحد، وعادةً ما تكون لديها وظائف حيوية كيميائية متشابهة أيضاً. من الأمثلة على هذه العائلات هي عشرة الجينات المسؤولة عن وحدات الهيموغلوبين في الإنسان، وهذه الجينات مقسمة لمجموعتين في الكروموسومين المختلفين، وتسمى هاتان المجموعتان المواضع الكروموسومية لغلوبين-ألفا وغلوبين-بيتا. تصنف الجينات إلى عائلات استناداً على النكليوتيدات أو تسلسلات البروتين المتشابهة. إن كانت الجينات في عائلة جينية معينة مشفرة للبروتين، فإن المصطلح عائلة بروتينية قد يستخدم للإشارة إليها. (ar) Una família gènica o família multigènica és un grup de loci cromosòmics la seqüència de nucleòtids és similar i que deriven d'una seqüència comuna ancestral. En alguns casos, les famílies gèniques no només alberguen multitud de còpies en el genoma de gens amb lleugeres diferències, sinó també pseudogens més variables. Aquest fet s'explica per una major acumulació de mutacions a causa de la menor pressió de selecció existent sobre una variant gènica quan hi ha una altra còpia viable en correcte funcionament. Aquest fet es considera un mètode de generació de variabilitat en el cas de les duplicacions gèniques. Per exemple, l'actina, una proteïna clau en les cèl·lules, tot i que està molt conservada en la filogènia, està codificada per una família multigènica que, en plantes, alberga més de 6 (ca) A gene family is a set of several similar genes, formed by duplication of a single original gene, and generally with similar biochemical functions. One such family are the genes for human hemoglobin subunits; the ten genes are in two clusters on different chromosomes, called the α-globin and β-globin loci. These two gene clusters are thought to have arisen as a result of a precursor gene being duplicated approximately 500 million years ago. If the genes of a gene family encode proteins, the term protein family is often used in an analogous manner to gene family. (en) Una familia génica o familia multigénica es un grupo de loci cromosómicos cuya secuencia de nucleótidos es similar y que derivan de una secuencia común ancestral. En algunos casos, las familias génicas no sólo albergan multitud de copias en el genoma de genes con ligeras diferencias, sino también pseudogenes más variables. Este hecho se explica por una mayor acumulación de mutaciones debido a la menor presión de selección existente sobre una variante génica cuando existe otra copia viable en correcto funcionamiento. Este hecho se considera un método de generación de variabilidad en el caso de las duplicaciones génicas. Por ejemplo, la actina, una proteína clave en las células, si bien está muy conservada en la filogenia, está codificada por una familia multigénica que, en plantas, alberga (es) Une famille multigénique est un ensemble de gènes, au sein d'un même génome, qui présentent des homologies de séquences (on ne peut déterminer un pourcentage de ressemblance à partir duquel les gènes seront considérés comme homologues, contrairement aux protéines homologues qui doivent présenter au moins 20 % de similitude) issues d'un gène ancestral ayant subi une duplication, mutation et transposition (→ les protéines codées par ces gènes ont les mêmes fonctions, ex : opsines bleues, vertes, rouges). Ainsi les protéines produites par ces gènes auront globalement les mêmes fonctions, comme c'est par exemple le cas de l'hémoglobine et du CMH ou encore pour les différentes opsines constituant les différentes cellules photosensibles tapissant notre rétine (plus de 40 % de similitudes entre e (fr) 遺伝子ファミリー（いでんしファミリー、遺伝子族、英: Gene family）とは、たった一つの遺伝子の複製によって形成された、幾つかの類似遺伝子の組み合わせである。一般的に同じ族の遺伝子は類似の生化学的機能を有する。ヒトヘモグロビンサブユニットは、異なる染色体に2つの族（α-グロビン遺伝子座とβ-グロビン遺伝子座）と10個の遺伝子にコードされている。これら2つの遺伝子族は5億年前に1つの遺伝子が複製され続けた結果、生じたと考えられている。 ある遺伝子がどの遺伝子族に属しているかはヌクレオチド配列や、被コードタンパク質のアミノ酸配列における類似部分から判断される。特にアミノ酸配列は類似性に関してより多くの情報を提供する。分類は更に厳密には系統発生解析により行われる。コード領域におけるエクソンの位置は共通の祖先を推測するのに役立つ。 特定の方向を伴った遺伝子族の拡大または縮小は偶然の結果でも、自然選択の結果でもあり得る。どちらの結果なのかを判断することは難しいが、統計モデルとアルゴリズム技術による解析による試みが行われている。 (ja) Een genfamilie is een homologe groep genen waarvan ook de functies vaak, maar niet altijd, sterke onderlinge overeenkomsten vertonen. Leden van een genfamilie zijn in biochemisch opzicht gelijkaardig. Ze worden categorisch gerangschikt op basis van gedeelde nucleotide- of . Wanneer het specifiek om de codering van eiwitten gaat, wordt vaak van een eiwit- of gesproken wanneer men een genfamilie aan wil duiden. (nl) Uma família de genes é um conjunto de vários genes semelhantes, formados pela duplicação de um único gene original e geralmente com funções bioquímicas semelhantes. Os genes são categorizados em famílias com base em seqüências compartilhadas de nucleotídeos ou proteínas. Técnicas filogenéticas podem ser usadas como um teste mais rigoroso. As posições dos exons na sequência de codificação podem ser usadas para inferir ancestralidade comum. O conhecimento da sequência da proteína codificada por um gene pode permitir que os pesquisadores apliquem métodos que encontrem semelhanças entre as seqüências de proteínas que forneçam mais informações do que semelhanças ou diferenças entre as seqüências de DNA. 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